Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181: MCCPILRI181_00085
Help
Entry
MCCPILRI181_00085 CDS
T03704
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mcar
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181
Pathway
mcar03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcar00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
MCCPILRI181_00085 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mcar03021
]
MCCPILRI181_00085 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcar03400
]
MCCPILRI181_00085 (rpoC)
Enzymes [BR:
mcar01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
MCCPILRI181_00085 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mcar03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
MCCPILRI181_00085 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcar03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
MCCPILRI181_00085 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
EF-G-binding_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEA10453
LinkDB
All DBs
Position
1:100372..104139
Genome browser
AA seq
1255 aa
AA seq
DB search
MENLNRKKAIKIELANPDTIRSWSHGEVLKPETINYKTLKAEKDGLFDERIFGPTKNYEC
VCGRYKKANPMNKGKKCEKCGVELTESIVRRERMGHIELEEPVTHIWMFKVAPYRIAAIL
DLKAKELEEVVYFVSHIVLEQGNQNHFLEKEVLDLGSSRITKTREKLQLSILDVIDQIND
PDHRDTKKANRLLEELKNTSIPFSIDEATSLISKYTNAKFGIGARAVEYLLEKVDLTKEI
EAIKIQLENSKKTPNERTKLLKRLETFDSLKRSKQRPEWMVMRVIPVIPPDIRPIIQLDG
GRFTTSEINDLYRRIIIRNERLKKVKEMGAPSIIVNNEKRMLQEAVDALFDNERKPKPVQ
GKNKRPLKSLTSVLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSARSVIAIGPDLKMYQAGLPREMAITLF
KPFVIQWLQDHEYAENVKIAEKMLLQNDPKVWEALEQVIKDRPVLLNRAPTLHRLGIQAF
EPKLVKGKAIRLHPLVTTAFNADFDGDQMAVHVPITKEAVAESRALMLGSSAILGPKDGK
AIVTPGQDIILGNYYLTTEEKNAKGQGMIFSSLDEAFMAYNSGQIHLNSLIGIALSALPE
EKFSDKNQRLNSYLLTTVGKLYFNQIFDDNFPWINSNNIWNAKEAVKEFIYDFSQDIDKV
IENVQVQQPIKKKELSLIIERYFETHGARKTAEMLDKMKDLGFSFSTKSGTTISAGDVVA
FTHKYDEFKEADQKVEQITDFYNMGMLTNSEKKRRIIDVWSEVKDKIQNELATVLRKDVK
NPIFVMVDSGARGNVSNFTQLVGMRGLMNDTKGDIKEIPIKSSFREGLTVSEYFVSTHGA
RKGMADIALKTADSGYLTRRLVDVSQEIVVVNEDCEPTKGFEVSAIIDTKHDNVIVPLKD
RLVGRFTFKDIYDDDKNLVASANTLIDKNIAEKIIMSGISSVIIRSVLTCDNKRGVCQKC
YGLNLATASVVNIGEPVGVIAAQSIGEPGTQLTMRNFHTGGVAGNVDITQGLPRIKELLD
VTTPKGAVAIISEVDGVVSEIEDYNGVFVINIVTENEEVKKYKTEFNSVLRVEQGSSVMA
GQKLTEGAIDLHQLLEFGGIQDVQNYILKEVQKVYRLQGIEISDKYIEIIIKQMLNKVKI
TDSGDSDLLPGEIITIQNYKEVVQDCIVKSIRPPLSKAQIFGIKKAPLESSSWLSSASFQ
DTARVLTRAIIKGKEDKLEGLKENIMLGNLIPAGTGLTGTQEVEQLAEQYHNNEY
NT seq
3768 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatttaaatcgtaaaaaagcaataaaaattgaattagctaaccctgatacaatt
cgttcatgatcacatggagaagttttaaaaccagaaactattaactataaaacattaaaa
gccgaaaaagatgggttatttgatgaaagaatttttggtccaactaaaaactatgaatgt
gtttgtggaagatataaaaaagccaaccctatgaataaagggaaaaaatgtgaaaaatgt
ggtgttgaattaactgaatcaattgttcgtagagaaagaatgggacatattgaactagaa
gaaccagttactcacatttgaatgtttaaagttgctccttatagaattgctgcaattcta
gatttaaaagcaaaagaactagaagaagtagtttactttgtttctcatattgttctagaa
caaggtaatcaaaatcattttctagaaaaagaagttttagatttaggttcatcaagaatt
actaaaactagagaaaaattgcaactatcaattttagatgttattgatcaaattaatgat
cctgaccatagagatactaagaaggctaatagattattagaagaattaaaaaatacttct
attccattttcaatagatgaagcaactagcttaattagtaaatatactaatgcaaaattt
ggaattggagctagagctgttgaatatttattagaaaaagtagatttaactaaagaaatt
gaagcaattaaaattcaacttgaaaattctaaaaaaaccccaaatgaaagaactaaatta
ttaaaacgtttagaaacttttgattctttaaaacgttctaaacaacgtcctgaatgaatg
gttatgagagtaattccagttattccaccagacattcgtcctattattcaattagatggt
ggtcgttttactacttctgaaattaatgatttatatagaagaatcattattagaaatgaa
agattaaaaaaagttaaagaaatgggtgcaccttcaattattgttaataacgaaaaacgt
atgttacaagaagctgttgatgctctatttgataatgaaagaaagccaaaaccagttcaa
ggaaaaaataaacgcccattaaaatctttaactagtgttttaaaaggaaaacaaggtcgt
tttagacaaaacttattgggaaaacgtgttgattattcagctagatcagttattgcaatt
ggaccagatctaaaaatgtatcaagcaggtttaccaagagaaatggcaattactttattt
aaaccatttgttattcaatgacttcaagatcatgagtatgctgaaaatgttaaaattgct
gaaaaaatgttattgcaaaatgatccaaaagtttgagaggcactagaacaagtaattaaa
gacagacctgtattgttaaaccgtgctcctacattacaccgtttgggaattcaagcattt
gagcctaaattagttaaaggaaaagcaattcgtttacacccactagttacaactgcattc
aatgctgactttgatggtgatcaaatggcagttcacgtacctattacaaaagaagctgtt
gctgaatcaagagctttaatgttgggttcaagtgctattttaggaccaaaagatggaaaa
gctattgttactccaggtcaagatatcattttaggaaattattatttaactactgaagaa
aaaaacgccaaaggacaaggaatgattttttcaagtttagatgaagcgtttatggcttat
aatagtggtcaaattcatttaaactcattgattggaattgctttatcagctttacctgaa
gaaaaatttagtgataaaaatcaaagattaaattcttatttattaacaactgttggaaaa
ctttactttaatcaaatttttgatgataatttcccatgaattaattcaaataatatttga
aatgctaaagaagcagttaaagaattcatttatgatttttcacaagatattgataaagta
attgaaaatgttcaagttcaacaaccaattaagaaaaaagaattatcacttattattgaa
agatactttgaaactcatggagctagaaaaactgctgaaatgctagataaaatgaaagat
ctaggatttagtttttcaacaaaatcaggaaccacaatttcagctggagatgttgttgct
tttactcataaatatgacgaatttaaagaagcagatcaaaaagttgaacaaattactgat
ttttacaatatgggtatgttaactaatagtgaaaagaaacgtagaattattgatgtttga
tcagaagttaaagataaaattcaaaatgaattagcaacagtactacgtaaagatgttaaa
aatccaatttttgtaatggttgattcaggagcccgtggtaatgtttcaaactttactcaa
ttagttggtatgcgtggattaatgaacgatactaagggagatattaaagaaattcctatt
aagtcttcattccgtgagggattaactgtttcagaatatttcgtttcaactcatggagct
agaaaaggtatggctgatattgccttaaaaactgctgactcaggttatttaactagaaga
ttagttgacgttagtcaagaaattgttgttgttaatgaagattgtgaaccaaccaaagga
tttgaagtatcagctattattgatacaaaacatgataatgttattgttccattaaaagat
agattggttggaagattcacatttaaagacatttatgatgatgataaaaatctagttgct
tctgctaatacattaattgataaaaatattgctgaaaaaattattatgtcaggaattagt
tcagtaattattagatcagttttaacttgtgataataaacgtggtgtttgtcaaaaatgt
tatggactaaacttagctactgcttcagttgttaatattggtgaaccagtaggagttatt
gctgctcaatcaattggagaaccgggaactcaattaacaatgcgtaacttccatacagga
ggagttgctggtaatgttgatattactcaaggacttcctcgtattaaagaattattagat
gttacaactccaaaaggtgctgttgctataatttctgaagttgatggagtagttagtgaa
attgaagattataatggtgtatttgtaatcaatattgttactgaaaatgaagaagttaaa
aaatataaaactgaatttaattcagtattacgtgttgaacaaggatcaagtgttatggcc
ggtcaaaaattgactgaaggagctattgatttacatcaattattagaatttggtggaatt
caagatgtgcaaaattacattttaaaagaagtacaaaaagtttatagattacaaggtatt
gaaatttcagacaaatatattgaaatcatcattaaacaaatgttaaacaaagtaaaaatt
actgatagtggtgattctgatttattacctggagaaattattacaattcaaaactataaa
gaagtagtacaagattgtattgttaaatcaattagaccacctttatcaaaagcacaaatt
tttggtattaaaaaagcacctctagaatcaagctcatgattatcttctgcttcattccaa
gatactgctagagtattaactagagcaattattaaaggaaaagaagataaattagaagga
ttaaaagaaaatattatgttaggtaatttaattccagccggtactggtttaactggaact
caagaagttgaacaactagcagaacaatatcataacaatgaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
