Mesoplasma chauliocola: CK556_03210 Help Entry CK556_03210       CDS       T05062                                  Name (GenBank) ribonuclease J   KO K12574   ribonuclease J [EC:3.1.-.-] Organism mchc  Mesoplasma chauliocola Pathway mchc03018   RNA degradation Brite KEGG Orthology (KO) [BR:mchc00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    03018 RNA degradation     CK556_03210  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mchc03019]     CK556_03210 Messenger RNA biogenesis [BR:mchc03019]  Prokaryotic type   Bacterial mRNA degradation factors    RNA degradosome components     Ribonucreases      CK556_03210 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B Lactamase_B_2 RMMBL Shikimate_DH Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ASZ09338 UniProt:  A0A249SNW2 LinkDB All DBs Position 707186..708952 Genome browser AA seq 588 aa AA seqDB search MEKEKNNSSNQIIEKEDFEPFVFKQKEVQRKYIKTDSPTKVFALGGLEEIGKNTYCIEHE NEIIMIDAGVKFPDDSMLGINAVIPDYSYLKENESKIKALFITHGHEDHIGGIHYLVKQV NIPVIYAPELAAALIRDRLKEHKLTDKTIVKEYVADDIWATKNLRVSYAALNHSIPDAFG ILIETPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELSKLASMGDKGIELLMADSTNAEVEGYTPGEK GIIENIDKLFLKAKGRIFITTFASNVHRIQQIVELANKYDKKVVILGRSIERIIKIIRQM GHLKINDKMFIKANDIEKHPANKIMIISTGSQGEPMAALSRIATNRHQSISIIPGDTVIF SSSPIPGNRADVEILINRLTRIGANVIESSPSNKIHTSGHASQEEQKLLFTLLRPNYFMP MHGEFRMLKKHIETAESVNLKSGHGFVMANGDQLELLQGKAQIGKRIDADAIYVDGKDMT AHASNIIRERDILSKDGLISVVVSIDSQTNKLLCAPRIISRGSFYVKDSGNIISEAITIV TEAINEVLNSSKPTFGAIKKAIKQSLSPYIFKTKRRNPLIIPVILNKK NT seq 1767 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggaaaaagaaaaaaataattcttcaaatcaaattattgaaaaagaagattttgaacct tttgtatttaaacaaaaggaagtccaaagaaaatatattaaaactgattctccaactaaa gtttttgctttaggaggactagaagaaattggtaaaaacacatattgtattgagcatgaa aatgaaattattatgattgatgctggagttaagtttcctgatgattcaatgttaggaatt aacgcggttattcctgattattcttacttaaaagaaaatgaatcaaaaattaaagcatta ttcataacacatggtcatgaggatcacattggtgggattcattatttagttaaacaagta aatatacctgttatatatgcgcctgagttagctgctgctttaattagagacagattaaaa gaacataaattaactgataaaacaattgttaaggaatacgtggctgatgatatttgagca acaaaaaacttacgtgtaagttatgcagctttaaaccactcaattcctgatgcttttgga attttaattgaaacgccaaatgggaatattttttcaactggtgattataaatttgactga tcgcctttaggacattttgctgagttaagcaaattagctagcatgggtgataaaggaatt gaacttttgatggctgattcaacaaacgctgaagttgagggctatactcccggtgaaaaa ggaattatagaaaacattgataaattatttttaaaagcaaagggaagaattttcataaca acatttgcatcaaacgtgcaccgtattcaacaaattgttgaattagcaaataaatatgat aaaaaagttgttattttaggaagatctattgaaagaataattaaaataatccgccaaatg ggacacttaaaaatcaatgataaaatgttcattaaagctaatgatattgaaaaacatcca gcaaataaaataatgattatctcaactggtagtcaaggtgaaccaatggctgcactatct agaattgcaactaatagacaccaatcaatttcaattattccaggagatacagttatattc tcttcatcaccaattccaggtaatagagcagatgttgaaattttaattaatagattaact cgtattggagctaatgttattgaatcttctccaagcaacaaaatacatacttcagggcat gctagccaagaagaacaaaaattactatttacattattaaggcctaattattttatgcct atgcatggtgagtttagaatgttaaaaaaacacattgaaactgctgaatcagttaattta aaatcagggcatggttttgtaatggctaacggtgatcaactggaattacttcaaggtaaa gctcaaattggtaaacgtattgatgcagatgctatttatgttgatggtaaagatatgact gctcatgcttcaaatattattagagaacgtgatattttaagtaaagatgggttaatttca gttgttgtttcaattgattctcaaactaataaattattatgtgctccaagaattatttct cgaggaagtttttatgtaaaagattcaggaaacataataagtgaagctatcacaattgtt actgaagcaataaacgaagtattaaattcttcaaaaccaacatttggagcaattaaaaaa gctattaagcaatcattgtctccttacattttcaaaacaaaacgtagaaatccgttaatt attccagttattctaaataaaaaataa

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