Mycoplasmopsis canis PG 14: AXW82_01045
Help
Entry
AXW82_01045 CDS
T04557
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mck
Mycoplasmopsis canis PG 14
Pathway
mck03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
AXW82_01045
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mck03021
]
AXW82_01045
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mck03400
]
AXW82_01045
Enzymes [BR:
mck01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
AXW82_01045
Transcription machinery [BR:
mck03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
AXW82_01045
DNA repair and recombination proteins [BR:
mck03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
AXW82_01045
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
SMODS
DUF2634
Ribosomal_S13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMD81147
LinkDB
All DBs
Position
complement(279435..283877)
Genome browser
AA seq
1480 aa
AA seq
DB search
MVNNSSLNMRNKEKIKKITLSLATREDVKSWSHGEVTKPETINYKTYKPEKDGLFDELIF
GPVIDYKCPICGTKYKKSDVNTICSKTQQCKKYNPEILPKISRRSRMGHISLHTPVVHFW
FFKIDHSVISNLLGLRIEDGSEKQAVTKSDLEKLIYYKSHIVLESGSLKSLKKNTIIDIN
EAANIYDKALEELKELNQDDEEALENITEALYELREYAQSQDGKDFGIDFYQYNNVIREY
SDAIIGTGSQAIEYLLKNLDLEKEQQIVQEQIDKINNEINKQRDVSTSKIQQRQKLYKRL
TIISSFIRSGQKPTDMLIYELPVIPADLRPLVQLDGGRHSTSDVNELYRRIIIRNNRLAK
WNETDAPMLIKQNEYRMIQEAVDALIDNARKKPTPVSSRDNHPLKSISDGLTGKKGRFRQ
NLLGKRVDYSARSVIVGGPSLKMYEVGVPRDIAAKLFEPWIIKALIEKEDGITSIKTAKK
LIENLDPRIWPYVEKAIENRPVLLNRAPTLHRLSIQAFQPVLIRSKAIKLHPLVTTAFNA
DFDGDQMAIHVPVSEKAVREAQELMLASKNILGPKDGEPIINPSQDIILGLYYLTIEKTG
EKAIGEGNYYQNLDELMLAYERGKVTLHSRVILPIKSLNKPQLLNATKKPYLFSTVGKFL
LNSVLPADFEFVFGKYVEKTYKKNSKGETKVSEKEVIHTSRYDLERYTLDYGQNFREEIA
NTELNLALSKKDIARIIRKIYEEYVAVITIEDIAKVLDSVNKLNFKDQLDNLKLLVDYKG
DLIPNSHAKLINQFISEEFEKISYTYKAADSLKDSVEWSINEYSKGLEKVWFRYSNYVSE
ILDKIKELGFKYSTISGTTISMNDVKTLDSTSEHIKEGEEYINKLKEFFENGYLTDDERY
KLTIEKWAKVKDKIEKSLKEVTKSDLDNPLFMMMTSGARGNSSNFTQLAGMRGLMSNNTK
VLKADAENDRVVRSTIEIPVKSSFLRGLSAYEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRR
LVDVAQSIVVREADCGSDFGFVVKAIKDTKTDTVIETLWERIEGRYTNKAIYDENNNLVI
DANQLITPEIANKIVNDLKLEQVEIRSVLSCHTKNGVCKVCYGKDLASNRVVNIGEAVGI
VAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAYDNPWGKPAEISKVYGVI
AKIEQVVSKDTGKVTDITEVTIATKDDQGNDYIEVVTGRTSQKLRVKVGDSVIPGQKIFE
GPIVLNQLLNATDARTVQNYLLKEIQRLYRLQGITIADKYIEIIISQMLSKILIIDPGDS
RFFSGALVDTFVYQNENAKLLADGKKPAYGKVKISGAKQIPLLSSSFLAAASFQETAKIL
VNSSVGQRVDQLEGLKENIILGQKIPAGTNSDYELKGKYDIREFRSYFPNKIDPNNYVEP
TLDISEDELSIDDITEESYSDEIFDQNDEYNEFYDFGDEV
NT seq
4443 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgaataattcgtctttaaacatgcgtaataaagaaaaaattaaaaaaataaccctc
tcattagctactagagaagatgtaaaaagttgatcacatggtgaagttactaaaccagaa
acaattaattataaaacttataagcctgaaaaagacggtttatttgatgagttaattttc
ggtccagttattgactataaatgtcctatttgtggtactaagtacaaaaaaagtgatgtt
aatactatttgttcaaaaacacaacaatgtaaaaagtataaccctgagatacttccgaaa
atttcaagaagaagtagaatgggtcacatttcattacacacacctgttgtacatttttga
ttctttaaaatagatcactcagttatttcaaatctacttggtcttagaattgaagatgga
agcgaaaaacaagcagtaactaaatctgatcttgaaaaacttatttattataaatcacat
atagttcttgaaagtggttcattaaagtcacttaaaaagaatacaattattgatattaat
gaagccgcaaatatttatgataaagctttagaagaattaaaagaactcaatcaagatgat
gaagaagctttagaaaatattacggaagcattgtatgagttaagggaatacgctcaatct
caagatgggaaagattttggtattgatttttatcaatataataatgttattagagaatat
tcagatgcaattattggtactggatcacaagctattgaatatttattaaaaaatcttgac
cttgaaaaagaacaacaaattgtccaagaacaaatcgataaaatcaataatgaaattaat
aaacaacgtgatgtttcaacatcaaaaattcaacaaagacaaaaactatataaacgttta
acaataatttcttcatttataagatcaggccaaaaaccaactgatatgttaatctacgaa
ttacctgttattcctgcggatcttagaccattagttcaattagatgggggaagacactca
acaagtgatgttaacgaactttatcgtcgtattattattagaaacaaccgtctagctaaa
tgaaacgaaacagatgctccgatgcttattaaacaaaatgagtatcgtatgattcaagaa
gctgttgatgctttaattgataacgctagaaagaaacctactccagtttcttcaagagat
aatcaccctcttaaatctatttctgatggactaacaggaaaaaaaggacgttttcgtcaa
aatcttttagggaaacgtgttgactattctgcgcgtagtgttattgttgggggaccttca
ttaaaaatgtatgaagttggtgttcctcgtgatattgctgcaaaattatttgaaccatga
attattaaagccttaatagaaaaagaagatggaattacaagtattaaaacagctaaaaaa
ttaatagaaaatcttgatccaagaatttgaccatatgttgaaaaagctatcgaaaatcgt
ccagttcttttaaaccgtgcacctacattgcaccgtctttcaattcaagcctttcagcct
gtcttaatacgttcaaaagctataaaattacacccattagtaacaaccgcttttaacgct
gacttcgacggggaccaaatggctattcacgtaccagtatctgaaaaagcagttcgtgaa
gctcaagaattaatgcttgcttctaaaaatattttaggacctaaagatggagaacctatc
attaacccttcacaggatattattttaggtctttactatttaacaattgaaaaaacaggg
gaaaaagctattggtgaaggtaattattaccaaaaccttgatgagttaatgttagcttat
gaaagaggtaaggtaactttacattcaagagtaattcttcctattaaatcattaaataaa
ccacaattactgaatgctactaaaaaaccatatttattctcaactgtcggaaaattcttg
ctaaatagcgtgcttccagcagattttgaattcgtttttggtaaatatgtagaaaaaaca
tataagaaaaattcaaaaggtgaaacaaaagtttcagaaaaagaagttattcatacttca
agatatgatttggaaagatatacacttgattatggacaaaacttccgcgaagaaattgct
aatacagaattaaacttagctttatctaaaaaagatattgcaagaattattagaaaaata
tatgaagaatatgttgcagtaataacaattgaagatatagcgaaagttttagattctgtt
aataaattaaactttaaagatcaattagataatcttaaattacttgttgattataaaggt
gatttaattcctaactcacatgctaaattaattaatcaatttatttcagaagaatttgaa
aaaatttcttacacatataaagccgctgactcactaaaagattcagttgaatgatcaatt
aatgaatattcaaagggtcttgaaaaagtttgattcagatattcaaactatgtatcagaa
atattagacaaaattaaagaattaggatttaaatattctactatttcaggtacaacaatt
tctatgaatgatgttaaaacgttagattcaacatcagaacacataaaagaaggtgaagaa
tacattaacaaacttaaagaattcttcgaaaatggttacttaactgatgatgaacgttat
aaattaacaattgaaaaatgagcaaaagttaaagataaaattgaaaaatcacttaaagaa
gttacaaaatcagatttagataacccattatttatgatgatgacttctggagcccgtggt
aattcatctaactttacccagttagcaggtatgcgtgggcttatgagtaacaacaccaaa
gttcttaaagccgatgctgaaaacgaccgtgtcgttcgttcaacaattgaaattccagtt
aaatcttctttcttacgtggacttagtgcatatgaattttattcatctacccacggggct
cgtaagggtcttacagatacagctcttaacacagctaaatctgggtacttaactcgtaga
ttagtggacgttgctcaaagtatagtagttagagaagcggattgtggatcagattttggt
ttcgttgtaaaagcaattaaagatacaaaaactgacacagttattgaaacattatgagaa
agaattgaaggtagatatacaaacaaggctatctatgatgaaaataataaccttgttatt
gatgcaaatcaattaattacaccagaaattgctaataaaatagttaatgatttaaaacta
gagcaagtagaaattcgttcagtattatcttgtcacacaaagaatggtgtatgtaaagtg
tgttatggaaaagatcttgcttcaaaccgtgtagttaatattggtgaagctgttggtatt
gttgcagctcaatcaatcggtgaacctggaacacagcttaccatgcgtacattccatact
ggaggggttgctggggttgaagatattacaggtggattcggaagattgattgagttaatt
gatgcttatgacaatccatgaggtaaaccagctgaaatttctaaagtatatggggttata
gctaaaatcgaacaagttgtaagtaaggatactggaaaagtaacggatataacagaagtt
acaattgcaacaaaagatgatcaaggaaatgattatatagaagttgttacaggtagaaca
tcacaaaaactacgtgttaaagttggtgattcagttattcctggtcaaaagatctttgaa
ggtccaattgttttaaatcaattattaaatgcaactgatgctagaactgttcaaaattac
ctattaaaagaaattcaaagattataccgtttacaaggtattacaattgcggataaatat
atcgaaattattatttctcaaatgctttcaaaaattttaattattgatccaggtgattca
agattctttagtggagcattggttgatacatttgtttaccaaaatgaaaatgctaaatta
ttagctgatggtaaaaaacctgcttacggaaaagttaaaatttctggtgcaaaacaaata
ccattgctttctagttcattcttagctgcggcttctttccaagaaacagctaaaatcctt
gttaattcatcggttggtcaaagagttgatcaacttgaaggtcttaaagaaaatattatt
ttagggcaaaaaattcctgctggaacaaactcagattatgaattaaaaggtaaatatgat
attagagaatttagatcatatttccctaacaaaatcgatccaaataattatgttgaacca
actcttgatatttcagaagatgaattatcaatagatgacataacagaagaatcatatagt
gatgaaatttttgatcaaaatgacgaatataatgaattctacgattttggggatgaagtt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
