KEGG   Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343: MCAP_0774
Entry
MCAP_0774         CDS       T00309                                 
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC, A subunit
  KO
K03701  excinuclease ABC subunit A
Organism
mcp  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
Pathway
mcp03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcp00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    MCAP_0774 (uvrA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mcp03400]
    MCAP_0774 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:mcp03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     MCAP_0774 (uvrA)
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
     Supressor
      MCAP_0774 (uvrA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrA_inter UvrA_DNA-bind ABC_tran SMC_N nSTAND3 AAA_29 AAA_21 RsgA_GTPase AAA_14 nSTAND1 AAA_22 APS_kinase NB-ARC AAA_18 ATPase NACHT DnaJ_CXXCXGXG T2SSE cobW Viral_helicase1 AAA_23 MeaB
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABC01484
UniProt: Q2SR90
LinkDB
Position
892149..894989
AA seq 946 aa
MSTDKIIIKGAREHNLKNIDLELPKNKLIVFTGLSGSGKSSLAFSTIYQEGRRRYIESLS
AYARQFLGGNEKPDVDSIEGLSPAISIDQKTTSHNPRSTVGTVTEIYDYLRLLYARIGQP
YCINNHGQIKAVSIKEIVENIKQSTSDGEQIHILSPVIRDKKGTHIDILEKLRNDGFIRV
IVDDQLRMLDDQINLEKNQRHNIDIVVDRIIYHNNDEINSRIFTAVEMGLKYSNNLIKIA
FPNSNKQEKLFSTSFSCKVCDFVVPELEPRLFSFNAPLGACELCNGLGVSLEPDINLILP
DLKLSINQGGVVYYKNFMHTKNIEWQKFRILCDYYYIDLNTPLKDLTQKQRDIILWGSDR
EIDIKIVTENNNKYEKYDFIEGNAALIKRRYFESKSEEARKWYSKFMSSKICKQCKGSRL
NDIALSVKINEKSIFDYTNMSISEQLDFLLNIDLTPTQAMIAKLVLDEIISRTNFLNEVG
LGYLNLSRTATTLSGGESQRIRLAKQIGSQLTGILYVLDEPSIGLHQKDNDKLIKTLKHL
RDLGNTLIVVEHDEDTMKSSDWIVDIGPRAGEYGGEITFSGTYQDILKSDTITGRYLSRK
EGIVVPKIRRGGNGKKIEIIGASENNLKNINVTIPLNKFITITGVSGSGKSTLLEDIVYK
GIHNNLSKEYLPIGKVKEIKGIENINKAIYISQEPIGKTPRSNPATYTSVFDDIRDLFTN
LPEAKIRGYKKGRFSFNVHGGRCEHCQGDGVITISMQFMPSVEVVCEICEGKRYNDETLT
VKYKNKSIADVLNMSVSEAYVFFENIPQIKQKLETILEVGLGYIKLGQNATTLSGGESQR
IKLSTYLLKKQTGNTMFLLDEPTTGLHVDDVKRLIGVLNKLVDLGNTVLCIEHNLDFIKV
SDHIIDLGPDGGEYGGQVVVTGTPEQIINHPTSYTAKYLKDYIIND
NT seq 2841 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaacagataaaattattataaaaggtgctagagaacataatttaaaaaatattgat
ttagaacttcctaaaaataaattaattgtttttacaggcttaagtgggtctggaaagtct
tcattagctttttcaacaatttatcaagaaggaagaagaagatatatcgaatcactttct
gcttatgctagacaatttttaggtggtaatgaaaagcctgatgttgattctattgaaggt
ttatctcctgcaatttctattgatcaaaaaaccacaagtcacaatcctagatcaactgtt
ggaactgttactgaaatttatgattatttacgtttattatatgcaagaattggacagcct
tattgtattaataatcatggtcaaattaaagcagtaagtattaaagaaattgttgaaaat
attaaacaatcaactagcgatggtgaacaaattcacattttatctccagtaattagagat
aaaaaaggaactcatattgatattttagaaaaactaagaaatgatgggtttattagagtt
attgttgatgatcaattaagaatgctagatgatcaaattaatttagaaaaaaatcaaaga
cataatatagatatagttgttgatagaattatttatcataataatgatgaaattaattca
agaatatttacagctgttgaaatggggttaaaatattcaaataacttaattaaaattgca
tttccaaattctaataaacaagaaaaattattttcaacttctttttcatgtaaagtttgt
gattttgtagttccagaacttgaacctagattattttcatttaatgctccacttggtgct
tgcgaattatgtaatggattaggtgttagtttagaaccagatataaatttaattcttcct
gatttaaaattatcaattaatcaaggtggggttgtttattataaaaattttatgcataca
aaaaatatagaatgacaaaaatttagaattttatgtgattattactatattgatctaaac
actcctttaaaagatttgactcaaaaacaaagagatataattttatgaggaagtgatcga
gaaattgatattaaaattgttactgaaaataataataaatatgaaaaatatgattttatt
gagggtaatgcagctttaatcaagagaagatattttgaatctaaatcagaagaagctaga
aaatgatattcaaaatttatgtcttctaaaatatgtaaacaatgtaaaggaagtagatta
aatgacattgctttatctgtaaaaattaatgaaaaatctatatttgattatactaatatg
agtatttctgaacagttagattttttattaaacattgatttaactccaactcaagctatg
attgcaaaattagttctagatgaaattatttcaagaactaactttttaaatgaagttgga
ttaggatatttaaatctatcaagaacagctacaactttaagtggtggagaatctcaaaga
attagattagctaaacaaattggatctcaattaactggaattttatatgttttagatgaa
ccatcaattggattacatcaaaaagataatgataaattaattaaaactttaaagcattta
agagatctaggaaatactttaattgttgttgaacatgatgaagacacaatgaaaagtagt
gattgaattgttgatattggccctagagctggagaatatggtggagaaattacttttagt
ggaacatatcaagatattttaaaatcagatacaattactggtagatatttatcaagaaaa
gaaggtatagtagttcctaaaattagacgcgggggtaatggtaaaaaaattgaaattatt
ggagctagtgaaaataatttaaaaaatattaatgtaactattcctttaaataaatttata
actattacaggtgttagtggatctggaaaatcaactttactagaagatattgtttataaa
ggaattcataataatttatcaaaagaatatttaccaattggaaaagttaaagaaattaaa
ggtatagaaaatattaataaagctatttatatttctcaagaaccaattggaaaaactcca
agaagtaatccagcaacttatacttcagtttttgatgatattagagatctatttactaat
cttccagaagcaaaaattagaggttataaaaaaggtagattttcatttaatgttcatggt
ggtagatgtgaacactgtcaaggtgatggagtaattacaatttctatgcaatttatgcca
agtgttgaagttgtttgtgaaatttgtgaaggtaaaagatataatgatgaaactctaaca
gttaaatataaaaataaatcaattgccgatgttttaaatatgagtgttagtgaagcttat
gtcttttttgaaaatatacctcaaattaaacaaaagttagaaactattttagaagttggt
ttaggttatattaaactagggcaaaacgctacaactttaagtggtggagaatctcaaaga
attaaattatctacttacttattaaaaaaacaaactggaaatactatgtttttattagat
gaaccaacaactggtttacacgttgatgatgttaaaagattaattggtgttttaaataaa
ttagttgatttaggaaatacagttttatgtattgaacataatctagactttattaaagtt
tcagatcatattattgatcttggtcctgatggtggagagtatggtggtcaagttgtagta
actggaactccagaacaaataattaatcatccaacttcttatacagctaaatacttaaaa
gattacataattaatgattag

DBGET integrated database retrieval system