Microchaete diplosiphon: NIES3275_68900
Help
Entry
NIES3275_68900 CDS
T09944
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mdp
Microchaete diplosiphon
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Malectin
GSDH
TIG
Malectin_like
PLRV_ORF5
YnaL
SSL_N
Calx-beta
Fn3_Dep-1_3rd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY94836
LinkDB
All DBs
Position
complement(8702127..8705546)
Genome browser
AA seq
1139 aa
AA seq
DB search
MVTKILRINTGGAAYTDTQGNLWEADNYFSDGNTYTTTAAIANTVEDPLYQDERWLDKFS
YDIPVDNGDYTVNLKFSELFWTEAGQRVFDVNVENQLVFDDLDIFKEAGGNNIALDKSFK
VKVTDGILNLDFLASVNNAKIDAIEIIPVDTTPTPTPTPTPTPTPTPTPTPTPTPTPAPT
PTATGKTIRINAGGADYRDSQGNLWEADNSKYFDGGNTYTTTAPIANTVDDGLYQDEHWS
DKFSYAIAVDNGKYTVKLKFSELFWTEAGQRVFDVSAEGNPVITNLDIFKAAGGNNIALD
KSFDVTVADGTLNLQFLASVNNAKIDAIEIIPVDTTPTPTPTPTPTPTPTPTPTPEAIRI
NVGGKAYTDAKKNKWDADQPQYVVGDSNVYTTTAEIGKTEDDPIYQDDRYAAKLAYEIPV
TAGNYTVNLHFAENFFTVFNERIFDVSLEGQKVFSDVDIFKQSKNAFFTGNNSALVLSVP
TVTVTDGKLNLNLDASVNNALLSGLEIIPLTGPQVILQQTQGRTEVTEGSADDSYSLVLN
TQPTADVTINVVKGDRLTTDKTSLTFTPANWNVPQTVNVNVVDDKIAQGADNLTISHTIS
TTDSNYQNLTIPELPVSVNDNDIVAISFTKKTVASIAAPSTAAWGPDGRLYVGTYSGEIR
AYTFDEKYNVIDTQIITTIQDKAGNKPNILGIAFNPYDQSGSPSIYVAHTRLYGNGGSAF
PKTEQSFYSGQVSILDGPNFSNLTALVTGLPTSNQDHGINALTFDQKGDLYINVGSNTNA
GVINSNIGGLPESPLSAAILKAEISKPGFKGDIKYVLQNPLPPGYEIPAGLTFDPADSQA
FGDVANVVPGTDVSVYASGLRNPFGAVFTTKGLLYATDNGHNTGFGELSTSATTSIPAPG
APDELNLIKQGEYYGSPNRNRGRTDDRQNVFYGPDKPSIPGVYTAPLTTFASSTNGIDEY
RATTFQSQLRGNLIAQQWNQKLYSVALSADGTKVIKNTVLNADSPVADGLSLVTGPGGAI
LGIDYADNAITVATADDLYIVDTTAYDIFPWRAPAAGGNTFVIGGKNFGGETEVSIGGQA
ATITSVSSQIIKGILPNFTASQFIDPNKDGLLDVVVKSNNQTSVITDAFAPLNDSAIFV
NT seq
3420 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaccaagatcctccggatcaatacaggtggtgcagcctacactgatactcagggt
aatctctgggaagctgataattatttttctgacggtaacacttatactacaactgcggcg
atcgccaatactgttgaagaccctctttatcaagacgaacggtggctagacaaattctct
tatgacattcctgttgataacggcgactacacagttaacctcaagttttccgaactcttc
tggactgaagctggacaacgtgtatttgatgtaaatgtcgaaaatcagttagtctttgat
gacttggatatttttaaagaagcgggtggtaataacatcgctttggataagtcttttaag
gttaaagtcactgatgggattttaaatttagatttcttggcgagtgttaacaatgccaaa
atcgacgcgattgaaatcattcctgtagatacaacaccaacgcccacacccacgcccacg
cccacaccaacacccacaccaacaccaacacccacacccacaccaacgcccgcgcccaca
cccacagccacaggcaaaacaattcgcattaatgcaggtggtgcagattacagagatagt
cagggtaatctttgggaagcagataatagtaagtattttgatggcggtaacacctatact
acaactgcaccgatcgccaatactgttgacgacggcctttatcaagacgaacattggtca
gataaattctcttatgccattgctgttgataacggcaaatatacagttaagctcaagttt
tccgaactcttctggactgaagctggacaacgtgtctttgacgtaagtgctgaaggtaat
ccagtaattactaacttggatattttcaaagcagcgggtggtaataacattgctttggat
aagtcttttgatgttacagttgctgatggcacactgaatttacagttcttggcgagtgtc
aacaacgccaaaattgatgcgattgaaatcattcctgtagatacaacaccaacaccaaca
cccacgccaacacccacacccacgccaaccccaacgccaacaccagaggctattcggatc
aatgtaggtggtaaagcttacactgatgccaaaaagaataagtgggatgcagatcaaccg
caatatgtggttggtgacagcaacgtctataccaccactgcggaaattggcaagacagaa
gatgatcctatatatcaagacgatcgatatgcagcaaagctagcttacgagattcccgta
acagctggtaactatacagtaaatctgcactttgctgagaatttcttcactgtcttcaat
gagcgcatctttgatgtttctttagaaggtcagaaagtgttctctgacgtagacattttt
aaacaatctaaaaatgcgttcttcacaggtaataactcagcgctagtactatctgtgcct
actgtgactgttactgatggcaagctgaatcttaatttggatgccagcgttaacaatgct
ctgctctcaggtctagagattatcccactcactggccctcaggtgattttgcaacaaaca
caaggtagaactgaggttacagaaggaagtgctgatgatagttactcattagttctgaat
acacaaccgaccgcagatgtcacaattaatgtagttaaaggcgatcgcttaactacagat
aagactagcctgacctttactcctgctaactggaatgttccgcaaactgtaaatgtcaat
gtagttgatgacaaaatagcccaaggtgctgacaatctcaccatttctcatactatctct
actacagatagcaactatcaaaatctcaccatcccagaacttcctgtcagcgtcaacgat
aatgatatcgttgctatcagcttcactaagaaaacagtagcttcaatagctgcaccctca
actgcagcttgggggccagatggcagattatatgtaggtacttatagtggtgaaatcaga
gcttatacctttgatgaaaagtacaatgttatcgatacccaaatcatcaccacaattcaa
gataaagctggcaacaaaccaaacatcttgggtattgcttttaacccctacgatcaatct
ggttcccccagtatttacgttgcccatacaaggctttatggtaacggtggcagtgctttt
cctaaaacagaacagtcattttatagcggtcaagtttccatactagatgggccgaatttc
tccaacttgacagctttagtcacaggactaccaacttccaatcaagaccacgggatcaat
gctttaacattcgatcaaaaaggtgatttatacatcaatgttggtagtaatactaacgca
ggtgtcattaacagcaacattggtggtttaccagaatcacctttgtctgcggctatctta
aaagcggagatttccaaaccgggctttaagggtgatatcaagtatgttctacaaaatccc
ctacctcctggttatgaaatcccagcaggattaacttttgatcctgcagatagtcaagcc
tttggtgatgttgccaatgttgtaccgggtactgacgtttcagtctatgcaagtggtctg
cgaaatccctttggcgcagtttttactaccaaaggattgctttatgctactgataatggt
cataacacaggctttggagaactttctacctcagctacaacttctatccctgcacccggt
gcgccagatgaactaaacctgatcaaacaaggtgaatactacggttctcctaaccgcaat
cgtggacgtactgatgatcgccaaaatgttttttatgggccagataaaccaagcattcct
ggtgtttatacagcgccactcacaacttttgcttcttcaactaatggcattgatgaatat
cgggcaacaactttccaaagccaattgcgcggtaatttaattgcccagcaatggaaccaa
aaactttacagcgtggctttatcagctgatggcacaaaagttatcaaaaatacagttctc
aatgctgattctcccgttgcagatggtttgagtttggtaactgggcctggtggtgcaatt
ctcggtattgactatgctgataatgcaattaccgttgcgacggcggacgatctttacata
gtagatactactgcttatgatatcttcccttggagggcaccagcagcaggtggtaataca
tttgtgattggcggtaaaaactttggtggagaaactgaagtttcaattggcggacaagct
gcaactatcacttcagtttcatcccaaataattaaaggaattctccccaactttaccgct
agccagttcattgatcccaataaggatggattgttagatgtagttgtgaagagtaataat
caaacatctgtgattacagatgcatttgcaccattaaatgacagtgcaatctttgtttag
DBGET
integrated database retrieval system