KEGG   Metamycoplasma cloacale: DK849_00390
Entry
DK849_00390       CDS       T06147                                 
Name
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mclo  Metamycoplasma cloacale
Pathway
mclo03030  DNA replication
mclo03430  Mismatch repair
mclo03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mclo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    DK849_00390
   03430 Mismatch repair
    DK849_00390
   03440 Homologous recombination
    DK849_00390
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mclo03032]
    DK849_00390
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mclo03400]
    DK849_00390
Enzymes [BR:mclo01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     DK849_00390
DNA replication proteins [BR:mclo03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     DK849_00390
DNA repair and recombination proteins [BR:mclo03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     DK849_00390
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 HHH_3 DNA_pol3_a_NI RNase_H_2 T2SSK Auto_anti-p27 zf_DPOE_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AWX42547
UniProt: A0A2Z4LMS8
LinkDB
Position
88447..92778
AA seq 1443 aa
MASEYRQSLLKLAKNLNFELDSEWKDVEVAFVLDSETKTYHMQFTLDNLISFHKFDAFKK
TIEKKLGKPIECQLEVRSSIRDKGLILDYLIYLLQKYRHPLCKFRSFLTKDNVELTETEF
ILTINIKEVFDQFLKYRDDIQTLLEQLGYSFYTVNLKLNESKANKRSTIENIVKNFDTLK
INRKEVELENTNTHRRFNNNNNKGKAIEMSISDALLSYEPLVSLKGEIFKTDVRNLKNNN
LLYTVGISDYKEAIMLKMFVSSEAEQPNFVIGKTIVVTGRLVDDQYSGKKMLEVRKVSDI
IFTEDLQQLSNDNEEEKRIELAARTHMSTQDGISTPKEYLKAAEHYGHEAIAIVDYEGVQ
GFPEFYNTAKKNKKVKPIFGVTLNAIDSRNNFFLNFRNQDFELANETYVVFDIETTGLSA
RFNEIIEFGAVVIQNGAIIEKQQFFLKPSKPIPAKIVELTKIDDNIVNEFGIEYNEGVQR
IYNILKDKISVAHNANFDIGVCKENFKKLGLDTSRITAIDTLAVAHYLFPEFYKFKLGTV
AKKFNVLYDSEIAHRADYDAEILAKVWKAMILKLSRQNNINTSIELNDVYDEQMFNKKMS
YEIRILAKNQSGLKKMFKHISTALTNQYYGHAILFLDKLKTDPDIYIGSSTHRSYLWDKV
IYGDTESIDKAIAPYDYIELPPISTFNYLLYDESLTEENIKFAYKDLIKRAKEQNKILVA
VSDSRFVYDYQKLIHSIYMVAPQLGNTQHWLHKYVRHNPPVFKYLTTKEMLDEFSFLNDA
NLIKEIVIKNPKMISDSIDSNIEVIKNKLYVPTFDDSANKLRDLVYKNAHQRYGQNIDPI
IQARIEKELNPIIKYGYSVIYWISHKLVKKSNDDGYLVGSRGSVGSSIVANLANISEVNP
LDPHWLCNQCKYLEWNKDKNFHSGWDLPDKICPNCQTIMIKDGHSIPFETFLGFEANKVP
DIDLNFSGEYQPIIHNYTKELFGDSHTLRAGTISTVASKTAYGFCQGFDEKIHPIGSRLG
WSKTFLDFLSTKTEGVKRTTGQHPGGIIIIPTEFEVEDFTPINYPANDTKSSWKTTHFDF
TSIHDNVLKLDLLGHDDPTVIKMLEELTNTNAIKDIPKTDDNVLKLFSTTESLGIDPSQI
SGETTGAYGLPEFGTQFVRRMLKTAQPKSFNDLILMSGLSHGTDVWNNNAEELIKSGKSI
NECVCCRDDIMLNLMAWEVDSIDAFNIMEKVRKGKGLTEDEEKLLTSKQVPSWYIESLKK
IKYMFPKAHATAYVIMAWRIAWYKLYYPLAFYASYYSTRPDAIDIKVMSGGKSVVTAKLN
ELKNKMTQNLEMTTKEKDLIPMLEITQELYARGLMIKNIDLLKSKATQWIVDEEHKALIP
PLAVVDGLGATVAETIVKAREESPFLSIEDLMERTKLNSRLLNELRNLGVIDNLEETNQN
ELF
NT seq 4332 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcgagcgaatatagacaaagcttattaaaattagcaaaaaatttaaattttgaatta
gattctgaatgaaaagatgtagaagttgcatttgttttagatagtgaaactaaaacttac
catatgcaatttacattggataatctaatttcctttcataaatttgatgcttttaagaaa
acaatagaaaagaaattaggtaaacctattgaatgtcaattggaagttcgttcatctatt
cgtgacaaaggattaattttagattatttaatttatttattacaaaaatatagacatcct
ctttgtaaatttagaagcttcttaacaaaagataacgtcgaattaactgaaactgaattt
attttaactattaatatcaaagaagtttttgatcaatttttaaaatatagagacgatata
caaactttattagaacaattaggttattcattttataccgttaatttaaaactaaatgaa
tcaaaagcgaataaacgttctactattgagaatattgttaagaattttgacactttaaag
attaatcgaaaagaagttgaattggagaacacaaatactcatcgtcgttttaataataat
aacaataaaggtaaagcgattgaaatgagtatttcggatgcgcttttatcatacgaacca
ttagtttcgcttaaaggagaaatttttaaaaccgatgttcgtaatttaaaaaacaataat
ttgttatatacagtaggtatttctgattataaagaagcaattatgctaaaaatgtttgtt
tcaagcgaagcagaacaacctaattttgtaattggaaaaacaattgttgtaactggaaga
ttagttgatgatcaatattctggtaaaaaaatgttagaagtaagaaaagtatctgacatt
atttttacagaagatttacaacaattaagcaatgataatgaagaagaaaaaagaattgaa
ctagcagctagaacgcatatgtccacacaagatgggatttccacacccaaagaatatcta
aaagctgccgaacattacggtcatgaagcaatagcgattgttgactatgagggtgttcaa
ggctttcctgaattttataataccgctaaaaagaataaaaaagttaaacctatttttggt
gtaactttaaatgcaattgatagtagaaacaatttctttttaaactttagaaatcaagat
tttgaattagcgaatgaaacatatgttgtatttgatattgaaacaaccggactatcggct
cgttttaatgaaattattgagtttggtgctgttgtgattcaaaatggtgcaattattgaa
aaacaacaattctttttaaagccttcaaaacctattccggcaaaaatcgttgaattaacc
aaaattgacgacaatatagttaatgaatttggtatagaatataacgaaggggttcaacgt
atttataacattttaaaagataaaatttcagttgcccacaatgctaatttcgatatcggt
gtatgtaaagaaaactttaaaaaattaggtttagatacttcaagaatcacagcgattgat
acccttgcagttgctcattatttattccctgaattttataaatttaaactaggaactgtt
gcaaagaaattcaatgttttatatgattcagaaattgcccatagagctgattatgatgct
gagatattagctaaagtctgaaaagcgatgattttaaaactatctagacaaaataacatt
aatacttcaattgagttaaacgacgtttatgatgaacagatgtttaataaaaaaatgtca
tatgaaattagaattttagctaaaaaccaaagcggtttaaagaaaatgtttaaacatatt
tctacagctttaaccaatcaatattatggacatgcaatattatttttagataaattaaaa
acagatccagatatatacatcggttcatcaacacaccgttcttatttatgggataaagta
atttatggtgatactgaatcaattgataaagcaattgctccatatgattacattgaatta
ccaccaatttctacctttaattatttattgtatgatgaatcattaactgaagagaatatt
aaatttgcttacaaagatttaattaaaagagctaaagaacaaaataaaattcttgttgct
gtttctgattccagatttgtctatgattatcaaaaattaattcattcaatctatatggtg
gcacctcaattgggtaatactcaacactgattacataaatatgttcgtcataatccccct
gtttttaaatatctaacaacaaaagaaatgttggatgaatttagttttttaaatgatgct
aatttaattaaagaaattgttattaaaaaccccaaaatgatttctgattcaattgatagc
aacattgaggttattaagaataaattatatgttccgacttttgatgattcagctaataaa
ttaagagatttagtttataaaaatgcacatcaaagatatggtcaaaatattgatccaatt
attcaagcaagaattgagaaagaattaaaccctattattaaatatggttattcagtaatt
tattgaattagtcataaattagttaagaaaagtaatgacgatggttatttagttggtagt
cgtggttcggttggtagctcaattgttgctaacctagcaaatatttcagaagtaaaccct
cttgatccacattgattatgtaatcaatgtaaatatctagaatggaataaggataaaaat
ttccattcgggttgagatctaccggataagatatgtccaaattgtcaaactataatgatt
aaagatggtcatagtattccatttgaaactttccttggatttgaagcaaataaagtccct
gatatagatttaaacttttctggtgaatatcaaccaattattcacaattacacaaaagaa
ttattcggagatagtcatacattaagagcgggaacaatttctactgttgcctctaaaact
gcatatggtttctgtcaaggatttgatgaaaaaattcacccaattggctcacgtttggga
tgatctaaaacatttttagatttcctatctacaaaaacagaaggtgttaaaagaacaaca
ggtcaacaccctggtggaattataattattccaactgaatttgaagttgaagatttcacc
ccaataaactacccagctaacgatacaaaaagcagttgaaaaacaacacattttgacttc
acctctattcatgataacgtattgaaattagatctgttaggtcatgatgatccgactgtt
attaaaatgttagaagaattaacaaacactaacgcaatcaaagatattcccaaaacagat
gataacgtattgaaattattctcaacaactgaatcattaggtattgatccatcgcagata
tcgggtgaaactacaggagcatatgggttgcctgaatttggtactcaattcgttcgtaga
atgttaaaaacagcgcaacctaaatcgtttaacgatttaattttaatgtcaggattaagc
cacggaactgatgtgtgaaacaataacgcagaggaattaattaaaagtggaaaatctatt
aacgaatgtgtttgttgtcgtgatgacattatgctaaacttaatggcttgagaagtagat
tcaattgatgctttcaatattatggaaaaagttagaaaaggaaaaggtttaaccgaagat
gaagaaaaacttttaaccagcaaacaagttcctagttgatatatcgaatctttaaagaaa
attaaatatatgtttcccaaagcgcacgctactgcttatgttattatggcttgaagaatt
gcgtgatataaactatattatcctttagctttctatgcttcatattattcaactcgccca
gatgcaattgatattaaagtcatgagtggtgggaaaagtgtcgtaacagctaaattgaat
gaattaaaaaacaaaatgactcaaaatcttgaaatgacaactaaagaaaaagatttaatt
ccgatgttagaaattacacaagaattatacgcacgtggattaatgattaaaaacattgat
ttattaaaatcaaaagcaactcaatgaatcgttgatgaagaacataaagcattgattccg
ccgttagctgttgttgatggtttgggtgcaactgtggctgaaactattgttaaagccaga
gaagaatcgccatttctttcaattgaggatttaatggaaagaactaagttaaattctaga
cttttaaatgaattaagaaatctaggtgttattgataatttagaagaaaccaaccaaaat
gaattattttag

DBGET integrated database retrieval system