Mycoplasmopsis citelli: NCTC10181_00557
Help
Entry
NCTC10181_00557 CDS
T07104
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III polC-type
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mcit
Mycoplasmopsis citelli
Pathway
mcit03030
DNA replication
mcit03430
Mismatch repair
mcit03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcit00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
NCTC10181_00557 (polC)
03430 Mismatch repair
NCTC10181_00557 (polC)
03440 Homologous recombination
NCTC10181_00557 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mcit03032
]
NCTC10181_00557 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcit03400
]
NCTC10181_00557 (polC)
Enzymes [BR:
mcit01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
NCTC10181_00557 (polC)
DNA replication proteins [BR:
mcit03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
NCTC10181_00557 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcit03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
NCTC10181_00557 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
HHH_3
DUF1980_C
Zn_ribbon_8
T2SSK
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU74698
UniProt:
A0A449B270
LinkDB
All DBs
Position
1:732279..736637
Genome browser
AA seq
1452 aa
AA seq
DB search
MKNKEFYSDISFNNFAKYSKLGELESIQDAYIANNQIIFSDDQKSAYLTICFKTIPSVSD
FSLLKHKIEDFKDLTLHVNFSVDDYYPEDLKIKDYVFYFLLHEPKFAQIAQNYQNQSILI
LNHQTRKWVFTHTDPEMETTFNEIIDYLKEKFNNLNLNKIDFEIELKKIEIKKEIVPESF
ILEQEKKLLQSSNSNNDSFNKSVYNAKKNKYNSNKSNYQQLNIKDVHSLIEVPQDYNVAI
KGQIYKSDFIDRKNFFIYKYWISDLKDAIEVSYFQKEKLSDDGIFSVNDWVEVYGSLSES
FDKTQKIIKAKQIVKTKSSLEAKVDNEPVKRIELNAKTKMNTMDGIMSPSQVIEIAKNFG
HKAVGIFDLNGVQAFPEFYQAAKKAKIKPIYGAAFNVIHKNNKVFLNDFEDLNLDDIEYV
SFDLETTNLSARFGEIIEFGGVIIKNKTIIDEFQFFLKASAPISSFTTSLTSITNKMLED
EGLSQIEGLNRIYEILNNRYAVAHNCNFDMGFIQQKFIEYNIPIPNTTFIDALAISRLLF
PWKRRHTLGAFSSYLSIDYNESEAHRADYDARVLANTWIAAIETLKKSNIFTCKELSNFL
TDGFYSNVRPDEISIMVLNQEGLRELFKFVTLALTKRYFGRAKLFYDDLIKSKNLLFGSG
GIRSPLIDAYLFGSEFQQKELLNLFDYIEVPHPKAFLNQVSKNELTILQVQEALKKLIKD
ATNLGKTVVAISDARYESEQDQIFYKSLVYSMGIGGAPHFLFNKSKAESGTLTVPQLHFL
TTREMLDEFAFLEDLKLIKDIVINNPKKIEQMVDDNIEVIKKDLYTPKFDNSNQKLYDLV
YKTAREKYGENLPKIIEERLEKEITPIIKYGYDVIYWISNRLIQKCEDMGSIAGSRGSVG
SSLVATMAGITEVNPLPPHYICEKCKYFELIENNQITSGYDLDDKNCPKCGTLLDKDGHS
IPFETFLGFNADKVPDIDLNFSGDYQAEIHNEVKRIFGESNTLRAGTISTIKEKTAFGYI
KKIEEEYKFGYSRNFIDFLSSKIIGVKRTTGQHPGGIIIIPKEFQVEDFTPTNYPADDIT
IDWKTTHFDFHAIHDNVLKLDILGHRDPTAILMLQRITNINFQKDIPKKDPRVMSLFTST
KELNISPSQIGGEETGAIGLPEFGTNFVRRMLKEAKPTSFADLISVSGLSHGTDVWANNA
QSLIKNKDFSLRDVICCRDDILYYLKSKGVDALYSFKIMEKVRKGKGLTDEEVAELQKNN
IPDWYIESMQKIKYMFPKAHAAAYVLMAWRIAWFKLYYPLEYYATFLTIRVDEFDIETIV
NDHGAIKTNNKINEINKLPNKSVLDDALLTTLESVRELYARGFSIDNINLEKSLEKEWVI
DKKENKLIPPFSSVKGLGESVAKRIIQARNEREFLSKEDFAKRTSINKTLLDTLNNLGVL
SNLDDTDQMKLF
NT seq
4359 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaggaattttatagtgatatatcttttaataattttgcaaaatactcaaaa
ttaggagaacttgaatcaattcaagatgcatatattgcaaataatcaaattatttttagc
gacgaccaaaaaagtgcatatttaacaatttgttttaaaactattccttcggtttctgat
ttttctttgcttaaacacaaaattgaagattttaaagatttaacgcttcatgtaaatttt
tctgttgatgattattatcctgaagatcttaaaattaaagattacgttttttattttctt
ttgcacgaacctaaatttgctcagatagcacaaaattatcaaaaccagtcaattcttatt
cttaatcatcaaaccagaaaatgagtttttactcatactgatcctgaaatggagaccact
tttaatgaaattattgattatttaaaagaaaaatttaataatcttaatttaaataaaata
gattttgaaattgaactaaaaaaaattgaaattaaaaaagaaattgtccctgaaagcttt
attttagaacaagaaaaaaaattgctccaatcatcaaattcaaacaacgattcctttaat
aaaagtgtttataatgctaaaaaaaataaatataactccaataaatcaaattatcaacaa
ttaaatataaaagatgttcattcgctaattgaagtacctcaagattataatgttgcaatt
aaaggtcaaatttataaaagtgattttattgaccgtaaaaactttttcatttataaatac
tgaatatctgacttaaaggacgccattgaagtttcgtattttcaaaaagaaaaattatct
gatgatggaattttttcagttaatgattgagttgaagtttatggttctttaagtgaaagt
tttgacaaaacgcaaaaaattattaaagcaaagcaaattgttaaaaccaaatcttctttg
gaagctaaagttgataatgaacctgttaaacgtatcgaactaaatgctaaaactaaaatg
aacactatggatggaattatgagtccatctcaagttattgaaatagctaaaaatttcgga
cacaaagcagtaggaatttttgacttaaacggtgttcaagcttttccagaattttatcaa
gctgctaaaaaagctaagataaaaccaatttatggggctgcttttaatgtaattcataaa
aataataaagtttttttaaatgactttgaagatttaaatttagatgatattgaatatgta
tcttttgacttagaaacgactaatttatcagctcgatttggtgaaattattgaatttggt
ggcgtaataattaaaaataaaacaattattgatgaatttcagtttttcctaaaagcttct
gctcctatttcgtcttttaccactagtttaacttcaattaccaataaaatgctagaagat
gaagggctttcgcaaatagagggattaaatagaatttatgaaattttaaataatcgttat
gcagttgctcacaactgtaattttgatatgggatttatacagcaaaaattcattgaatat
aatatcccaatcccaaatacaacatttattgatgctctagctatttctcgtttgcttttt
ccgtgaaaaagaagacacactcttggtgctttttcttcatatttatcaattgattacaac
gaaagtgaagctcaccgtgctgattatgatgctcgagtattggctaatacatgaatagct
gctattgagacattaaaaaaatcaaatatttttacttgtaaagaattatctaactttctt
actgatggattttattctaacgttcgtcctgatgaaataagtataatggttttaaatcaa
gaaggtttaagagaacttttcaaatttgtaactttagctttaactaaacgttactttggt
cgtgcaaagcttttttatgatgatttaattaaatcaaaaaacttattatttggatcaggt
ggaattcgaagccctttaattgatgcatatttatttggtagtgaatttcaacaaaaagaa
ttattaaatttatttgattacattgaggttccacatccaaaagcgtttttaaatcaagtt
tcaaaaaacgagttaacgattttacaagttcaagaagcacttaaaaaacttattaaagac
gcaacaaatttagggaaaacagtagtagctatttctgatgctcgttacgaaagtgaacaa
gaccaaattttttataaatcacttgtttattcaatgggaattggaggggctccacacttt
ttatttaataaatccaaagctgaatcaggaactttaactgttccacaattacacttttta
actactcgtgaaatgcttgatgaatttgcttttttagaagatttaaaactaattaaagat
attgttattaataatcctaaaaaaatagagcaaatggtagatgataatattgaagttatc
aaaaaagatttatacactccaaaatttgataattcaaaccaaaaactttatgacctagtt
tataaaactgcaagagaaaaatatggagaaaatctccctaaaattattgaagaaagatta
gaaaaagaaattactccaattattaaatatggttatgatgttatttattggatttctaac
cgtctaattcaaaaatgtgaggatatgggttcaattgctggaagtaggggaagtgttggg
tcttcgcttgtagctacaatggcgggaattactgaagttaatccacttcctccgcattat
atctgcgaaaaatgtaagtattttgaattaattgaaaacaaccaaattacatctggatat
gatttagatgataaaaattgtccaaaatgtggaaccttgttagataaagatggacattca
attccttttgaaacctttttaggatttaatgcagataaagttcctgatattgatttaaac
ttttcaggagattatcaagctgaaattcataatgaagttaaacgtatttttggagaaagc
aacacattaagggccggaacaatttcaactattaaagaaaaaaccgcttttggttatatt
aaaaaaattgaagaagaatataaatttggctattcacgaaattttattgattttttatct
tcaaaaatcattggagtaaaacgaactaccggacaacatcctggaggaataattattatt
cctaaagaatttcaagtggaggattttaccccaactaattatccagctgatgatattaca
attgattgaaaaacaacccattttgatttccatgctattcatgataatgttttaaaactc
gatattttaggacaccgtgatccaactgcaattttaatgcttcaaagaattactaatatt
aactttcaaaaagatattcctaaaaaagatcctcgagtaatgtctctttttacttcaaca
aaggaattaaacatttctccttcacaaattggtggagaagaaacaggagcaattggttta
cctgaatttggaacaaactttgtacgtagaatgcttaaagaagcaaaacctacaagtttt
gcagatctaatttcagtatcaggcctttctcatggtactgatgtgtgagcaaataatgct
caaagtttaattaaaaataaagacttttctcttagagatgtaatttgttgtagggatgat
attttatattatctaaaaagtaaaggtgttgatgctctttattcatttaaaatcatggag
aaagttcgtaaaggtaaaggtttaactgatgaagaagttgcagaattacaaaaaaacaat
atacctgattgatacattgagagtatgcaaaaaattaaatatatgttccctaaagcccac
gctgcagcatatgttcttatggcttgaagaattgcgtgatttaagctttattatccactt
gaatattacgcaaccttcttgacaattagggtagatgaatttgatattgaaacaattgta
aatgatcatggagctattaaaaccaataataaaattaatgaaattaacaaactacctaat
aaatctgttttagatgatgcattattaacaactcttgaatcagtgcgagaattatatgcg
aggggattttcaattgataatattaatttagaaaaatctcttgaaaaagaatgagtaatt
gataaaaaagaaaacaaactcattccaccattttcatctgtaaagggacttggtgaatcg
gttgcaaaacggattattcaagctcgaaatgaaagagaatttctttctaaagaagatttt
gcaaaacgaacttcaattaacaaaacacttttagatactctaaataatcttggtgtacta
agtaatttagatgatactgatcaaatgaaattattttaa
DBGET
integrated database retrieval system