Mycoplasmopsis caviae: NPA07_00110
Help
Entry
NPA07_00110 CDS
T08517
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mcav
Mycoplasmopsis caviae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transglut_core
Choline_bind_1
PH_10
DUF4073
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UUD35273
LinkDB
All DBs
Position
complement(31570..33825)
Genome browser
AA seq
751 aa
AA seq
DB search
MKKKRLLIGFSFGLALPTFVSSSCGTQVKNLPNDPNNPNTSVPSTPLTPAKVYPKPHTLK
PATPVKKDQPAPDQGKPWVSLIPSKPYNPNPPISKPNITINPLNKEKLPNWIDPNLTTAQ
LKDKLLYFKHNYGFVDTNKRLNAEKISLRKGKEFQIKLGNQNLNESDTEVFVKHDGNVYT
LDEYNALASKLLTVSKTGLIKCNENCSFNNSEDYIDGIWIKEKSTNNYFSLSVNVLNTED
AETDEMVEKGDEAFKRIANYFTSIEDRVERILAINNFVMNALKYNMKRVGRKNQDYFGIN
ELIATCEGYSRMVQRIASYSGFEDIELQEDWLKPKSDRHAWNKVKIDGHWYYLDTTWNDD
ENKKVYRGKNEMTTFLLKGQLMSKSRFGVQDTADEAKEYRHYPFEKDGLMVNEFNDLHKV
MKMQIISGCRSKDNKYSIGLVYPVSLMQSIDQELGNGLRLREGAAEHGYFYRHTMRSINL
LKQKFTDLDFDKNEEIKILSAKLINENKVEFTFDKKVDGFIKECFKLTFKDATGVELRYG
DVDKFETSGEGKKVTLSLKNTINLSHIQNAKINFEINRLGYTFTFVNNKNEIDFSSSYKN
HTPAQYIIESGRRVKFENTTNIIKYAFIDWKINKSVKWNNYVPGTSFDVGPLNEYLLVQS
IDPTSGKVFSIQRFAITRFSSFLEPQLSADKKYITNVSNIMEYNIEGTHEWHPVTNGYIK
VEYPGQKYKIRYKSSNEYKLYSSDIKELDTK
NT seq
2256 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagaagagattacttattggattttcatttggtttagcactgccaacctttgtt
agttcatcttgtggtactcaggttaaaaatttacctaatgacccaaataatccaaataca
tcagtgccatcaactccactaacaccagcaaaagtgtatccaaaacctcatacgctaaaa
cctgcgacacctgttaaaaaagatcaacctgcacctgaccaaggtaaaccgtgagtttcc
cttataccatctaaaccatataatcccaatccaccaattagtaagccaaatattactata
aatcctttgaataaggaaaaattaccaaactgaattgacccaaatttgaccactgcacaa
ttaaaggacaagttattatactttaaacacaattacggttttgttgatacaaacaaaaga
ttaaacgcagaaaaaatttctttaagaaaaggtaaggaatttcaaattaaattaggtaac
caaaatcttaatgaaagtgataccgaggtttttgtaaaacatgatggaaatgtttataca
ttagatgagtataatgctttggcttcaaaattgctaacagtttcaaaaacaggtttaata
aaatgtaatgaaaattgttctttcaataattcagaagattatattgatggtatttgaata
aaggaaaaatctacaaacaattacttttctcttagtgtaaatgtattaaacacagaagat
gctgaaactgatgaaatggttgaaaaaggtgacgaagcatttaaacgtattgctaattac
ttcacaagcatcgaagacagagttgaaagaattctggcaattaataactttgtaatgaac
gccttaaaatataacatgaagagagttggtcgaaaaaatcaagattactttggtattaat
gaattaattgccacttgcgaaggctactcaagaatggttcaaagaattgcaagttattca
ggctttgaagatattgaattacaagaagattgattaaaacctaaatcagacagacacgct
tgaaacaaagtaaaaattgatggtcattgatattatttagatacaacatgaaatgatgat
gaaaacaagaaagtttatagaggcaaaaatgaaatgacaactttcttgcttaaaggtcaa
ttgatgagtaaatcgcgttttggtgttcaagacacagcagatgaagctaaggaatataga
cactatccttttgaaaaagatggtttaatggttaatgaatttaatgacttacataaagta
atgaagatgcaaattatatctgggtgtagaagcaaggataataaatattcaattggctta
gtatatcctgtttcattgatgcaaagtatcgaccaggagcttggtaatggacttaggttg
cgtgaaggtgctgctgaacatggttatttttatagacatacaatgagatcaataaacttg
cttaagcaaaaattcactgatttagattttgacaagaatgaagaaattaaaattcttagt
gctaaattaattaatgaaaacaaagttgaatttacctttgataaaaaagttgatggcttt
attaaggaatgtttcaaactaactttcaaagatgcaacaggtgttgaattacgctatggc
gatgtagataaatttgaaacttctggtgaaggcaaaaaggttaccttaagtctaaaaaac
acaattaacctaagccatattcaaaacgcaaaaattaattttgaaattaatcgtctaggt
tacactttcacttttgtaaacaataagaatgaaatagatttctcaagtagttataaaaac
cacactcctgctcaatatattattgaaagtggtcgccgtgttaaatttgaaaatactact
aacataataaaatacgcatttattgattgaaaaataaataagagcgtaaaatgaaataat
tatgtccctggtacaagttttgatgttggtccacttaatgaatacttacttgttcaaagt
atagatcctacaagtggcaaggtttttagtattcaacgttttgctattacaaggtttagt
tcatttttagaaccacaactatcggctgataaaaaatatataactaatgtaagcaacata
atggaatataacattgaaggtacgcacgaatgacatcctgtaactaatggttatattaaa
gttgaatatccaggtcaaaaatataaaattcgatacaagtcaagcaatgaatataaactt
tatagttcagatataaaggaactcgacaccaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
