Maribellus comscasis: GM418_08425
Help
Entry
GM418_08425 CDS
T07297
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
mcos
Maribellus comscasis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcos00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mcos02000
]
GM418_08425
Transporters [BR:
mcos02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GM418_08425
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarboxypepD_reg
STN
CooC_C
FecR_C
Big_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGY48077
UniProt:
A0A6I6K5Y3
LinkDB
All DBs
Position
2060873..2064091
Genome browser
AA seq
1072 aa
AA seq
DB search
MKVVFFIMLIAAIHVSANSYSQNRRFNLDMKNVSIKQVLEEIELQSEFRFLYSDTKIDVE
RKVDAYFSNNTIEEVLQKVLVSSGISYQVIERQILLTNTKDSLLFEQQGGNKVKGKITDL
NGLPLPGVTVVVKGTTKGTVSDANGEYSLSDIPGNAVLLFSFVGMKTLEIPQEGKATINV
VMEEEAIGIEEVVAIGYGTLKREELTNAVSSVNSEDFVKGSVKDAAQLIRGQIAGVNIIN
PDADPTGTSQIVLRGVTTLAAGTQPLIVIDGVPGSLTDVAPEDIETIDVLKDGSAAAIYG
TRGTNGVVLITTKKVKGETPATIEWNSYVTTQTITKTIDFMNADQYRNLVAQEKPGAIDY
GATTKWIDQIFRTPISQNHNFSMKGGNSSTNYIMNINYKQLQGLMLRSDNNVLTTRIEAN
HTMFDGKLKLNGNIIGYDQKYFSGGDGYSWRGDVYRNALIYNPTDPVKDEDGNWTEHPEM
NNYANPLALIKETEGEIAITNFKPFGTITFYPLEGLTLKALASRDIYNKTAGYSESFNHL
NSIREKRTGFASKGTTRNVDDLLELTSTYSKSFKNHNINALAGYSFQQDTYEFYWMNNFD
FPSDKYSYNNMSDGAALTEGRAGMDSNKTSSRLVSYFGRVNYSFKNKYLLMASLRYEGSS
KFGKDHKWGAFPAVSAGWNLMKEDFMKNIQSSVSQLKLRVGFGITGTAPSDTYQSLSRLT
YGNKYLLNGEWIPVIYPSSNANPDLRWETKEEVNIGLDFGFFNNRISGAIDAYKRTTKDL
LWNYNVSTPPYLYSSVLANAGSMENKGLEIQITAIPVETKDFNWTTKVNYSTNSNKLLSL
SNDKFQLQSGYFYTGSTGEPIQSTTHRVEEGEAIGNFYGFKSIDIDEDGYWIIEGKDGNP
KPIAEQQPDDKKVLGNGLPKHYLSWDNTIRYKQFDLNVTMRGAFAYQILNMTKMFYAVPV
SLTRGNVVASTYDNIYGKRPLNDYQELQYVSYFIEDGDYWKIDNITLGYTLNLKGSIVKN
LRLYLSGSNMFTITGYSGIDPEVNSLGLYPGLDYRDRYPSTRTFTFGFSMKF
NT seq
3219 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtagtattctttattatgcttatcgcagcaatccatgtttctgcaaacagctac
tctcaaaacagacggtttaacctggatatgaaaaatgtttcaataaaacaggtattggaa
gaaattgaactccaaagtgagttcaggtttttatacagtgatacaaaaattgatgtcgaa
cgtaaagttgacgcttatttttcaaataataccatagaagaggtattacagaaggtttta
gtttcctccggaattagttatcaggttattgaaagacaaatattgttaacaaatacaaaa
gactctcttttatttgagcaacaaggcggtaataaggtaaaaggaaaaatcactgatctc
aatggattgccgttacccggagtaactgtagtcgtaaaaggcactactaaaggtaccgtt
tctgacgcaaacggcgaatattcattatcggatatccccggaaatgctgtgctgctgttt
tcatttgtaggaatgaagaccctggaaattccgcaggaaggaaaagctacaattaatgta
gtaatggaagaagaggctattggcattgaggaggttgtggccattggctacggaacctta
aaaagagaggaattaacaaatgcggtgtcaagtgtaaactcggaagactttgtaaaaggt
tctgtaaaagatgcagcgcagcttataagagggcaaattgcgggtgttaacattataaat
cccgacgctgatccaaccggaacttcacaaattgttttacgcggagtaacaacattagct
gccggcacccagccattaattgtaatcgacggagttcccggctctctgaccgatgttgct
ccggaagacattgaaaccattgatgtacttaaagatggttctgccgcagcaatttatggc
acccggggcaccaacggcgttgtgcttataaccacgaaaaaagttaagggcgaaactcct
gcaactatagaatggaatagttatgtaacaacacaaactattaccaaaacaattgacttt
atgaatgcagatcaataccgaaatctggtagcacaagaaaaaccgggagcaattgattat
ggtgccacaacaaaatggatcgaccaaattttcagaactccaatttcccagaatcataat
tttagtatgaaaggaggaaactccagcacaaactacataatgaacatcaattacaaacag
cttcagggattgatgttgcgctccgataataatgtgttgactacccgaatagaagccaac
catacaatgtttgacgggaagttaaaacttaatggaaatattattggctacgatcaaaaa
tatttctctggaggcgatggttacagttggagaggggatgtatacagaaatgcactgatt
tacaatccgaccgaccctgttaaagacgaagacgggaactggacagaacatcctgaaatg
aacaactacgccaatccactggccttaataaaagaaacagaaggagaaattgcaattaca
aattttaaaccttttggaacaataactttttatcctctcgaaggactaacgctcaaggca
ctggcatcaagagacatttacaacaaaacagccggatattctgaatcatttaaccacttg
aacagcatccgggaaaaaagaaccggattcgcatccaaaggtacaacaagaaatgtagat
gacttgctggaactaacgtcaacatattcaaaatcatttaaaaaccacaacattaacgct
ttggcaggttacagtttccagcaggacacctatgaattttactggatgaacaactttgac
tttcccagcgataaatattcatacaataatatgtcagacggcgctgctctcacggaaggt
agagccggaatggattccaacaaaacctcatcgagactggtaagttattttggcagggtg
aattacagttttaaaaacaaatatttgcttatggccagtttaaggtacgaaggctcctca
aaatttgggaaagaccataaatggggggcattcccggccgtttcagccggttggaacctg
atgaaggaggattttatgaaaaatatccaaagttcagtgtctcaattaaaattaagagta
gggtttggtattacgggaacagctccgtcagacacataccaatcgctaagcagattaacc
tacggaaataagtatttgttaaacggtgaatggattcctgtaatatatccttcttccaat
gccaaccccgacttaagatgggaaacaaaagaggaagttaatattggattggattttgga
ttctttaacaaccgaatctccggagctatagatgcttataaacgcacaacaaaagattta
ctctggaactacaatgtttcaacgcctccgtatctttacagcagtgtgcttgcaaatgca
ggttcaatggaaaacaaaggacttgaaattcaaatcaccgcaattccggtggaaacaaag
gattttaactggacaacaaaggtaaactattccactaacagtaataaactgctttcattg
tccaacgataaattccaacttcaaagtggatatttttataccggttctaccggagaacca
atacagtcgactacacacagagtagaagaaggtgaggcaatcggaaatttctatggtttt
aaatcaatcgacattgacgaagacggttactggatcattgaagggaaagacggaaaccca
aaacccattgcggaacagcaaccagatgacaaaaaagttttgggcaatggtttaccaaaa
cactacctcagctgggacaatacaattcgttacaaacaatttgatttaaacgtaacaatg
cgcggtgcttttgcctatcaaatattaaatatgacaaaaatgttttatgctgtaccggtt
agtcttacccgtggaaacgtagtggcaagcacttatgataatatttatgggaaaagacct
cttaatgattatcaggaacttcagtatgtaagttactttattgaggacggtgattactgg
aaaatcgataatattacgctgggctacactctcaatctaaaagggagtatagtaaagaat
ctgagattgtatttatcgggctcaaatatgtttaccattaccggatatagcggaatagat
ccggaagtaaatagtttgggattatatccggggctggattacagagacagatatccttca
accagaacatttacgttcggattttcaatgaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
