Mycoplasmopsis columbina: NCTC10178_00208
Help
Entry
NCTC10178_00208 CDS
T06777
Symbol
pepF1
Name
(GenBank) Oligoendopeptidase F, plasmid
KO
K08602
oligoendopeptidase F [EC:3.4.24.-]
Organism
mcom
Mycoplasmopsis columbina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcom00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
mcom01002
]
NCTC10178_00208 (pepF1)
Peptidases and inhibitors [BR:
mcom01002
]
Metallo peptidases
Family M3
NCTC10178_00208 (pepF1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M3
Peptidase_M3_N
FH3_FHOD1-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU76799
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(200886..202709)
Genome browser
AA seq
607 aa
AA seq
DB search
MKQYKNVSDVEKQYKFDLEDILQGKKFDYWVEEFKRHLELTLKNKDSKYNNLKNYAESFE
LGIRTGIISNKISNYINNYTNRELNNPQYKELENKVNQLVDDFNKNFGSETVRFFKNIDK
VKSWLDSDELKPYRKLLEELIDEYDHKLDDNIEEYLTKTSKANPNYEGVFTLLTDSEIDY
GFVLDGKGKKHKLNPVTRRKYLKSDDKILRKNTVLQWNKSIVKHKESLANLLFQQFKTLN
VEAKVRNYTSAVNMLTSKDKVDDELLQILFSKVQSLNKTIAKYRNAFKKFYELKFKEKYH
PRYDSSRDLVKVKTEYTIEEMQQIVLDSLKPFGNEYYETVNKALKENWVDYMTIENKVSG
AYSIGETYGIDKKYILMNFDGQFESVETLAHELGHSLHSYFADKNNNFYDSQYPIFLAEI
ASIFNEEMLYDHLLKTNKNDKFKFQLVEKMIDGFIGVVQRQIIWANYEYNLYNAIDKYTV
NESYDSISKLYFENLKKYTNKKLKYESNFLIDCVNVPHFYYGFYVYKYAIGQLVSNYFFS
KYKKEGKEYLQYYISNFLSKGGSDYPLEILKNVGVDLKSDEFYQIGFSYFEELVDEYIKL
GNKIFKK
NT seq
1824 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaatataaaaatgttagtgatgttgaaaaacaatataaatttgacttagaagat
attttacaaggtaaaaaatttgattattgagtagaagaatttaaaagacacttagaacta
actttgaaaaacaaagatagtaaatataacaatcttaaaaattatgctgaatcatttgaa
ttaggaattagaacaggaatcattagcaataaaatatctaactacattaataactataca
aatagagaattaaataatccacaatacaaagaactagaaaataaagtaaatcaacttgtt
gatgattttaataaaaattttggttcagaaactgttagattttttaaaaatatcgacaaa
gttaaatcatgacttgatagtgatgaattaaaaccttatcgtaaattattagaggagtta
attgacgaatatgaccataaattagacgataacatcgaagaatacttaacaaaaacttct
aaagctaatcctaattacgagggtgtgtttactcttttaacagacagtgaaattgattat
ggttttgttttagatggcaagggtaaaaaacataaattaaatcctgtaactagaagaaaa
tatttaaagagtgatgataaaattttacgtaaaaacactgttttacaatgaaataaatca
attgtaaaacataaagaatccttagctaatttacttttccaacaatttaaaacattaaat
gttgaagcaaaagttagaaattatacttcagccgtaaatatgctaacttcaaaagataaa
gttgatgatgagttgttacaaattttattttctaaagttcaatcattaaataaaactatt
gcaaaatacagaaatgcctttaaaaaattctatgaacttaaatttaaagaaaaatatcat
ccaagatatgatagttctagagatttagtcaaagtaaaaactgaatacaccatagaagaa
atgcaacaaattgttttagattcattaaaaccatttggtaatgaatactatgagactgta
aacaaggctcttaaggaaaattgagtagactatatgactattgaaaataaagtgtcagga
gcatattcaattggtgaaacttatggcattgataaaaaatatatcttaatgaattttgac
ggtcaatttgaatcagttgaaactttggctcatgaattaggccattctcttcattcttat
tttgcagataaaaataataatttttatgatagtcaatatcctattttcttagcagaaata
gcttcaattttcaatgaggaaatgttatatgatcatcttttaaaaactaataaaaacgat
aaatttaaatttcaattagtcgaaaaaatgattgatggattcattggtgttgtgcaaaga
caaattatttgagcaaactatgaatataacttatataacgctatcgataaatatactgta
aatgaatcatatgattctatttcaaagctttattttgaaaatttaaaaaaatatacaaat
aaaaaacttaaatatgaatctaatttcttaattgattgtgtaaatgttcctcatttttat
tacggtttctacgtttataagtatgctataggtcaattggtttcaaattatttcttctct
aaatacaaaaaagaaggtaaagaatatttacaatactacattagtaatttcttaagcaaa
ggtggttcagattatcctcttgaaattctaaaaaacgttggtgtagatttaaaaagtgat
gaattctaccaaattggttttagttatttcgaagaattagttgatgaatatattaaatta
ggaaataaaatttttaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system