Mycoplasmopsis columbina: NCTC10178_00537
Help
Entry
NCTC10178_00537 CDS
T06777
Symbol
secDF
Name
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
mcom
Mycoplasmopsis columbina
Pathway
mcom02024
Quorum sensing
mcom03060
Protein export
mcom03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcom00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
NCTC10178_00537 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
NCTC10178_00537 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
NCTC10178_00537 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
mcom02044
]
NCTC10178_00537 (secDF)
Secretion system [BR:
mcom02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
NCTC10178_00537 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU77099
LinkDB
All DBs
Position
1:651008..653581
Genome browser
AA seq
857 aa
AA seq
DB search
MFRNLRKFFKNLVSLSNWKRITIAVITLISAILTVVFGSLFYVSKNVNKSVEYGGGVEFL
VQVTDQTSDKTTDKFTQNVAGALSNRLTGGTEFNGTKVQTQGDGKILITRNGSLTDAERK
NFEDIIINKPNLVLTDTNMIPIFVNGEFNENKETLDYENISKYIPPLKPSGASNQFIQTS
GKYNVLIKLLDKNAEREWTDATSYIASSPDQTILMWLNLDELVSVAKERFSAQWIKAKEN
PYNFVHVDEALSDSNGRRNILKENQIKAKDFLISEARAASPLSGDSFTITGNFNEGEAKQ
LAANINFGTSKYKLDILSSNYISASSVGDSFNKALIAGIIVFAIISIFMIVNYGLLGALS
TISIALYVFLTLLMFTILRGEYSPVTIAALIIGIGIGVDANIITFERLKSEVYAGEKIKK
AIKNSNRLAMSSIIDANLTTLIVSFTLFYFGTSAVRGFSLSLVFSVIFTLLIMLFFTKGI
SNLIVGTGFFNKRLWLLGIKYKKINNLKTNALYRRFDYVKHAKWFIIGSLVFVLIGLIVF
SSVAGSNKEFWSGFNRSFEFQGGINISIEGKDTYIITQNDATAIKNFIINNQNALGIKDV
AKYTNILPIDSSNTMFKISIKTAQDLNNNVEQIKSLILQQYPDVHVWSYGISSIEAQNLV
KNALLAVGISFIGIILYTLIRLKWTYSFAAIVGLLHDVLLTIAFIVITRLELSPIIVAAV
LSIIAFSINDTIVVFDRIRERVSLVYYKNFLDAKQIKEIANSSIADTIKRSLYTSLTTIM
AVIVLLAFKDATNLAFNLTMIFGLAIGAYSSIFICTWLWVKLETIRQLGIKKREESKFWV
ISKDEEQIFPGINDFIA
NT seq
2574 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttagaaatcttagaaaattctttaaaaatttagtatctttaagtaactgaaaaaga
attacaattgcagtaattactttaatttctgcaattttaaccgttgtttttggaagtctt
ttttatgtttcaaaaaatgttaataaatcagttgaatatggtggaggagttgaatttcta
gtccaagtaactgatcaaactagcgataaaacaacagataaatttacacaaaatgtagct
ggagcacttagcaatagattaactgggggaactgaatttaatggtactaaggttcaaact
caaggagatggaaaaattctaattacaagaaatggttctttaaccgatgcagaacgtaag
aattttgaagacataattatcaataaacctaatttagttctcactgacacaaacatgatt
ccaatatttgtcaatggtgaatttaatgaaaataaagaaactttggattacgaaaatatc
agcaagtatattccgccgctcaaaccatctggtgcatctaatcagttcattcagacatca
ggaaaatataatgttttaattaaattacttgataaaaatgccgaaagagaatgaacggat
gcaacttcatacatagcatcttcaccagatcaaacaattttaatgtgattaaatcttgat
gaattagtatctgttgccaaagaacgtttttcagctcaatgaataaaagctaaagaaaat
ccctataactttgttcatgttgatgaggcactttctgatagtaatggcagaagaaatatt
ttgaaagagaatcaaattaaagctaaagatttcttaattagcgaagcaagagcagcaagt
cctctaagcggtgattcttttacgattacaggtaattttaatgaaggtgaagccaaacaa
ctagcagcaaatattaattttggtacttcaaaatataaacttgatattctttcttcaaac
tacatttctgcttcttcagttggtgattcatttaataaagcgcttattgccggaattatt
gtttttgcaattatttcaattttcatgatcgtaaattatggactattaggagcactaagc
actatttccatcgctctttatgtattcttaactttattaatgttcacaattttaagagga
gaatattcacctgttacaatcgctgcattaattattggaattggaattggagtcgatgcc
aacattataacttttgaaagacttaaatctgaagtttatgccggcgaaaagattaaaaaa
gctattaagaattcgaatcgcttggctatgtcttcaattattgatgcaaacttaactact
cttatagtttcattcacgttgttctattttggaactagtgctgtaagaggttttagcctt
tcattagtcttttctgttattttcactcttctaataatgcttttctttacaaaaggaatt
agtaatttaatagttggaactggtttctttaacaaacgtctttgacttttaggaattaaa
tacaaaaaaattaataatttaaaaacaaatgctctttatcgtagatttgattatgttaaa
catgctaaatgatttattattggttcattagtttttgtactaataggattaatagtattt
tcttcagttgctggttcaaataaagaattctgatctggattcaatagatcatttgaattt
caaggtggaattaatatttcaattgaaggaaaagatacttatataatcactcaaaatgat
gcaacagcaattaaaaacttcattattaataaccaaaatgctttaggtatcaaagatgtt
gcaaaatatacaaatatcttgccgatagattcatcaaacacaatgtttaaaatttcaatt
aaaactgcacaggatttaaacaataatgttgaacaaataaaatcattaattcttcaacaa
tatcctgatgttcatgtttgaagctacggaatttcttcaattgaagctcaaaatttagtg
aaaaatgcattgcttgcagtgggaatttcatttattggaattattctttatacattaatt
agattaaaatgaacctactcatttgcagcgattgtaggacttttacatgatgttcttctc
actattgcattcatagtgattacaagactagaactttcacctattattgtggctgctgtt
ctttcaattatcgcattttcaattaacgacacaattgttgtcttcgatagaattagagaa
agagttagtttagtttactataaaaattttcttgatgcaaaacaaattaaagaaattgct
aattcatcaattgcagatacaattaaacgtagtttatatacttctcttaccaccattatg
gctgttattgtattattagcctttaaggatgctaccaatttagcttttaatttaactatg
atttttggattagcaattggggcatatagttcaattttcatttgtacatgactttgagtt
aaattagaaactattagacagttaggcattaaaaaacgtgaggaaagcaaattctgagta
ataagcaaagatgaggaacaaattttcccaggaattaatgattttatagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
