KEGG   Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343: MCAP_0339
Entry
MCAP_0339         CDS       T00309                                 
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III, alpha subunit, Gram-positive type
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
mcp  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
Pathway
mcp03030  DNA replication
mcp03430  Mismatch repair
mcp03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcp00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    MCAP_0339 (polC)
   03430 Mismatch repair
    MCAP_0339 (polC)
   03440 Homologous recombination
    MCAP_0339 (polC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:mcp03032]
    MCAP_0339 (polC)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcp03400]
    MCAP_0339 (polC)
Enzymes [BR:mcp01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     MCAP_0339 (polC)
DNA replication proteins [BR:mcp03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MCAP_0339 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcp03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     MCAP_0339 (polC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP DNA_pol3_a_NII HHH_6 DNA_pol3_a_NI tRNA_anti-codon RNase_H_2 Rv2179c-like
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABC01802
UniProt: Q2SSE0
LinkDB
Position
complement(402434..406873)
AA seq 1479 aa
MQTKILNIFKKLDIKLSEDDYIYFKDAILVETPRISKIKNKGYLHIQIKDFLPIEVLKQI
DNKLKNNNYFNFKLILDVENQHINKQLISQYLEFIKMYKSLFNNRISWKLLDIYNFDLEN
NQLIFTVSSQTTKNDISQELDYCLAKLNQFGFKNLSYLINVKEISLDALDQQEQKNSTSI
EQQTVIKQVEKKSSLPTSYKNKRTNLDKPSYQSLLDVEDDAQNIVIQGVVINKEFKLSKT
GRKIFYIDITDYHSSIRCMYFAKSDALCEFDDLTDEQLNSKNVEEIKESKIKINDWISVK
GKTSLSLYDQEQIFYIDDFKKINKQIISRTDDAKTKRVELHAHTKMSVMDGVSDPTDYLE
LISSWNHKAIAFTDHTNVQAFPDIYKALNSVNKKRIDQEKIKAIYGLEINMLNNDLWYVK
NPKNQNLKDAKMVFFDLETTGLSPELDEIIEFGAIEYNFKTGERKKIDILIKPKSKLKDF
TKKLTNINEEMLENKPGIEVAFKEINQVIKDAILVAHNANFDYTFLSHWSEKLGYGKLEN
TIIDTLTISRIIYPELKSHRLGSLAKRVNISYDPSIAHRGDYDADILADIYERMLDDTRK
KTKITIDSDWDKINPLNNIDNLNYHKNKGFHTNILVKNQTGLKELYKLVTKSHTTNFYSS
PKIFKSDLIEVKKNNNLLFGSSCVNSEIFELARTSTLENLKQAISFYDYIEIQPISVYKN
LLQNDSLDLDQLKKIITNIISIARQENKLIVASSDCHYTNPELKQIREVYINAKGLGGIR
HPLFDFNNKVKDYPDQYLRTTNEMLEEFSWLEDENLIYEIVVINSNKINEMIDVNVIPIK
DGLFTPKIANVDEKLRDKCYQTAKQMYGENLPDIVEKRLEKELGSITKHGFAIVYWISHL
LVKQSYDDGYLVGSRGSVGSSFVATMAQITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFDTDPTYKCGYD
LPTKKCPNCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQNQAHNFTKKMFGENN
VFRAGTISTVAEKTAFGYVKTYFEETKRDASLPRKTEINRLAKLAQGVKRTTGQHPGGII
ILPNEYEIEDFTPVNYPADDLSSTWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHDDPTALRMLRDLT
NIDPITIPTDDKNVYSLFSSLQALNLTSDKINDEITGAIGIPEFGTGFVRNMLKETKPKT
FADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKDNKANISTVIGCRDDIMVYLINMGLESSLAFMIM
ESVRKGKGLKKEWIDIMKKHNIPDWYIDSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAWYKIYYP
TEYYATYLSTKADVFDLKTALGGYEAVLLKLKSQQQKVKNGEKLSKKEEDLEVVYEVLLE
MFARNIKFSNIDFEKSEATKFKVDILEDNTKIIIPPFNVIDSLGEAVALSIINARNTKPI
TSVNDLKNRTQTTQTQIKIFEEFNILDSLSVDEQLTFDF
NT seq 4440 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaacaaaaatactaaacatctttaaaaaattagatatcaaattaagtgaagatgat
tatatctattttaaagatgctattttagtagaaactcctagaatttctaaaattaaaaac
aaaggttatttgcatattcaaattaaagactttttaccaatagaagttttaaaacaaatt
gataacaaactaaaaaataataattattttaattttaaattaatacttgatgtagaaaat
caacatattaataaacaactaattagtcaatatttagaatttattaaaatgtataaatct
ttatttaataatcgaatttcttgaaaattattagatatttataattttgacttagaaaat
aatcaattaatttttacagtaagtagtcaaacaactaaaaatgatattagtcaggaatta
gattattgtttagctaaattaaatcaatttgggtttaaaaatcttagttatttaataaat
gttaaagaaattagtttagatgctttagatcaacaagaacaaaaaaatagtacaagtata
gaacaacaaacagtaattaaacaagttgaaaaaaaatcaagtttacctactagttataaa
aataaaagaactaatttagataaacctagttatcagtcattattagatgttgaagatgat
gcacaaaacattgtaattcaaggtgttgtgattaataaagagtttaaattatcaaaaaca
ggtagaaagattttttatatagatataactgattatcattcttcaattagatgtatgtat
tttgcaaaaagtgatgcattatgtgaatttgatgatttaactgatgaacaattaaattct
aaaaatgttgaagaaattaaagaaagtaaaataaaaataaatgattgaattagtgttaaa
ggaaaaactagtttatctttatatgatcaagaacaaattttttatattgatgattttaaa
aagattaataaacaaattataagtagaactgatgatgctaaaactaagcgtgttgaatta
catgctcatactaaaatgagtgtaatggatggagttagtgatccaactgattatttagaa
ctaattagtagttgaaatcataaagcaattgcttttacagatcatactaatgtacaagct
tttccagatatttataaagctttaaattcagttaataaaaaacgtattgatcaagagaaa
attaaagctatttatggtttagaaatcaatatgttaaataacgatttatgatatgttaaa
aatcctaaaaatcaaaatttaaaagatgctaaaatggtcttttttgacttagaaactact
gggttaagtcctgaattagatgaaattattgaatttggagctattgaatataactttaaa
actggtgaaagaaaaaaaatagatattttaattaaaccaaaatcaaaactaaaagatttt
actaaaaagctaactaatataaatgaagaaatgttagaaaataaaccaggaattgaagtt
gcttttaaagaaattaatcaagtaataaaagatgctattttagtagctcataatgctaat
tttgactatacttttttatcacattgatctgaaaaactaggttatggaaaattagaaaac
actattattgatactttaacaatctcaagaattatttatcctgaattaaaatcacacaga
ttaggttcattagcaaaaagagtaaatatttcatatgatccaagcattgctcaccgtggt
gattatgatgctgatatattagctgatatttatgaaagaatgttagatgacactagaaaa
aaaactaaaatcacaatcgatagtgattgagataaaataaatcctttaaataatatcgat
aatttgaattatcacaaaaataaaggttttcatacaaacattttagttaaaaaccaaaca
ggattaaaagagttatataaattagtaacaaaatcacatactactaatttttattcatct
ccaaaaatttttaaaagtgatttaatcgaagttaaaaaaaataataatttattatttggt
tcaagttgtgttaatagtgaaatttttgaactagctagaactagtacacttgaaaattta
aaacaagcaattagtttttatgattatattgaaattcaaccaattagtgtttataaaaat
ttattacaaaatgattcactagatttagatcaattaaaaaaaataattacaaatattatt
agtatagcaagacaagaaaataaactaattgtagcaagtagtgattgtcattatacaaat
cctgaactaaaacaaattagagaagtttatattaatgctaaaggacttggtggaattaga
catccattatttgattttaataataaagttaaagattatcctgatcaatatttaagaaca
actaatgaaatgttagaagaatttagttgattagaagatgaaaatttaatttatgaaata
gttgttattaactctaataaaattaatgaaatgattgatgtcaatgtcattcctattaaa
gatggattatttactccaaaaattgctaatgttgatgaaaaattaagagataaatgttat
caaacagcaaaacaaatgtatggagaaaatttaccagatattgttgaaaaaagattagaa
aaagaattaggttcaattacaaaacatgggtttgctattgtttattggatttctcattta
ttagttaaacaatcatatgatgatggatatttagtaggatcacgtggttcagttggttca
tcatttgtagcaactatggctcaaattacagaagttaatcctttaaaagctcattataga
tgtttaaattgtaaatactcagattttgatactgatccaacttataaatgtggatatgat
ttgcctacaaaaaaatgtcctaattgtaatgaaaaactaattggagatggtcatgatatt
ccatttgaaacttttttaggttttgatggtgataaagttccagatattgatttaaacttt
tctggagaatatcaaaaccaagctcataattttactaaaaagatgtttggtgaaaataat
gtttttagagctggaacaatctcaacagttgctgaaaaaactgcttttggttatgtaaaa
acttattttgaagaaactaaaagagatgcaagtttgccaagaaaaactgaaattaataga
ttagcaaaactagctcaaggagtaaaaagaacaactggtcaacatccaggtggaattatt
attttaccaaacgagtatgaaattgaagattttactccagttaattatccagctgatgat
ttaagttcaacttgaaaaacaactcattttgatttccattcaattcatgacaatttatta
aaaatggatattctaggtcatgatgatccaaccgctttaagaatgctaagagatttgaca
aatattgatccaattactattccaacagatgataaaaatgtttattcattattttcatct
ttacaagctttaaatttaacttcagataaaattaatgatgaaatcactggagctattgga
atacctgaatttggaactggctttgttagaaatatgctaaaagaaacaaaaccaaaaact
tttgctgatctagtacaaatttctggtctttcacatggtactgatgtttggttaggtaat
gctagagatttaattaaagataataaagctaatatttctacagttattggatgtagagat
gatattatggtttatttaataaatatgggattagaaagttctttagcttttatgattatg
gaatcagttagaaaaggtaaaggattaaaaaaagaatgaatcgatattatgaaaaaacat
aatattccagattgatatattgattcatgtttaaagattaaatatatgtttccaaaagcg
catgccactgcttatgtgttaatggcttatagaattgcttgatataaaatttattatcca
actgaatattatgcaacttatttatctacaaaagctgatgtttttgatttaaaaacagct
cttggtggatatgaagcagttttattaaaattaaaatctcaacaacaaaaagtaaaaaat
ggagaaaaattatcaaaaaaagaagaagatttagaagttgtatatgaagttttattagaa
atgtttgctagaaatattaagtttagtaatattgattttgaaaaatctgaagctactaaa
tttaaagtagatattttagaagataatactaaaattattattccaccatttaatgtgatt
gattcactaggagaagcagtggcactttctataattaatgctagaaatacaaaaccaatt
acttcagttaatgatttaaaaaacagaacacaaactacacaaactcaaattaaaattttt
gaagaatttaatattttagactcattatcagttgatgaacaattaacttttgatttctaa

DBGET integrated database retrieval system