Microchaete diplosiphon: NIES3275_79700
Help
Entry
NIES3275_79700 CDS
T09944
Name
(GenBank) glycosyl hydrolase, BNR repeat protein
Organism
mdp
Microchaete diplosiphon
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_18
DUF6242_C
LtfC
GBD_Hemicentin
TIM-barrel_EndoS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY95893
LinkDB
All DBs
Position
plasmid09:25322..29983
Genome browser
AA seq
1553 aa
AA seq
DB search
MGFSQDYSNVPDWVSKSEGYQTGAMVKYQGNIFYANFWASEPGVGDADSNGWRFYDELYD
VTPHTPTEQAKIIAYIPTWRKKEGFNYTNDEMYQYITHGIVAFLMFSETNLGEFDTNSVN
DVNAILSDVVNTGHQNGTKISIALGGATDYGFLNLMTSIGNNPANPLLDKAVQNVANFVN
SNNLDGVDLDLECWWGKPGEKDQGGRKKSEGPHPAGYALTLFAQKLKQAIPDKLVSAAVF
GTSWYGNNYDSKIADYVDWLGVMTYDLTGSWNTSPVGPHSALFKIRNQESSKIRNQEFYQ
ESYIEEQQGDWPGGGTIDNPILSVEDTLWYWTNPLFVNWQGSGQNIPRTKIAAGVPIYGY
DFAYGKDPDELSGQVPPGYKSIRYKDILSQFPDAHQAPNGNIKVSGNTPRPPFISASGSY
PYAHNIYFETPDTAVTKLKFLKNVGCQGVIIWELSNDVWEEAKSIIKALYKNSGNHEKSP
IVTFPRTRQELPILLELEETQGLLYLSKDVFVRNIDLFNGPAVSVFDNEIYCLYKRKNDH
LLWGLTFDGSKWSSNIRFTNNLIETDASTDDMIAYVEIALSESPALVVFNGVLYCFHQGD
GYSGELWYTTYDHHGEPWRAKKWSEDKKVPNVGISGSPAVAVFNNKIYCFHEGSRSNQEL
WYTTFDGSNWENDQKVPNVGISGSPAVAVFNNKIYCFHEGSRSNQELWYTTFDGSNWEND
KLIPNVGISGSPSLAVFNNQLYCFHQGSKNNGELWWSRFIFNSITAHEVSNLGLSKSPSV
AVFQNKIYCLHQGQGDNGELWYSTFDGSKWLQDQKVSNVGISESPAVLVFNNQLYCFHQG
SNNNGELWYSYTKDGVTWEIDTKVPNVGLSKSPSVTVFQNKIYCFYQLAGNGGSLRYITF
DGTTFSSATLSGPGTFVGYPSKDGQRFPIGSDQSPAVVVFNNQLYCFHQGSNNNGELWYS
YTKDGWTWEIVDTQIPNIGLSKSPSVAVFKDKMYCFHQGMGDNRELWYTIFDGSTWLQDQ
KVSNVDISESPAVVVFNNKLYCFYQNNNNQLLYSLLNEETNGSPWIEVRGANSYCYCMCN
RSNNNHQGYLNHTHTMNIEAGAPYFYAVLTKDDDTVDFPTGAKLEIQDPDGNKYDRDIQE
ENQLVKMSGDSVRFLIIKDPKPGNWTMTMSAPEGVGFHCECNTVPSKDPYDTITNALSMT
NQLQKRGLSDDNQGWIGVAATTAIVSGGVTEATVALDISVTFSIAGATLSLTPFGIFFLA
AAIGTAAVTVTLLSSVASTPTRSEPSNQVSEIATGLTNTAQTISTTPLPTPQPQQADDAI
QLYLRTESNRQNNEGLGDFEILLQNGSQFTYDSYLQWIVEIRNNARTGNMMAVRLNINGA
QSPWIRVNPGNFYITAFSLADNPWTENNWRDIPANLINYGNNSINISFESIRNAMFRVRD
WINNPRNRLEEGPLQILIFLSAEAARFDGVAFAVNALLRRQVDSYDWLNFRPLLTNWGSI
STQIYHLPPGGLQPGISLYISRSFALQNRYENLVNYLTTLEEWEYPLGFPMAD
NT seq
4662 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggattttctcaagattattcaaacgttcctgactgggtatctaaaagcgaaggatac
caaaccggagcaatggttaaatatcaaggaaatatcttttatgccaacttttgggcttca
gaacctggtgtaggagatgcagatagcaatggttggcgattttatgatgagttatatgat
gtaacacctcatactccaactgagcaagccaaaataatagcatatattcctacatggcgt
aaaaaagaaggctttaactataccaatgatgagatgtatcaatacattactcatggaata
gtcgcttttttaatgtttagcgagacaaatcttggtgagtttgacaccaattcagtcaat
gatgttaatgcaattctttcagatgttgttaatactgggcatcaaaacggtacaaaaatt
tcaattgcactgggaggtgcaactgattatggatttcttaatttgatgacatctatagga
aataatcccgcgaatccactactcgataaagcagtacaaaatgtagccaattttgtgaac
tcgaacaatttagatggtgtagacctagatttagaatgctggtggggtaaaccgggtgaa
aaagatcagggaggaagaaaaaaaagtgaaggaccacatccggctggatatgctttgact
ttgtttgcacaaaaattaaagcaagctatacctgacaagctggtttcagctgctgtcttt
gggacatcatggtatggaaataactatgattccaaaatagctgattatgtggattggcta
ggagtgatgacatatgatttaactggttcatggaatacctctcccgtaggtccacattca
gccctttttaaaataagaaatcaggagtcttctaaaatacgtaatcaagagttttatcag
gagtcctacattgaggaacaacagggagattggcctggtggtgggactattgataatcct
attctttcagtggaagatacgctttggtactggacaaatccattatttgtcaactggcaa
ggtagtggacaaaatatacctagaactaagatagcagcaggtgtgccgatctatggatat
gactttgcctatggtaaagatcccgatgaactcagtggtcaagtacctccaggatataag
tcaattaggtataaagacatcttgagtcaatttcctgatgctcatcaggctcccaatggc
aatattaaagtctcgggaaacacaccaagacctcctttcatctcagcttcaggaagctac
ccgtatgctcacaatatctactttgaaactccagatactgcggttaccaaattaaagttc
ttgaaaaacgtaggatgccaaggcgtgattatttgggagctttcaaatgatgtttgggaa
gaagcaaaaagcattattaaagcgctttacaaaaactcaggtaatcatgaaaaatcacct
attgttacatttcctcgaaccagacaagaattaccaattctattggagcttgaagaaaca
caaggtttgttatacctatctaaagacgtttttgtgcgaaatatagacctattcaatggg
ccagcagtttcagtatttgataacgagatttactgcttgtataaaagaaaaaatgatcat
ttattatggggtcttacttttgatggaagtaaatggtcttcaaacataaggtttactaac
aatctgattgaaaccgatgcatctacagacgatatgatagcatatgttgaaattgcgtta
tctgaatcaccagcattagtagtctttaatggtgtactttattgcttccatcaaggagat
ggatatagtggagaattgtggtacacgacttacgatcatcacggagagccgtggagggct
aaaaaatggtctgaagacaaaaaagtaccaaatgtaggtatatcaggttcccctgctgtg
gcagtttttaataataagatttattgcttccatgaaggatctcgcagcaatcaagaacta
tggtataccacttttgatggaagcaactgggaaaatgatcagaaagtaccaaatgtaggt
atatcaggttcccctgctgtggcagtttttaataataagatttattgcttccatgaagga
tctcgcagcaatcaagaactatggtataccacttttgatggaagcaactgggaaaatgac
aaactaatacctaatgtaggtatatctggatcgccctcactagcagtatttaataaccaa
ctttattgctttcaccaaggcagcaagaataatggagaattgtggtggtctcggtttatt
tttaactcgattacagcacatgaagtgtcaaatcttgggctatcaaagtcaccatctgtg
gcagtgtttcaaaacaagatttactgcttacaccagggacagggagataatggagaattg
tggtacagcacctttgatggaagtaaatggttacaagatcaaaaagtatctaatgttggc
atatctgaatcaccagcagtgcttgtatttaacaaccaactttactgcttccatcaaggt
agcaacaataatggagaattgtggtattcctatactaaggatggcgtgacatgggagatt
gacactaaagtgccaaatgttgggctatcaaagtctccatccgtgacagtgtttcaaaac
aagatttactgcttttatcaattagcgggaaatgggggttccttgaggtacatcacattt
gatggcactacattttcatcagcaactctctcaggaccgggtacatttgttggctatcca
agtaaggacggtcagcgctttcctataggcagcgatcaatcaccagcagtggttgtattt
aacaaccaactttattgcttccatcaaggtagcaacaataatggagagttgtggtattcc
tatactaaagatggctggacatgggagattgtggatacacaaataccaaatattgggcta
tcaaagtccccatctgtggcagtatttaaagacaagatgtactgctttcatcagggaatg
ggagataatagagaattgtggtacaccatctttgatggaagtacatggttacaagaccaa
aaggtatcaaatgttgatatatctgaatcaccagcagtagttgtatttaacaacaagctt
tactgcttctaccaaaacaacaacaatcaattgttgtatagtctccttaatgaggagaca
aatggtagcccttggattgaagtgcgtggtgcaaattcatactgttattgtatgtgtaat
cgctccaacaataaccatcaagggtatttgaaccatacccatacgatgaacatagaagca
ggtgcgccatatttttatgctgtcctcactaaagatgatgatacggtagatttcccaact
ggtgcaaagctggaaattcaagatcctgatggaaacaaatacgatcgcgatattcaagaa
gaaaatcaacttgtgaagatgtccggggattcagttcgatttcttattatcaaagacccc
aagcccggaaattggacgatgacgatgtcagcgcctgagggggtcggtttccattgtgaa
tgcaatacagttccgtctaaagatccttatgatacgataacgaatgccctcagtatgaca
aatcagcttcagaaacggggtttgtctgacgacaatcaagggtggattggagtagcggca
accacagcaattgtatctggtggagttactgaggcaacagtagctttagatatctcagta
acgttctcaattgcgggagccacactatcactaacccccttcggaatattcttcctagcc
gctgctataggaacagcggcagtcactgtaactttactatcatcagtagcttcaaccccg
acaagatcagaaccaagtaatcaagtttcagaaatagcaactggtctgactaatactgca
caaactatatcgactacccctctaccaacaccgcaaccacagcaggcggatgacgcaatt
caactgtaccttaggactgaaagtaacagacaaaacaatgaaggattaggggattttgag
attttactgcaaaatgggagtcaattcacatatgattcttatcttcagtggattgttgag
attagaaataatgctcgaacaggaaatatgatggctgtgcgactcaatataaatggtgct
caaagcccatggattagggttaatccagggaacttttatataacagcattttccctagca
gataatccatggactgagaataattggcgtgacatacctgctaacctaatcaattatggt
aacaattccataaatatcagttttgagtcaatccgaaacgctatgtttcgagtaagggac
tggattaataaccctagaaaccgattagaagaaggtccactacagatcttaatctttctt
agtgctgaagcagcaagatttgatggggtggcgtttgctgttaatgctctgttgcgaaga
caagttgactcttatgattggctaaactttagacctctgctcacaaactggggctctata
tctactcagatttatcatctgccacctgggggattgcaacctgggatttcattatatatc
agccgtagttttgctctgcaaaacagatatgaaaatcttgtgaattatttgactacactc
gaggaatgggaatacccattgggatttccgatggctgattga
DBGET
integrated database retrieval system