KEGG   Mycoplasmopsis columbina: NCTC10178_00532
Entry
NCTC10178_00532   CDS       T06777                                 
Symbol
yhgF
Name
(GenBank) RNA (S1 domain)-binding protein
  KO
K06959  protein Tex
Organism
mcom  Mycoplasmopsis columbina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcom00001]
 09190 Not Included in Pathway or Brite
  09192 Unclassified: genetic information processing
   99973 Transcription
    NCTC10178_00532 (yhgF)
SSDB
Motif
Pfam: Tex_YqgF HHH_3 Tex_N Tex_central_region HHH_9 S1 HHH_7 YqgF HHH_6 AmiA-like
Other DBs
NCBI-ProteinID: VEU77096
LinkDB
Position
1:complement(646773..648923)
AA seq 716 aa
MNISIINVSKKLNLEEKQVETVLNFLQEGATVPFIARYRQAHTGGLNEEIIQEIDNLYQY
DVELNKRREAILNILSENKLLTSELEEKIKNVETKAELENIYEPFKVGKKTKATDAIALG
LEPLAKAIFEAQDEMFSPINEAKKYLNDKVESVEFAIEQAKYIISQWISQDVETREFVKE
QIKNYGFIETKKKKNADDEKEIFKIYYEHKERIKYVPNHRVLAMNRGEDKKIISYDLTYS
INTINYQLNNKYFKIKRTGKIINEALKDSLERLIYPSIEREIKRELFEKAEKEAIKLFAE
NVESMLLWPAVKNKKVLAIDPAFVNGCKIAVLNENGQVLDIKIIYPNPPLNKVKEAKEIV
NKLLNKYESDIIVIGNGTASRETEQFISKLLKERKVIDPKEHIQFAIVSEIGASVYSASD
IAIKEFPNLSVEERSAINIGRRFQDPLNELVKIDPKSIGVGQYQHDVDQKDLNKALEFKV
DKVVNLIGVDVNSATEEILKYVSGLNKKVAQSIVLWRNENKEFKNREELKKVKGLGSKAY
EQAIGFLRIYDSQNFFDKTSIHPESYELAYKIVDYLNLDLNNIDSNLLKSQNAESLAEKF
NSNKYDVSLILEALANPTKDIRDEKEGYLLKDDILNLEDLHEGLIVDGSISNITDFGIFA
YIGLKENVFVHKSAILDKNNKLINTIYDHFKIGDNLKIEIIEIDKEKAKIKGKINH
NT seq 2151 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatatttctattataaatgtatctaaaaaattgaatttagaagaaaaacaagttgaa
acagttttaaatttcttacaagaaggagcaactgttccttttattgctcgttatagacaa
gcacatactggcggcttaaatgaagaaataattcaagaaattgataatctttatcaatat
gatgttgaattaaacaaaagaagagaagcaattttaaatatcttaagcgaaaacaaattg
ttaacttctgaattagaagaaaaaattaagaatgttgaaaccaaagcagaattagaaaat
atttatgaaccatttaaagtaggtaaaaaaactaaagctactgatgctattgcactaggg
ttagaaccactagcaaaagcaatttttgaggctcaagatgaaatgtttagtccaattaat
gaagctaaaaaatatttaaatgacaaagttgaaagtgttgaatttgcaattgaacaagct
aaatacattattagtcaatgaatatcacaagatgttgaaacaagagagtttgttaaagaa
caaattaaaaactatggttttattgaaactaaaaagaaaaagaatgcagatgatgaaaaa
gaaatttttaaaatttattatgaacataaagaaagaattaaatatgttcccaatcaccgt
gttttagctatgaatcggggagaagacaaaaaaataatttcttatgatttaacttacagc
ataaatacaattaattatcagttaaacaataaatatttcaaaattaaaagaactggaaaa
attattaacgaagctttaaaagactccttagaaagattaatttatccttctattgaaaga
gaaattaagagagaactttttgaaaaagcagagaaggaagcaataaaactatttgctgaa
aatgttgagtctatgctcctttgaccagctgttaaaaataagaaagttttagctattgat
ccggcctttgttaatggttgtaaaattgcagttttaaatgaaaatggacaagttcttgat
attaaaatcatttatcctaatccaccattaaataaggtaaaagaggcaaaagaaatagtt
aataaacttctaaataaatatgaaagtgacattattgttataggtaatggaactgcatca
agagaaactgagcaatttattagtaagttattaaaagagagaaaagtaatagatccaaaa
gaacacattcaatttgctattgtttctgaaataggagcaagtgtttattctgcgtctgat
atagcaataaaagaatttcctaatctttccgttgaagaaagatcagcaattaacattgga
agaagatttcaagacccacttaatgaattggtaaaaattgatccaaaatcaattggtgta
ggacaatatcaacatgatgttgaccaaaaagacttaaacaaagctttagaatttaaagtt
gataaagtagttaatttgataggcgttgatgtaaatagtgcaacagaagagattttaaaa
tatgtttctggattaaataaaaaagttgctcaatcaattgttctttgaagaaatgaaaat
aaagaatttaaaaatcgtgaagaattgaaaaaggttaaaggattgggatctaaagcatat
gaacaagctataggttttttaagaatttacgactcacaaaacttctttgataaaacatct
attcaccctgaaagttatgaattagcgtataaaatagttgattatttaaatttagattta
aacaatattgattcaaacttattaaaatctcaaaatgcagaaagtttagcagaaaaattt
aactcaaacaaatatgatgttagtttaattttagaagcattagctaatccaacaaaagat
ataagagatgaaaaagaaggatatcttttaaaagatgatattttgaatcttgaagatctt
catgaaggattgattgttgatggttcaatatcaaacattactgattttggaatttttgct
tatattggattaaaagaaaacgtttttgttcataaatcagctattttagacaaaaataat
aaattaattaatacaatctatgatcattttaaaattggagataacctcaaaattgaaatt
attgaaattgataaagaaaaagcaaaaattaaaggaaaaataaatcactag

DBGET integrated database retrieval system