Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181: MCCPILRI181_00411
Help
Entry
MCCPILRI181_00411 CDS
T03704
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III PolC-type
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mcar
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181
Pathway
mcar03030
DNA replication
mcar03430
Mismatch repair
mcar03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcar00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MCCPILRI181_00411 (polC)
03430 Mismatch repair
MCCPILRI181_00411 (polC)
03440 Homologous recombination
MCCPILRI181_00411 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mcar03032
]
MCCPILRI181_00411 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcar03400
]
MCCPILRI181_00411 (polC)
Enzymes [BR:
mcar01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MCCPILRI181_00411 (polC)
DNA replication proteins [BR:
mcar03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MCCPILRI181_00411 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcar03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MCCPILRI181_00411 (polC)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
DNA_pol3_a_NII
DNA_pol3_a_NI
HHH_6
tRNA_anti-codon
RNase_H_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEA10777
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(421776..426215)
Genome browser
AA seq
1479 aa
AA seq
DB search
MQTKILNIFKKLDIKLSEADYIYFKDAILVETPRISKIKNKGYLHIQIKDFLPIEVLKQI
DNKLKNNNYFNFKLILDVENQHINKQLISQYLEFIKMYKSLFNNRISWKLLDIYNFDLEN
NQLIFTVSSQTTKNDISQELDYCLAKLNQFGFKNLSYLINVKEISLDVLDQQEQKNSTSI
EQQTVIKQVEKEPSLPTSYKNKRTNLDKPSYQSLLDVEDDAQNIVIQGVVINKEFKLSKT
GRKIFYIDITDYQSSIRCMYFAKSDALCEFDDLTDEQLNSKNVEEIKESKIKINDWISVK
GKTSLSLYDQEQIFYIDDFKKINKQIISRTDDAKTKRVELHAHTKMSVMDGVSDPTDYLE
LISSWNHKAIAFTDHTNVQAFPDIYKALNSVNKKRIDQEKIKAIYGLEINMLNNDLWYVK
NPKNQNLKDAKMVFFDLETTGLSPELDEIIEFGAIEYNFKTGERKKIDILIKPKSKLKDF
TKKLTNINEEMLENKPGIEVAFKQINQVIKDAILVAHNANFDYTFLSHWSEKLGYGKLEN
TIIDTLTISRIIYPELKSHRLGSLAKRVNISYDPSIAHRGDYDADILADIYERMLDETRK
KTKITIDSDWDKINPLNNIDNLNYHKNKGFHTNILVKNQTGLKELYKLVTKSHTTNFYSS
PKIFKSDLIEVKKNNNLLFGSSCVNSEIFELARTSTLENLKQAISFYDYIEIQPISVYKN
LLQNDSLDLDQLKKIITNIISIARQENKLIVASSDCHYTNPELKQIREVYINAKGLGGIR
HPLFDFNNKVKDYPDQYLRTTNEMLEEFSWLEDENLIYEIVVINSNKINEMIDVNVIPIK
DGLFTPKIANVNEKLRDKCYQTAKQMYGENLPNIVEQRLEKELGSITKHGFAIVYWISHL
LVKQSYDDGYLVGSRGSVGSSFVATMAQITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFDTDPTYKCGYD
LPTKKCPNCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQNQAHNFTKKMFGENN
VFRAGTISTVAEKTAFGYVKTYFEETKRDASLPRKTEINRLAKLAQGVKRTTGQHPGGII
ILPNEYEIEDFTPVNYPADDLSSTWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHDDPTALRMLRDLT
NIDPITIPTDDKNVYSLFSSLQALNLTSDKINDEITGAIGIPEFGTGFVRNMLKETKPKT
FADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKDNKANISTVIGCRDDIMVYLINMGLESSLAFMIM
ESVRKGKGLKKEWIDIMKKHNIPDWYIDSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAWYKIYYP
TEYYATYLSTKADVFDLKTALGGYEAVLLKLKSQQQKVKNGEKLSKKEEDLEVVYEVLLE
MFARNIKFSNIDFEKSEATKFKVDILEDNTKIIIPPFNVIDSLGEAVALSIINARNTKPI
TSVNDLKNRTQTTQTQIKIFEEFNILDSLSVDEQLTFDF
NT seq
4440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaacaaaaatactaaatatctttaaaaaattagatatcaaattaagtgaagctgat
tatatctattttaaagatgctattttagtagaaactcctagaatttctaaaattaaaaac
aaaggttatttgcatattcaaattaaagactttttaccaatagaagttttaaaacaaatt
gataacaaactaaaaaataataattattttaattttaaattaatacttgatgtagaaaat
caacatattaataaacaactaattagtcaatatttagaatttattaaaatgtataaatct
ttatttaataatcgaatttcttgaaaattattagatatttataattttgacttagaaaat
aatcaattaatttttacagtaagtagtcaaacaactaaaaatgatattagtcaagaatta
gattattgtttagctaaattaaatcaatttgggtttaaaaatcttagttatttaataaat
gttaaagaaattagtttagatgttttagatcaacaagaacaaaaaaatagtacaagcata
gaacaacaaacagtaattaagcaagttgaaaaagaaccaagtttacctactagttataaa
aataaaagaactaatttagataaacctagttatcagtcattattagatgttgaagatgat
gcacaaaacattgtaattcaaggtgttgtgattaataaagagtttaaattatcaaaaaca
ggtagaaagattttttatatagatataactgattatcaatcttcaattagatgtatgtat
tttgcaaaaagtgatgcattatgtgaatttgatgatttaactgatgaacaattaaattct
aaaaatgttgaagaaattaaagaaagtaaaataaaaataaatgattgaattagtgttaaa
ggaaaaactagtttatctttatatgatcaagaacaaattttttatattgatgattttaaa
aagattaataaacaaattataagtagaactgatgatgctaaaactaagcgtgttgaatta
catgctcatactaaaatgagtgtaatggatggagttagtgatccaactgattatttagaa
ctaattagtagttgaaatcataaagcaattgcttttacagatcatactaatgtacaagct
tttccagatatttataaagctttaaattcagttaacaaaaaacgtattgatcaagagaaa
attaaagctatttatggtttagaaatcaatatgttaaataacgatttatgatatgttaaa
aatcctaaaaatcaaaatttaaaagatgctaaaatggtcttttttgacttagaaactact
gggttaagccctgaattagatgaaattattgaatttggagctattgaatataactttaaa
actggtgaaagaaaaaaaatagatattttaattaaaccaaaatctaaactaaaagatttt
actaaaaagctaactaatataaatgaagaaatgttagaaaataaaccaggaattgaagtt
gcttttaaacagattaatcaagtaataaaagatgctattttagtagctcataatgctaat
tttgactatacttttttatcacattgatctgaaaaactaggttatggaaaattagaaaac
actattattgatactttaacaatttcaagaattatttatcctgaattaaaatcacacaga
ttaggttcactagcaaaaagagtaaatatttcatatgacccaagcattgctcaccgtggt
gattatgatgctgatatattagctgatatttatgaaagaatgttagatgaaactagaaaa
aaaactaaaatcacaatcgatagtgattgagataaaataaatcctttaaataatattgat
aatttgaactatcataaaaataaaggttttcatacaaacattttagttaaaaaccaaaca
ggattaaaagagttatataaattagtaacaaaatcacatactactaatttttattcgtct
ccaaaaatttttaaaagtgatttaatcgaggttaaaaaaaataataatttattatttggt
tcaagttgtgttaatagtgaaatttttgaactagctagaactagtacacttgaaaattta
aaacaagcaattagtttttatgattatattgaaattcaaccaattagtgtttataaaaat
ttattgcaaaatgattcactagatttagatcaactaaaaaaaataattacaaatattatt
agtatagcaagacaagaaaataaactaattgtagcaagtagtgattgtcattatacaaat
cctgaactaaaacaaattagagaagtttatattaatgctaaaggacttggtggaattaga
catccattatttgattttaataataaagttaaagattatcctgatcaatatttaagaaca
actaatgaaatgttagaagaatttagttgattagaagatgaaaatttaatttatgaaata
gttgttattaattctaataagattaatgaaatgattgatgtcaatgtcattcctattaaa
gatggattatttactccaaaaattgctaatgttaatgaaaaattaagagataaatgttat
caaacagcaaagcaaatgtatggagaaaatttacctaatattgttgaacaaagactagaa
aaagaattaggctcaattacaaaacatggatttgccattgtttattgaatttctcattta
ttagtaaaacaatcatatgatgatggatacttggtaggatcacgtggttcagttggttca
tcatttgtagcaactatggctcaaattacagaagttaatcctttaaaagctcattataga
tgcctaaattgtaaatactcagattttgatactgatccaacttataaatgtggatatgat
ttacctacaaaaaaatgccctaattgtaatgaaaaactaattggagatggtcatgatatt
ccgtttgaaacttttttaggttttgatggtgataaagttccagatattgatttaaacttt
tctggagaatatcaaaaccaagctcataattttactaaaaagatgtttggtgaaaataat
gtttttagagctggaacaatctcaacagttgctgaaaaaactgcttttggttatgtaaaa
acttattttgaagaaactaaaagagatgcaagtttgccaagaaaaactgaaattaataga
ttagcaaaactagctcaaggagtaaaaagaacaactggtcaacatccaggtggaattatt
attttaccaaatgagtatgaaattgaagattttactccagttaattatccagctgatgat
ttaagttcaacttgaaaaacaactcattttgatttccattcaattcatgacaatttatta
aaaatggatattctaggccatgatgatccaaccgctttaagaatgttaagagatttgaca
aatattgatccaattactattccaacagatgataaaaatgtttattcattattttcatct
ttacaagctttaaacttaacttcagataaaattaatgatgaaatcactggagctattgga
atacctgaatttggaactggttttgttagaaatatgctaaaagaaacaaaaccaaaaact
tttgctgatctagtacaaatttctggtctttcacatggtactgatgtttggttaggtaat
gctagagatttaattaaagataataaagctaatatttctacagttattggatgtagagat
gatattatggtttatttaataaatatgggattagaaagttctttagcttttatgattatg
gaatcagttagaaaaggtaaaggattaaaaaaagaatgaatcgatattatgaaaaaacat
aatattccagattgatatattgattcatgtttaaagattaaatatatgtttccaaaagcg
catgccactgcttatgtgttaatggcttatagaattgcttgatataaaatttattatcca
actgaatattatgcaacttatttatctacaaaagctgatgtttttgatttaaaaacagct
cttggtggatatgaagcagttttattaaaattaaaatctcagcaacaaaaagtaaaaaat
ggagaaaaattatcaaaaaaagaagaagatttagaagttgtatatgaagttttattagaa
atgtttgctagaaatattaaatttagtaatattgattttgaaaaatctgaagctactaaa
tttaaagtagatattttagaagataatactaaaattattattccgccatttaatgtgatt
gattcactaggagaagcagtggcactttctataattaatgctagaaatacaaaaccaatt
acttcagttaatgatttaaaaaacagaacacaaactacacaaactcaaattaaaattttt
gaagaatttaatattttagactcattatcagttgatgaacaattaacttttgatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
