Mongoliitalea daihaiensis: IPZ59_01190
Help
Entry
IPZ59_01190 CDS
T07844
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
mda
Mongoliitalea daihaiensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YDG
MBG_2
Por_Secre_tail
Chlam_PMP
DUF3244
fn3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UJP65277
LinkDB
All DBs
Position
342044..346597
Genome browser
AA seq
1517 aa
AA seq
DB search
MNLFLKSFYEPFKQLVILLFLLALTTQAYSQRLRPPFIPPSLDPIENPTNPPTSSPSLVV
TNGNNSGAGSLRQVVADAPAGSMITFSGVTTVTLSTTEIILNKNLTISGANEVTINGGGN
SRIFNITGNPTVSLRNLTFTNGLEDLGGAIFNNSSNLEIISCLFENNQANQKGGAIYNNN
ASPRITNTFFAENHVIAVAPPIVECTAVTNVTRTVSANTLSVFWSPSPAALSYTFNIRAS
SDTEFLQFQVDQSLSSINLENLVSSTTYSYFITTNCADGVTRNTATFTVTTNASSVPIGP
GAGRGEPIAPAVRLISPNGRINSAATQDFLGGGAIFNDGSSPRIVNTLFFSNTVSSTGGP
LGAAILNVNGSNPQITNTTFGRNQVLGPNNQPISSGATNFGTIANDDNSASSITNSIIWG
NPSGGIVGPNGTVTFSAVENGPTGTGNQNINPQFVSLSSGDLRLQPTSPLRDAGNPSTDL
SIFPGGTAEPLDFDANPRVVGGIIDMGAFELELNLQPQTITITPPTVLIYGDRDVSFTAT
TTSGLPVTYSVESNPFISVNSDGTGLNANRATATPVTITVSVEGNSSFEPASTTLSLPVL
QRQLTIPPPIISPKVYDGNTSADITIGTLENKVASDVVDVNATGTFDNPDAGTGKTVSVS
YVISGADAGNYITPVDFTSTDGVITPRQLTITPPSISPKVYDGNTSADILIGILENKVPN
DVIDVNATGTFDNPNAGTGKTVTVSYVISGADAGNYLTPVDFISTDGVITPRQLTITPPS
ISPKVYDGNTSADILIGILENKVPNDAIDVNATGTFDNPNAGTGKTVTVSYVISGADAGN
YLTPVDFISTDGVITPRQLTITPPSISPKVYDGTTSADILIGILENKVPNDVIDINATGT
FDNPNAGTGKTVTVSYVISGADAGNYLTPVDFISTDGVITPRDLFITPFEGQRKAQGSED
PELAFEAIGFVVGEDNSILTGQLGREPGESCGTYEIINSNLSAGNNYTVILTAGVLFEIF
DATPPTLILKNISVQLDNSGNASITISDIDNGTTDNCSAFEDLIFEISQTAFTCENTEPI
TVTVKVTDLAGNSSEGSAEITVLQPLIPISTNISSTVARNQNGNVLIYANAPARLAVPAS
TVLQAINIPSSYTGLTFEWFVKLDENSAFISIAQTNTLTVQAEGDFNRTYKVVVTSDAGC
VAEEQISVISIETSCDRGGNNRVQVCHLPGGNFSRRITLCVNVNAVDAFLRNNPGSFIGN
CNITFRLDTEPETISVPWNTSLETIKEIIDQKREEWFGGTPDLTVQGKGFNPFQAGIHTL
QVNLDESEGSQLENPVNVKIEIQAKPLAESIELSTLSIPSEIRSGDILATISTIDPADDI
HTYHLEENLNLAIEGNQLIWTGTDIAPQKITTRIISTDRAGQSIDREVTFLREIALNEFL
LYPNPATHETNAKVQLDGSASVTITVYDITGRILINETTFEEETFIRTLNLDGMATGVYL
VQVKIGYLVMTQRLMKN
NT seq
4554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatctctttctaaaatcattttacgagccgttcaaacagttggtgatcttgctcttt
ttattagcacttactacacaggcatattcacaacggttgcgacccccatttatcccccct
tcactcgatcccattgaaaacccaactaatccccctacaagttcaccttcattggtggtt
accaatggaaataattctggagcgggaagtcttcgtcaggtagtagcagatgctcccgct
ggtagtatgattactttttcaggagtaaccaccgtaaccctatctacaactgagataatt
ctcaataaaaacctcaccatcagtggggccaacgaagtgacgatcaatgggggaggcaat
tcaagaattttcaacattacaggaaatcccacagtatcactaagaaatttaacatttaca
aatggactagaagacttgggtggggctatattcaataattcgtccaaccttgaaattatc
agttgtttgtttgaaaataatcaggcaaaccagaaaggaggcgcaatttacaataacaat
gcatcccccagaatcaccaatacttttttcgctgaaaaccatgttatagcagttgccccc
cctatagtagaatgtacagcggtcaccaatgtaacaagaacagtaagcgcaaatacgctt
tcagtcttttggagccctagccctgctgcgctttcatatacttttaacattagggcttca
tctgacacagaatttcttcaattccaagtagatcaatctctgagttctatcaatcttgag
aatttagtatcttcaaccacctatagttactttatcactacaaattgcgctgatggagta
acaagaaatacggctacattcaccgttacaaccaatgcatcgagtgttcctataggtcca
ggtgcaggtcgaggtgaacctattgctccagcagttaggcttataagtcctaacggtagg
ataaatagcgcagcaacccaagatttccttggtgggggagcaattttcaacgatggttct
tccccaagaatagtgaacacgctatttttctcaaatacagtttcctccacaggtgggcca
ttgggtgcagcaattctcaatgtcaatggttctaatccacaaatcacaaataccacgttt
ggtagaaaccaagttctaggacccaataatcagcctatttcgtcaggtgcaacaaacttt
ggtaccattgcgaatgatgacaattcggcatcttctatcaccaattccattatttggggc
aacccatctggaggtattgtgggtcccaatggtacagtcaccttctcagctgtggaaaat
ggtccaactggtacgggaaatcaaaacatcaacccacagtttgtaagtctttcttcagga
gacttacgcctacaaccaacttctcctttacgtgatgcaggaaatccttcaacagactta
agtatattccctggggggacagctgaaccactggattttgacgccaatcctagagtagta
ggaggaatcattgacatgggcgcctttgaactagagctaaaccttcaaccacaaaccatc
actatcacgccaccaacagttttaatctatggagatagagatgttagctttactgctact
actacttctggtcttccagtgacttattccgttgagagcaatccattcatatcagttaac
tctgatggaactggactcaatgccaatagagctacggcaactccggtgacgattactgta
tctgttgaaggaaattcatcttttgaacctgccagcacaacgttatcactacctgtcctc
caaagacaactgaccattcccccgccaatcattagccctaaagtctatgacggcaataca
tctgccgatatcacaataggtaccttggaaaacaaagtagcaagcgacgtggtagacgta
aacgcaacgggaacatttgataatcctgacgcaggtacaggaaaaacggtctccgtaagc
tatgtaatctccggagcagatgcaggaaactatattaccccggttgattttaccagcaca
gatggggtgattactccaaggcagctgaccattactccgccaagcattagccctaaagtt
tatgacggcaatacatctgctgatatcttaataggcatcttggaaaacaaagtacctaac
gatgtgatagacgtaaatgcaacgggaacatttgataatcctaacgcaggtacaggtaaa
acggtcacggtaagctatgtaatctctggtgcagatgcaggtaactacctaacccctgtt
gattttatcagtacagatggggtgattactccaaggcagctgaccattactccgccaagc
attagccctaaagtttatgacggcaatacatctgctgatatcttaataggcatcttggaa
aacaaagtacctaacgatgcaatagacgtaaatgcaacaggaacatttgataatcctaac
gcaggtacaggtaaaacagtcacggtaagctatgtaatctctggtgcagatgcagggaac
tacctaacacctgttgattttatcagtacagatggggtgattactccaaggcagctgacc
attactccgccaagcattagccctaaagtttatgacggcactacatctgctgatatctta
ataggcatcttggaaaacaaagtacctaacgatgtgatagacataaatgcaacgggaaca
tttgataatcctaacgcaggtacaggtaaaacggtcacggtaagctatgtaatctctggt
gcagatgcagggaactacctaacccctgttgattttatcagcacagatggggtgattacc
ccgagagacttatttattactcctttcgagggacaaagaaaagcgcaaggatcagaagac
cctgagttggcatttgaagcaattggtttcgttgtaggtgaagataactccattcttaca
ggacaactcggaagagaaccaggtgaatcctgtggcacttatgaaatcattaatagtaat
ttaagtgctggaaacaactatacggtcattcttacagcaggcgttttgtttgagattttc
gatgctactcctcctactttgatacttaaaaacatcagtgttcaattggataactcgggg
aatgccagtatcaccatctcagatattgataatggaacaacagataattgttcagctttt
gaagaccttatatttgagatcagccaaactgcctttacttgcgaaaatacggaaccaatc
acagtaaccgttaaagtaactgaccttgctggaaactctagtgaaggttcagcagaaatc
actgtccttcaaccactaattccaatttcgacaaacatcagttccacagttgcaagaaat
caaaatggcaatgtactgatctacgccaatgcaccggcacgacttgcagtaccagcttca
acagtcttgcaggcgattaatatcccaagcagttatactggacttaccttcgagtggttt
gtgaaattagatgagaacagtgcatttatcagcatagcgcaaaccaatacactcactgta
caagctgaaggtgattttaatcgtacttacaaagtagtagtgacaagtgatgcaggttgt
gtagcagaagaacagatttctgtaatttctatagaaacttcctgcgatagaggaggtaat
aacagagtacaagtttgtcatttgccaggagggaactttagtagaagaattacattatgt
gtcaatgtaaatgctgtagatgcattcctaagaaacaacccaggttcatttattggaaat
tgtaacatcacatttagattggatactgagcctgaaaccatttcagttccttggaataca
agtttggaaaccatcaaggaaattatcgatcagaagagagaagaatggtttggaggcacc
cctgatttaactgttcaagggaaaggattcaacccattccaagcaggaattcacaccctt
caggtgaatcttgatgaatccgaaggcagtcaattagaaaatccggtgaatgtaaagata
gaaatccaggcaaaacctttagcagaatcgattgagttaagcaccttaagtattccatcc
gaaattaggagcggtgacatccttgcaacgatcagtactatagatccagcagatgatatt
catacctatcacttggaagaaaatttaaacctagccatcgaaggaaatcaactaatttgg
acaggtacagatatagctcctcagaaaataaccactagaattattagtactgatcgagct
ggacaaagtatcgacagggaagtgacattcctccgtgaaatagctctcaatgaattcttg
ctctatcctaatccagcaactcatgagaccaatgcaaaagtccaattggatggaagcgcg
tcggtaactataacggtttatgatattactggaaggatcttgatcaatgaaaccactttt
gaagaggaaacctttattagaaccttaaacttagatggcatggctacgggtgtatacctt
gtacaagtcaaaatcggctatcttgtaatgacgcaacgattgatgaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
