Mesomycoplasma conjunctivae: MCJ_007160
Help
Entry
MCJ_007160 CDS
T00919
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mco
Mesomycoplasma conjunctivae
Pathway
mco03030
DNA replication
mco03430
Mismatch repair
mco03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mco00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MCJ_007160 (polC)
03430 Mismatch repair
MCJ_007160 (polC)
03440 Homologous recombination
MCJ_007160 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mco03032
]
MCJ_007160 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mco03400
]
MCJ_007160 (polC)
Enzymes [BR:
mco01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MCJ_007160 (polC)
DNA replication proteins [BR:
mco03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MCJ_007160 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mco03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MCJ_007160 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
RNase_H_2
DNA_pol_A_exo1
HHH_3
HTH_19
DEDDh_C
YhfH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAT05400
UniProt:
C5J7D7
LinkDB
All DBs
Position
complement(818592..822959)
Genome browser
AA seq
1455 aa
AA seq
DB search
MDKKFKKLCDFIGWSVPYDWDDVTIEKDPNPSELMNIRIFKTSLPKAKSTYDLLQNVQKF
NTGFPEKYSFKLNLDLKIEQPDFKDEEFLDYANLIAQLVFKQANFFTNLEFIRNNIDEFT
VLFLNKETFQLVLKNEDKFFKIAKKLGIPQLKINFLYDDRLENQISIDELNARQKSLIRP
LDSPKITKKKASSKPLKEYEFIDLKDIRSHLQPSVWFYAQVYKINSIKTKKNTFFNQIFV
NDANYTEAVKFSFASKNENLDFVVGDYLKVWADILKPENPFKDNVDISLRKLEKVKRPES
FGLPRIDNAKKKRVELTARTSKSTMDGISSPKEYVEAAEQMGFTAIGIADSDSVQAFPDF
FNALKGKSIKGIYGSTFSTVSSKIHKVLNYKKNFDLKSARYVVFDLETTGLSPVYNEIIE
FGAVVIQDGIQTESHQFFVKAKEPIPTEITKITNITQEMVDEQGIEATEAFYRISKIIKD
SILVAHNAKFDFNFLAELFKKEASMTIDQPIIDTLQVSRFLNPSQKSHSLKNVSKLIGLY
YDETVAHRADYDAEILSKVWLNFLTQILDQDITDLKKLEYTSQSIFDLKPEKVFSKEFTI
IAKNQAGIKKLYQLVSLSNTDYLISKPLLFYDLLEKDENLLIGSGGPESILIDNLLFSTK
ENAEKFIPIFDFIELPPPEAFRHLIERNMFKKEHIFDLLKTLIAFGKKYKKPVVAIGDVR
YVEPKQKIFHELYIYAKRVGGGSHNLFDHREREDYKKSHIFPDKYLFTTEELINQFAFLE
DEKLIKEIVIKNSNLISDQIDNNIEIIKPGLYKPKFDNSEYKLKEFVYENAHKKYGKIIP
EKIEKRIKRELNPIIEHGFHVIYWISKSLVHEAKRQGAIVDSRGSVGSSIVAYLTGITDV
NPLEPHYLCLSCQNVEFSDDPDILCGYDLPEKKCSKCGHILNRDGQNIPFETFLGFEADK
VPDIDLNFSSDIQLKMHDYVRDLFGDKNTFRAGTILTNAEKTVYGLARKLSEVKASLDKR
FQSNQEISFFTTTFMDFLATKANGVKRTSGKHAGGIIVIPEEYDIEDFTPINYPANNEKS
GWKTTHFDYDSIHDNLLKLDILGHDDPKILLLLEEITGIKSETIPKSDPQIIELFYSTKP
LKIKPEQIGGELTGAIGLPEFGTPFVRKMLQNARVKSFADIVAICGLSHGKNVWQDNAEP
LIREQKLQIKDVISCRDDIMIYLIKQNLDPLTAFNIMERVRKGKGVDEEQEQLMIAKNVP
NWYIDSLKKIGYMFPKAHAAAYAMKAWKIAFFKLYYPLAFYSVFFTIRPDVKDIDSLTLP
HAEIDRKIKELRKKVNSSSTSVSAKEKDLIPFLEISLELKARGFEIEKINLEKSEAQQWI
INYENNSLIPPFSSLEGIGDINASNIVKARSEKAFISIEDFEQRTGTNSTAIKKLEEMGV
FKNISKKAQVSLFDF
NT seq
4368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaaaatttaaaaaactttgtgattttataggttgaagtgttccttatgattgg
gatgatgtgacaattgaaaaagatcctaacccatcagaattaatgaatattcgtattttt
aaaacaagcttgcctaaagcaaaaagtacttatgatttattgcaaaatgttcaaaaattt
aatacaggttttcctgaaaaatatagttttaaactcaaccttgatttaaaaatagaacaa
ccagattttaaagatgaagaatttttagactatgcaaatttaatagcacaacttgttttt
aaacaagctaatttttttactaatttagaatttattcgcaataatattgacgagttcaca
gttttatttttaaacaaagaaacttttcaacttgtgcttaaaaatgaagataagtttttc
aaaattgcaaaaaaattgggcattccacaattaaaaattaattttttatatgatgacagg
cttgaaaaccaaatcagtattgatgaattaaatgctaggcaaaaatcattgatcagacct
ttagattcaccaaaaataactaaaaagaaagcaagctcaaaaccactaaaagaatatgaa
tttatagacttaaaagatattcgtagtcacttacaaccttcagtttggttttacgcacaa
gtctataaaatcaactcaattaaaacaaaaaagaacactttttttaatcaaatttttgta
aatgatgctaactatacagaagcagttaaattttcatttgcatctaaaaatgaaaattta
gattttgttgttggtgattatttaaaagtttgagcagatattttaaaaccagaaaaccca
tttaaagataatgttgatatttctttaagaaaactagaaaaagttaagcgtccagaatct
tttggtctaccacgaattgacaatgctaaaaagaaaagagttgaattaacagcacgaact
tcaaaatccacaatggatggtatttcaagtcctaaagaatatgtcgaagccgctgagcaa
atgggctttactgcaatcggaattgccgactctgattctgtgcaggctttccccgatttt
ttcaacgcacttaaaggtaaatcaattaaaggtatttatggctctaccttttcaacagtg
agtagcaaaattcacaaggttctaaattataagaaaaattttgatttaaaatctgcaaga
tatgttgtcttcgaccttgaaacaactggtctttctcctgtttataacgagatcatcgaa
tttggtgctgttgtcattcaggacggaattcaaactgaatcacaccaattttttgtcaaa
gctaaagagcctattccaacagaaattaccaagataactaacataactcaagagatggtc
gatgagcaaggaatagaggcaactgaagctttttatagaatttctaaaattattaaagac
agtattttggtagcccataatgctaaatttgacttcaattttttagcagaattgtttaaa
aaagaagcaagtatgacaattgaccaaccaataattgatacattacaagtcagtcgcttt
ttgaatcctagtcaaaaatcacatagccttaaaaatgttagcaaacttattggtttgtat
tatgatgaaacagttgcacaccgcgctgactatgatgcggaaattttatcgaaagtttga
ctaaattttttaacacaaattttagatcaagatattacagatttaaaaaaacttgagtat
acaagtcaatcaatttttgatttaaaacctgaaaaagtttttagcaaggaatttacaatt
attgcaaaaaatcaagcaggaatcaaaaagttataccaattagtatcattatctaatact
gattatttgatttcaaagcctttacttttttatgatttgcttgaaaaagatgaaaattta
ctcattggctcaggtggcccagagtcaattttaattgataatcttttgttttctacaaaa
gaaaatgctgaaaaattcattccaatttttgactttatagagctaccaccacctgaagct
tttagacatttaatagagcgaaatatgtttaaaaaagaacacatttttgatcttttaaaa
actttaatagcttttggtaagaagtataaaaaaccagttgttgccatcggtgatgttcgt
tatgttgaaccaaaacaaaaaatttttcatgaattatatatttatgcaaaacgcgtcggt
ggtggttcacacaatctttttgatcatcgagagcgcgaagattataaaaaatcacatatt
ttcccagataaatacctttttacaacagaagaattgattaatcaattcgcctttcttgaa
gatgaaaaattaattaaagaaatagtgataaaaaattctaatttaatatctgatcaaatc
gataataatattgaaataattaaacctggtttatacaaacctaaatttgataattcagaa
tataaattaaaagaatttgtctatgaaaatgcacataaaaagtatggaaaaattattcct
gaaaaaattgaaaagcgtataaaacgtgagctaaatccaattattgagcacggttttcat
gtcatttattgaatttctaaaagtctagttcatgaagcaaaaagacaaggtgcaattgtt
gattctcgtggttctgtaggctcttcaattgtggcatatttgacaggtattactgatgtt
aatcctttagaaccgcattatttatgtcttagttgtcaaaatgtcgaattttcagatgac
cctgatattttatgtggttatgatctacctgaaaaaaaatgttcaaaatgtggtcacatt
ttaaaccgtgatggtcaaaacataccttttgaaacctttttaggttttgaagctgataaa
gttcctgatattgatcttaacttttcaagtgatattcaattaaaaatgcatgattatgta
agggatctttttggcgataaaaacacttttcgagccggaactattttgacaaatgcagaa
aaaacagtttatggattagcgcgaaaacttagtgaagtcaaagctagtttagataaaaga
tttcaatctaatcaagaaatatccttttttacaaccacttttatggatttcttagcaaca
aaagcaaatggggttaaaagaacaagtggaaaacacgctggtggtataattgtgattcct
gaagaatacgatatcgaagactttactccaataaattatccagccaataatgaaaaatct
ggttgaaaaacaacacattttgattatgattccattcatgataaccttttaaaattggat
attttaggtcatgatgatcctaaaatattgcttcttttagaagaaataacaggtataaaa
tctgagactattccaaaaagtgatccacaaattattgaactattttattctactaaacct
ttaaaaataaagccagaacaaattggtggggagttaactggggcaataggactacctgaa
tttggaaccccttttgttagaaaaatgcttcaaaatgcgcgagttaaaagtttcgctgac
attgttgcaatttgtggtctttcacatggtaaaaatgtttggcaagataatgcagaacct
ttaattcgcgaacaaaaattgcaaataaaagatgtaatatcttgtcgtgatgacataatg
atttacttaattaagcaaaatttagatccactaaccgctttcaatatcatggaaagagtg
cgaaaaggaaaaggggttgatgaagaacaagagcaattaatgattgccaaaaatgttcca
aattgatatattgattcgctgaaaaaaattggttatatgtttccaaaagctcatgccgcc
gcctatgcaatgaaagcctgaaaaatcgcttttttcaaactttattaccctctcgctttt
tattcagttttttttactatccgtccagatgtcaaagatatcgactcgttaacccttcca
catgccgaaatagatagaaaaataaaggaattacgtaaaaaagtaaactcttcttctacc
agtgttagtgctaaagaaaaagatttaattccttttttagaaattagtttagaattaaaa
gcgcgcggttttgaaattgaaaaaattaaccttgaaaaatcagaagctcagcaatgaatt
attaactatgaaaacaatagtttgattccaccattttcatctttggaaggcatcggggat
ataaatgctagcaatattgtcaaagctagaagcgaaaaagcttttatttctatagaagat
tttgagcaacgcactggcacaaattctaccgcaatcaaaaaattagaagaaatgggagtc
tttaaaaatatttcaaaaaaagcacaagttagcttatttgatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
