Maribellus comscasis: GM418_18615
Help
Entry
GM418_18615 CDS
T07297
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
mcos
Maribellus comscasis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcos00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mcos02000
]
GM418_18615
Transporters [BR:
mcos02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
GM418_18615
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
DUF7382
TTR_TEN1-4
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QGY45610
UniProt:
A0A6I6JWU4
LinkDB
All DBs
Position
4666968..4670207
Genome browser
AA seq
1079 aa
AA seq
DB search
MKKNRFEGFLTFLLIAIIMAFSLDSLAQQKQISGQIMDPDGAPVPGVTVIVKSTTVGTVS
GLDGTYDLTVPADAATLVFSYIGMISQEVAIGNQTVINITMEPDVIGLEEVVAVGYATRK
AGELTGAVSTVQATDIEEMSVVDASEALRAVAGVTVLESNTPGEGATVRVRGLGTINNND
PLWVVDGVPGGSVTPNNIESITILKDAAAQAIYGARAANGVVLVTTKSGRKNQKAQVNVT
IKTGVTRNTNYYDLLNTQEYGEMLWLQTYNDWETAHNSWVAEGSPAGEEPVLTYSHPLYG
NGSTPDIPEYIRPARATSVDLSLYDDKMIHEDGDDTYLIMKANQEGTRWLQEADRPAKYQ
EYTVDLNGGSQATSYAFQMGYMLEEGVLKWTGYDRFNLRSNITTSPADWVEIGERLGVTY
SQDYGHQTNNSESSIVSWAYRMPPIVPVYDVMGNYAGTRAEGTGNAQNPIFLLDSNKDDK
TKRMNVSGNVYIKLTPLAGLTIQSLAGVNYTARHYRNPGFVEKAHAERGKYASLEEEASF
GLQYNWTNTLSYSKLFADVHDVTIMFGTEAIDYSYNYINASRSEFFSKDLNYMQLATGLQ
SINNDGNLDSWSLFSMFGRLNYNYENKYMLEAVVRRDGSSRFGKSNAYGVFPAFSLAWRI
SKESFMASTSSWLDDLKIRAGYGTTGNDRIGNYNSYTKFDINYNNSFYPITGVNATTGAT
GFYQSSFGNPDVKWETTKTTNVGIDAAIKKNLTLSLDVWQRVTSDMLYPKQIPMVLGRAD
APSVNVGEMKNRGFDIQVGYVNSALNGDLKYDVSFDLSHYKNEIVKLSDNEDEFLSGSSY
REMIYTRSEIGTSFPEFYGYVVEGIFQTQAEADAWPTAFGAGGTYNQPGHYKYKDVNDDG
VINSEDRTYIGSPHPDFTAGFNLNVSYKGFNLVARLYSSYGNEMVNYVRRFIDFVQFQGG
RSHDRLYNSWGSPYLSDNSKAKLPKAEGNDIDSQQPSTAFIEDASYLRMENLRLGYDLNR
LLGDKFRNLQVYGQVTNLFTISKYSGLDPEVNNSGSNLGIDSGAWPTPRQIVFGINLGL
NT seq
3240 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaatcgttttgaaggttttctaacctttctgttaattgccattataatggca
ttttcacttgattctttagcacaacaaaagcagatttccggacaaatcatggatccagat
ggagcaccagtgcctggagttactgttattgtaaagtctactaccgtaggtacggtttcc
gggttagatggaacatatgatttaacagttcctgctgatgcggcaacactggtgttttca
tacattggtatgataagccaggaagtggcgattggaaatcaaaccgtgattaacataaca
atggagcccgatgtcatcgggttggaagaagtggtcgctgttggctatgctacacgaaaa
gcaggggagcttaccggagctgtttctacagttcaggcaaccgatattgaagaaatgtct
gttgtagacgcttctgaagctttaagagcagttgccggtgttaccgtattagagtcgaat
actccgggagaaggcgccacggttcgtgttcgcggtcttggcacaattaataacaacgat
cctctgtgggttgttgacggcgttccgggagggagcgttacacctaataatattgaatct
attaccattttaaaagacgcagcagctcaggcaatttatggtgcccgggcagctaacggt
gtagttttggttacaactaaatcagggcggaaaaaccagaaggcacaggtaaatgtaaca
attaaaaccggtgtcaccagaaatacaaactattacgatcttttaaacacacaggaatat
ggcgaaatgttgtggctgcaaacatataatgactgggaaacagcacataattcgtgggtt
gctgaaggaagtccggcaggggaagagccggtgcttacttattctcatccgttgtacgga
aacggttcaacacccgacattcccgagtatatacggccagcaagagcaaccagtgttgac
ctttcgctatatgacgataaaatgattcatgaagatggtgatgatacctatttaattatg
aaagcaaatcaggaaggcacgagatggctgcaggaagccgatcgcccagcaaaatatcag
gaatacacggttgatttaaatggaggaagtcaggctacgtcatatgcttttcaaatgggg
tacatgcttgaggaaggtgtattaaaatggactggttacgaccgttttaaccttcgttca
aatattacaacaagtcctgctgattgggttgaaataggagaaagattgggcgtcacctat
agccaggattacggtcaccaaacaaataactcagagtcttcaattgtatcgtgggcctat
cgtatgccacctattgtcccggtttatgatgttatgggtaactatgcaggcacaagagcc
gaaggaaccgggaatgctcaaaacccgatatttttgcttgactccaataaggacgacaaa
accaaaaggatgaatgtgagtggaaatgtgtatattaaacttactcctctggccggactg
acaatacaaagtttagcaggggtaaattacaccgcccgtcactacagaaatcctggtttt
gtagaaaaagctcatgctgaaagaggtaaatatgcttcgttggaagaagaagcaagtttt
ggtttgcaatacaactggacaaatacactttcctattcaaaattgtttgccgatgtacac
gatgtaacgataatgtttggtaccgaagcaattgattattcatataattatatcaatgca
tcacgttcagaattcttttcaaaagacttgaattatatgcagttggccactgggttacaa
agtatcaataacgacggtaacctggactcctggtcgctgttttcaatgttcggacgtttg
aactataattatgaaaataaatacatgctggaggcggtggtgcgtcgcgatggttcttca
cggtttggtaaatcaaatgcatacggtgtattccctgctttttctctggcctggagaatt
tcaaaagaaagttttatggcctcaacttccagttggcttgatgatctgaagatacgtgca
ggttatggtactacaggtaacgacaggattggtaattataacagttataccaaatttgat
atcaattataataattctttttatccaataacaggtgtaaatgctactaccggtgcaacc
ggtttttatcagtcaagttttggtaaccctgatgtgaaatgggaaactactaagactacg
aacgtagggattgatgctgctattaagaaaaacctgactttatcactcgacgtttggcaa
agggtaacatccgatatgctttatccaaaacaaatacctatggtgctggggcgcgccgat
gcaccctctgttaatgttggtgaaatgaaaaatcgtggttttgatattcaggtaggttat
gtaaacagtgccctgaatggtgatttaaaatatgatgtaagttttgatttgtcgcattat
aaaaatgagattgtaaaactttcagataatgaagatgagttcctttccggatcttcatat
cgcgaaatgatttatacaagaagtgaaattggaacatcctttcctgaattttatggttat
gttgttgaaggaatttttcagacgcaggcagaagctgacgcatggccgacagcttttgga
gccggtggaacttataatcaacccggtcattacaaatacaaggatgtaaatgacgatggg
gttattaattcggaagatagaacctatattggttcacctcatccggattttacagctggt
ttcaatctaaatgtcagttacaagggatttaatttggtagcccgtttgtattccagctat
ggaaacgaaatggtaaattatgtaagacgttttatcgattttgttcaattccagggagga
aggagtcacgacaggttgtacaattcgtggggaagtccttatttgagtgacaactctaaa
gctaagttgccaaaggctgaaggtaatgatatcgacagccagcaaccatcaacagctttt
attgaagatgcgtcgtatttaagaatggaaaatttgagattggggtatgatttgaacaga
cttctgggtgacaaattcagaaacttacaggtttacgggcaggtaacaaatctgtttaca
attagcaaatactcggggttagatccagaagtaaataatagtggaagcaatttaggtata
gattcaggtgcgtggccaactccaaggcaaattgtttttggaattaatcttggcttatag
DBGET
integrated database retrieval system