Microchaete diplosiphon: NIES3275_24600
Help
Entry
NIES3275_24600 CDS
T09944
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
mdp
Microchaete diplosiphon
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mdp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mdp02000
]
NIES3275_24600
Transporters [BR:
mdp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NIES3275_24600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
DUF3432
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY90444
LinkDB
All DBs
Position
complement(3131661..3133718)
Genome browser
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MRNQLIARWGTQLIISSVTITTGMLWENSSIIATEIAQAEEKEPDIELTVIDKLLNEPVF
SPFRREGTVKDSTRPVYVITGEEMEAQGARTVREALRFLPGILGDGTVGTEVNALSGQFI
RGSNTGQVLILLDGRPINNLGGGGFDLSEFTTNNIERVEVLPGGGSTLYGSDAIGGVINI
VTRRPTEQITTDTKVNFGSYGLNQQSIQNSGKSGDISWLVGYSRTQAQNNYRFRIPEANF
EGTRTNNDALFNNFNVKLEANLGKRNTLTLSTLYLGKEQGVPGGVPIPVPQFGQGFFNTL
TDNNRKYTDQVLTDLTWNSKLGSGDDSLLTARVYADFLNTRFDNRSGAITSQNRFDTKQD
SYGLQVTHNWNIAKNQTLVYGFDYRNTNVRNTTFNYGTNITRENYDDAIGQGAIFGRYEI
NFSPSFSMNLGVRQDFSSLVNGSFTSPSVGAKLAVSDSTTLRANYIRNFRAPTIANLFNT
NPTNIGNPDLKPEQGDSFDVGIDQKLGNIGLLRLTFFRNLVSDTIAFKSLIPPVNGNTGT
WENIGLVETTGIEASLNLQIARNVYTFVNYTANDPRILASANPAEIDKELRFAGADKLNL
GVSYENAKGWYFGVLMNSLNGYPTNNINTEFLSGYTTFDLKMRVPISDSLILTGSLDNLF
DQRYQLFPGYPDGGRVFQVGLSSRF
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtaatcaacttatcgccagatggggaactcaacttatcatctctagcgtgactatc
accacagggatgctgtgggaaaattccagcatcatcgccacagaaattgcacaagcagaa
gagaaagaaccagatattgaactgacagttattgacaaactcctcaatgaacctgtattt
tccccttttcgccgcgagggaacagtcaaagattccacccgtccggtgtatgtcattacc
ggcgaagaaatggaagcgcaaggtgcaagaactgtcagagaagcactgcgatttcttcct
ggtattttaggtgacggtacagttgggacagaagtaaacgctttaagtggccaatttatt
cgcggttctaataccggacaagtcttaatcttattggatggtagaccaattaataattta
ggtggtggtggtttcgatttatcagaatttaccacgaacaatattgaaagagtcgaagtc
ttacccggaggtggttcaactctttatggttcagatgcaataggtggggtaattaatatt
gttacccgtcgtcctacagagcaaattaccacagacaccaaagttaattttggttcctat
ggattgaaccaacaaagtattcaaaatagtggaaaatccggtgatatatcttggttagtt
ggatatagccggactcaagcacaaaataattatcgctttcgtattcctgaagctaacttt
gaggggacaagaacgaataatgacgcactctttaataactttaatgtcaaattagaagca
aatttaggaaaacgtaacaccttaactctctccaccttatatttaggtaaagaacaggga
gtaccaggaggcgtacccattcctgtacctcaatttggacagggattttttaacactctc
accgataataatcgtaaatacacagaccaagttctcactgatttaacctggaactccaaa
ttaggtagcggcgatgattcacttttaacagcgagagtttacgctgattttctcaacact
cgttttgataatcgcagtggcgcaattacatcccaaaaccgctttgataccaaacaagat
tcctatggtcttcaagttacccataactggaacattgcgaagaatcagaccttagtttat
ggctttgattatcggaataccaatgtacgcaacaccacatttaattatggaacaaatatt
accagagaaaattatgatgatgctataggtcaaggggcaatttttgggagatatgaaatt
aacttttctcctagttttagtatgaatttgggagtgcggcaagattttagtagtttggtc
aatggttcgtttacttcgccatctgtaggggcaaagttagcggtatcagattcaactaca
ctccgagctaactatatcagaaacttccgcgctccaaccatagctaatttatttaatact
aatcctactaacattggtaatcctgacctcaagccagaacaaggagatagttttgatgtg
gggattgaccaaaagttagggaatattggtttgttgaggctgacattttttagaaacctt
gtttctgatacaattgccttcaaaagtttaatcccacctgtaaatggtaatacaggaact
tgggaaaatatcgggttagtagaaactacgggaattgaggcttcgttaaatttacaaata
gcgaggaatgtttatacttttgttaattatacggcgaacgatccgcgtattttagcaagt
gctaatccggcggaaattgataaggagttgcggtttgcaggtgcagataaattaaatttg
ggtgtgtcttatgaaaatgctaaaggttggtattttggtgtgttgatgaattctttaaat
gggtatcctactaataatattaatacggagtttctttcggggtatactacttttgattta
aagatgcgtgtacctattagtgatagtttaattttaactgggagtttggataatctgttt
gatcagcgttatcagttgtttcctggttatcctgatggggggagggtttttcaggttggg
ttgagttctcggttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
