KEGG   Mesoplasma coleopterae: MCOLE_v1c05980
Entry
MCOLE_v1c05980    CDS       T05286                                 
Symbol
rnj
Name
(GenBank) ribonuclease J
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mcol  Mesoplasma coleopterae
Pathway
mcol03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcol00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    MCOLE_v1c05980 (rnj)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mcol03019]
    MCOLE_v1c05980 (rnj)
Messenger RNA biogenesis [BR:mcol03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     MCOLE_v1c05980 (rnj)
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B Anti-Pycsar_Apyc1 Lactamase_B_2 RMMBL Shikimate_DH
Other DBs
NCBI-ProteinID: ATZ21109
UniProt: A0A2K8P300
LinkDB
Position
681984..683750
AA seq 588 aa
MEKEKNISTNQIIEKEDFEPFVFKQKEVQRKYIKTESPTKVFALGGLEEIGKNTYCIEHE
NEIIMIDAGVKFPDDSMLGINAVIPDYSYLKENESKIKALFITHGHEDHIGGIHYLVKQV
NIPVIYAPELAAALIRDRLKEHKLTDKTIVKEYVADDIWATKNLRVSYAALNHSIPDAFG
ILVETPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELSKLASMGDKGIELLMSDSTNAEVEGYTPGEK
GIIENIDKLFLKAKGRIFITTFASNVHRIQQIVELANKYDKKVVILGRSIERIIKIIRQM
GHLKINDKMFIKANDIDKYPANKIMIISTGSQGEPMAALSRIATNRHQSISIIPGDTVIF
SSSPIPGNRADVEILINRLTRIGANVIESSPNNRIHTSGHASQEEQKLLFTLLRPNYFMP
MHGEFRMLKKHIETAESVNLRPGHGFVMANGDQLELLQGNAQIGKRVDADAIYVDGKDMT
AHASNIIRERDILSKDGLISVVVSIDSQTNKLLCAPRIISRGSFYVKDSGNIISEAITIV
TEAINEVLNSSKPTFGAIKKAIKQSLSPYIFKTKRRNPLIIPVILNKK
NT seq 1767 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaaggaaaaaaatatttctacaaatcaaattattgaaaaagaagattttgaacct
tttgtttttaaacaaaaagaagttcaaagaaaatatattaaaactgaatcaccaactaaa
gtgtttgctttgggtgggcttgaagaaattggtaagaacacttactgtatagaacatgaa
aatgaaattatcatgattgacgcaggagttaagtttcctgatgattcaatgttaggaatt
aacgctgttattcctgattactcatatttaaaagaaaatgaatcaaaaattaaagcttta
tttattactcatgggcatgaggatcacattggtggaatacactatttagttaaacaagtt
aatatacctgttatttatgcacctgaattagctgctgccctaattagagacagattaaaa
gaacacaaattaacagataaaacaattgttaaagaatatgttgctgatgatatttgagca
accaaaaacttacgtgttagttatgctgctttaaaccactctattccagatgcatttggt
attttagttgaaactcctaatggaaatattttttcaacaggggattataaatttgactgg
tcacctttaggacactttgccgaattgagtaaattagcaagtatgggtgataaagggatt
gaacttttgatgtcagactcaacaaatgctgaggttgaaggttatacacctggtgaaaaa
ggaatcattgaaaacattgataaacttttcttaaaagcaaaaggaagaatctttattaca
acttttgcctcaaacgttcaccgtattcaacaaattgttgaattagctaataaatatgat
aaaaaagttgttatccttggtagatctattgaaagaattattaaaataattcgtcaaatg
ggtcacttaaaaattaatgacaaaatgtttattaaagctaatgatattgataaatatccg
gctaataaaattatgattatctcaacaggtagtcaaggtgagccgatggctgcactttca
aggattgctacaaatagacaccaatctatttcaataattcctggtgacactgtaattttc
tcatcatcaccaattccaggaaatagagctgatgttgaaatcttaattaatagattaact
agaataggcgctaatgttattgaatcttcaccaaacaatagaattcatacttctggtcac
gctagtcaagaagaacaaaaattattatttacattattaagacctaattattttatgcca
atgcatggtgaattcagaatgttaaaaaaacacatcgaaacagctgaatcagtaaattta
agacctgggcatggatttgtaatggcgaatggtgatcaattagaattattacaaggtaat
gctcaaattggtaaacgagttgacgctgatgcaatttatgtagatggaaaagatatgact
gctcatgcttcaaatataattagagaacgtgatattttaagtaaagatggattaatatca
gttgttgtttcaattgactcacaaaccaacaaactattatgtgcgccaagaataatttca
cgtggaagtttttatgtaaaagattcaggaaatattattagtgaggcaattacaattgtt
acagaagcaataaatgaagtattaaattcttctaaaccaacttttggggcaattaagaaa
gcaattaaacaatcactttcaccttacatttttaaaacaaaacgcagaaatccattaatt
attccagttatattgaacaaaaaataa

DBGET integrated database retrieval system