Melitaea cinxia (Glanville fritillary): 123666048
Help
Entry
123666048 CDS
T09237
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(III) chain-like
Organism
mcix
Melitaea cinxia (Glanville fritillary)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Fibrinogen_BP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123666048
NCBI-ProteinID:
XP_045456211
LinkDB
All DBs
Position
25:complement(5527279..5540723)
Genome browser
AA seq
2024 aa
AA seq
DB search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NT seq
6075 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccatatcgaagagcaagttgtgcttagattgtcatagctacttgctatttggttca
gaagctacaccaaatcaaggtgaaggttcgataggtggatataatgacaaatctttcagt
tggaataaagcagaagctttctcgaactacccagctggtttaaacagcgatcacaaggat
tattcagtaaaaatcatcgataggaatagaaacgcttattatagatcagacagtgattta
aatgcagcttcagtgaagaagaataactactaccattacaattctggtggaggtttaata
actggaaaaaattataaaactttgaactggaataacgctgaaggttcctcgaactatgca
gcggattcaaatagtaatcgtaaggaatatttaggacaaatttacgatgggaataggaac
gaccattttagatcagagagtgattcaaagttggcttcagtgaacaaaaatgattattac
aattacaattccggttcatataatggacacaatcatccacatggccgacaccacccacac
ctactaaagccccattctccagtctatagtccaccacttaggtacccatactatccacaa
caaattcaccctcaaccaatatacccacagcctattgtgcctcttaaccagccatttgtg
actccaagaaaaccggtcaaaaattatgctattaatgaagggtactatgcccgggatata
cactacccgggagctaaaccagtggttaatcagccatacttaggaccatcagttggacca
gtaggatacccgccaaataatcttcaagtttccccaattggttctgaagatgataaacca
aaacaactatataaggattcatttggaaattcaccaaacaatccacaacaaggatttcct
aaggaacaaagaggtttaccaagctatccacaatacagttaccctgattcaaactatgcg
tattcttatgctggtagctttggtagctcttatgccaatcagcaaaatagctactcaaaa
aattgggactacaacaatagtggatctaatttaccaggatcacctaatggaccacaagga
ggctcaccaaacaaccctcaaggaggtagcaatccacatgaaggctcaccatacaaccca
caagaaggcaacaacccacaaggagactcaccaaccaaaccacaagaaggcttaacaaac
aaccctcagtggggatcaccaaccaactcacaaggagactcacctagtaaccctcaagga
agctcaccaaacaacccaaaaggagactcacctactaacccacaaggggactcaccaaac
aaaccacaaggaaattcaccaaccaacccacaaaaggactcaccaagcaatccacaatgg
ggctcaccaaccaacccacaaagagactcaccaacatactcacaaggaggcgcaccaact
aacccacaaggagaatcaccaagcaatctacaatggggctcaccaaccaacccacaaaga
gactcaccaacatactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaaggacaatcatcaagc
aattcacaatggggctcaccaaccaacccacaaggagactcaccaaccaaagcacaagaa
ggctcaacaaacaaccctcaatggggatcaccaaccaactcacaaggagactcacctagt
aatcctcaaggaagcacaccaaacaacccacaaggagattcaccaaccaacccacaaggg
gacttaccaagcaatccacaatggggctcacctactaacccacaaggggactcaccaaac
aaactacaaggagattcgccaacaaatccacaaggggactcaccaagcaatccacaatgg
ggctcaccaaccaacccacaaagagattcaccaacatactcacaaggaggtgcaccaact
aacccacaaggagaatcaccaagcgattcacaatggggctcaccaaccaacccacaagga
gactcaccaaccaaaccacaagaagactcaacaaacaaccctcaatggggatcaccaacc
aactcacaaggagactcacctactaacccacaagaggaatcaccaagcaatccacaatgg
ggctcactaaccaacccacaaagagactcgccaacatactcacaaggaggcgcaccaact
aacccacaaggagaatcaccaagcaattcacaatggggctcaccgaccaacccacaagga
gactcaccaaccaaagcacaaggagattcaccaaccaacccacaagtggactcaccaact
aactcacaaggaaactcacctagtaaccctcaaggaagctcaccaaacaactcacaagga
gactcacctactaacccacaaggggattcactaaacaaaccacaaggagagtcaccaacc
aacccacaaggggactcaccaagcaatccacaatggggctcacctactaacccacaaggg
gactcaccaaacaaaccacaaggagatttaccaaccaacccacaaggggactcaccaagc
aatccacaatggggctcaccaaccaacccacaaagagactcaccaacacactcacaagga
ggcgcaccaactaactcacaaggagaaccaccaagcaatccacaatggggcacaccaacc
aacccacaaagagagtcaccaacacactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaagga
gaatcaccaagcaatccacaatggagctcaccaaccaacccacaaagagacccaccagca
tactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaaggacaatcaccaagcaattcacaatgg
ggctcaccaaccaacccacaaggagactcaccaaccaaagcacaagaaggctcaacaaac
aaccctcaatggggatcaccaaccaactcacaaggagactcacctagtaatcctcaagga
agcacaccaaacaacccacaaggagattcaccaaccaacccacaaggggacttaccaagc
aatccacaatggggctcacctactaacccacaaggggactcaccaaacaaactacaagga
gattcgccaacacatccacaaggggactcaccaagcaatccacaatggggctcaccaacc
aacccacaaagagattcaccaacatactcacaaggaggtgcaccaactaacccacaagga
gaatcaccaagcgattcacaatggggctcaccaaccaacccacaaggagactcaccaacc
aaaccacaagaagactcaacaaacaaccctcaatggggatcaccaaccaactcacaagga
gactcacctactaacccacaagaggaatcaccaagcaatccacaatggggctcactaacc
aacccacaaagagactcgccaacatactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaagga
gaatcaccaagcaattcacaatggggctcaccgaccaacccacaaggagactcaccaaca
cactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaaggagaatcaccaagcaatccacaatgg
agctcaccaaccaacccacaaagagacccaccagcatactcacaaggaggcgcaccaact
aacccacaaggagaatcaccaagcaattcacaatgtggctcaccaaccaacccacaaaga
gactcaccaacatactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaaggagaatcaccaagc
aattcacaaggagactcacctagtaatcctcaaggaagctcaccaaacaacccacaagga
gactcacctactaacccacaaggggactcaccaaacaaaccacaaggagatttaccaacc
aacccacaaggggactcaccaagcaatccacaatggggcccaccaaccaacccacagaga
gactcaccaacatactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaagaagaagcaccaagc
gattcacaatggggctcaccaaccaacccacaaggagactcaccaaccaaaccacaagaa
ggctcaacaaacagccctcaatggggattaccaaccaactcacaaggagactcaccaaac
aacccacaaggagactcacctactaccctacaaggggactcaccaaacaaaccacaagga
gattcacctactaccccacaaggggacccaccaaacaaaccacaaggagatttaccaacc
aacccacaaggggactcaccaagcaatccacaatggggcccacctactaacccacaaggg
gaatcaccaaacaaaccacaaggagattcaccaaccaacccacaagaggactcaccaagc
aatccacaatggggctcaccaaccaacccacagagagactcaccaacatactcacaagga
ggcgcaccaactaacccacaagaagaagcaccaagcgattcacaatggggctcaccaacc
aacccacaaggagactcaccaaccaaaccacaagaaggctcaacaaacagccctcaatgg
ggattaccaaccaactcacaaggagactcaccaaacaacccacaaggagactcacctact
accctacaaggggactcaccaaacaaaccacaaggagattcacctactaccccacaaggg
gacccaccaaacaaaccacaaggagattcaccaaccaacccacaaggggactcaccaagc
aatccacaatggggctcaccaaccaacccacaaagagactcaccaacatactcacaagga
ggcgcaccaactaacccacaaggagaatcaccaagcaatccacaatggggctcaccaacc
aacccacaaagagactcaccaacatactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaagga
gaatcaccaagcgattcacaatggggctcaccaaccaacccacaaggagactcaccaacc
aactcacaaggagactcacctagtaaccctcaaggaagcacaccaaacaacccacaagga
gattcaccaaccaacccacaaagagactcaccaacatactcacaaggaggcgcaccaact
aacccacaaggagaatcaccaagcaattcacaaggagactcacctagtaaccctcaagga
agctcaccaaacaacccacaaggagactcacctacgaacccacaaggggactcaccaaac
aaaccacaaggagattcaccaaccaacccacaaggggacttaccaagcaatccacaatgg
ggctcacctactaacccacaaggggactcaccaaacaaaccacaaggggactcaccaagc
aatcttcaatggggctcaccaaccaacacgcaaagagactcaccaacatactcacaagga
ggcgcaccaactaacccacaaggagaatcaccaggcaattcacaatggggctcaccaacc
aacccacaaggagactcaccaaccaaaccacaagaaggctcaacaaacaaccctcaatgg
ggatcaccaaccaactcacaaggagactcacctagtaaccctcaaggaagctcaccaaac
aacccacaaggagactcacctactaacccacaaggggactcactaaacaaatctcaagga
gattcaccaaccaacccacaaggggactcactaaacaaatctcaaggagattcaccaacc
aacccacaaggggactcaccaaacaaaccacaaggagattcaccaatcaacccacaaggg
gactcaccaagcaatccacaatggggctcaccaatcagcccacaaagagactcaccaaca
tactcacaaggaggcgcaccaactaacccacaaggagaatcaccaagcaatccacaatgg
ggctcaccaaccaacccacaaagagactcaccaacatactcacaaggaggcgcaccaact
aacccacaaggagaatcaccaagaaattcacaatggggctcaccaaccaaccctcaagga
ggatcaccagtcaacccacaaggagatttaccaaataacccacaagaaagttcaccaaac
aacccacaaggagactttccactggttgtaggaggctctaagaaatgtggtaaaggtaag
aaaaatacatggtga
DBGET
integrated database retrieval system