Myroides sp. JBRI-B21084: P3875_06420
Help
Entry
P3875_06420 CDS
T09249
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
mcla
Myroides sp. JBRI-B21084
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SprB
HYR_4C
Bact_surface_Ig-like
Por_Secre_tail
Ig_3
I-set
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKW45421
LinkDB
All DBs
Position
1308987..1314131
Genome browser
AA seq
1714 aa
AA seq
DB search
MKGKKLIYLIVSAFLFVTQLQSQTTYDFNTPAVISSGPAGFGFWNTQADITIGGVPYVLT
SGGNGSFTNINTGGVSNSKALRKDGSGGDTFTLKRQDGQPFQFYGIWVQHQSMNSYSQFY
TLPPWYTLTTSGQDSFTYQDMTAMTAGTNTSSSKTIDAGVNGVTVTSVQISFQAILYYKV
DNIKVGPVVIACTPPVFSLNPSNVSTCDGSSVTLNAAATGATAYEWQVNTGSGYTTISNG
GPYSNATTANLTISAVSTAMSGYTYRCVAINGVNTCFANSTDATLTVANFPTITQSQMNV
WCNGGSNGSATVSLIGGTGTYAYSWSPSGGNASTATGLVAGNYSVTISDGTCSVIKNFTI
QQPSAINGTTSVTNVSCFGGSNGSIDLTPTGGTPPYTFNWGGGITTEDRTGLTAGAYSVI
ITDANVCSKTVNVTVNQPTNGVDGSAVVTNISCTGGLTGAIDLTPMGGTPPYSYDWGGGI
TTEDRTGLAAGNYSVVITDANSCTKTINATVGLSVPVSGTTAITNVSCFGGSNGAINLTP
TGGTAPYTFNWGGGITTEDRTGLAAGNYSVIITDANGCSETINATVSQPTSLVNGTTVVT
NVSCNGGVNGAINLTPTGGTAPYTFDWGGGITTEDRTGLAAGAYSVTITDANGCTKTLNV
TVMQPTAINASTVVTNVSCNGGTNGAINLTPTGGTAPYTFNWGGGITTEDRSGLVAGNYS
VIITDGNGCTKTVNVTVTQPTTIILQTSQDVPATCANSADGVATVNVTGGVSPYTYNWSN
GANTATATGLAAGTYSVIVTDFNGCSQNTSIVISFVDTTAPVLDMPVLPTITKECAVVAG
DIVAPTATDNCAGSITATTIDPLTYAQQGTYTITWLYDDGNGNRTTQTQTVVIDDVTAPV
TNMNVLPTITKECAVVTGDIVAPTATDNCVGTLTATTTDPLTYTQQGTYTITWVYNDGNG
NTTTQNQTVVVDDVTAPVPNMTVLPTITKECAVVTGDIVAPTATDNCVGTLTATTTDALT
YTQQGTYTITWLFNDGNGNTTTQTQTVVVDDVTAPVPNMTVLPTITKECAVVTGDIVAPT
ATDNCVGTLTATTTDPLTYTQQGTYTITWLYNDGNGNTTTQTQTVVVDDVTAPVPNMTVL
PTITKECAVVTGDIVAPTATDNCVGTLTATTTDALTYTQQGTYTITWLFNDGNGNTTTQT
QTVVVDDVTAPVPNMTVLPTITRECAVVTADIIAPTATDNCAGTLTATTNDPLNYTQQGT
YTITWLFNDGNGNTTTQIQTIVVEVSPLDVVTFDNLTTVYNGSAHEIQVNNLPAGASVSY
TISPDSGLNNAAINAGTYVVTAVVTPPATAVNCTSRTIVADLIIEKASQSITFNNLDVLM
LENAADFQLTATASSQLPVSYTYTYAQSTPAATVTPEGWVTLVHSGSILITAHQDGNENF
LPAATVSRELVIESEDASIQQIVVNGQVYTNPESTIYVMQDCENLLNNVEVEIEAEFGSQ
VTPAREFFIQTPKPGVYKETVKVVSQNGANQEIYNVIVERPFVFEDIVIQKFDNTLLVNN
NPKTNGGYKFVAYKWYRNDVLIGTEQVYSVGSTLNDQLDENVEYSVTVTTDDGQEIHTCP
STVTRVHDLSMKVYPNPVQTNSTFTIDFGTPSKSYEGTTASIFTTDGKLLFTTQIVNNNT
AITLPSTIAAGMYMLVVENNEKQFKEVVKIVVKQ
NT seq
5145 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaggaaaaaaattaatttatttaattgtcagtgcctttttatttgtaacacaatta
caatcgcaaacaacttatgatttcaatactcctgctgtaatttcaagtggacccgctggt
tttggtttttggaatactcaggccgatattacaatcggcggcgttccctacgtattaaca
tcaggtggaaatggttcttttacaaatattaatacaggcggagtttcaaatagtaaagct
ttaagaaaagatggctcaggtggagatacttttactttaaaaagacaagatggtcagccc
tttcaattctacggaatatgggtacaacaccaaagtatgaattcttattcacaattttat
actttgcctccatggtatacattaactacttctggtcaagatagttttacatatcaagat
atgacagctatgacagctggtacaaatacatcaagttctaaaactattgatgcaggtgta
aatggtgtaacagttacttcggtacaaatttcatttcaagccattttatattataaagta
gataatattaaagttggtccagtagttattgcatgtacaccacctgtttttagtttaaat
cctagtaatgtaagtacatgtgatggaagttctgtaactttaaatgcagcagcaactggt
gcaacagcttacgaatggcaagttaacacaggttctggttacacaactatttcaaacggt
gggccttattctaatgctacaacagctaatttaaccatatcagctgtatcaacagctatg
agtggctatacgtacagatgtgttgcaataaacggagttaatacttgttttgctaactca
actgatgcaactttaactgtagctaattttccaacaattacacaatctcaaatgaatgtg
tggtgtaatggtggctcaaatggttccgcaaccgtttccttaattgggggaacaggaact
tatgcatatagttggtcgccttcaggcggaaatgcttcaacagcaacaggtttagtggca
ggtaattattcggttacaatttcagatggaacttgttctgttattaaaaattttacaata
caacaaccatcagcaattaatggaacaacttcggttacaaacgtatcttgttttggtggt
tcaaacggtagcatagatttaactccaacaggtggtacgcctccttatacttttaattgg
ggtggcggtattactactgaagacagaacaggattaacagcaggtgcttattctgtaata
ataacagatgcaaatgtatgttcaaaaactgtaaatgtaactgtaaatcaaccaacaaac
ggagtagatggatctgcagtagttacaaatatttcatgtacgggtggattaacaggtgca
attgatctgacaccaatgggtggaaccccaccttattcttatgattggggtggaggtatt
acaactgaagatagaacaggtttagcagcaggtaattattctgttgtaatcaccgatgca
aatagttgtacaaaaacaattaatgcaaccgtaggtttatctgtacctgtttcgggtaca
actgcaataacgaatgtatcttgttttggtggatcaaacggagctataaatttaactcca
actggtggtacagctccatatacttttaattggggtggtggaataactaccgaggataga
actggtttagccgctggtaattattctgtaattattaccgatgcaaacggttgttcggaa
actattaatgctactgtaagtcaacctacatctttagtgaatggaaccacagttgttaca
aatgtttcttgtaatggtggagttaatggagcaattaatttaactcctactggtggaacc
gctccttatacttttgattggggaggtggaataactactgaagatagaacaggattagcg
gcaggtgcatattcggtaacaattaccgacgcaaatggttgtactaaaacgttaaatgta
acagtgatgcagcctacagcaattaatgcttcaacagttgtaacaaatgtttcttgtaat
ggaggaacaaacggagctataaatttaactccaactggtggaacagctccttatactttt
aattggggtggcggtattactaccgaagatagatcaggtttagtagcaggtaattattct
gtaattattaccgatggaaatggttgtactaaaacggtaaatgttacagttacacaacca
actacaataattttacaaactagtcaagatgttcctgcaacatgtgcaaattccgcagac
ggtgtagctacagttaatgttactggtggtgtttcaccttatacttataattggtcaaat
ggcgcaaatactgcgactgcaactggtttggcagccggaacttattcagttattgtaaca
gattttaatggatgttctcaaaatacatctatagttatatcttttgtcgataccactgct
cctgtgttagatatgccagtgttaccaacaattactaaagaatgtgcagtagtagctgga
gatattgttgcgccaacggctactgataattgtgcaggttctattactgcaacaacaata
gatccattaacctatgcacaacaaggtacctatactattacttggttatatgatgatgga
aatggaaatagaacaactcaaactcaaacagtagtaattgatgatgttacagcaccagtt
acaaatatgaatgtattacctacaatcacaaaagaatgtgctgttgtaacgggcgatatt
gttgcacctacagcaactgataattgtgtaggtacattaacagcaacaactacagatccg
ttaacatatacccaacaaggtacatacactattacttgggtatataatgatggaaatgga
aatacaaccacacaaaatcaaacagtagtagttgatgatgttacagcaccagttccaaac
atgactgtattaccaacaatcacaaaagaatgtgcagttgtaacgggcgatattgttgca
cctacagcaactgataattgtgtaggtacattaactgcaacaactacagatgcgttaaca
tatacgcaacaaggtacttatactattacttggttgtttaatgatggaaatggaaataca
actacacaaactcaaactgtagtggttgatgacgttacagcaccagttccaaacatgact
gtattaccaacaatcacaaaagaatgtgctgttgtaacgggcgatattgttgcaccaaca
gcaactgataattgtgtaggtacattaacagcaacaactacagatccgttaacatatacg
caacaaggtacttatactattacttggttatataatgatggaaatggaaatacaaccaca
caaactcaaacagtagtggttgatgacgttacagcaccagttccaaacatgactgtatta
ccaacaatcacaaaagaatgtgctgttgtaacgggcgatattgttgcgccaacagcaact
gataattgtgtaggtacattaacagcaacaactacagatgcgttaacatatacgcaacaa
ggtacatatactattacttggttgtttaatgatggaaatggaaatacaactacacaaact
caaacagtagtagttgatgatgttacagcaccagttccaaacatgactgtattaccaaca
attacaagagaatgtgctgttgttacagctgatattattgcaccaacagcaactgataat
tgcgcaggtacattaacagcaacaactaacgatccgttaaattatactcaacaaggtact
tacactattacttggttgttcaacgatgggaatggaaatacaactacgcaaatacaaaca
atagtggtagaggtttctcctttagatgtggtaacatttgataatttaactaccgtttat
aatggttctgcacacgaaatacaagtaaataatttacctgcgggtgcttcggtttcttat
actatatcaccagattcaggtttaaacaacgctgccataaatgcaggtacttatgtagta
acagcagttgttacaccaccagctacagcagtaaattgtacaagtagaacaattgttgcc
gatttaattattgaaaaagcatcgcaaagtataactttcaacaacttagatgtattgatg
ttagaaaatgcagcagattttcaattaacagctacagctagttcgcaattgccggttagt
tatacctatacatatgcacaaagcactcctgcggctactgtaactcctgaaggttgggta
actttggttcattcaggatcaatcttaattacagcgcatcaagatggtaacgaaaacttt
ttaccagcagcaactgtaagtagagaattggttattgaaagtgaagatgcatcaattcaa
caaatcgtagtaaatggtcaggtttatactaatccagaatcaacaatttatgtaatgcaa
gattgtgaaaatttactaaacaatgttgaggttgaaattgaagctgaatttggttcacaa
gtaactcctgctcgcgaattttttattcaaacaccaaaacctggtgtttataaggaaact
gtaaaagttgtttcgcaaaatggtgctaatcaagaaatctataatgttattgttgagcgt
ccgtttgtgtttgaagatattgtaattcaaaaattcgataacacattattagtaaacaac
aatccaaaaacaaatggtggttataagtttgtagcttacaaatggtatagaaatgatgtt
ctaattggtaccgaacaagtttattctgttggtagtactttaaatgatcagttagatgaa
aacgttgaatacagcgttactgttacaacagacgatggtcaggaaattcatacatgtcct
tcaactgttacaagagtacacgatttaagtatgaaagtataccctaatcctgtacaaaca
aacagcacatttacaattgattttggtaccccatcaaaatcttacgaaggtacaactgct
tctatctttacaaccgatggtaaattattatttacaactcaaattgtaaataataacacg
gcaattacattgcctagtacaattgcagcaggtatgtatatgttggttgttgaaaacaac
gaaaaacagtttaaagaagtagttaaaatagttgttaaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
