Mesoplasma coleopterae: MCOLE_v1c05980
Help
Entry
MCOLE_v1c05980 CDS
T05286
Symbol
rnj
Name
(GenBank) ribonuclease J
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mcol
Mesoplasma coleopterae
Pathway
mcol03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcol00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MCOLE_v1c05980 (rnj)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcol03019
]
MCOLE_v1c05980 (rnj)
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcol03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MCOLE_v1c05980 (rnj)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
RNase_J_C
Lactamase_B
Anti-Pycsar_Apyc1
Lactamase_B_2
RMMBL
Shikimate_DH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATZ21109
UniProt:
A0A2K8P300
LinkDB
All DBs
Position
681984..683750
Genome browser
AA seq
588 aa
AA seq
DB search
MEKEKNISTNQIIEKEDFEPFVFKQKEVQRKYIKTESPTKVFALGGLEEIGKNTYCIEHE
NEIIMIDAGVKFPDDSMLGINAVIPDYSYLKENESKIKALFITHGHEDHIGGIHYLVKQV
NIPVIYAPELAAALIRDRLKEHKLTDKTIVKEYVADDIWATKNLRVSYAALNHSIPDAFG
ILVETPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELSKLASMGDKGIELLMSDSTNAEVEGYTPGEK
GIIENIDKLFLKAKGRIFITTFASNVHRIQQIVELANKYDKKVVILGRSIERIIKIIRQM
GHLKINDKMFIKANDIDKYPANKIMIISTGSQGEPMAALSRIATNRHQSISIIPGDTVIF
SSSPIPGNRADVEILINRLTRIGANVIESSPNNRIHTSGHASQEEQKLLFTLLRPNYFMP
MHGEFRMLKKHIETAESVNLRPGHGFVMANGDQLELLQGNAQIGKRVDADAIYVDGKDMT
AHASNIIRERDILSKDGLISVVVSIDSQTNKLLCAPRIISRGSFYVKDSGNIISEAITIV
TEAINEVLNSSKPTFGAIKKAIKQSLSPYIFKTKRRNPLIIPVILNKK
NT seq
1767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaggaaaaaaatatttctacaaatcaaattattgaaaaagaagattttgaacct
tttgtttttaaacaaaaagaagttcaaagaaaatatattaaaactgaatcaccaactaaa
gtgtttgctttgggtgggcttgaagaaattggtaagaacacttactgtatagaacatgaa
aatgaaattatcatgattgacgcaggagttaagtttcctgatgattcaatgttaggaatt
aacgctgttattcctgattactcatatttaaaagaaaatgaatcaaaaattaaagcttta
tttattactcatgggcatgaggatcacattggtggaatacactatttagttaaacaagtt
aatatacctgttatttatgcacctgaattagctgctgccctaattagagacagattaaaa
gaacacaaattaacagataaaacaattgttaaagaatatgttgctgatgatatttgagca
accaaaaacttacgtgttagttatgctgctttaaaccactctattccagatgcatttggt
attttagttgaaactcctaatggaaatattttttcaacaggggattataaatttgactgg
tcacctttaggacactttgccgaattgagtaaattagcaagtatgggtgataaagggatt
gaacttttgatgtcagactcaacaaatgctgaggttgaaggttatacacctggtgaaaaa
ggaatcattgaaaacattgataaacttttcttaaaagcaaaaggaagaatctttattaca
acttttgcctcaaacgttcaccgtattcaacaaattgttgaattagctaataaatatgat
aaaaaagttgttatccttggtagatctattgaaagaattattaaaataattcgtcaaatg
ggtcacttaaaaattaatgacaaaatgtttattaaagctaatgatattgataaatatccg
gctaataaaattatgattatctcaacaggtagtcaaggtgagccgatggctgcactttca
aggattgctacaaatagacaccaatctatttcaataattcctggtgacactgtaattttc
tcatcatcaccaattccaggaaatagagctgatgttgaaatcttaattaatagattaact
agaataggcgctaatgttattgaatcttcaccaaacaatagaattcatacttctggtcac
gctagtcaagaagaacaaaaattattatttacattattaagacctaattattttatgcca
atgcatggtgaattcagaatgttaaaaaaacacatcgaaacagctgaatcagtaaattta
agacctgggcatggatttgtaatggcgaatggtgatcaattagaattattacaaggtaat
gctcaaattggtaaacgagttgacgctgatgcaatttatgtagatggaaaagatatgact
gctcatgcttcaaatataattagagaacgtgatattttaagtaaagatggattaatatca
gttgttgtttcaattgactcacaaaccaacaaactattatgtgcgccaagaataatttca
cgtggaagtttttatgtaaaagattcaggaaatattattagtgaggcaattacaattgtt
acagaagcaataaatgaagtattaaattcttctaaaccaacttttggggcaattaagaaa
gcaattaaacaatcactttcaccttacatttttaaaacaaaacgcagaaatccattaatt
attccagttatattgaacaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system