Mycoplasmopsis caviae: NPA07_05550 Help Entry NPA07_05550       CDS       T08517                                  Name (GenBank) ribonuclease J   KO K12574   ribonuclease J [EC:3.1.-.-] Organism mcav  Mycoplasmopsis caviae Pathway mcav03018   RNA degradation Brite KEGG Orthology (KO) [BR:mcav00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    03018 RNA degradation     NPA07_05550  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mcav03019]     NPA07_05550 Messenger RNA biogenesis [BR:mcav03019]  Prokaryotic type   Bacterial mRNA degradation factors    RNA degradosome components     Ribonucreases      NPA07_05550 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B Anti-Pycsar_Apyc1 Lactamase_B_2 RMMBL Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  UUD35238 UniProt:  A0A3P8K9B5 LinkDB All DBs Position 1126003..1127844 Genome browser AA seq 613 aa AA seqDB search MNPTRLIPIGGVQEIGKASLIIEYENQIFIIDAGIKFADTAITGIKGIIPDYTYLAQKYK NIEGLFITHGHEDHIGGVIYLMKQVAVKKIFAPRIAIQYLKLKFDENKLKNKVEFIEIEK NAVHQFGECFVDFWTAQHSIPDAFGIRVKTPNGSVMCTGDFRFDYNPIGETYTDFAKLDQ MGKEGLTVLLSDSTNAMRPFHSPSENDILTDIEKYMRQATRKTIITAFASNLTRVTAIIE LAVKLGKKVATFGRSMVQGIKIGRKLGCIKAPASVFVDKKEIAKVPEKDLVILTTGSQGE QLAALSRMSYGKHQSVKVEKGDLIIFSSSPIPGNRMVIELLVNRLSKLGAIIKENGVDGY LHTSGHAYKHEHDKIFQLTKPKYFLPYHGEFRMSIVHGQSAVRNGVKEENVMIPEIGRVY NMLNEVITPSDEKINCGPIYIDGHTTLNLSANILKERAKLADSGFVNIVMNINKKNNSII GRPSLVSRGSFYVKTSLELVEEAKRIAHGAALFYIKNTPNWNVVDLKQLIVERLENLFYK EKRRRPVIVPTVLFSDDENEPAFAKSKIKFNDKNAKDEEKSKKASATLKEVKSEIFGENV EITEDIHDDEDEE NT seq 1842 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaatcctactagattaattcctattggtggagttcaagaaattggtaaagcttcatta ataattgaatatgaaaatcaaatttttattattgatgcaggaattaaatttgctgataca gctataacaggtattaaaggaattattcccgattacacttatttagctcaaaaatataag aatattgagggactttttattacccacggacacgaggatcatattggtggtgtaatttac ttaatgaagcaagtggctgttaaaaagatttttgcccctcgtatagcaattcaatatctt aaattaaaatttgatgaaaataaacttaagaataaggttgaatttattgaaattgaaaaa aatgcagttcatcaatttggtgaatgttttgttgatttttgaactgcgcaacactcaatt ccagatgcctttggtatcagagttaagacacctaatggttcagtaatgtgtactggtgac tttagatttgattacaatccaatcggtgaaacctatacagattttgccaaattagatcaa atgggtaaagaaggcttaacagttcttttatcggattcaacaaatgcaatgcgtcctttt cactcaccgagtgaaaatgatatcttaacagatattgaaaaatacatgcgtcaagcaaca agaaaaacaataattactgcttttgcttcaaacctaacaagagtaactgctattattgaa cttgctgttaaattaggcaaaaaagtcgcaacttttggtcgttcaatggttcaaggaatc aaaattggtcgcaaattgggttgtattaaagcgcctgcaagtgtttttgtagataaaaag gaaattgcaaaagttcctgaaaaagaccttgttatattaactacaggatctcaaggcgaa caacttgctgctttatcaagaatgtcatatggtaagcaccaaagtgttaaagttgaaaag ggtgacttaattattttttcttcaagtccaattccaggaaatagaatggttatagaactt ttggttaatagactttcaaaattaggtgctattatcaaagaaaatggtgttgatggttac ttacatacttctggccacgcttataaacatgaacatgacaaaatttttcaacttacaaag cctaaatactttttaccataccatggtgaatttagaatgagcattgtacatggtcaaagc gcagttagaaatggcgttaaagaagaaaatgtaatgatacctgaaattggtagagtttac aatatgcttaatgaagttataacaccaagtgatgagaaaataaattgtgggcctatttat attgatggtcatacaaccttaaatttaagtgcaaatattcttaaagaaagagcaaaatta gctgatagtggttttgtcaatatagttatgaatattaacaaaaaaaataactcaataata ggacggccaagtttagtaagtcgtggaagtttttatgtaaaaacttcacttgaattagtt gaagaggctaaaagaatagctcatggggctgctttattctatattaagaatactccaaat tgaaatgttgtggatcttaaacaattaattgttgaacgccttgaaaacttgttctataaa gaaaaaagaagaagacctgtaattgttccaacagttctctttagtgatgatgaaaatgaa ccagcttttgcaaaaagtaaaataaaatttaatgataaaaatgcaaaagatgaagaaaaa tctaaaaaagcatctgcaactcttaaagaagttaagagcgaaatttttggtgaaaacgtt gaaattaccgaagatattcatgatgacgaagatgaggaataa

DBGET integrated database retrieval system