Mycoplasmopsis columbina: NCTC10178_00417
Help
Entry
NCTC10178_00417 CDS
T06777
Symbol
smc
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
mcom
Mycoplasmopsis columbina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcom00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
mcom03036
]
NCTC10178_00417 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
mcom03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
NCTC10178_00417 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_15
AAA_21
AAA_29
DUF1664
DUF3450
ABC_tran
E2R135
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU76994
LinkDB
All DBs
Position
1:510233..513250
Genome browser
AA seq
1005 aa
AA seq
DB search
MKLIKVEAHGFKSFADPISLKFDGGVAGIIGPNGSGKSNINDAIKWVLGERSAKELRGDN
MEDVIFAGSKTAKPMDRAEVTLTFDNRGGTSALPHDFITISRVLERGTGSNQYYLNGELC
RQKDIKDIAMETGIGKSSLAIISQGTVSDIAEATAEERKAIFEEAAGVSKYKFRKKEALS
KLEKTEHGLEKIRLVIAEIEKKLVPLRKQAEKAKVFIAKSEELKQVEVGLLVDNIQTFGK
KFDELTVELEGVLETKNDLESRIESLSVKINQAEALKAEEEAELRKLSKELDTVKERHTS
ISMILARQNERHKLIASGEKAANLDEQIASYRALIESHGNRLKAVERDIIAIENRISENS
QLIEDYHREINNVNISINKKTSELTKVETLLSSLKQQKENHGLLHKGTKTIIENKTLFGK
TLKGTVADLIKVDLEYVPAINAILANAIQNIVVDKSETAVKAVNFLKQNNGGRATFIPLA
SIQPKSVRDDLVLAIQGHTGFVGIANELVKVDVQYDILNKFLLGNVIVAADIESANSIAN
ILERRYMVVTLEGDIIRAGGVITGGVQNNTQTILGLDEKIAELEKLIPGLRAAKHSFDAK
LNEISNYRRSALELANEYKQQLHALKVKKASEQELFDEFNIKYKELANKTIELDNVELSV
KSEEADLEVLQSQLIALDAQFKVKGETVARLSTEIKLFNNNRADFQTSLNKLNSSFAEKM
TQKERSKLILEQSRERLSAQYKMTFESAQENFKLELNREQAEEIVRELREEIDALGSVNL
ESLQNLVEEENRYNELAENEKELAEAKDSLDAAIAEMDKIIINRLTNIVNDVNDEFNNVF
RSMFGGGQAKLYFTDPKNILESGVEIEAQPPGKNIKNLKLFSGGEKSLIAISLLFGILKA
RPLPLCILDEVEAALDEANVVRYAEYLQQLKAKTQFLVITHRHGTMSRVDALFGATMQTR
GVTSFFSLQLEEAKKLVQDEQKDYDELEKGSKSLSQNEVLELITE
NT seq
3018 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattaataaaagttgaagcacatggatttaagtcatttgctgatcctatttcattg
aaattcgatggtggagttgccggaattattggaccaaatggttctggtaaatcaaacatt
aatgatgcaattaaatgagtgcttggagaaagaagtgctaaagaattacggggcgataac
atggaagatgttatttttgcaggttcaaaaactgcaaaaccaatggatcgtgccgaagtt
actttaacttttgataatcgaggtgggactagtgctttaccacatgatttcattactatt
agtcgtgttttagaaagaggaactggatctaatcaatactacttaaatggtgaattatgt
cgtcaaaaagatattaaagacattgctatggaaactggaattggtaaatcatcattagcc
atcatttctcaaggtactgttagtgatattgccgaagcaactgctgaagaaagaaaggca
atttttgaagaagcagctggggtttcaaaatataaatttagaaaaaaagaagctctaagt
aagttggaaaaaaccgaacatggtttagaaaaaattagacttgttattgctgaaattgaa
aaaaaattagtgcctttaagaaagcaagctgaaaaagcaaaagtttttattgccaaaagt
gaagaattaaaacaagtagaagttggtttattagttgataatattcaaacctttggtaaa
aaatttgatgaattaactgttgaattagaaggtgttttagaaactaaaaacgatcttgaa
tcaagaattgaaagtttaagtgttaaaatcaaccaagctgaagctcttaaagcagaggaa
gaagcagaattaagaaaattatcaaaagaacttgacactgttaaagaaagacacacaagt
attagtatgattttggctcgtcaaaatgaaagacacaaattaattgcctcaggtgaaaaa
gcagctaatttagatgagcaaattgcttcatatcgtgctttgattgaatcacatggtaat
agattaaaagctgttgaaagagatattattgcaattgaaaatagaattagtgaaaattca
caattaattgaagattaccatcgtgaaattaataacgttaatatttcaattaacaaaaaa
accagtgaattaaccaaagtcgaaactttattaagcagcttaaaacagcaaaaagaaaat
catggtttacttcataaaggaactaaaaccattatcgaaaacaaaactctttttggtaag
accttaaaaggaacagttgcggatttaatcaaagttgatttagaatatgtgcctgcaatt
aatgcaattttagctaatgcaattcaaaatattgttgtcgataagagtgaaacagctgtg
aaagcagttaacttcttaaaacaaaataatggtggtagagctacttttattcctttagct
tcaattcaacctaaatcagttagagacgatttagttttagcaattcaaggtcatactggc
tttgtgggcattgctaatgaacttgttaaagtagacgtgcagtatgacattttaaataaa
ttcttacttggaaatgttattgtagctgctgacattgaaagtgctaattctattgccaat
attttggaacgtcgttacatggttgtaactttagaaggtgacattattagagccggtgga
gttatcactggtggggtacaaaataatactcaaacaattttaggattagacgaaaaaata
gctgaattagaaaaattaatccctggattaagagcagctaaacattcatttgatgctaaa
ctaaatgaaatttcaaattatcgtcgttctgctcttgaattagctaacgaatataaacaa
caattacatgctttaaaagttaaaaaagcaagtgaacaagaattatttgacgaattcaat
attaaatataaagagttggcaaataaaactattgaattagacaatgttgaattgtcagtt
aagagtgaagaagcagatttagaagttttacaaagtcaattaattgctttagatgctcaa
tttaaagttaaaggtgaaacagtagctcgtttatcaactgaaattaaattatttaataat
aatcgtgcggattttcaaactagtttgaacaaattaaacagttcttttgctgaaaaaatg
acacaaaaagaaagatcaaaattaattttagaacaatcaagagaacgtctttctgctcaa
tataaaatgacttttgaatcagcacaagaaaactttaaacttgaattaaatagagaacaa
gctgaagaaattgttagagaattacgtgaagaaattgatgctttaggctcagttaactta
gaatctcttcaaaatcttgtagaagaagaaaacagatataatgaattagcagagaatgaa
aaagaattggcagaagctaaagattctcttgatgctgctattgcagaaatggataaaatt
atcattaacagacttacaaatattgtaaatgacgtaaatgatgaattcaacaatgtcttt
agaagtatgttcggtggtggacaagctaaactatactttactgatccaaaaaatatttta
gaatcaggtgttgaaattgaagcacaacctcctggaaaaaatattaaaaatctcaaactt
ttctctggtggagaaaaatcattgattgctatttcacttttatttggtattttaaaagca
agaccgcttcctttatgtattctagatgaagttgaagcagcgcttgatgaggctaatgtt
gtacgttatgctgaatacttacaacaattaaaagctaaaactcaattccttgttattaca
caccgtcatggaactatgagtcgtgttgatgctttatttggggctacaatgcaaacaaga
ggtgttacttcattctttagccttcaattagaagaagctaaaaaattagttcaagatgaa
caaaaagactatgatgaattagaaaaaggatctaaatctttgagccaaaatgaagtactt
gaattaataacagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
