Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181: MCCPILRI181_00592
Help
Entry
MCCPILRI181_00592 CDS
T03704
Symbol
cshB
Name
(GenBank) DEAD-box ATP-dependent RNA helicase CshB
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
mcar
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcar03019
]
MCCPILRI181_00592 (cshB)
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mcar03009
]
MCCPILRI181_00592 (cshB)
Enzymes [BR:
mcar01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
MCCPILRI181_00592 (cshB)
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcar03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
MCCPILRI181_00592 (cshB)
Ribosome biogenesis [BR:
mcar03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
MCCPILRI181_00592 (cshB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
PhoH
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEA10952
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(616924..618285)
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MKFTDFGFKKYINDTLDQIEFIAPTSIQQKAIPLLKKHQNVIALAHTGTGKTHSFLLPIL
NNLKLEENNNYVQAVIISPTRELGLQIYQNTKLFLKNNPLINCNLFIGGEDISKNIEQLE
KKQPHIVIGTPTRLKELYDLNKLRLTTTSYFIIDECDIIFDLGFIEDVDYLISKINQNVT
IGIFSATISQQLSAFCKKYIKNAHFIDDSQNKISTSNVKHILIDTKNKELEQSLIQIINS
INPFLCIIFVNQKDEISKIVEILHKNNIKQVAELHGNLQPRLRLSMLKKIQNNEFKYLVA
TDVASRGVDIKGVSHIISINLPSDLTYYIHRSGRTGRNNSTGYSYIIYNLKNKTQIEELI
KKEIEFETKKLIDNQLVDIKTNYKKVKVFKELDAESKQVINKYKNKKVKPNYKKKRKQEL
DKIKQKIRRKHIKENIEKIKKAKYQKRRSELFD
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttactgattttggttttaaaaagtatattaatgatactttagatcaaattgaa
tttatagctcctacttcaattcaacaaaaagcaattcctttattaaaaaaacatcaaaat
gttattgctttagcacatactggaacaggtaaaactcatagttttttattacctatttta
aataacttaaaattagaagaaaataataattacgttcaagcagtaattattagtccaact
agagaacttggtttacaaatttatcaaaacactaaactatttttaaaaaataatccttta
attaattgtaatttatttattggtggagaagatattagtaaaaatattgagcaactagaa
aaaaaacaaccacatattgtaattggaacaccaactagattaaaagaactttatgattta
aataaactaagactaacaactacaagttattttattattgatgaatgtgatataattttt
gatctgggtttcattgaagatgttgattatttaatttctaaaattaatcaaaatgttaca
attggaatatttagcgcaactatttctcaacaacttagtgcattttgtaaaaaatatatt
aaaaatgctcattttattgatgatagtcaaaataaaatttcaacaagtaatgttaaacat
attttaattgatactaaaaacaaagaactagagcaaagtttaatacaaattattaattca
attaatccttttttatgtattatttttgttaaccaaaaagatgaaattagtaaaatagtt
gaaattttacataaaaataatattaaacaagttgctgaattacatggtaatctacaacca
agattaagattatcaatgttaaaaaaaattcaaaataatgagtttaaatatttagttgca
actgatgttgcttctagaggtgttgatattaaaggtgtaagtcacattatttcaattaat
ttaccaagtgatttaacttattatatacatagatctggaagaactggaagaaataattca
actggatatagttatataatttataatttaaaaaataaaactcaaattgaagaactaatt
aaaaaagagattgaatttgaaactaaaaaacttattgataaccaattagttgacataaaa
actaattataaaaaagttaaagtttttaaagagttagatgctgaatcaaaacaagttata
aataaatataaaaataaaaaagtaaaaccaaattataagaaaaaaagaaaacaagagctt
gataaaattaaacaaaaaataagacgtaaacatattaaagaaaatattgaaaaaattaaa
aaggcaaaatatcaaaaaagaagatcagagctatttgattag
DBGET
integrated database retrieval system
