Methanobacterium congolense: MCBB_1963
Help
Entry
MCBB_1963 CDS
T04503
Name
(GenBank) putative protein ORF5B
Organism
mcub
Methanobacterium congolense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
TRAP_beta
DUF7619
CARDB
DUF7507
bMG3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SCG86511
UniProt:
A0A1D3L4G2
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2033618..2042068)
Genome browser
AA seq
2816 aa
AA seq
DB search
MKTKLLLFTVFLLIITLCGTASAADTSNITFNSSTNLTNSNSNVNASNQSNIVLSGNVTR
CDNGLPFSGVTISVNSLNGSFVGSTTTDAVGFYSMNFSSDERNFMVTASHTGHVPETKYV
DATTCTNNSGNLVGFANFKLGPIPVSTVTAPNSSFINESFNFQVSFKDGGDVTGYGPYIE
LITPEGVTLNPSSVTYLGSKVTVTDNGIFPASGTLIDALTGLSVTGTPGSHLWIIQYPLG
SFTTQEPEAVLNLTATVDGNATLGLPLNITAYPVFRYGATPTGTTPLRGVSSTTPVTPTV
IKLTKTSDAHEQETATGSNYPVTYTLTVDVANGQTVNNVTLIDYIPGNLQFVKVVDPAGG
TVIQQPSTTTPGGKLIINFGSITGVLGSDRVVKYTVFAPEFNNTAGYVLDPSTGATTNAT
NNATVNGTYLSNPVSSSDSYTLNLKSLAVQKGVSDTTNSTNHKPLDILKYTVNFQVSDFF
SLKELVIMDTMGDGQTFLNDAAHTPTLTLHLPSGTYNLNFNPLDSSVFQMIHNSTTGETY
LVFNVSQLLINNGLSGVLEGVNYTGVNNGATEGSINFWSQINVNYENPNHPVVSNDYIKN
SVTDSAKLTENNSSVSDGSGTQIRIVSPTASKSIYKINGSDPVSGNPVKPGDTVTFSLEV
YVPTTNLENFSITDYLPLPFLRTVGFSNGQTPVAQGTLPSAGQWCFASDDTFSALTGTIP
TLVVDPVQNTLTFFYGNVYNATQPTSLVHILFTVTATDEPMVDSLYLTNLMNINYNNTFL
ETFADNKIVSLTTQEPHITVTKTANTTTAQGGDSVTYTIKIQNTGHATAYNVNVLDNFKN
LFFPSYVQSITGVTATYQNGQSIDLTGLGDLFGNGLNFGALYPIYTANDSSHINMSTIII
TYTALLGNVYPNQSLTNTVNVTNYTSSPLAGSPNYVTNPADYSSTATVTTLKPQFTKSYL
GSLDGISSGNNLTIGEKGRFRLVVTLPGGQITNLKIVDTLPNGLTYLGYYLNTSGPGYLG
SLAPLSFTQSGNVLTFLFSGTSNTTSGSNNIFYIDLDFIVANSTSNPVHSTNNTQTNSAT
LSWTDPGNSPITRTAAVNVVEPLLNITKTFSPNPVQGGQTTTVTITVKNTGSSTAYHTII
TDPLNGTNGSQIFDLTSVLEGTTASGFSYNYSNGVVTYTGGDIAAGQTKTFTFTVKILPD
VVIGPRYTNTATANYYSLPWNGTSPDPNGRQYTNSGSAVLRTGNPTIGKNILTSSIHGTT
GNLTVGEYVTYRIPVTMPTGVFNNLKVVDTLPNGFQYTGVYFVNTTNFSGVISNPIVTVS
GQSITFLFSGLTNSTASNNPFYIDLQALVLNQTINNATVPTKTNRVNLTWDENTAGAFTA
TKTATIVEPKLSVSKSVTPTTVDGGDKMTVTLNVTNNGGSPAYNVNLTDTLNSTLFDLTT
FSYTPVTGFNISLIGNTVKIVAGDDTTVINPGQTIQFIFTLNAMKDAPSNSSFINNATIQ
SFRSLPPSYTESRAYPAVNSNNVIISTVAPSASKTINSTSEPDSTGTNVMVGEVVTYQLN
LTVPEGKTINVNLNDVLSSKLKYLAGSAQIKRSNGSITATGFNFSQINAFENIDPTTTSN
IAFNLGNITYTGTDGLQNGTLTLIFNAVVLNSQNQRGDTIPNSLIFTYQNATGQTSSSTT
SSPALNVVVPQLSSSKQVLNPVTPASVEGGQNVTFKVQVQNNNTTNGAPAYNLQILDPLL
PDYTGLDYTHLIITPSNAGIVFHDFSTAGVLNITVDRLLPGEYLNITYNATVNPQVKYGD
QNVTNTVNFTGTTLPGDHGTNNSTPGNPGADDGKRTGDPLQGAINNLYSNATATLTARKP
TISKAIVGSSNSPVGGSVHYRITITLPVGVTDDMYLTDVMASGTSYVTGSATLTPSTGIS
TEFAVPQVSGTGTLNFDFGWINATQSGTIYLDYYGLVENVLSNQNGVTLTNTANMYFKDP
QNPGNYLNGGSSNATSTVVEPNLQVTKTASKTNLNTGEQFTYTVTVKHTATSTSDAYDVQ
VVDTLPYGLTYVPGSEVLPPTWTLTVSGSTLTFTAPVLTLSEGDVSFIFNCTVNNNYNLA
GGNLTNIAVSTYASEPSGNPDRRTGTDGLGPGVLNDYYTTGNAQVHVLGADIVVEKVGPS
SVNAGEPLNYTVIVINKGPDTAVNVVLNDTIMGSWFNRLVNPQYSINGGSWINVPSGSWA
LNLGNILPGAENNVTIAVRSILASSAPAGQINNTATATSTTADPVPTDNTSTALTDVGIN
DSLVITKTGPSGPLTAGKDNITYTLTIHNNGPSDSSQLTITDDVPGVLTNVEYFVVGYST
SWMEWNNPLIWLQPLTAGQDIVIEIRGNILPNATSSNGNELNSIVVTNNANVTSPTDPAG
SSDQWNTTVVAQVDVFVEKTGTPNPVVPGTNVTYTIKVGNRGPSTAVGVTLNDIVPSVIV
NPEFSLDNGTTWNPWTGNLLLGNLEPNQNLTVLLRGTENATNHDNFTNTATVSSQTNDPN
TEDKTSSYEIRVKTADIEVTKDANNLTPNYNQNVTFTVTVTNHGPDEATGVVVSDLLPDG
LKLISYSATQGFYNSTTGIWMVGTLENGFNSTLTIIAQVVKTGNLTNVANKTAENEYDPN
PENNNDSKTLNVPAAATLSITKTASPVKLHIHESVIFTLIVQNHGPDAAVSVYVDDKLPK
GLKYLSSSANYGSYDPSTGIWTIGDLPNGTTAVLTMKCGVEVLGPLENHAHVYSSTYDPI
LHPTSAAAGVSVTPQPVPNNPDKNGKTVPMQPTAVPLAALVLAVLMIVGGFGFKKR
NT seq
8451 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactaaattactgctgtttacagtttttttactgataattaccctttgtgggaca
gcatcagctgcagatacttcaaatattacttttaattcaagtactaatttaactaattct
aattcgaatgttaatgcttcaaatcaatctaacatagttttatcaggtaatgtaactcgc
tgtgataatggattgccattcagcggagtcacaataagtgtcaattctttaaatggtagt
tttgttggaagcacaaccacagatgctgttggattttactcaatgaacttttcaagtgat
gaaaggaacttcatggtcacagcaagccacacaggacacgtacctgaaacaaaatatgtg
gatgcgacaacctgcacaaataattcaggaaatcttgtaggttttgcgaacttcaaactt
gggccaataccagtttcaacggtcacagcaccaaattcctcctttataaatgaaagtttt
aactttcaggtgagcttcaaggatggtggagatgttacaggttacggaccttacattgaa
ctcataacgcctgagggtgtaaccctaaacccatcaagtgtaacataccttggatcgaag
gtgactgttacagataatggtatattcccagcatcgggaacattgatcgatgccctcact
ggactgtctgtcacaggaactccaggttcacacctctggataatccagtacccccttgga
agtttcacaacccaggaacctgaagcagtgctcaacctcactgcaacggtagatggaaat
gcaacacttggtcttccactgaatatcacagcatatccagtttttcgttacggtgcaaca
ccaactggaaccacaccacttcggggtgtaagttcaacaacacctgtaacaccaacggtt
ataaaactcacaaagaccagtgatgcccatgagcaggagacagccactggatccaactac
cctgtgacctacaccttaacagttgatgttgcaaatggacagacagttaacaacgtaacc
ctgattgattatattcctggaaatcttcagttcgttaaggtagttgatccagcaggtgga
acagtgatccagcagccatcaacaaccacccctggtggaaaactcataatcaactttgga
tccataactggagtgcttggctcagatagggtggtgaagtacacagtctttgcaccagaa
ttcaacaacaccgcggggtatgtacttgacccatcaacaggtgccacaaccaatgcaacc
aacaacgcaactgtcaatggaacctacctctcaaaccccgtttcatcaagtgacagttac
actctgaacctgaaatcacttgcagtgcagaagggagtttcagatacaacgaattcaaca
aaccacaaaccccttgacattctgaagtacactgtgaacttccaggtatcagacttcttc
tcactcaaggagcttgtgataatggatactatgggggatggtcagacattccttaatgat
gcagcacacacaccaaccctaacattacaccttccaagtggaacatacaacctgaacttc
aaccctcttgattcatcagttttccagatgatccacaacagcacaactggtgaaacctat
ttagtgttcaatgtatctcaattgttaataaacaatgggttgagtggtgtgctggaggga
gttaactacactggagttaacaatggagccacagagggttcaattaacttctggtcccag
atcaatgtgaactatgagaaccctaaccatcctgtggtttccaacgattacataaaaaat
tcagtgacagattctgcaaaacttactgaaaataacagttctgtatccgatggaagtgga
acccaaataaggatagtttctccaacggcatcaaagtcaatatacaagatcaacggttca
gacccagttagtggaaatcctgttaaacctggagatacagtcacattttcgctggaagtt
tatgttccaacaaccaaccttgaaaatttcagcataacagattacttgccactcccattt
ttaaggacagtcggattttcaaatggtcagacacctgtagctcagggcactttaccctcg
gcggggcagtggtgttttgcaagtgatgacacattcagtgcccttacaggaacaattcct
acactggttgttgatcctgttcagaacaccttaacctttttctatggaaatgtatacaat
gcaacacagccaacgagtttggttcacattctctttactgtaacggccactgacgaacca
atggtcgattctctctacctcactaaccttatgaacatcaattacaacaacacattcctg
gagacattcgcagacaacaaaattgtttcactcacaacacaggagccacatataaccgtc
acaaaaactgcaaacacaaccactgctcaaggtggggacagcgtaacctacacgataaag
attcagaatacaggtcatgctactgcatacaacgttaatgtgttggataatttcaagaac
ctcttcttcccaagctacgtacagtcaataacaggagtaactgcaacatatcaaaatggc
cagtccatagatctcactgggttaggagacttatttggaaatggtttaaactttggagca
ctttaccctatttatactgcaaatgattcaagtcacatcaacatgagcacgataatcatc
acttacacagctctccttggtaacgtctacccaaatcagagcttaactaacactgtaaat
gtaaccaattatacctcatcacccctggccggaagccctaactatgtgacgaatcctgca
gattacagttcaactgctacggtaacaactttaaaacctcaattcacaaaatcatatctt
ggatcacttgatggaatcagttcagggaacaatttaacaataggagaaaaaggaaggttc
agacttgttgtaacacttcctggagggcagataacaaatctaaaaatagtggacacactg
ccaaatggattaacctacctaggttactatttaaacacaagtggacctggatacctggga
tccttagctcctctaagtttcactcagagcggtaatgtgttaacattcctattttcagga
acatccaacacaacatcaggttccaacaacatattctacatagatcttgatttcatcgtt
gcaaacagcacatcaaaccctgtacatagtacaaacaacacacaaaccaacagcgcaacc
ctgagctggacagaccctggaaattcaccgataacaagaactgctgcagttaatgtggtg
gaaccattactgaatattaccaaaacattcagtccaaacccggttcagggaggacaaacc
acaaccgtaaccatcacagttaaaaatacgggtagctcaacggcttaccacacaattata
acggatcctttaaacggaacaaacggcagtcaaatatttgatttaacaagtgttttggaa
ggaacaacagcttctggatttagttataactattcaaatggagttgtaacatacactggt
ggggacatagctgctgggcaaacaaaaacattcacattcacggttaaaattttaccggat
gttgtaattggaccaaggtataccaacactgcaacagcaaactattattcactgccttgg
aatggaacgagtcctgatccaaatggaaggcagtacactaattcaggttcggctgtactt
agaactggaaaccctacaataggaaaaaacatcttaacatcaagcatacatggaacaaca
ggcaacctcactgttggagaatacgtgacatacagaatacctgtaacaatgccaacaggt
gtttttaacaaccttaaagtcgtggatacacttccaaatggattccaatacactggagtt
tacttcgttaacaccaccaacttcagtggagtaatctcaaatccaattgtaacagtttca
ggacaatccataactttcctgttttcaggcttaacaaacagcacagcatcgaacaaccca
ttttatatagatctacaggcattggttttaaaccagaccattaacaatgccacagttcca
acaaaaactaacagggtgaacctcacatgggatgaaaatacagcaggagcatttacagct
acaaaaactgcaacgatcgttgaaccgaaactttcagtatccaaatcagtcacaccaaca
acggttgacggcggtgataaaatgactgtaaccctgaacgtgaccaacaatggaggatca
cctgcttacaatgtaaacttgacagataccttaaattcaacactctttgacctaaccacc
ttcagttacactccagtaactggctttaacatatccttaataggtaacactgttaaaata
gttgcaggtgatgatacaacagttatcaaccctggtcaaaccatacaattcattttcaca
ctcaatgcaatgaaagatgcaccatccaattcatctttcatcaacaatgcaacgatccag
agtttcaggtcgctacctccaagttacactgaaagtagggcctaccctgcagtgaattcc
aacaacgtaatcataagtacggttgctccaagtgcttctaaaaccataaattcaacttca
gaaccagattccacaggaacaaatgttatggtaggtgaagttgtaacttaccaactcaat
ctaacagttcctgagggaaaaacaattaatgttaatttgaatgatgttttaagttccaaa
ttaaaatatctggctggttctgcccagataaaaagaagcaatggaagtataactgcaact
ggattcaacttcagccaaataaatgcatttgaaaatatagatccaacaacaacttcaaat
attgcatttaacttgggaaacatcacttatactggtactgatggacttcaaaacggtacc
ctaactctcatattcaatgcagttgttctcaacagtcagaatcagaggggggacaccata
cctaacagtttaatattcacgtatcaaaacgctaccggccagaccagttcaagcacaacc
agttctcctgctttaaatgtggtcgtgccacagttatcctcatcaaaacaggttctaaat
ccagttactccagcttcggttgaggggggacagaacgtgaccttcaaggttcaggttcaa
aacaacaacacaaccaacggagcaccagcatacaacctgcagatcctggatcctttactt
ccagactacacaggacttgattacacccacctaataatcactccaagcaatgcaggaatt
gttttccatgacttctccactgccggagttcttaacatcacagttgacagactgctgccc
ggtgagtatctgaatatcacctacaacgcaacagtcaatccacaggttaaatacggcgac
caaaatgttacaaacacggttaactttacaggaacaacattacctggagatcatggtact
aacaactccacaccaggaaatcccggtgcagatgatggtaaaagaactggtgatccactc
cagggagctattaacaacttatactcaaatgcaacagccaccttaactgcaagaaaacca
acgatttccaaggcaattgttggtagcagcaattcacctgtaggtggttctgtgcattac
aggataacaataacccttccagtgggcgttactgatgatatgtatttaacagatgtcatg
gcttctggaacttcctatgtaactggaagtgcaactctaactccttcaacaggaatttca
acggagtttgctgttcctcaagtttctggaactggcacactgaacttcgactttggatgg
atcaatgcaacccagtctggaactatctaccttgattactatggacttgttgagaatgtt
ctctcaaatcagaatggagttacattaacaaacactgccaacatgtactttaaagaccct
caaaacccaggaaattacctgaacggaggatcatcaaatgcaacatccactgtggtggaa
ccaaaccttcaggtaacaaaaacagccagcaaaacaaatctaaacacgggagaacagttc
acatacactgtaactgtaaaacacacagcaacaagcacatcagatgcatacgacgtacaa
gtggtggacacactcccctatggattaacctacgtgcctggctcagaggttctgccacca
acatggactttaacagtttcaggcagcactctgaccttcacagccccagtactgacactt
tctgagggtgatgtaagtttcatcttcaactgtaccgtgaacaacaactacaaccttgca
gggggtaaccttacaaacattgcagtttcaacctacgcatcagaaccttctggtaatcct
gacagaagaactggaactgatggacttggacccggagttctaaatgattactacaccact
ggaaacgctcaagtgcatgttttaggtgctgatattgttgttgagaaggttggaccctcc
agcgttaatgctggtgaaccactgaactacacagtaatcgtgataaacaaaggccctgac
acggctgtaaacgtggtcttaaatgacacaatcatgggttcatggttcaaccgccttgtt
aatccacagtactccattaacggaggctcatggatcaacgtaccttcaggttcatgggca
ctgaaccttggaaacatactgccaggggcagaaaacaatgtaacaatagctgtaagatca
atacttgcctcttcagcacctgcaggacagataaacaacacagcaactgcaacatcaaca
actgcagatcctgttccaactgataacacaagtacggctttaacagatgtcggaataaat
gattctctggtcattacaaaaacaggaccttcaggacctttaaccgctggaaaagataac
ataacctacactttgacaatacacaacaatggtccgtctgattcatcacagctgacaata
actgacgatgttccaggggtgcttaccaatgttgagtacttcgttgtaggatacagcaca
tcttggatggaatggaacaacccactgatatggttgcaacctttaactgcaggtcaagac
attgtaatagagataaggggaaacatacttccaaatgctacatcatccaatggtaatgag
ttgaacagcatagtggttacaaacaatgctaatgtaacctctccaacggatcctgcaggc
agttctgaccaatggaacaccacggtcgtggcgcaggttgatgtgtttgtcgaaaaaaca
ggaacaccaaaccctgttgttccaggaacaaatgtaacatacaccataaaagttggtaac
aggggaccttcaactgcagttggagtaacattgaatgatattgttccatccgttattgtc
aatccagaattcagcctggacaatggaacaacatggaacccgtggactggaaacctttta
ctcggtaacttggaaccaaaccagaatttaacagtacttctgaggggaactgagaatgca
accaatcatgacaatttcacaaacacggcaacagtttcatcccagacaaacgatccaaac
actgaagataaaacatcttcctatgagataagggttaaaacagcagatatagaagttaca
aaggatgcaaacaacttgacacctaactacaatcagaacgtgaccttcacggttacagtg
accaaccacggccctgatgaagctacaggtgttgttgtatctgatctacttccagatgga
cttaaactcatatcatactctgctactcagggattctacaactcaacaacaggtatatgg
atggttggaacgctggaaaatggtttcaactcaactttgaccataattgcccaggttgtt
aaaacaggaaacctgacaaacgttgccaacaaaactgcagagaatgaatacgatcctaat
cctgaaaataacaacgactcaaagactctgaacgtaccagcagctgcaacactttcaata
actaaaacagccagcccagtaaaacttcacatacatgaatctgtgattttcactttaata
gtgcagaatcatggtccagacgcagctgttagtgtttacgttgatgataaacttccaaag
ggattgaaatacctttcatcaagtgcgaattatgggtcatacgatccaagtactggaata
tggacaattggggatctgccaaatggcacaactgcagttttaacaatgaaatgtggtgtg
gaagttttagggcctttagagaatcatgcacatgtgtactcaagtacgtatgatcctatt
ctccatccaacttcagctgcagcaggagtcagtgtaactccacagccagtgccgaataat
ccagataaaaatggaaaaactgttccaatgcagccaacagccgtaccacttgcagcactt
gtgcttgctgtgctcatgattgttgggggtttcggatttaaaaagaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system