KEGG   Mesoplasma chauliocola: CK556_01360
Entry
CK556_01360       CDS       T05062                                 
Name
(GenBank) HD domain-containing protein
  KO
K03698  3'-5' exoribonuclease [EC:3.1.-.-]
Organism
mchc  Mesoplasma chauliocola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mchc00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mchc03019]
    CK556_01360
Messenger RNA biogenesis [BR:mchc03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     CK556_01360
SSDB
Motif
Pfam: HD tRNA_anti-codon OB_Ssb-like TraI_2 L544_NTransf
Other DBs
NCBI-ProteinID: ASZ09003
UniProt: A0A249SN07
LinkDB
Position
290864..291844
AA seq 326 aa
MKKINELNNSIPAADLVVRLEKIIVSTATNGSSYLILNLSDKTGRIEARKWTVTEEDKQL
LQPNAFVLFKNAAINEFRGVLQLKVNDYTIVSETELASYGLKSSDFFIEAPINIEKNYAE
LMTILEGLTNETYSKLTIGLIKKYEQEFLTYPAAMTIHHNVKGGLFWHSFTLVKNAMALR
PSYSYASIDWELLICGAILHDIGKVIEIVDLTGTDYSLQGKVIGHISIGNTELNKIAEEL
NLYKDENGNINESLTLLQHMIIASHGKKEYGSPTEPVIIEAIMLSMFDDLDAKVFKINDE
LNKVEHKTWTPRIISVDGKMFYKHKK
NT seq 981 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaaataaatgaattaaataattccataccagcagctgatttagttgttaggtta
gaaaaaataattgtttctacagcaactaatggttcatcttatttgattttaaatttatca
gataaaactggtagaattgaagcaagaaaatgaacagtaacagaagaagataaacaatta
ttacaaccaaacgcttttgttttgtttaagaatgcagctataaatgaatttaggggtgta
ttacaacttaaagttaatgactatactattgtaagtgaaacagaattagcttcttatgga
ttaaaatcaagtgacttctttattgaagcaccaattaacattgagaagaactatgctgaa
ttaatgacaatcttagaaggtttaacaaatgagacatacagcaaattaacaattggttta
attaagaaatatgaacaagaatttttaacatatccagcagctatgactattcatcataat
gttaaaggtggattattctgacatagttttacactagtgaaaaatgcaatggcactaaga
ccaagttattcatatgcttcaattgattgagaacttttaatttgtggagctattcttcac
gatataggaaaagtaattgaaattgttgatctaactggaacagattatagtttacaaggc
aaagtaattggtcacattagtattggtaatactgaattaaataaaattgcagaagaatta
aatttatataaagatgaaaatggaaatataaatgaaagcttaacattattacaacatatg
attattgcaagtcatggtaaaaaagaatatggttcaccaacagaaccagttattattgaa
gctattatgttatcaatgtttgatgatttagatgcaaaggtatttaaaataaatgacgag
ttaaataaagttgaacataaaacatgaacacctagaattattagtgttgatggaaaaatg
ttttataaacacaaaaaataa

DBGET integrated database retrieval system