KEGG   Mycoplasmopsis citelli: NCTC10181_00169
Entry
NCTC10181_00169   CDS       T07104                                 
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
mcit  Mycoplasmopsis citelli
Pathway
mcit03030  DNA replication
mcit03430  Mismatch repair
mcit03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcit00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    NCTC10181_00169 (dnaE)
   03430 Mismatch repair
    NCTC10181_00169 (dnaE)
   03440 Homologous recombination
    NCTC10181_00169 (dnaE)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mcit03032]
    NCTC10181_00169 (dnaE)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcit03400]
    NCTC10181_00169 (dnaE)
Enzymes [BR:mcit01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     NCTC10181_00169 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:mcit03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     NCTC10181_00169 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcit03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     NCTC10181_00169 (dnaE)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger PHP HHH_6 Luciferase_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: VEU74334
UniProt: A0A449B1A8
LinkDB
Position
1:complement(237183..240125)
AA seq 980 aa
MKHPIILHTNTEYSFLSSTIKVNELFELILEQKSPYLTLTDKENFFALPMFLDFAKEHNL
KLIAGIELTLENQKNVIVYAKNYQGYIFINELILKRSYNETVSLEQLNNENILIINHPEN
GYEIEELENIFDNFYFNSKKQVSDFKTVYAPLKKVLYEQESEILHILNQIAQKKELESIQ
EYGDYFDLTEFEDVDDKVLAQMEAFVNLIEPFSLSSEIKLASFENPKLLLKQKINQDKYT
KLIKRHGKDIVDERIKYELETIEKSNFINYFLVIKDVLDFAREQRIEIGPGRGSSSGSII
AFLLDITNVNPIEYGLLFERFLNVARVSLPDIDLDIQDDRRNELLEYIGKRFGIEKCALI
STFQTLALKSSLRDVARVLKIPLSDVDKVCDSLTKFDTSLDIAYQRNAKYKMLVDKHEKL
HQYARKIEGMPRQSGIHAAGVIISDRPLTDVVPVRHSNAPLNQVEFEMNYLEKYGLIKID
FLGLKNLTVINQIESHIGEPYRFDQVINLNFNPFNDKSTFDLINSLNTDGIFQLESPGMK
GVIKQVQVDTFEDIYAIISLFRPGPKDFIPDYANVKFHKQKVDKIHPIYDQIVAPTHGII
VYQEQIMQIAQQVAKMSFIEADLLRRAISKKNAHDLSTYSEIFYKRGVENNIKMEILKQI
YAQIEKFALYGFNKAHAVAYSFISYKLAFYKARYPEIFYKVIIDNATGDLTSIKNSALHA
SKQNIIVHSPHINHALFKSEIIFKNAQNVKSQLYLPLLIIKGIGPSAIAKISEELQRGGK
IDNFFTGILRLKASGVGDAVIETLIKANVFRDFGNVVELINALPAINNGAEIFKKIYAKS
EEPLETKLQKFISDTGFDQKRIQTFDMDINLEIKLEKELLGSVYNAYPTKKYERDLKLED
LRENQNNFFYVFLESIKKNPKGQVIVKISDSSSAISAFIFEHSAMDLVNYPQSRVILVNL
SLSAKGYYSIKSWEEVSHAE
NT seq 2943 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaacatccaatcattttgcataccaatactgaatattcttttttatcttcaactatt
aaggtaaatgaactttttgagttaattttagaacaaaaaagtccttacttaacattaact
gataaagaaaatttctttgctttaccaatgtttttagattttgctaaagaacataattta
aaattaattgctggaattgaattaactttagaaaatcaaaaaaatgttatagtttatgct
aaaaattatcaaggatacatttttattaatgaactgattttaaagcgttcttataatgaa
actgtatcattggagcaattaaataacgaaaatattttaattattaatcaccctgaaaat
gggtatgaaattgaggaattagaaaatatttttgataatttttattttaattcaaaaaaa
caagtttcagattttaagactgtttatgctccacttaaaaaagttttatatgagcaagaa
agtgaaattttacatattttaaatcaaattgctcaaaaaaaagaacttgaaagcattcag
gaatatggagattattttgacttaactgaatttgaggatgttgatgataaagttttagca
caaatggaagcctttgttaatttgattgaaccttttagtctttcaagtgagattaaacta
gcttcttttgagaacccgaaattattgctcaagcaaaaaataaatcaagataaatataca
aaattaattaaacgtcacggtaaagatattgttgatgagcgaattaaatatgagcttgaa
acaattgagaaatcaaactttattaactattttttagttattaaggatgtccttgatttt
gcaagagaacaaagaatcgaaattggaccaggaagaggttcttcttcagggtcaattatt
gcttttttattggatataacaaatgttaatcccattgaatatggacttttatttgaacgc
tttttaaatgtagctcgtgtttcgctccctgatattgatttagatattcaagatgatcgt
cgtaatgaacttttagaatacattggaaaacgttttggcatcgaaaaatgtgcattaata
tcaacatttcaaactttagcacttaaatcttcactgcgtgatgttgctagagttttaaaa
atccctcttagcgatgttgataaagtttgtgattcgttaactaaatttgatacttcttta
gatatagcttatcaacgtaatgctaaatacaaaatgttagttgataaacacgaaaaatta
caccaatatgctcgaaaaattgaaggaatgcctcggcaaagcggaattcatgctgccgga
gttattattagtgatcgacctttaactgatgtagtgccagttcgtcattcaaacgcacct
ttaaatcaagtagaatttgaaatgaattatttagaaaaatatggactaattaaaattgat
tttttgggtttaaaaaatcttactgttattaatcaaattgaaagtcatatcggtgaaccg
tatcgctttgatcaagttattaatttaaacttcaatccttttaatgataagtcaactttt
gatttaattaattcacttaatactgatggaatttttcaacttgaatctcctggaatgaaa
ggtgttattaagcaagttcaggttgacacttttgaagacatttatgcgattatttccctt
tttagaccaggtcctaaagattttattcctgattatgctaatgttaaatttcataaacaa
aaagtggataaaatccaccctatttatgatcaaattgtcgcaccaactcatggaattatt
gtttatcaagagcaaattatgcaaattgctcagcaagttgctaaaatgagctttattgaa
gctgatttattacgtcgagctatctctaaaaagaatgctcacgatttaagcacatattcg
gaaattttttataaacgtggagttgaaaataatattaaaatggaaatactaaagcaaatt
tatgctcaaattgaaaaatttgctttatatggatttaataaagcacatgcagttgcttat
tcatttattagttataagctagctttttataaagctcgttatccagaaattttttataaa
gttattattgataatgctaccggagatttaacaagcattaaaaatagtgcattacatgct
tcaaaacaaaatattattgttcattctccacatattaatcatgcactttttaaaagtgaa
attatttttaaaaatgctcaaaatgttaaatcacaactttatttaccacttttaattatc
aaaggaattggaccaagtgcaattgcgaaaatttctgaagaattacaacgtggcggaaaa
attgataacttttttaccggaattttgagactaaaagcttctggagttggagatgcagtt
attgaaacacttattaaagccaatgtttttagagactttggaaatgttgttgagttaatt
aacgcacttccagcaattaataatggagctgaaattttcaaaaaaatttatgcaaaatct
gaagaacctcttgaaactaagcttcaaaaatttattagtgatactggatttgaccaaaaa
cgaatccaaacttttgatatggatattaacttagaaattaaacttgaaaaagaattatta
ggatctgtttataatgcttatccaaccaaaaaatacgaacgtgacttaaaattagaagat
cttagagaaaatcaaaataatttcttttacgtttttttagaaagtattaagaaaaaccca
aaaggtcaagtaattgtgaaaatttcagattcttcaagtgcaatttcagctttcattttt
gaacattcagctatggatttagtcaattatccacagtctagagttattttagtaaattta
tcactatcagcaaaggggtattattcaattaagagttgagaggaagtttcacatgcggaa
taa

DBGET integrated database retrieval system