Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343: MCAP_0455
Help
Entry
MCAP_0455 CDS
T00309
Name
(GenBank) helicase, RecD/TraA family, putative
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
mcp
Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
Pathway
mcp03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
MCAP_0455
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcp03400
]
MCAP_0455
Enzymes [BR:
mcp01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
MCAP_0455
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcp03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
MCAP_0455
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
Viral_helicase1
UvrD_C_2
AAA_11
SH3_13
SLFN-g3_helicase
OB_YrrC
AAA_12
AAA_22
Helicase_RecD
NPHP3_N
RsgA_GTPase
AAA_28
AAA_29
PhoH
T2SSE
AAA
NTPase_1
ABC_tran
HHH_5
TsaE
DEAD
AAA_18
AAA_17
AAA_16
cobW
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABC01432
UniProt:
Q2SS34
LinkDB
All DBs
Position
complement(541179..543374)
Genome browser
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MEEQIKIRGYLSKFLYKSNSWALAIFIDEKNSKKTIKIKGEITDLKPKVLYELTGKQTLH
IKYGTSFEVSSYALANINTSDQIINFLKSDVFPGIGNLTAKKIAKLYSNNFIEEILNNKE
KFLQIKDISKDKLELIYNKIKQINDQNWLRIEFINNNLSLKIFDKLKKYTDNEIEIRQLF
TNNWFEFAINNNLGLIQEIDKIFLYFNNNQIDDLTRIAYWSLTACNEILFNSGDSYTLKH
RLINKLTSLIKLNDLNIINNGLEYAFSHNLLVSDDQKIYTYESYSDELIISNAIVKHNIK
NNDINDDLLDLYIEQIQNKTSSQIKNFKYDTSQKLALKNFVKNKISIITGGPGTGKTTII
KAIVSLFEKVYHSTNYAICTPTGRAAAKIRENFYDSNATTMHKLLGYEKDKKFLINQDHP
LDYDLLIVDECSMIDARLFSQFFLSINKAKKIVLIGDVDQLASVSYGNVFFDIISSNVLS
TTNLTQIHRQNLDNGIIDLAYMIKNDNFDLNKLNSLKNVECYFNKDKDWCLEKVKEIYEK
NINNQANIQVISPVYADILGIENLNNFIQYNFNLNILDTNNIYDRLRFRYAINDKVMYLK
NDSELNLSNGDIGYISQINKTNNKFSSAIINFNNNFLEFSSEQFDDISLSYCCSVHKTQG
SEYDKVILVLQNTLFNTFINKKLLYTAITRAKKQLFIIGDYDLFLLGINKQAKLRKTTLV
KHILNNLKMKE
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaacaaataaaaattagaggttatttgtctaagtttttatataaatcaaattcg
tgagctttagcaatttttatagatgaaaaaaatagtaaaaaaactataaaaattaaaggt
gaaattactgatttaaaacctaaagttttatatgaacttacaggtaagcaaacgcttcat
attaaatatggaactagttttgaagttagtagttatgctttagcaaatataaatacttca
gatcaaattattaattttttaaaatctgatgtttttcctggtattggtaatttaacagct
aaaaaaatagcaaaactttattcaaacaattttattgaagaaattttaaataataaagaa
aagtttttacaaataaaagatattagtaaagataaattagaattaatttataacaaaatc
aaacaaattaatgatcaaaactggctaagaatagaatttataaataacaatttaagttta
aaaatttttgataaattaaaaaaatatactgataatgaaatagaaataagacaactattt
acaaataattgatttgaatttgctattaataacaatttaggtttaattcaagaaatagat
aaaatttttttatattttaataataatcaaattgatgacttaactagaattgcttattga
agtttaactgcttgtaatgaaattttatttaattcaggagatagttatactttaaaacat
cgtttaataaataaacttactagtttaattaaactaaatgatttaaatattattaataat
ggattagaatatgcttttagtcataatttattagttagtgatgatcaaaaaatctatact
tatgaatcttatagtgatgaattaattataagtaatgcaattgttaaacataatattaaa
aataatgatattaatgatgatttattagatttatatattgaacaaattcaaaataaaact
agtagtcaaattaaaaactttaaatatgatacttctcaaaaactagctttaaaaaatttt
gttaaaaataaaatcagtattattactggaggacctggaactggtaaaactacaattatt
aaagcaattgtaagtttgtttgaaaaagtttatcattcaactaattatgcgatttgtaca
ccaacaggaagagcagcagctaaaattagagaaaacttttatgattctaatgcaacaacg
atgcataaattattaggctatgaaaaagataaaaaatttttaataaatcaagatcatcca
ttagattatgatttattaattgttgatgagtgttcaatgattgatgcaagattatttagt
caattctttttatcaattaataaagctaaaaaaatagttttgattggtgatgttgatcaa
ttagctagtgttagttatggaaatgtattttttgatattattagtagtaatgttttaagc
acaactaatttaactcaaattcaccgtcaaaatttagataatggaattattgatttagct
tatatgattaaaaatgataattttgatttaaataagctaaatagtttaaaaaatgttgag
tgttattttaataaagataaagactggtgtttagaaaaagtcaaagaaatttatgaaaaa
aatattaacaatcaagcaaatatacaagtaatttctccagtatatgctgatattttggga
atagaaaatttaaataatttcattcaatataactttaatttaaacattttagatactaat
aatatttatgatagattaaggtttagatatgctattaatgataaagtaatgtatttaaaa
aatgatagtgaattaaatttatctaatggagatattggctatattagtcaaattaataaa
acaaataataaattttcttcagcaataattaattttaataataattttttagagtttagt
agtgagcaatttgatgatattagtttaagttattgttgtagtgttcataaaactcaaggt
agtgaatatgataaagtgattttagttttacaaaacacactctttaatacatttattaat
aaaaagttattatatacagcaataacaagagctaaaaaacaattatttattattggagat
tatgatttgtttttattaggaattaataaacaagcaaaattaagaaaaactactttagta
aaacatatcttaaataatttaaaaatgaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
