Mycoplasmopsis citelli: NCTC10181_00572
Help
Entry
NCTC10181_00572 CDS
T07104
Symbol
recD
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
mcit
Mycoplasmopsis citelli
Pathway
mcit03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcit00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
NCTC10181_00572 (recD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcit03400
]
NCTC10181_00572 (recD)
Enzymes [BR:
mcit01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
NCTC10181_00572 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcit03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
NCTC10181_00572 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
SH3_13
UvrD_C_2
Viral_helicase1
AAA_11
PIF1
AAA_22
SLFN-g3_helicase
UvrD-helicase
NPHP3_N
AAA_5
RsgA_GTPase
Helicase_RecD
AAA_16
NACHT
AAA
ABC_tran
RNA_helicase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU74712
UniProt:
A0A449B293
LinkDB
All DBs
Position
1:750878..753088
Genome browser
AA seq
736 aa
AA seq
DB search
MSSQKLKGSFVKFLKGGKGSNWALLMFKPDNGSKTIVLYARNNVPNLYVQYEISFKSNSK
YSHNKLLESYIPIANTQDINWEEYFFKHVPSIGKTTAKKVNEKWGNEIFNLVKDTKQNYA
ELSEILSDRQIESFKNYYEQNTHQVDSLMILNSENDIKFFYSNSMQSFYEKLLNLIKTKE
SFIEMFQVKSPYSLYFDYELDLSDVDRFALLLDSTYQNDKNQFSNDRFEAYVDFLLKDKE
SNNSTLINIAEVAKDVAGILNFEKEDIIERFKFLIAHKKVRFRQVGEISYLTRNSTYEKE
KLILSKITQINSKKSMNLNCNISEEFNTLSNEQKDAFLNFLNFNISVVSGGPGTGKSYLI
KFINKTLQENGLENLKDYYILTPTGRASSNISLKINEQCKTIHSMLRIDKNERGINEETL
EALKEVKVVVVDEFSMVNVNIFSKLLSSCPNLEKIILIGDVEQLPAIGPGNLLEEIISFN
LAKTTFLEKNFRTESKEIVQHFSAIKYNQLPVFKKSIVDLYQFNSNTFLSDITNLFLEEV
KKFSLDNVILLAPSYKGSVGITNLNNEIQKQLNPNSEIIYTIKKFQDEINFKIGDRVIQL
ENRVADDIYNGDIGYIKGLIIDNNKKTKTIVVEFKRNANVINVKYSEMEFREQINLAYAI
TVHKFQGSETDSVIFAINPQYKFMTTKKLIYTATSRAIRHLSIATNVNCDYLEILVENSA
NKENILTNFRYILQGE
NT seq
2211 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagctcacaaaaattaaaaggcagttttgttaagtttttaaaaggtggaaaaggctca
aattgagctcttttaatgtttaaaccagataatggaagcaaaactattgttttatatgct
cgcaacaatgtaccaaatttatatgttcaatatgaaataagttttaaaagtaattcaaaa
tatagtcataataaacttttagaatcatacatcccaattgctaatactcaagatattaat
tgagaagaatacttttttaagcatgttccttcaattggtaaaactactgcaaaaaaagtt
aatgaaaaatgagggaatgagatttttaatttagtcaaagacactaaacaaaattatgct
gaattaagtgaaattttatctgatagacaaattgaatcttttaaaaattattatgaacaa
aatactcatcaagttgattcgttaatgattttaaattctgaaaatgatattaagtttttt
tattcaaacagcatgcaaagcttctatgaaaaattacttaatttaattaaaactaaagaa
tcttttattgaaatgtttcaagttaaatctccctatagtttatattttgattatgaattg
gatttaagtgatgttgatcgctttgcgttattactagattcaacatatcaaaatgataaa
aatcaatttagtaacgatcgttttgaagcgtatgtagattttttgcttaaagacaaagaa
agcaataattcaactttaattaatatagcagaagtagcaaaagatgttgctggaatacta
aattttgaaaaagaagatattattgaacgttttaaatttttaatcgctcacaaaaaagtg
cgttttcgtcaagttggggaaatttcttatttgactagaaattctacttatgaaaaagaa
aagttaattttaagcaagataactcaaataaattcaaaaaaatcaatgaatttaaattgc
aatatttcagaagaatttaatactttaagtaatgagcaaaaggatgcatttttaaatttt
ttgaattttaatatttcagttgtttctggcggacctggaactggaaaaagttatttaatt
aaattcattaataaaacattacaagaaaatggactggaaaatcttaaagactattacatt
ttaacccccacaggaagagcaagtagtaacatttctcttaaaattaatgaacagtgcaaa
acaattcatagtatgctaagaattgataaaaatgagcgtggaatcaatgaagaaacttta
gaagctttaaaagaagttaaagtagttgtagttgatgagttttcgatggttaatgttaat
attttttctaaattactttcatcatgtccaaatttagaaaaaataattttaattggtgat
gttgaacaacttccggcaattggaccaggaaatttgcttgaagaaattattagttttaat
ttagctaagacaacctttttagaaaaaaactttcgaactgaatctaaagaaattgttcaa
cactttagtgcaattaaatataatcagcttcctgtatttaaaaaatcaattgtggattta
tatcaatttaatagcaatacatttttaagtgatattacaaatttatttttagaagaagtt
aaaaaatttagtttagataatgtaattttacttgcaccttcatataaagggagtgttgga
attactaatttaaataatgaaattcaaaaacaacttaatccaaatagtgaaattatctat
acaattaaaaagtttcaagatgaaattaactttaaaattggcgatcgggtaattcaactt
gaaaatcgagttgctgatgatatttataatggagatattggttatattaaaggtttaatt
attgataataataaaaaaaccaaaaccattgtagtagaatttaaacgcaatgcaaatgtt
attaatgttaaatattcagaaatggaatttagagagcaaattaacttagcttatgctatt
actgttcataaatttcaaggttcagaaactgatagtgttattttcgcaattaatccacaa
tataaatttatgacaactaaaaaattaatttatactgctacttctcgagcgattagacat
ttaagtattgcgacaaatgttaattgcgattatttagagattttagttgaaaatagtgca
aataaggaaaatattttaactaatttcagatatattttgcaaggagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
