Momordica charantia (bitter melon): 111022020
Help
Entry
111022020 CDS
T05045
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
mcha
Momordica charantia (bitter melon)
Pathway
mcha03015
mRNA surveillance pathway
mcha03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcha00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
111022020
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111022020
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
mcha03041
]
111022020
Spliceosome [BR:
mcha03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
111022020
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111022020
NCBI-ProteinID:
XP_022154866
UniProt:
A0A6J1DQ02
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
483 aa
AA seq
DB search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NT seq
1452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggcatgtacgatcaagggggagacgctgctccttcgtcttacggagcccctgga
ggcggcggtggatatggcggcggtggcggagggtatggaggtggcggtgggaagggcggt
gacggtggatatggtggtgggggccgaggtggcggcggcggtagaggctatggaggacga
ggtggcggtggaggctacggcggtcgaggaggcggcggtggtggttatcaaggaggagat
cgcggtggtggtggtggtggtggtggtggttatcaaggaggagatcgtggtgggcgaggt
ggtggacgtggtggcgggggtggtcgtggtggaagcggcagagatggcgattgggtctgc
cctaatcctggctgtgcgaatttgaactttgctagaagagtggagtgtaacaaatgtggg
gcaccatcaccaggaggtactaatgaccgaagtggcggtggtggttataatagaggtgga
gctgatgggggttatggtggtaatcgtaatggcaggggtggtaacttccatggtggtaga
agtggaactcatgatggaggtcgaaatgaaggagggaacagaggtggtggttcttacggt
ggtcaccagggaggagaagatagtgggtatagtcaggttcccccatcatcagcaccccaa
tctggtggtgttggtggctcttatccaccatcttactctggtggaagtgcagattatggg
actgatgcagttcctccacctgcgagctacggtggaactacataccctccaacttatggt
ggacccaccggtggctatggtggtgatagtataggtgatgggcggacttctgctggtcgc
ggtgggccgtctggtggatatgatggtggctacaatgcaggtggtagaggtggctataac
gctggtggtagagtagggagctataatgctggtggtagaggtggtggttttggaagtaca
ccagtggagtcagcacaggtgaagcagtgcgatgacaattgtgatgatacatgtgataac
tctagaatctatgtttctaatttgccaccagatgtgaccattgatgaattgagagaacta
tttggcggcattggtcaaattggaagaatcaagcagaagaggggctacaaggatcagtgg
ccttggaacataaaaatatatactgatgagatgggaaataacaaaggcgatgcatgtgta
tcatatgaagatccttcagcagcgcattctgctggcggtttctataacaatcatgatttg
agaggttttaaaatcagtgttgcaatggctgagaagtctgcaccgagggctccacctaca
ttcaaccatggaggtggtggtagaggaggtggatatggaggtggtggagacaggcgtaga
gatagctatagggacggaggctctggacccgatagacatcagcatggtggaaatcgatct
cgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
