Metamycoplasma cloacale: DK849_00390
Help
Entry
DK849_00390 CDS
T06147
Name
(GenBank) PolC-type DNA polymerase III
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mclo
Metamycoplasma cloacale
Pathway
mclo03030
DNA replication
mclo03430
Mismatch repair
mclo03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mclo00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
DK849_00390
03430 Mismatch repair
DK849_00390
03440 Homologous recombination
DK849_00390
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mclo03032
]
DK849_00390
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mclo03400
]
DK849_00390
Enzymes [BR:
mclo01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
DK849_00390
DNA replication proteins [BR:
mclo03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
DK849_00390
DNA repair and recombination proteins [BR:
mclo03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
DK849_00390
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
HHH_3
DNA_pol3_a_NI
RNase_H_2
T2SSK
Auto_anti-p27
zf_DPOE_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWX42547
UniProt:
A0A2Z4LMS8
LinkDB
All DBs
Position
88447..92778
Genome browser
AA seq
1443 aa
AA seq
DB search
MASEYRQSLLKLAKNLNFELDSEWKDVEVAFVLDSETKTYHMQFTLDNLISFHKFDAFKK
TIEKKLGKPIECQLEVRSSIRDKGLILDYLIYLLQKYRHPLCKFRSFLTKDNVELTETEF
ILTINIKEVFDQFLKYRDDIQTLLEQLGYSFYTVNLKLNESKANKRSTIENIVKNFDTLK
INRKEVELENTNTHRRFNNNNNKGKAIEMSISDALLSYEPLVSLKGEIFKTDVRNLKNNN
LLYTVGISDYKEAIMLKMFVSSEAEQPNFVIGKTIVVTGRLVDDQYSGKKMLEVRKVSDI
IFTEDLQQLSNDNEEEKRIELAARTHMSTQDGISTPKEYLKAAEHYGHEAIAIVDYEGVQ
GFPEFYNTAKKNKKVKPIFGVTLNAIDSRNNFFLNFRNQDFELANETYVVFDIETTGLSA
RFNEIIEFGAVVIQNGAIIEKQQFFLKPSKPIPAKIVELTKIDDNIVNEFGIEYNEGVQR
IYNILKDKISVAHNANFDIGVCKENFKKLGLDTSRITAIDTLAVAHYLFPEFYKFKLGTV
AKKFNVLYDSEIAHRADYDAEILAKVWKAMILKLSRQNNINTSIELNDVYDEQMFNKKMS
YEIRILAKNQSGLKKMFKHISTALTNQYYGHAILFLDKLKTDPDIYIGSSTHRSYLWDKV
IYGDTESIDKAIAPYDYIELPPISTFNYLLYDESLTEENIKFAYKDLIKRAKEQNKILVA
VSDSRFVYDYQKLIHSIYMVAPQLGNTQHWLHKYVRHNPPVFKYLTTKEMLDEFSFLNDA
NLIKEIVIKNPKMISDSIDSNIEVIKNKLYVPTFDDSANKLRDLVYKNAHQRYGQNIDPI
IQARIEKELNPIIKYGYSVIYWISHKLVKKSNDDGYLVGSRGSVGSSIVANLANISEVNP
LDPHWLCNQCKYLEWNKDKNFHSGWDLPDKICPNCQTIMIKDGHSIPFETFLGFEANKVP
DIDLNFSGEYQPIIHNYTKELFGDSHTLRAGTISTVASKTAYGFCQGFDEKIHPIGSRLG
WSKTFLDFLSTKTEGVKRTTGQHPGGIIIIPTEFEVEDFTPINYPANDTKSSWKTTHFDF
TSIHDNVLKLDLLGHDDPTVIKMLEELTNTNAIKDIPKTDDNVLKLFSTTESLGIDPSQI
SGETTGAYGLPEFGTQFVRRMLKTAQPKSFNDLILMSGLSHGTDVWNNNAEELIKSGKSI
NECVCCRDDIMLNLMAWEVDSIDAFNIMEKVRKGKGLTEDEEKLLTSKQVPSWYIESLKK
IKYMFPKAHATAYVIMAWRIAWYKLYYPLAFYASYYSTRPDAIDIKVMSGGKSVVTAKLN
ELKNKMTQNLEMTTKEKDLIPMLEITQELYARGLMIKNIDLLKSKATQWIVDEEHKALIP
PLAVVDGLGATVAETIVKAREESPFLSIEDLMERTKLNSRLLNELRNLGVIDNLEETNQN
ELF
NT seq
4332 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgagcgaatatagacaaagcttattaaaattagcaaaaaatttaaattttgaatta
gattctgaatgaaaagatgtagaagttgcatttgttttagatagtgaaactaaaacttac
catatgcaatttacattggataatctaatttcctttcataaatttgatgcttttaagaaa
acaatagaaaagaaattaggtaaacctattgaatgtcaattggaagttcgttcatctatt
cgtgacaaaggattaattttagattatttaatttatttattacaaaaatatagacatcct
ctttgtaaatttagaagcttcttaacaaaagataacgtcgaattaactgaaactgaattt
attttaactattaatatcaaagaagtttttgatcaatttttaaaatatagagacgatata
caaactttattagaacaattaggttattcattttataccgttaatttaaaactaaatgaa
tcaaaagcgaataaacgttctactattgagaatattgttaagaattttgacactttaaag
attaatcgaaaagaagttgaattggagaacacaaatactcatcgtcgttttaataataat
aacaataaaggtaaagcgattgaaatgagtatttcggatgcgcttttatcatacgaacca
ttagtttcgcttaaaggagaaatttttaaaaccgatgttcgtaatttaaaaaacaataat
ttgttatatacagtaggtatttctgattataaagaagcaattatgctaaaaatgtttgtt
tcaagcgaagcagaacaacctaattttgtaattggaaaaacaattgttgtaactggaaga
ttagttgatgatcaatattctggtaaaaaaatgttagaagtaagaaaagtatctgacatt
atttttacagaagatttacaacaattaagcaatgataatgaagaagaaaaaagaattgaa
ctagcagctagaacgcatatgtccacacaagatgggatttccacacccaaagaatatcta
aaagctgccgaacattacggtcatgaagcaatagcgattgttgactatgagggtgttcaa
ggctttcctgaattttataataccgctaaaaagaataaaaaagttaaacctatttttggt
gtaactttaaatgcaattgatagtagaaacaatttctttttaaactttagaaatcaagat
tttgaattagcgaatgaaacatatgttgtatttgatattgaaacaaccggactatcggct
cgttttaatgaaattattgagtttggtgctgttgtgattcaaaatggtgcaattattgaa
aaacaacaattctttttaaagccttcaaaacctattccggcaaaaatcgttgaattaacc
aaaattgacgacaatatagttaatgaatttggtatagaatataacgaaggggttcaacgt
atttataacattttaaaagataaaatttcagttgcccacaatgctaatttcgatatcggt
gtatgtaaagaaaactttaaaaaattaggtttagatacttcaagaatcacagcgattgat
acccttgcagttgctcattatttattccctgaattttataaatttaaactaggaactgtt
gcaaagaaattcaatgttttatatgattcagaaattgcccatagagctgattatgatgct
gagatattagctaaagtctgaaaagcgatgattttaaaactatctagacaaaataacatt
aatacttcaattgagttaaacgacgtttatgatgaacagatgtttaataaaaaaatgtca
tatgaaattagaattttagctaaaaaccaaagcggtttaaagaaaatgtttaaacatatt
tctacagctttaaccaatcaatattatggacatgcaatattatttttagataaattaaaa
acagatccagatatatacatcggttcatcaacacaccgttcttatttatgggataaagta
atttatggtgatactgaatcaattgataaagcaattgctccatatgattacattgaatta
ccaccaatttctacctttaattatttattgtatgatgaatcattaactgaagagaatatt
aaatttgcttacaaagatttaattaaaagagctaaagaacaaaataaaattcttgttgct
gtttctgattccagatttgtctatgattatcaaaaattaattcattcaatctatatggtg
gcacctcaattgggtaatactcaacactgattacataaatatgttcgtcataatccccct
gtttttaaatatctaacaacaaaagaaatgttggatgaatttagttttttaaatgatgct
aatttaattaaagaaattgttattaaaaaccccaaaatgatttctgattcaattgatagc
aacattgaggttattaagaataaattatatgttccgacttttgatgattcagctaataaa
ttaagagatttagtttataaaaatgcacatcaaagatatggtcaaaatattgatccaatt
attcaagcaagaattgagaaagaattaaaccctattattaaatatggttattcagtaatt
tattgaattagtcataaattagttaagaaaagtaatgacgatggttatttagttggtagt
cgtggttcggttggtagctcaattgttgctaacctagcaaatatttcagaagtaaaccct
cttgatccacattgattatgtaatcaatgtaaatatctagaatggaataaggataaaaat
ttccattcgggttgagatctaccggataagatatgtccaaattgtcaaactataatgatt
aaagatggtcatagtattccatttgaaactttccttggatttgaagcaaataaagtccct
gatatagatttaaacttttctggtgaatatcaaccaattattcacaattacacaaaagaa
ttattcggagatagtcatacattaagagcgggaacaatttctactgttgcctctaaaact
gcatatggtttctgtcaaggatttgatgaaaaaattcacccaattggctcacgtttggga
tgatctaaaacatttttagatttcctatctacaaaaacagaaggtgttaaaagaacaaca
ggtcaacaccctggtggaattataattattccaactgaatttgaagttgaagatttcacc
ccaataaactacccagctaacgatacaaaaagcagttgaaaaacaacacattttgacttc
acctctattcatgataacgtattgaaattagatctgttaggtcatgatgatccgactgtt
attaaaatgttagaagaattaacaaacactaacgcaatcaaagatattcccaaaacagat
gataacgtattgaaattattctcaacaactgaatcattaggtattgatccatcgcagata
tcgggtgaaactacaggagcatatgggttgcctgaatttggtactcaattcgttcgtaga
atgttaaaaacagcgcaacctaaatcgtttaacgatttaattttaatgtcaggattaagc
cacggaactgatgtgtgaaacaataacgcagaggaattaattaaaagtggaaaatctatt
aacgaatgtgtttgttgtcgtgatgacattatgctaaacttaatggcttgagaagtagat
tcaattgatgctttcaatattatggaaaaagttagaaaaggaaaaggtttaaccgaagat
gaagaaaaacttttaaccagcaaacaagttcctagttgatatatcgaatctttaaagaaa
attaaatatatgtttcccaaagcgcacgctactgcttatgttattatggcttgaagaatt
gcgtgatataaactatattatcctttagctttctatgcttcatattattcaactcgccca
gatgcaattgatattaaagtcatgagtggtgggaaaagtgtcgtaacagctaaattgaat
gaattaaaaaacaaaatgactcaaaatcttgaaatgacaactaaagaaaaagatttaatt
ccgatgttagaaattacacaagaattatacgcacgtggattaatgattaaaaacattgat
ttattaaaatcaaaagcaactcaatgaatcgttgatgaagaacataaagcattgattccg
ccgttagctgttgttgatggtttgggtgcaactgtggctgaaactattgttaaagccaga
gaagaatcgccatttctttcaattgaggatttaatggaaagaactaagttaaattctaga
cttttaaatgaattaagaaatctaggtgttattgataatttagaagaaaccaaccaaaat
gaattattttag
DBGET
integrated database retrieval system