KEGG   Musca domestica (house fly): 101897761
Entry
101897761         CDS       T03448                                 
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(IV) chain
  KO
K06237  collagen type IV alpha
Organism
mde  Musca domestica (house fly)
Pathway
mde04382  Cornified envelope formation
mde04512  ECM-receptor interaction
mde04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mde00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    101897761
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    101897761
 09150 Organismal Systems
  09158 Development and regeneration
   04382 Cornified envelope formation
    101897761
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04147 Exosome [BR:mde04147]
    101897761
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:mde00536]
    101897761
Exosome [BR:mde04147]
 Exosomal proteins
  Exosomal proteins of other cancer cells
   101897761
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:mde00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   101897761
SSDB
Motif
Pfam: Collagen C4
Other DBs
NCBI-GeneID: 101897761
NCBI-ProteinID: XP_005186422
UniProt: A0A1I8MIT7
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1773 aa
MEPLWKRLLFAAVFAGAFLGINAQFWKTTDTGAIYNTAKHYRPEVEAPRQPIDNSYSIID
SASNCTGNTPGCIPKCFAEKGNRGLQGPIGVPGPKGLPGYPGTEGPPGDKGQKGEPGPLG
PRGLKGERGTPGIPGMSGVPGIQGIAGNPGAPGIPGKDGCDGEKGLPGLAGLSGMAGPRG
YPGQPGAKGEKGEPAKENGDYAKGEKGEPGFAGRAGNPGPEGPIGPKGERGETGPLGAPG
LRGDRGLKGEKGAPCFPRPQPGRKGEKGEKGEPARSAGLRGGKVEIISEKGQRGEKGEMG
PAGEKGAVGEQGAPGREGPKGEKGLPGGPGDRGRQGAFGPPGPPGQKGDRGETGLNGLPG
KPGQKGEPGRPGKPGERGLVGPPGPPGGGRGSPGAPGPKGPRGYPGAPGPKGLDGFDGPP
GPQGFPGAKGGPGMPGNNGVEGPPGEKGQKGNAGRPGPMGPQGPIGHTGPPGPEGQKGEA
GLPGYGERGPKGDDGTPGSPGLKGAKGERGLTGAPGAPGDSKLGLPGTPGAVGAPGPRGD
QGRPGLPGPKGDMGPKGDAGGKCSDCAPGQKGDKGDRGTDGSPGRDGLRGPPGERGYPGE
RGSDGIPGPPGPPGEKGRDGNPGAPGPYGLPGKDAMVDLNQIVAEKGEKGDRGYPGAPGV
KGERGETGAAGLNGQKGEFGDKGERGYPGPPGSDGAPGNPGRDGFDGVPGRSIKGEPGLA
GRDGEKGDKGTTGPSGIKGDPGTCDVDFLKVPAKGNKGDRGAPGNPGAMGPTGSQGDKGN
AGQKGETGPQGPPGPAGPRGMTGPRGEPGPQGPIGAPGNPGRDGLRGPPGRNGPPGQKGE
QGIARPGPPGSIGRPGMPGPKGDRGVEGPMGPPGMDGAPGYPGEKGDSGQPGAPGAPGFD
GPKGDTGPRGPTGPPGPPGKPGVDGVQGRDGAKGEPGYPGLVGMPGMKGERGAPGVDGPK
GFTGVAGPPGKRGPPGPAGIPGAKGDRGERGLTGKDGLPGVRGPPGPPGVMGVKGDMGPM
GPPGADGVPGIDGAKGDRGLPGMDGPRGEPGDAAEKGQKGEPGASGLRGEPGMTGAPGMP
GEKGVPGIAMHGRPGAPGMKGDRGRDGLNGVDGRPGEKGDQGMPGLTGAKGIKGDFGLPG
APGLPGMDGKPGQMGAPGPIGHTGPKGDKGERGFPGLNGAKGDKGERGVPGFNGAAGPKG
DRGFPGPAGLNAAPITIKGEPGEMGEPGLIGLPGPMGLKGNQGAPGFTGPKGDRGLTGPP
GPNGLNGMPGAKGERGLTGDVGAPGLTVKGEKGLPGRTGKNGREGAPGLPGQKGEKGLAG
LPGTPGATGAPGPIGPQGPKGDRGLVGAPGRDGANGMPGAPGIKGDMGYPGPKGDMGLPG
VQGEKGDKGETGMAGFPGSRGLTGEKGDRGLDGMEGLPGPVGAPGEKGFQGPPGINGRDG
LPGLKGDKGEPGKIPPPGPKGEPGYPGRDGQKGERGPPGPRGLIGLQGERGEKGDMGLVG
LTGAVGRPGPKGDTGPAGLVGRDGAPGPMGPKGEPGAPCSHAPDYLTGILLVRHSQTAQV
PRCEPGHQELWTGYSLLYVDGNDYAANQDLGSPGSCVRRFSTLPMLTCGAGNICNYASRN
DKSFWLTTNNPTMPMMPVPAQEVSQYISRCVVCEVPANVIAVHSQTLDVPSCPGGWEGLW
IGYSFMMHTAVGSGGGGQDMSSPGSCLEDFRPVPFIECNGGKGHCFFYDTINSFWLVTIE
EYQQFQRPDMVTLKAGNLQQRVSRCQVCIKNSS
NT seq 5322 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagcccctgtggaagcggctactgtttgccgctgtatttgctggagcgtttttagga
ataaatgctcaattctggaaaaccaccgacaccggtgccatctacaacactgctaaacac
tatcgtcccgaagttgaagccccccgccagccgatcgataacagctactcgataatcgac
agtgccagcaactgtaccggcaatacgcccggttgtattcccaaatgttttgccgaaaag
ggtaatcgcggtctgcagggacccattggtgtgcccggtcccaagggcttgcctggctat
cccggtaccgaaggtccacccggcgacaagggtcagaagggtgaacccggtccccttgga
cccagaggcttgaagggtgaacgcggtacacccggtattcccggtatgtctggcgtgccc
ggtatccaaggtattgctggcaatcccggtgctcccggtatacccggtaaagacggttgt
gacggtgaaaaaggtttgcccggcttggccggtctaagcggtatggctggtcctcgtggt
tatccaggtcagcctggtgccaagggtgagaaaggtgaaccggccaaggaaaatggtgac
tatgctaagggtgaaaagggtgaacccggttttgctggccgtgctggtaatcccggtcct
gaaggtccaatcggtcccaagggtgaacgtggtgaaactggtcctcttggcgcccccggt
ttgcgaggcgatcgcggtttgaaaggtgaaaaaggtgctccatgcttcccacgaccacag
cctggcagaaagggcgagaagggtgagaagggcgaaccagccagatctgcaggattacgt
ggcggcaaagtggaaattattagcgaaaagggtcaacgtggtgaaaagggtgaaatgggt
ccagctggtgaaaagggtgctgttggtgaacagggcgctcccggtcgtgaaggtcccaag
ggtgaaaagggtcttcctggcggtcccggtgatagaggtcgtcaaggtgctttcggtcca
cctggtccacctggccaaaagggtgatcgcggtgaaactggtttgaatggcttgcccggt
aaacctggtcaaaagggtgaacctggtcgtcccggtaaacccggtgaacgaggtttggtc
ggtccccctggcccacctggtggcggtcgtggctctcctggcgctcccggtcccaaaggt
cctcgtggttatcccggtgccccaggtcctaaaggtttggatggttttgatggtcctccc
ggcccacaaggtttccccggtgccaagggtggtcccggtatgcccggtaacaatggtgtt
gaaggtcctcccggtgaaaagggtcaaaagggtaatgcaggtcgtccaggtcccatgggt
cctcagggtcctatcggtcacactggtcccccaggtcctgaaggtcaaaagggtgaagct
ggtctccctggttacggtgaacgcggtcctaaaggtgatgatggaactcctggatctccc
ggcttgaagggtgcaaagggtgaacgtggtttgactggtgcccctggtgctcctggtgac
tcgaaattaggtcttcccggtactcctggtgccgttggtgctccaggtcctcgtggtgat
caaggtcgtcccggtctgcccggtcccaaaggtgatatgggtcctaagggtgatgctggc
ggcaaatgctcagactgtgctcccggccaaaaaggtgacaaaggtgatcgtggtacagac
ggtagccccggccgtgatggtcttagaggtcctcccggagaacgtggttatcctggcgaa
cgtggttctgatggtattcctggcccccctggtcctcctggcgagaagggtagagatggc
aaccccggtgctccaggtccctatggtttacccggtaaagatgctatggtcgatttaaat
caaatcgttgccgaaaaaggcgaaaagggtgatcgcggctacccaggtgctcctggtgtc
aagggtgagcgtggcgaaactggcgctgctggtctaaacggacaaaagggtgaatttggt
gacaagggcgaaagaggttatcctggtcctccaggtagtgatggcgctcccggcaatccc
ggcagagatggctttgatggtgtccctggtcgcagcattaagggcgagcctggtttggct
ggtcgcgatggcgaaaagggtgacaaaggtacaactggtccaagtggtataaaaggtgac
ccaggtacttgcgatgttgattttttgaaggttcccgctaagggcaacaagggtgatcgc
ggtgctcctggcaaccccggtgccatgggtccaactggttcgcagggcgacaagggcaat
gctggccaaaagggtgagacaggtccacaaggtccacctggacctgctggtcctcgcggt
atgactggcccacgtggtgaacccggtccacaaggtcccattggtgctcctggtaatccc
ggcagagatggtttgcgtggtccccccggcagaaatggtccccccggtcaaaagggtgaa
caaggtattgctagacccggtccacctggtagcattggtcgtcccggtatgcctggtccc
aagggtgatcgtggcgtggaaggtcccatgggtcctcccggtatggatggcgctcctggc
taccctggcgaaaagggtgacagtggtcagcctggtgctcccggtgctcctggctttgat
ggtcccaagggtgatactggtcctcgcggtccaactggtcctcccggtccccctggtaaa
cctggtgttgatggtgttcaaggtcgtgacggcgctaagggtgaacccggttatcccggt
ttggtcggtatgcctggtatgaagggtgaaagaggtgctcccggtgttgatggtcccaaa
ggttttactggtgttgccggtccccctggcaaacgtggtccacctggtcctgctggtatt
cctggtgccaagggtgaccgtggtgaacgcggcttgactggcaaggatggtttgcccggt
gtcagaggtcctcctggtccacccggtgtaatgggcgtgaaaggtgacatgggacccatg
ggtcctcccggtgctgatggtgttcctggtattgatggtgccaagggtgatcgtggtttg
cctggtatggatggtcctcgcggtgagcctggtgatgctgccgaaaagggtcaaaagggt
gaacctggtgcctctggtctgcgtggtgagcctggtatgactggtgcccctggtatgcct
ggtgaaaagggtgtacctggtattgctatgcatggacgtcccggcgctcctggcatgaaa
ggtgatcgtggtcgtgatggtctcaatggtgtcgatggcagacccggtgaaaagggtgat
caaggtatgcccggtcttactggcgccaagggtatcaagggtgactttggtttgcccggt
gctcctggtcttcccggcatggatggcaaacccggtcaaatgggtgctcctggtccaatc
ggtcataccggtcccaagggtgacaagggcgaacgtggtttccctggcctcaatggcgcc
aagggcgacaagggtgaacgtggtgtacctggtttcaatggtgctgccggtcctaaaggt
gatcgtggtttccccggcccagctggtctgaatgctgctccgattacgattaagggtgag
cccggtgaaatgggtgaacccggtttgattggcttgcccggtcccatgggtctgaagggt
aatcagggtgcacctggtttcactggtcccaagggtgatcgtggcttgaccggacctcct
ggacccaacggtttgaatggtatgcctggcgctaagggtgaacgtggtttgacaggtgat
gttggtgctcctgggctgaccgtcaagggtgagaagggtttgcctggccgtactggtaaa
aatggacgtgaaggtgcccctggtttgcctggacaaaagggtgaaaagggtctggctggt
cttccaggtactcctggtgccaccggtgcccccggccccattggtcctcagggtcctaag
ggtgatcgcggtctggttggtgcacccggcagagatggtgctaacggcatgcctggcgct
cctggtatcaagggtgatatgggttatcctggtcctaagggtgatatgggtctacctggt
gtacaaggcgaaaagggtgacaagggtgaaaccggcatggctggcttccctggcagtcgc
ggtctaactggcgaaaagggtgatcgtggtcttgatggtatggaaggtttgcccggtccc
gtgggtgctcctggcgagaagggcttccaaggtccacctggtataaatggtcgtgatggt
ctgcctggtctcaagggtgacaagggtgaacctggcaagattccaccacccggccccaag
ggtgaacctggttatcctggacgtgatggtcaaaagggtgaacgtggtcctcccggtcct
cgtggcctgattggtttgcagggcgaacgtggtgaaaagggtgatatgggtttggttggt
ttgactggtgccgtgggccgtcctggtcccaagggtgacactggtccagcaggtttggtg
ggtcgcgatggcgctcccggtcccatgggtcccaagggtgagcccggtgcaccatgtagc
catgctcctgactatcttaccggtattctgttggtgcgtcacagtcaaaccgcccaggtg
ccacgctgtgaacccggccaccaagaattatggactggctattccctgctgtatgttgat
ggtaatgactatgctgccaatcaggacttgggctcgcccggttcctgtgtcagacgtttc
tccacactgcccatgctgacctgtggtgccggcaatatttgcaactatgcctcgcgtaat
gacaaatccttctggttgaccaccaacaatcccaccatgcccatgatgcctgttcccgcc
caggaagttagccaatacatttcacgttgtgttgtgtgcgaagtgccggccaatgttatt
gctgtgcacagtcaaacactggatgtgccctcatgtcccggcggctgggaaggtttgtgg
atcggctacagctttatgatgcacactgctgtcggcagtggtggtggtggccaggacatg
tcctcgcccggttcctgtctggaagacttccgtcccgtaccgttcattgagtgcaacggc
ggcaagggccactgcttcttctacgacacaatcaacagtttctggctggtaaccatcgag
gagtaccaacagttccagagacccgacatggttaccctcaaggcgggcaacttgcagcaa
agagtctccaggtgtcaagtgtgtattaagaactcgtcataa

DBGET integrated database retrieval system