Mesoplasma chauliocola: CK556_01570
Help
Entry
CK556_01570 CDS
T05062
Name
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mchc
Mesoplasma chauliocola
Pathway
mchc03030
DNA replication
mchc03430
Mismatch repair
mchc03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mchc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
CK556_01570
03430 Mismatch repair
CK556_01570
03440 Homologous recombination
CK556_01570
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mchc03032
]
CK556_01570
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mchc03400
]
CK556_01570
Enzymes [BR:
mchc01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
CK556_01570
DNA replication proteins [BR:
mchc03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
CK556_01570
DNA repair and recombination proteins [BR:
mchc03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
CK556_01570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
PHP
DNA_pol3_finger
DNA_pol3_a_NII
HHH_6
DNA_pol3_a_NI
RNase_H_2
tRNA_anti-codon
Rv2179c-like
DEDDh_C
Pox_D5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASZ09044
UniProt:
A0A249SMY1
LinkDB
All DBs
Position
347762..352243
Genome browser
AA seq
1493 aa
AA seq
DB search
MLDQNILSLFQNLNIKLNEGELSFFEDATIEKKTLSSTKSKFKLYLKIKNFLPTRILHEI
HHKCVNASGIKIKLILNVQQQRIDKEILCEYIEFIKNNKAQNKTVIWNFIHSEDFEFDTD
ENLIKFVVDSKELKNQLVKELEYCLAKLNQFGFKELNYIIDVEDKTEEYIKQSLIIEQQT
KEQYKQFAPEQNDKSQGMFISKQNSQKWNTSLDKPSYASFEDIEEDAQNIVLHGKVLSIE
IRDSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGREDERTIMDPLTEEELSSDRVIEIKEKRVAK
GDWIAVKGKTSYSQYDKEQNFIIDKIAKISRSESMVKDEAEQKRVELHVHTKMSAMDGVS
TIQDYLHTADKWNWRAIAITDHINVQAFPDAYNELKKINKNKADDEKLKLIYGLEMNMIQ
KEDYWIVKNPKGQKIRDSKMVVFDLETTGLSPEMNEIIEFGAVVFDPITGKTTKHDYLFK
PKQPLKQFTMDLTNINEEMLVDKKNIEEDFDKIYELIKDSILIAHNANFDFNFLNNLSKK
LGYGELQNTVIDTLTLSRLVRPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFF
KIIAELKMSTPIVFDHDLMKLIPENDKENTNLLRSRGLHVNVLAKNQQGLKDIFKLVSIS
HTENFFNSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFEIARLNTNNKLEEIIQLYDYVEI
QPLSVYKNLITDNQMEEHELIEVIQKIIKTAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYIN
AKGLGGSRHPLFSFKNKNKSVDYPDQFMRTTNEMIKEMNWLNDANLVQEMVITNTNKIAD
MIENDIVVIKDGLFTPNIDNVDTLLKNKCYETAHDMYGEVLPEIVEARLEKELNSIIKHG
FAVVYWISHLLVEKSNKDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCAKCKYSDFE
TPVEIKCGYDLPQKDCPKCNSPLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHN
FTKEMFGEGNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKAFYEETGILEEEMPRKIEIERQAKLVEGVK
RTTGQHPGGIIILPKEFEIEDFSPVNYPADDASSSWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVD
PTALRMLGDLTGVDPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFV
RGMLKETKPKSFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKNDIANISTVIGCRDDIMVYLMGQ
GIDATTSFKIMESVRKGQGVRKEWKEIMLAHNVPEWYIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMA
YRIAWYKIYYPAEYYATFLTNRADAFDLRTFLGGYNGVKEKLTELETRRNKKDKMTTKEL
ALMPVLEIGLEMFSRGIKMANLNFEKSLASKYIIEKDPTTGEATLYPPFLVIDSLGDAVA
DSIIKARSERPLTSVKDLTSRTTITQTQLKIFEELNILDTLAQDEQLEFDFFN
NT seq
4482 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttggatcaaaatattttgagtttatttcaaaatttaaatattaaattaaatgaaggg
gaactttcattttttgaagatgcgacaattgagaagaaaactttaagttcaacaaaatca
aaatttaaattatatttaaaaattaagaattttttaccaacaagaatattgcatgaaatt
catcataaatgtgtaaatgcttcgggaattaaaataaaattaattttaaatgttcaacaa
caaagaattgataaagaaattctttgtgaatatatagaatttattaaaaataataaagct
caaaataaaacagttatttgaaactttatacattcagaagattttgaatttgatactgat
gaaaatttaattaagtttgttgttgattcaaaagaacttaaaaatcaattagtaaaagaa
ttagaatattgcttagcaaaattaaatcaatttggttttaaagaattaaactatataata
gatgttgaagataaaactgaagaatatataaaacaatcattaattattgaacaacaaacc
aaagaacaatataaacaatttgcacctgagcaaaatgataaaagtcaaggaatgtttatt
tcaaagcaaaattcacagaaatgaaatacttcattagataaaccaagttatgcttcattt
gaagatatagaagaagatgcacaaaacatagtattgcatggaaaagtattaagtattgaa
ataagagattctaaagctaataatcgtaaaatatactcaattggattaacagataataac
tcatcaattaaatgcatatactttggtagagaagatgaaagaactattatggatccatta
actgaagaagaattatcttcagatagagttattgaaattaaagaaaaaagagttgctaag
ggtgattgaatagcagttaaaggtaagacgtcttattcacaatatgacaaagagcaaaat
tttatcattgataaaattgctaaaatttcacgttctgaatcaatggtaaaagatgaagca
gaacaaaaacgtgttgaattacatgttcatacaaaaatgagtgctatggatggagtttct
acaattcaagactatttacatactgctgataaatgaaattgaagagcaatagctattaca
gatcatattaatgtacaagctttcccagatgcttataatgaacttaaaaaaattaataaa
aataaagcagatgatgaaaagctaaaactaatttatggtttagaaatgaatatgattcag
aaagaagattactgaattgttaaaaaccctaaaggccaaaaaattagagattctaaaatg
gtagtttttgacttggaaacaactggattatcaccggaaatgaatgaaataattgaattt
ggagcagttgtgtttgatccaattacaggtaaaacaacaaaacatgattatttatttaaa
ccaaagcaaccattaaagcaatttacgatggatttaactaacattaatgaagaaatgtta
gttgacaaaaaaaatatagaagaagattttgataaaatctacgaattaattaaagatagt
attctaatcgctcataatgcaaattttgactttaattttttaaataatttgtctaaaaaa
ctgggttatggagaattacaaaatacagtaattgatacattgactctttcaagattagta
agaccagctttaaaatctcatagacttggggctgtatgtaagaaattcggaattttatat
gatgaacatgtcgctcaccgtggtgattatgacgcagacgtattaaatgatttattcttt
aagattattgcagagttaaaaatgagtactcctattgtgtttgatcatgacttaatgaag
ttaataccagaaaatgataaagaaaatacaaacttgttaagatcacgtggacttcatgta
aatgttttagctaaaaatcaacagggtttaaaagatatatttaaattagtttctatttca
catactgaaaacttttttaactctcctaaaatatttaaagaaaagttaaaagagtttaaa
gaaaaaaataacattttaattggtgctggatgtgttaattcagaggtttttgaaattgct
agattaaatacaaacaataagctagaagaaataattcaattatatgattatgttgaaatt
caacctttaagtgtttataagaatttaattacagataatcaaatggaagaacacgaatta
attgaagtaatccaaaaaattattaaaacagcaaaaaaatataatgttatgttagttgct
acaagtgatgcacactacacaagacctgaattgaaaaaaattagagatgtatacattaat
gctaaaggattaggtggaagtagacacccattatttagttttaaaaataaaaataaatca
gttgattatcctgatcagttcatgcgaacaacaaatgaaatgattaaagagatgaactgg
ttaaacgatgctaatttagtgcaagaaatggttattacaaatacaaataaaattgctgac
atgattgaaaatgatattgttgtaattaaagatggtttgtttacacctaatattgataat
gtagatactttattaaaaaacaaatgttatgaaacagctcatgatatgtatggagaagta
ttgcctgaaattgttgaagctagattagaaaaagaattaaattcaattatcaaacatggt
tttgctgttgtttattgaatttcacatttattggttgaaaaatctaacaaagatggttat
ttggtaggttcaaggggaagtgttggttcaagctttgttgcaactgcatcaaaaatcact
gaggttaaccctttaaaagcacattatagatgtgcaaaatgtaaatattcagattttgaa
acaccagttgaaattaaatgtggatatgatttaccacaaaaagattgcccaaaatgtaat
tcaccattaattggtgatggacatgatattccatttgaaacattcttaggatttgatgga
gataaagttccagatattgatttaaacttttctggagaatatcaaccaattgcacataac
tttacaaaagaaatgtttggtgaaggcaacgtattcagagctggaacaatatcaactgtg
gctgaaaaaactgcctttggttatgtaaaagcattttatgaagaaacaggtattttagaa
gaagaaatgccaagaaaaattgaaattgaaagacaagcaaaattggttgaaggggtaaaa
agaacaacaggccaacaccctgggggaattataatcttaccaaaagagtttgaaatagaa
gatttcagtccagttaactatccagctgatgatgcttctagttcatgaaaaactacacac
tttgatttccactcaattcatgataatttattgaaaatggatattctaggacacgttgat
ccaactgctttaagaatgcttggagatttaacaggagttgatccaattaatattccaaca
aatgatcctaaagtatattctttatttagtaatctatctgctttaaatattaaaccagaa
caaattaatggagaaacaacaggagctattggattacctgaatttgggacaggatttgtt
agaggaatgttaaaagaaactaaacctaaatcatttgctgacttagtacaaatttctggt
ttatctcatggaactgatgtttgattaggtaatgctagagatttaattaaaaacgatata
gcaaacatttcaactgttataggatgtcgtgatgatattatggtttatttaatgggccaa
ggaattgatgcaacaacttcatttaaaattatggaatctgtacgtaaaggacagggagta
agaaaagaatgaaaagaaattatgttagcacataatgtacctgaatgatatattgaatct
tgtttaaaaattaaatatatgttccctaaagcgcatgctactgcttatgttttaatggca
tacagaattgcttgatataaaatatattatcctgctgaatattatgcgactttcttaact
aaccgagctgatgcatttgatctaagaactttcttaggcggttataatggagttaaagaa
aagctaacagaattagaaactagaagaaataaaaaagataaaatgactactaaagagcta
gcattaatgcctgttttagaaattggattagaaatgtttagtcgtggaattaaaatggct
aatttaaactttgaaaaatcactagcttctaaatatattattgaaaaagatccaacaact
ggagaagctacactatatcctccattcttagtaattgattcacttggagatgctgtggct
gattcaattattaaagcaagaagtgaacgaccattaacaagtgttaaagatttaactagt
cgtactacaataactcaaacacaattgaagatatttgaagagttaaatatcttagataca
ttagcacaagatgaacaattagaatttgacttttttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system