Mycoplasmopsis cynos: MCYN_0585
Help
Entry
MCYN_0585 CDS
T02424
Symbol
MCYN0585
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mcy
Mycoplasmopsis cynos
Pathway
mcy03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcy00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
MCYN_0585 (MCYN0585)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mcy03021
]
MCYN_0585 (MCYN0585)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcy03400
]
MCYN_0585 (MCYN0585)
Enzymes [BR:
mcy01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
MCYN_0585 (MCYN0585)
Transcription machinery [BR:
mcy03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
MCYN_0585 (MCYN0585)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcy03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
MCYN_0585 (MCYN0585)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCP24317
UniProt:
L0RVZ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(633942..638432)
Genome browser
AA seq
1496 aa
AA seq
DB search
MKKKMIIKYCNLNQEVKVNNSNSNAHKERIKRITLSLATREDVKNWSHGEVTKPETINYK
TYKPEKDGLFDELIFGPVIDYKCPICGSKYKKSDVNEVCGKLPQCKKYNPEILPKITRRS
RMGHITLHNPVVHFWFFKIDHSVISNLLGLRVERGNEKQNVTKSDLEKLIYYKSHIVLES
GNLKSLNKNTIIDINEAANIYDKALEELLEIYKDDKEAYEIISESLWELREYAKSQDGKD
FGIDFYQYNEVINEYSDAKIGTGSAAIEYLLSNIDLEKEQKLVQEQIDKINAEINKQRDV
STSKIQARQKLYKRLTIISSFIRSGQKPTDMLIYELPVIPADLRPLVQLDGGRHSTSDIN
ELYRRIIIRNNRLAKWNETDAPMLIKQNEYRMIQEAVDSLIDNARKKPTPVSSRDNHPLK
SISDGLTGKKGRFRQNLLGKRVDYSARSVIVGGPSLKMYEVGVPRDIAAKLFEPWIIKEL
IAHEEGITSIKTAKKLIENLDPRIWPYVEKAIQGRPVLLNRAPTLHRLSIQAFQPVLIRA
KAIKLHPLVTTAFNADFDGDQMAIHVPISEKAVREAQELMLASKNILGPKDGEPIINPSQ
DIILGLYYLTIEKSGENAKGEGNFYSNIDEMLLAYERGHVSLHSRVVLPIKSLNKPKLQL
QTTKPYIFSTVGKFLLNSVLPTEFEFVFGKYVEKTYKKSLNNEMQLVEREVIHTSKNDLD
HYTFDYGTNFYETFKNIDLNLALSKKDIARIIRKIYEEYVAVITIEDIASILNKINKFNF
KEQLEACEDLVDYKGEKIPSTHAKLINQFIIDEFEKISYSYKVNEAQKDSSDWNVHEYTK
GLENVWFKYSNYVSYILDKIKDLGFKYSTISGTTISMNDVKTLDSTADFIKEGEEYIKEL
KAFFEYGYLTDDERYKLTIEKWSKVKEKIEKSLKEVTKLDIDNPLFMMMTSGARGNASNF
TQLAGMRGLMSNNTKVLKADAENDRVVRSTIEIPVKSSFLDGLSSYEFYSSTHGARKGLT
DTALNTAKSGYLTRRLVDVAQSIVVREADCGSDFGFVVKAIKDTKTDTIIETLYERIEGR
YTNKAIYDHSGNLVIDANELITPEIANIIVNDLKLAEVEIRSVLSCHTKNGVCKICYGKD
LASNRVVNIGEAVGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFGRLIELIDAYDN
PWGKPAEISKVYGIISNIEQVTNKETGKVTDFIEVSITTKNEQGDEIIETISGRSSQKLR
VKVGDHVVPGQKIFEGPIVLNQLLNATDARTVQSYLLKEIQRLYRLQGITIADKYIEIII
SQMLSKILIIEPGDSRFFSGALVDTYVYQVENSKLLSAGKKPAYGKVKISGAKQIPLLSN
SFLSAASFQETAKILVNSSVAQRVDYLEGLKENIILGQKIPAGTNSDYELKGKYDIRSFK
SYFPDKFDPDLNSEEPITNFLDENFSINDITDEAYHNDIFDQSDEFTNYYDFEDDM
NT seq
4491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaagaagatgattatcaagtattgcaatttgaatcaggaggtgaaagtgaataat
tcaaactcaaatgctcataaagagagaattaaaagaattacattatcattagctactaga
gaagatgttaaaaattgatcgcatggtgaagtaaccaaacctgaaacaattaattataaa
acatataaacctgaaaaagatggattatttgatgaattaatcttcggtccagtaattgac
tataaatgtccgatttgtggatccaagtataaaaaaagtgatgttaatgaagtttgtggt
aaattacctcaatgtaaaaaatataaccctgagatactaccgaaaataacaagaagaagt
agaatgggtcatattactttgcataatcctgttgttcatttttgattttttaaaatcgat
cactctgttatttctaatcttttaggattaagggttgaaagaggaaatgaaaagcaaaat
gttactaaatctgatttagaaaaattaatttattataaatcacatatagtattggaaagt
ggtaacctaaaatcacttaataaaaatactattatcgacattaatgaagctgcaaatata
tatgataaagctttagaagaattattggaaatctataaagatgataaagaagcatatgaa
attatttcagaatcattatgagagttaagagaatatgctaagtcacaagatggaaaagat
ttcggaattgacttttatcaatataatgaagttattaatgaatattctgatgctaaaatc
ggaactggttcagctgctattgagtatttattaagtaatattgatcttgaaaaagagcaa
aaattagttcaagagcaaattgacaaaattaatgctgaaattaataaacaacgtgatgtt
tcaacctcaaaaattcaagcaagacaaaaattatataaacgtttaacaataatttcatca
tttattcgctcaggtcaaaaaccgactgatatgttaatttatgaattgccagttattcca
gcagatttaagaccgcttgttcagttagatggtggaagacactcaactagcgatattaat
gaattatatcgtcggattattattagaaataatcgtttagctaaatgaaacgaaactgac
gcgcctatgcttattaagcaaaatgaatatcgtatgattcaagaagcggttgattcatta
attgataatgctagaaaaaaaccaacaccagtatcatcaagggataatcatccattaaaa
tctatttctgatggtcttactggaaaaaaaggacgtttccgtcaaaacttgctcggaaaa
cgtgtggactattcagctcgtagcgttattgttggtggtccatcattgaaaatgtatgaa
gttggggtacctcgtgatattgcagcaaaattatttgaaccttgaattattaaagaacta
attgcacatgaagaaggtattacaagtattaaaactgctaaaaaattaatcgagaactta
gatccaagaatttgaccatatgttgaaaaagcaattcaaggacgtccggtattattaaac
cgtgcacctaccttgcaccgtttatctatccaagccttccaacccgttttaattcgtgct
aaagctattaaattacacccactagtaactacagcgtttaacgctgactttgacggggac
caaatggcaatccacgttccaatttcagaaaaagctgttcgtgaagcgcaagaattaatg
cttgcttctaagaatattctagggccaaaagatggtgaaccaattattaacccttctcaa
gatattattttaggtttatattatttaacaattgaaaaatcaggcgaaaatgctaaggga
gaaggaaatttctactctaatattgacgaaatgttgcttgcttatgaacgtggtcatgtt
tcattacacagtagagttgttttaccaattaaatcattaaataaaccaaaattacaactt
caaactactaaaccatacattttttcaactgttggtaaatttttattaaatagtgttctt
ccaacagaattcgaatttgtatttggtaaatatgttgaaaagacttacaagaaatcactt
aataatgaaatgcaactagtggaaagagaagtgattcatacatcaaaaaatgatttagat
cattacacttttgattatggaactaatttctatgaaacttttaaaaatattgatttaaat
ttagctttatctaaaaaagatattgcaagaatcattagaaaaatttatgaagaatatgta
gcggttattactattgaagatattgcaagtattttaaataaaattaataaatttaatttc
aaggaacaattagaagcatgcgaggatttagtagattataaaggggaaaaaattccttca
acacatgctaaattaatcaatcaattcattattgatgaatttgaaaaaataagttattca
tacaaggttaatgaagctcaaaaagattcatcagattgaaatgtacatgaatatactaaa
ggattagaaaatgtttgattcaagtattcaaactatgtttcatatattctagataaaatt
aaagatttaggatttaaatattcaactatttcaggtactacaatatcaatgaatgatgtt
aaaacacttgattctactgctgattttattaaagaaggcgaagaatacattaaagaatta
aaagccttttttgaatatggatatttaacagatgatgaacgttataaattaactattgaa
aaatgatcaaaggttaaagaaaaaattgaaaaatcgctaaaagaagttacaaagcttgat
attgataatccattgtttatgatgatgacttctggagctcgtgggaatgcatcaaacttt
actcagcttgccggaatgcgtggtcttatgagcaacaacacaaaagttttaaaagctgat
gcggaaaatgatcgtgtggttcgttcaactattgaaattcctgttaaatcatcattctta
gatggtctaagttcatatgagttttattcatctactcacggggctcgtaaaggactaacc
gataccgctcttaacactgctaagtcaggttatttaacacgtagacttgttgatgttgct
caaagtatagtagttcgtgaagctgattgtggctcagattttggttttgttgttaaagct
attaaagatacaaaaactgatacaatcattgagactctatatgaaagaattgaaggtaga
tacacaaataaagcaatatacgatcatagcggtaatttagttattgatgcaaatgaatta
attactccagaaattgctaatattattgttaatgatttaaaacttgctgaagttgaaata
cgttctgttttatcttgtcatactaaaaatggtgtatgtaagatttgttatggtaaggat
cttgcgtctaaccgggtggttaatattggtgaagctgttggtattgttgcagctcaatca
attggtgaacctggaactcagttaacaatgcgtacattccacaccggaggggtcgctggt
gttgaagatattacaggtggatttggtagattgattgaattaatcgatgcttatgataat
ccatgaggaaaaccggcagaaatatcaaaagtatatggaataatttcaaatatagaacaa
gtaactaacaaagaaacaggaaaagtaactgactttatagaagtttcaattactacaaaa
aatgaacaaggcgatgaaattattgaaacaatttcaggaagaagttctcaaaagttacgg
gtaaaagttggtgatcacgttgttcctggtcaaaagattttcgaaggaccaatagtttta
aatcagcttttaaatgcaactgatgcaagaacagttcaaagttatttattaaaagagatt
caaagattatatcgtttacaaggtattactattgctgataaatatattgaaattatcatt
tcacaaatgttatcaaagatcttaattattgaacctggtgattcaagattctttagtgga
gcattggtagatacatatgtatatcaagtagaaaactcaaaattattatctgctggtaaa
aaacctgcttatggaaaagtaaaaatttcaggagctaaacaaattcctttattatcaaat
tcattcttatcagccgcttctttccaagaaacagctaaaatacttgttaactcatcagta
gctcaaagagttgattatcttgaaggactaaaagaaaatattattttaggtcaaaaaatt
cctgctggaacaaattcagattatgaattaaaaggaaaatatgatattagaagctttaaa
tcatatttccctgataaatttgatccagatttaaattcagaagaaccaataactaatttc
ttagatgagaacttttcaattaatgatataactgacgaagcatatcataatgatattttc
gatcaaagtgatgaattcactaattattatgattttgaagatgatatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
