KEGG   Mycoplasmopsis cynos: MCYN_0451
Entry
MCYN_0451         CDS       T02424                                 
Symbol
MCYN0451
Name
(GenBank) Putative uncharacterized protein
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mcy  Mycoplasmopsis cynos
Pathway
mcy03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mcy00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    MCYN_0451 (MCYN0451)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mcy03019]
    MCYN_0451 (MCYN0451)
Messenger RNA biogenesis [BR:mcy03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     MCYN_0451 (MCYN0451)
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B RMMBL Lactamase_B_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: CCP24183
UniProt: L0RUL8
LinkDB
Position
478875..480767
AA seq 630 aa
MQNIQKIPTRIIALGGFEEIGKSTLLIEHKNHIFIIDSGIKFADTFNTGIKGIIPNFDYL
NQDEKIIEGLFITHGHEDHIGGVVYLVKKTKLNKIFAPRIAIQYLQLKFEEHNIKRKIEF
IEIQKNDVYKFENNCKVDFWTVQHSIPDAFGIRITTPNGSLMCTGDFRFDYTPIGNFTDF
ARLDEIGKQGLTALLSDSTNAMRPDHSPSESDILTDIERHMRSAKKKIIVTAFASNLTRI
KVIIELAAKLKKKVITFGRSMIQGVKIGKKLGYINVPDNVIIDKKAAKDIDDSKLVILTT
GSQGEQLAALSRMSFGKHATIKISKGDLIIFSSSPIPGNRMVIELLINRLYKLGAIIKEN
GVDGFLHTSGHAYKSEHDKIFQLTRPKYFLPYHGEYRMCVAHGNTAIENGVNPKNILIIK
KGIVFEMLDNEIKETNEKIDFGPIYIDGNSVLQFSQQILKERAQLKDSGFVSIVFLIDRQ
NNQIIGRPQIITRGSFFVKTSKDLIDESRRVSHGAVLYQIKNNPEWTKEELEKILMDRLS
SLFYKEKRRNPVIVPTIIFTDEKPDRDIAKYKIKFGPTKTSNESEYPIAKNNISDKLSKF
IDEKMREINELALAGNIETEYDDVDEEDEV
NT seq 1893 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcaaaatattcaaaaaataccaacaagaataattgctcttggtggttttgaagaaatc
ggtaaatcaacccttttaattgaacataaaaatcacattttcataattgattcaggaatt
aaatttgcagatacatttaacaccggaattaaaggaattatcccgaattttgattattta
aatcaagatgaaaaaataattgagggactttttattacacatgggcatgaggatcatatt
ggcggagtggtttatttagttaagaaaactaaattaaataaaatttttgctcctagaatc
gcgattcaatatttacaattaaaatttgaagagcataacattaaaagaaaaattgaattt
attgaaattcaaaaaaatgatgtttataaatttgaaaataattgtaaagttgatttttga
acagttcaacattccattcctgatgcatttggtattagaataacaacaccaaacggaagt
ttaatgtgtacaggggattttagatttgattatactccaattggtaattttactgacttt
gctagattagatgaaattggaaaacaaggtttaacagctttattatctgattcaactaat
gcaatgagaccagaccattcgccttctgaaagtgatattttaactgacattgaacgacat
atgcgttcagctaaaaagaaaataatagttaccgcttttgcttcaaacttaacaagaatt
aaggttattattgaacttgctgcaaaactaaaaaagaaagtaattacttttggacgttcg
atgatacaaggtgttaaaattggaaaaaaactcggttatattaatgtaccagataatgtc
attattgataagaaagctgcaaaagatatcgatgattcaaaattagttattttaacaact
ggttctcaaggagaacaattagccgctttatcaagaatgagtttcggcaagcatgcgact
attaaaatatctaaaggtgatttaataattttttcttctagtcctattcccggaaataga
atggttattgaattattaataaatagactttataaattaggtgcaattattaaagaaaat
ggagttgatggatttttgcacacttcagggcatgcttacaaaagtgaacatgataagatt
tttcaattgacacgacctaaatactttttaccttatcatggtgaatatcgtatgtgtgta
gctcatggaaatactgcaattgaaaatggtgttaatccaaaaaatatcttaatcataaaa
aaaggtattgtattcgaaatgcttgataatgagattaaagaaactaatgaaaaaatagat
tttggtccaatttatattgatggaaattctgttttacaattttcgcaacaaattttaaaa
gaacgtgcccaattaaaggattctggttttgtaagcattgtttttcttattgatcggcaa
aataatcaaattattggtagaccacaaattatcacaaggggaagtttctttgtcaaaaca
tcaaaagacctaattgatgaaagtagaagagtttcgcacggggctgttttgtatcaaata
aaaaataatcctgaatgaacaaaggaagaattagaaaaaattttaatggatcgtttgtct
tcattattttataaagaaaaaagaagaaatcctgttattgttccaactattatttttact
gatgaaaaaccggacagagatatcgctaaatacaaaataaaatttggtcctacaaaaact
tcaaatgaatcagaatatccaattgctaaaaataatatctctgataaattaagtaaattc
attgatgaaaaaatgagagaaatcaatgagcttgcactagcaggaaatattgaaactgaa
tatgatgatgtagatgaagaagatgaagtttag

DBGET integrated database retrieval system