Mycoplasmopsis columbinasalis: NCTC10184_00426
Help
Entry
NCTC10184_00426 CDS
T07140
Name
(GenBank) Uncharacterised protein
Organism
mcob
Mycoplasmopsis columbinasalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Gon7
ExbD
Dev_Cell_Death
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU78197
UniProt:
A0A449BAK5
LinkDB
All DBs
Position
1:512765..522631
Genome browser
AA seq
3288 aa
AA seq
DB search
MSKLKFNFKTLVWPKYVISAGLLIAGVGTTIGGVFASASKSDQKLGKVNPVQGDALINRF
VSDIEKDVTTKFMSGDHLREVALYDTKEDKVIYTINGQETSADVDQFLLDYFETNRELPS
LNIAYGTFNFFNDYVEAVSPSEFFKFTQWFMKNVSWGPEIITLKNFSIVRGVDQNGSSII
LGSHKDTNKETTVIKFYPDAFFGSLPIYSTTAGKNNAVDSLTSLVNAQYLTSEELTHLLQ
NAKEINSAQNINQSNRFRTLNDYTELVGAKVYAVRLQNWTDEFEKQAFNDITKAELNLIK
QDFENDGFTYALLTHGQDEQEARKNLAAELKKYAEISGNFNFFKQIDPQTVQLDEKTIIS
VELPTFANLETDEFEQKYLKVWFQDGTTFNLFDLISSTKVKTTVGSRKVYVAKDFASFEK
INSAWEFADQRYKTLKTSFDTAEQLVQTKFGIPSEKLDELTAQFKKFLEAEGEDDPNADD
TMVVAENNHSKLAEKIRFLNLAEKIFFNFSKARSLFKLMQLRVEFAETDFVKTYETKFAE
YAAESFEDTAKFQEKVNFVLESNKFYTTWYNKLFAVLDPFVNNKRFVSVDQNNHFIYAVD
LGDLPNYLISLDTLRELSKQNALNWRDYANLNGFLRKKSSTSLFGAKNTTAAFYFYNNAQ
DQPLDSLKKSEQTDVLKVEESKTKLSELTAEIAQLQTQINQFNDDLTALTSTTSAYNLLK
DYLTNGTSTAVALPEGYKLPGEESFEAQASEQILDFLQNSFLTNGSESFLAAYVNLALNG
NQKAPDNSVARKGIETLYNEVQTKMTTTSASDLYSQIKNASKNELTTKIDVAKVELWKAQ
FLERSSYTYDAVFNLETLRENLRSIKTRLVNSLPTVEDYKNLRIQLETKKLEQTFTDSLI
KLANVIGDATGEEVVTKYNSLRAAFESKKTQFAAQVTAKIEAEINSLSAQKAAAFLQIQY
VQPTSEFGVFFAPNAQLAYTKFANHNVASTAEATELLTKSITYQQNAVVESAFANLKTAG
NRNVTGIDGGAIASYATIINQWIENANNKNFTSIFAGKKDGSGTSANLSEELKNVFADSS
NKLFEQVNEQTTYKDFILKYETIFLNNLQAIITNLQDPSTLTKLVTMNQQVSKKFAYWVA
TNPNLDSEPENSEKLVAYRYFLNTFKVYNTLMEELKSGALLNLFQSALANYKFVQTQLTA
QNSVNGFFSRFVALYSIGSQVLSFLQKDYALTLDNKDYWQVGQVAANQTSDTPWSVTEAT
THKPALLLNILTDIFNFDSSSKQSPADSEYKTATTTSAAVRLAHSAELFAKVVTDPDTFV
TGNDPKWENRLIPFSESQLIDFVLPAFLDTLDGLANAYTKFSPFVAYHSAADTKTSLETL
VAQNNAKVTQLYANDAAKTDFVQYLAQLNKITTSQATIDTIDAKLQTWLPTELPETAQQN
PESESLYNAFYAVIQAVQTDYQTNGSSGETFKEIFNLQAEFEALKNQDFAREFESLTTQV
SDKFTEMSRQTPAIQNYLLNYDNLMRTKLFLTEYKKVLTGNDNTKIESFKKIFNTYFSEQ
FNLFAQTKQAQLDAVGFNDFKHYGPDGNPIFDLGDTFSQTKIAEFGNAEATKLKQLLNLE
GNQAQSLIDAKLAEIETKLTNFFTDLTPFFAQKDEIINLVKQKEAAIETYSNALNDLYKK
ASELIFNSSVFSGSINQEASLFLTLVLGQLTEIKNTKLTLNSLKQEIAEFTVSVEKIKTE
FQAKLNEEGFNTEVYTNYLQNAFDAIYLATKPENASKFTRLDYTLYVWAGALVSGLIQAD
FAAANVATANSVEEAAEIAEKLKTNLSSQERTTLNNRLTELYNQDKDKLLKYYFYNALIS
NQSFVTANPAVNNSTFGTSYWYVANNKLLDENFEYDLKAKAAIFDDTGIGAWSDVFFTVL
PSKLVTYITEVANTYGQLQTKVQKLFGAVKNYQNLFTLLLNTNLTGFEIFTRPFSAVLRN
KAILEQKEDNLNKRAGQTLNFTAGNQWYYGTNQVTLLAKLKEAGVLTATNEDEVKAKIKH
VNLDKFAKNGTNLELILREVEPKTEEAYVEPGYTDGYKVISVDANAKMEVVAKVADLLRE
LGYNKVFSPYVVNESSFRINEQGEKEKLFEIFSEDYLLLLDTVREKFPYAAEWQTGAHLE
RSIDANGEMTYEVKDGAYLGWNMNSRVGLWSVLKATDPNFKSLAWDFLAFVGAHEYGHHI
TLNGASDLGDKGSKPILVSALQPGYPPNINSYQNAEMLKLYLQARSNINVDNSPLLEFNE
KGERVNEAGEYPRWQLPTFNSETGEIEYKTEDATDVFGTPDGVTDVRLAFNNDKRRFGQN
FESFAAALKARQEAYGLTTDELKKHLRISDLWLLNALDPYSGTLNPSKFDGVLKVLTPTT
DGKEVYLPALPENNNLNLKDRAGNLIEFVKDDKSGKRLPKVVEASDPYIPAGSRVAATDP
ETGWTKMTKFTKVILKNEFGEDALQLPLNVVLTDPAEIEYYNNIVIKAIKAIQAFYPSSP
QIGGWDRDHSNAKIDNKVELDFTQNWPINGIFNQALTKQISAASYALAAKSYFDLVVKRQ
PQDAADLSAISKLKWYTLRPNGRSDYSYYSYYDLDENNKVIPLANVSNYLKTKAVDLPNQ
NGYTKFLDDAAVQNLTFAQFLERIAKNIEFYADDFDATTPISSKPEIWNLGANTTVFTNL
YRLSSFYPEGRWNYQNGTAAFATWLDGQYVITNAGNARNIFEGAYLANLAALEKTFNFKV
PPVYKIATYLSDDILSKKHLTSPLQSLFAAFGQNESAQPAIFRLITADNKVAPLNAEGFK
QAAKIKIDTANLNLDKHNEMFQAFGSNQTFGAQTEFTDVATFLKFVKIDLTKAKLNTTKH
RVDWDIAYVATKYSQTRFEDGLRNWLDTAKLTKDEKAGFEAMLKEANATEKAQLLANEFM
KRFIASPLALVHTHYTLAQLLADPSKYWIFDANVGLDYLKLADFDVFATNNESVLRDQFN
IILEQYKTKMSEYTWNQEFNPQRDLTMHQLSFLDVMLTRSKITIAPPNQLTALKPLFEAN
NQSEIVWVLQGILEQFGGKIKDKPDAFIESLYYSKTYRDFNQLFSDYTWSWAETINRDNL
QITYAPVAKNFQNLPTALGGASESSLGVTYVINGEKAQTWNDRKVLYSSSAAAQASVKGA
LQDFYKTLATERQAYNYNYNQIKTPYKFVTDEDFSPQISKESSYFGKILTDNNGWYLDRW
YREITDFLLYDDNGNPVEDDTIRIKNLEGGQWLTVWTPTDSSIFKTKV
NT seq
9867 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaactaaaatttaatttcaaaaccctagtttgaccaaagtatgtcatatccgca
gggttgttaatagctggagtaggaacgacgataggtggagtttttgcttcagcttcaaaa
tcagatcaaaagttaggaaaggttaatccagttcaaggagatgctttaattaatcgcttt
gtttcagatattgaaaaagatgtgacaacaaaatttatgagtggtgaccacttacgagaa
gttgctctttacgatacaaaagaagacaaagttatttacacaatcaatggtcaagaaaca
agtgctgatgtagatcagtttcttcttgattattttgaaacaaaccgcgaattaccttct
ctcaatattgcatacggaacttttaatttcttcaatgattatgttgaagctgtttcacca
tctgaatttttcaaatttactcaatggtttatgaaaaatgtttcttgaggtccagaaatt
attacactgaaaaatttctcaattgtacgtggagttgaccaaaacggttctagcataatc
cttggttcacacaaagatactaacaaagagacaacagtaatcaaattttatcctgatgcc
ttttttggttctttaccaatttattcaactactgcaggaaaaaacaatgccgtagattct
ttaacttcacttgtaaatgcacaatatttaacttctgaagaactcacccacttacttcaa
aacgctaaagaaatcaatagtgcacaaaacataaatcaaagtaatagatttagaacttta
aacgattacactgaactagttggtgcaaaagtttatgctgttcgtttacaaaattgaaca
gatgaatttgaaaaacaagcattcaatgacatcactaaagctgaattaaacctcattaag
caagattttgaaaatgatggttttacatatgccttacttacgcatggacaagatgaacaa
gaagctcgcaaaaatttagctgctgagttgaaaaaatatgcagaaattagtggtaatttt
aatttcttcaaacaaattgatccacaaactgtgcaattagatgaaaaaactattatttca
gttgaattaccaacatttgcaaatcttgaaacggatgagtttgaacaaaaataccttaaa
gtttgattccaagatggaacaacatttaatttgtttgatttaatttcaagcaccaaagtt
aagacaacagtagggtctcgtaaggtttatgttgcgaaagattttgcttcatttgaaaaa
attaattctgcatgagaatttgctgaccaacgttataaaaccttaaaaacatcatttgac
actgctgagcaattagttcaaactaaatttggtattccgagtgaaaaattagatgaatta
acagcacagtttaagaaatttttagaagctgaaggtgaagacgatccaaacgctgatgac
acaatggttgtcgcagaaaacaaccattcaaaattagcggaaaaaattcgttttcttaac
ttggctgaaaaaattttcttcaatttcagtaaagcgcgttcactctttaaacttatgcaa
ttaagagttgaatttgctgaaacagattttgtaaaaacatacgaaactaaattcgcagaa
tatgctgctgaaagtttcgaggatacagctaaatttcaagaaaaggtaaattttgttctt
gaaagcaacaaattttacactacttgatataacaaactttttgcagtgctcgatccgttc
gtgaataacaaacgatttgttagtgttgaccagaacaatcactttatctatgctgtggac
ttaggtgatttacctaactatctaatttctttagatactttacgagaacttagcaaacaa
aacgctttaaactgaagagattatgcaaatctcaatggttttttacgcaaaaaaagttct
acttcgttatttggcgctaaaaataccacagctgcattctatttctataataatgctcaa
gaccaaccactggattcgttgaaaaaaagcgaacaaactgatgtacttaaagttgaagaa
tcgaaaacaaaactcagtgaacttacagcagaaattgctcaacttcaaactcaaatcaat
caatttaatgatgatctcactgctttaacctcaacaacatcagcttacaatttattaaaa
gattacttgactaacggtacttcaacagctgttgcgctcccagaaggttacaaattacct
ggtgaagagtcctttgaagcacaagcgagcgaacaaattctagattttctgcaaaattca
ttcttaaccaatggttctgaatcatttttagcagcttatgttaatttagcacttaatgga
aatcaaaaagctccagacaattcagtcgcacgtaaaggtattgaaactctttacaatgaa
gttcaaactaaaatgaccacaacttcagcaagtgatctttacagtcaaattaaaaatgca
agcaagaatgaacttacaacaaaaattgatgtggccaaagttgaactttgaaaagcacag
tttttagaaagatcttcttacacttatgatgcagtctttaatttagaaacattgagagaa
aacttgcgaagtatcaaaacgcgtttagttaattcattgccaactgttgaagactataaa
aacttaagaattcaacttgaaactaaaaaacttgagcaaactttcactgattcacttatt
aaattagcaaatgttattggtgatgcaaccggtgaagaagttgtgactaaatacaacagt
ttgcgcgctgcgtttgaaagcaaaaaaactcaatttgcagctcaagtgactgctaaaatt
gaagcagaaatcaattctttaagtgcacaaaaagctgctgctttcttacaaattcaatat
gtacaaccaactagtgaatttggtgtctttttcgcgccgaacgcacaattagcttacaca
aagtttgctaatcataatgttgctagtactgccgaggcaacagagttacttacaaaatct
atcacttaccaacaaaatgctgtagttgaatctgcttttgcaaatcttaagactgccggc
aatagaaatgttactggtattgatgggggtgcaattgcttcgtatgccacaatcatcaac
caatgaattgaaaatgcaaataataaaaactttacttcaattttcgctggtaaaaaagat
ggttcaggcacaagtgcaaatctaagcgaagagttgaaaaatgtttttgctgatagttca
aacaaattgtttgagcaagtgaatgaacaaactacatataaagatttcattcttaagtat
gaaactatttttcttaataatttgcaagctattatcacgaatttacaagatccttcaaca
ctcaccaagttagtaactatgaaccaacaagtaagcaaaaaatttgcttactgagttgca
actaacccaaaccttgacagtgagccagaaaattcagaaaaattggttgcatacagatat
ttccttaatacattcaaggtttacaacactttaatggaagagcttaaaagtggcgcctta
ttaaacttattccaaagtgctttggctaactataaatttgtacaaactcaacttacagca
caaaattctgtgaatggcttcttctctagatttgttgctctttacagtattggtagtcaa
gttttaagtttcttacaaaaagattatgcactcaccttggataataaagactactgacaa
gttggtcaagttgctgccaaccaaacaagtgacacaccatgaagtgttacagaagctaca
actcacaaacctgcgttattattaaacattcttactgatattttcaactttgattcaagt
tcaaaacaaagtcctgctgatagtgaatataaaactgcaactacaacttcagcagcagtt
cgtttagcacatagcgctgagttgtttgctaaagtggttacagatccagatacttttgtc
acaggcaatgatccaaaatgagaaaaccgcctcattccattttctgagtcacaacttatt
gattttgtgcttccagcatttttggatactttagacggtcttgctaatgcttatactaaa
ttcagtccttttgttgcttatcattctgcagctgatacgaaaacaagtttagagacttta
gtggcacaaaataatgcaaaagtaacacaactttatgctaatgatgctgcgaaaactgat
tttgtacaatatcttgcacaacttaacaaaattaccacaagccaagcaactattgacaca
attgatgctaaattgcaaacatggcttccaaccgaattaccagaaactgcgcaacaaaac
ccagagtctgaaagcctttataatgctttctacgcagttattcaagccgtacaaacagac
tatcaaactaatggttcttctggtgaaactttcaaagaaattttcaacttacaagcagaa
tttgaagcactcaaaaaccaagactttgcgcgtgaattcgaatcgttaactacgcaagta
agtgataaattcacggaaatgtcacgtcaaactccagcaattcaaaattatttattaaac
tacgacaacctaatgagaactaaattgttcttaacggaatacaaaaaagttttaactggt
aatgacaacacaaaaattgaatcgttcaaaaaaatatttaatacttactttagtgaacaa
tttaacttgtttgcacaaacaaaacaagctcaattagatgctgttggtttcaatgacttt
aaacactatggtcctgatggtaacccaatttttgacttgggtgatacttttagtcaaacc
aaaattgctgaatttggtaatgcagaagcaactaaacttaaacaattactcaatcttgaa
ggtaatcaagcgcaaagtttaattgacgctaaactagcagaaattgaaaccaaattgact
aacttctttactgatttaaccccattctttgctcaaaaggatgaaattattaacttagtt
aaacaaaaagaagcagcaattgaaacttattctaatgctttgaatgatttatacaaaaaa
gcttcagagttaatttttaatagttctgtttttagcggttcaattaaccaagaagcttca
ctcttcttaactttagtattaggacaacttaccgaaattaaaaacactaaattaaccctc
aattcgcttaaacaagaaattgctgaatttacagttagtgttgaaaaaattaaaactgaa
ttccaagctaaacttaacgaagaaggcttcaacacagaggtatacacaaattacttgcaa
aatgcttttgatgcgatttatcttgcaactaaaccggaaaacgcaagcaagtttacgcgt
ttagattacacactttatgtgtgagctggtgccttggtgagtggtttgattcaagcagac
tttgctgctgccaatgtggcaactgcaaattcagtagaagaagcggctgaaattgcggaa
aaactaaaaacaaacttaagttcccaagaacgcacaacactaaacaatcgtttgacagaa
ctttacaaccaagataaagacaaattacttaaatactacttctacaatgctttaattagt
aatcaaagtttcgtgactgccaatccagcagtgaataattctacttttggaacaagctat
tgatacgtagctaacaataaattgcttgacgaaaactttgagtacgatctcaaagctaaa
gctgccattttcgatgacacaggtattggcgcatgatcagatgtgtttttcactgttctg
ccttctaaattggtaacttatattactgaggtggcaaacacctacggacaattgcaaaca
aaagtacaaaaattgtttggtgcggtcaaaaattatcaaaacttatttaccttattatta
aatactaaccttactggttttgaaatctttactcgtcctttctcagcagtgttgcggaac
aaagctattttggaacaaaaagaagacaatttgaacaaacgtgccggtcaaactcttaac
tttactgctggcaaccagtgatactatggtacgaaccaagtaactttacttgctaaactt
aaagaagcaggtgtcttaactgctactaacgaagacgaagttaaagccaaaattaagcat
gttaaccttgataaatttgctaaaaacggtactaacttagaactcatcttacgtgaagtt
gaacctaagactgaagaagcttacgttgaaccaggttatactgatggttacaaagttatt
agtgttgatgctaacgccaaaatggaagttgttgccaaagtcgctgatttgcttcgcgaa
ttaggttataacaaagtcttttcaccttacgtggtcaacgaaagtagttttagaatcaat
gaacaaggtgaaaaagaaaaattgtttgaaattttttcagaagattacttgcttttactt
gatactgtccgtgaaaaattcccttacgcagctgagtgacaaactggcgcgcaccttgaa
cgtagtattgatgctaatggtgaaatgacttatgaagttaaagatggtgcgtacttaggc
tgaaacatgaattcacgtgttgggttatgaagtgtactcaaagccactgatcctaacttt
aaatcattagcttgagatttcttagcttttgttggcgctcacgaatatggtcaccacatt
acgcttaatggagctagtgacttaggagacaaaggtagcaaaccaattttagttagtgca
cttcaacctggctacccaccaaatatcaactcataccaaaatgcagagatgttgaagttg
tatttacaagcacggagcaacattaacgttgataatagtcctttacttgaatttaacgaa
aaaggtgaaagagttaatgaagctggtgaataccctcgttgacaattacctactttcaac
agcgaaactggcgaaattgaatacaaaactgaagatgctactgacgtttttggtacacca
gatggtgtgaccgatgtccgtcttgccttcaataacgacaaacgtcgttttggtcaaaat
ttcgaaagctttgccgctgctctcaaagcgcgtcaagaagcatatggtttaaccactgat
gaactcaaaaaacacttgcggatttcagacttatggttactcaacgctcttgacccttat
tcaggtacactcaacccaagtaaatttgatggagttctaaaagtcttaactccaactaca
gatggtaaggaagtttacctacctgccttgccagaaaacaacaacttgaaccttaaagat
cgtgctggtaatttgattgaatttgttaaagatgacaaatcaggtaaacgattaccaaaa
gttgttgaagctagtgatccttacattccagctggtagcagagtggcagctacagatcca
gagactggttgaaccaaaatgactaaatttaccaaagttattttgaaaaatgagtttggc
gaagacgccttacaactaccattgaatgtagtcttaactgatccagcagaaatcgaatac
tacaataatatagttatcaaggcaattaaggctatccaagcattctacccaagctcaccg
caaataggcggctgagatcgtgatcattcaaatgctaaaattgataacaaagttgaatta
gacttcactcaaaactgaccaattaatggtatttttaaccaagcactcacaaaacaaatt
tccgcagcttcatacgcgttagcggctaaatcttactttgatttagttgtcaaaagacaa
ccacaagatgctgctgatttaagtgctattagtaaattgaaatgatacacattaagacct
aatggaagatctgattattcatattattcatactacgatttagacgaaaataataaagtt
attccacttgctaatgtttctaattatttaaagaccaaggctgttgatctgccaaaccaa
aatgggtacactaaattcttagatgatgccgcggtacaaaacttaacttttgctcagttc
ttggaacgaatagctaaaaacattgaattttatgctgacgattttgatgccacgacgcct
atttcaagtaagccagaaatctgaaatcttggtgccaacaccactgtctttactaatctt
tatcgattaagcagtttctacccagaaggtagatgaaactatcaaaacggaacagctgct
tttgcaacttgactagatggtcagtatgttattactaatgccggcaatgctcgtaacatt
tttgagggagcttaccttgcgaatcttgcagcacttgaaaaaacttttaattttaaagtg
ccaccagtttacaaaattgcaacatatttaagtgatgacattttgagtaaaaaacatttg
acttcaccattgcaaagtttatttgctgcttttggccaaaatgagagtgcgcaaccagca
atctttagattaattacagctgacaacaaagtagctccacttaacgcagaaggctttaaa
caagcagccaaaattaaaattgatacagctaacttgaatttagataagcacaatgaaatg
ttccaagcttttggttcaaaccaaacttttggtgctcaaactgaatttactgatgtggct
acattcttaaaatttgtcaaaattgatctcaccaaagccaaacttaacacaactaaacac
agagttgactgagacattgcttatgtagcaactaagtacagtcaaacacgttttgaagat
ggtttacggaactgattagacactgcaaaactaactaaagacgaaaaagctggttttgaa
gcaatgcttaaagaagcaaacgcaacagaaaaagcacaattacttgcaaatgaatttatg
aaacgtttcattgcgagtccattggctttagtccacactcattacacactggcacaatta
cttgctgatccaagtaaatactgaatctttgatgccaacgtgggacttgattaccttaaa
ctagctgactttgatgtatttgcaactaataacgaaagcgtcttgcgtgaccaattcaac
attattcttgaacaatacaaaacgaaaatgagtgaatacacttgaaatcaagagtttaat
ccacaacgtgatttaactatgcatcaacttagtttcttggatgtaatgctcacacggagc
aaaatcactattgcaccaccaaaccaacttacggcactcaaaccattatttgaagctaac
aaccaatcagaaattgtgtgggtactccaaggaatcctagaacaatttggtggcaaaatc
aaagacaagccagatgcctttattgaaagtctttactactcaaaaacttatcgtgacttc
aaccaacttttcagtgactatacttgaagttgagcagaaactatcaaccgtgataacttg
caaatcacttacgcacctgtagctaaaaacttccaaaacttaccaactgctcttggtggc
gcatcggagtcttcacttggtgttacctatgtaattaatggcgaaaaagcacaaacttga
aacgaccggaaagtgctttactcaagcagtgcagcagcacaagcctcagtcaaaggcgcc
ttgcaagacttctacaaaaccttagcaaccgagcgtcaagcttacaactacaactataac
caaatcaaaaccccttacaaatttgttactgacgaagacttttcacctcaaatatcaaaa
gaatcatcatactttggcaaaatcttaaccgacaataacggttgatacttagaccgttgg
taccgtgaaattactgacttcttactttacgacgacaacggtaatccagttgaagatgac
actattagaattaagaacttggagggggggcagtgactaaccgtgtggacgcctactgac
agttctatattcaaaaccaaggtgtag
DBGET
integrated database retrieval system