Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343: MCAP_0500
Help
Entry
MCAP_0500 CDS
T00309
Name
(GenBank) ATP-dependent RNA helicase, DEAD-DEAH box family
KO
K18692
ATP-dependent RNA helicase CshB [EC:
5.6.2.7
]
Organism
mcp
Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mcp03019
]
MCAP_0500
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mcp03009
]
MCAP_0500
Enzymes [BR:
mcp01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
MCAP_0500
Messenger RNA biogenesis [BR:
mcp03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Helicases
MCAP_0500
Ribosome biogenesis [BR:
mcp03009
]
Prokaryotic type
rRNA helicases
MCAP_0500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
PhoH
Cas3-like_C_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABC01111
UniProt:
Q2SRZ0
LinkDB
All DBs
Position
complement(597343..598704)
Genome browser
AA seq
453 aa
AA seq
DB search
MKFTDFGFKKYINDTLDQIEFIAPTSIQQKVIPLLKKHQNVIALAHTGTGKTHSFLLPIL
NNLKLEENDNYVQAVIISPTRELSLQIYQNTKLFLKNNPLINCNLFIGGEDISKNIEQLE
KKQPHIVIGTPTRLKELYDLNKLRLTTTSYFIIDECDMIFDLGFIEDVDYLISKINQNVT
IGIFSATISQQLSVFCKKYIKNAHFIDDSQNKISTSNVKHILIDTKNKELEQSLIQIINS
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TDVASRGVDIKGVSHIISINLPSDLTYYIHRSGRTGRNNSTGYSYIIYNLKNKTQIEELI
KKGIEFETKKLIDNQLVDIKTNYKKVKVFKELDAESKQVINKYKNKKVKPNYKKKRKQEL
DKIKQKIRRKHIKENIEKIKKAKYQKRRSELFD
NT seq
1362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
