Microchaete diplosiphon: NIES3275_30440
Help
Entry
NIES3275_30440 CDS
T09944
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor
Organism
mdp
Microchaete diplosiphon
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
CHASE2
GGDEF
Cas10-Cmr2_palm2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY91024
LinkDB
All DBs
Position
3817936..3820485
Genome browser
AA seq
849 aa
AA seq
DB search
MIAKYSHKFCKLVSLVTKYLNYQINPSITTLTLKQSVVIASILITGLVMGVKQLGWLQLL
ELVSYDQMVRLQPDAGYNPQLLVVTITEADIKEQKQWPLSDSVLAQLLAKLQQAQPTAIG
LDLYRNIPQPPGRDALMQQLRASNVITINYLGDQEAEGVSPISGLAPEQIGFNDFVVDPD
GVVRRNLIYAQQGEEKFYSFSLQLSLKYLAKQGTTLKVKSEALLLGNGVFPTLNNNSGGY
HDIDSAGYQVMISYRSPENIARQLSLTQVLRGEFEPNWIKDKVVLIGTTAPSLKDLFFTP
YSAGKPANPGLPGVLLHAQLVGQILNTTLDQQPVFWFWPEWAEFLWVWTWALVGSVLAWR
LRHPLSLGVAGVICLGGLFAICFGIFTQAGWIPLVAPILALAIATGTLLAYKLLHNTLHD
SLTDLPNRSLFLKQLEWVIAETKLPKSSRFAILFLGIDRFKFINESFGHQFGDQFLMNVT
QRLKACLGNRGILARVGGDEFAVLLKNINDSSEVTAIADQLHQKMSLPFKNNGQEIFTSI
SIGIALNQTELDYEPIALLRDAHTAMYRAKDLGKGRHEVFATGMHTQIVKRFQLEIDLHR
AIEQQEFELYYQSIISLTTARIVGFEALVRWNNPQYGFVSPAEFIPLAEETGLIIPLGKW
ILQAACQQLAVWQAQFPTTPPLMMSINISGHQLTQSDLVDYIEQTLQETGLNGESLKLEI
TETVAMNDVETAISIMLRLRTLNLRLSIDDFGTGYSSLSYLHRFPVNTLKIDRSFVSRME
DTDEDAAIVQTIIMLSHALGMDVVAEGVETAAQQAKLHSLGCEYGQGYFFSKPVDQKTAT
ALLDKQFNK
NT seq
2550 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgattgctaaatactcccataagttttgcaaattagtatctttagttactaagtatctt
aactatcagatcaacccatcgattaccacactgactttaaagcaatcagttgtcattgct
agtatcttgattacaggattggtaatgggtgtgaaacaactggggtggttgcaactttta
gaattggtcagctatgaccaaatggtgcgcctccaacctgatgctggttataacccacag
ctgttggtagtaacaattacagaagctgatattaaagaacagaaacaatggcctttgtct
gatagcgtccttgctcaactattagccaagctgcaacaagctcaacctacagctattggt
ttagacctctatcggaatatcccccaacctccaggtcgtgacgcgctgatgcagcaactt
cgggcttctaatgtaattactattaattatctcggggatcaagaagcagaaggagtatct
cctatttcgggtttagccccagaacaaataggctttaatgactttgtagttgacccagat
ggcgttgtccgtcgaaatttgatttatgcccagcaaggagaggagaaattctactccttt
tctttgcagttgagcctgaaatatcttgccaagcagggaactactctcaaagtaaaatca
gaggctttgctgttaggtaatggtgtatttcctactttaaataataattccggtgggtat
cacgatattgatagtgcaggctatcaagtgatgatttcttaccgttcacctgaaaacata
gcgcgacagctatcattaactcaagtactgcggggtgaatttgaacctaactggattaaa
gacaaggttgtactgattgggacaacagcccctagcttaaaagatttgttttttactcct
tatagtgctggtaaacctgcaaacccaggtttaccaggagtattactccacgctcaattg
gtcggacaaattcttaacacaactttagatcaacaacctgtattttggttctggccagaa
tgggcagaattcctctgggtgtggacttgggcgttggtaggtagtgtacttgcatggcga
cttcgccatcccctctctttaggagtagctggggtaatttgtttgggtggtctatttgct
atttgctttgggatcttcactcaagcaggctggataccgcttgtcgcaccaattttggca
ttagcgatcgcaactggcacgcttctggcttataagctattacacaatacattgcatgat
agcctcactgacctgcccaatcgcagtttgtttttgaagcaattggaatgggtaattgct
gaaacaaaactacctaaaagctcacgatttgccatcctatttttagggattgaccgcttc
aaatttattaatgagagctttgggcaccaatttggcgatcaatttttaatgaatgtcact
caaagattaaaagcttgcctaggaaatagaggaatattagccagagttggtggtgatgag
tttgctgttctactgaaaaatatcaatgatagtagtgaagtgactgctatagctgaccag
ctacatcagaaaatgtccttaccctttaaaaataacggacaagaaatttttactagcatc
agtattggtatagctttaaatcagactgaactcgattatgaaccaatagctttgctgcga
gatgcccatacagctatgtatcgcgctaaagatttgggtaaaggccgtcatgaggtcttt
gctacaggtatgcatacccaaattgtcaagcggtttcagttagaaatagacttgcatcga
gctattgaacagcaggaatttgagctttactatcagtcaataatttctttaaccacggct
agaatagttgggtttgaagcacttgtgaggtggaataatcctcaatatggctttgtttca
cctgcagagtttattcctctagctgaagaaacggggctgattattcctttaggaaagtgg
attttgcaagcagcctgtcaacaattggctgtttggcaagctcaatttcctacaactcct
ccgttgatgatgagcatcaacatttctggacatcagttaactcaatccgatttggtggac
tacattgagcaaactctccaagagacaggattaaatggcgaaagtttaaaattagaaatt
actgaaaccgtagccatgaatgacgtggaaacggcaattagcatcatgctgcgattgaga
actttaaatctcaggttaagtattgatgatttcggtacaggctattcttctttaagctat
ttacatcgcttccctgtcaacacattgaaaatagatcgttcttttgtcagccgtatggaa
gatactgacgaagatgctgcgatcgttcaaacgattatcatgttgagtcatgcattgggt
atggatgtagttgcagaaggggtggaaactgctgcacagcaagctaaattgcatagttta
ggttgtgagtatggacaaggctatttcttttctaagcctgtagatcaaaaaactgcaact
gcattactagataagcaattcaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system