Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343: MCAP_0097
Help
Entry
MCAP_0097 CDS
T00309
Name
(GenBank) Rnase R (VacB) and RNase II family 3'-5' exoribonucleases
KO
K12573
ribonuclease R [EC:
3.1.13.1
]
Organism
mcp
Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
Pathway
mcp03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MCAP_0097
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcp03019
]
MCAP_0097
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mcp03016
]
MCAP_0097
Enzymes [BR:
mcp01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
MCAP_0097
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcp03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MCAP_0097
Transfer RNA biogenesis [BR:
mcp03016
]
Prokaryotic type
tRNA degradation factors
MCAP_0097
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
S1
OB_RNB
OB_RNR_1st
CSD2
RNase_II_C_S1
S1CSD-TOTE-2
HTH_45
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABC01595
UniProt:
Q2ST22
LinkDB
All DBs
Position
complement(116085..118199)
Genome browser
AA seq
704 aa
AA seq
DB search
MESKIIEILKTNKHKVSLNKLLTYFNALDYSLIKNYLDQLEKNNKITISLENNIYLLDQI
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NT seq
2115 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
