KEGG   Mesomycoplasma dispar: MDIS_03730
Entry
MDIS_03730        CDS       T03700                                 
Name
(GenBank) lactamase
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mds  Mesomycoplasma dispar
Pathway
mds03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mds00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    MDIS_03730
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mds03019]
    MDIS_03730
Messenger RNA biogenesis [BR:mds03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     MDIS_03730
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP Lactamase_B Lactamase_B_2 RNase_J_C RMMBL Anti-Pycsar_Apyc1
Other DBs
NCBI-ProteinID: AJR12440
UniProt: A0AAJ5NSG9
LinkDB
Position
complement(984858..987377)
AA seq 839 aa
MSSTVNPTRFFGLGGMQEIGKSTLVIEDDHDIVIIDAGIKFANIFLTGIKGMVPNYQYLQ
KKQEKIRGLFITHGHEDHIGGIVYLVQEVNIKKIFAPKIAIEYLKAKFDDQKINPKVTFV
EINKMDSYRFESLTVDFWTAQHSIPDAFGIRVSSKHGSIMCTGDFRFDYTPIGNYTDFER
LKEIGNQRLTALFSDSTNAMRPNHSPSERDILADIEMHMRSATRKIIITAFASNLTRIKA
LIEIGVKLGKKILVFGRSMVNGINIGRRSGYINVSDDVFLGKNLNGVEENQMLILTTGSQ
GEQLAALDRMSNKKHPKISIEPRDMIIFSSSPIPGNKIKIEHLINRLYKLSAIIKENGPD
GYLHTSGHAYKAEHEKIFQLTKPKYFFPYHGEYRMSVAHSQTAIESGVDPKNVIIAENGQ
VFKMVDQEIYKTREKIPCEPIYIDGETISRDNSRIINERQEMRENGFVFVLIPFHKEKNL
LTGRISIITKGTFSVRTGSQIIAEIRRLCFTSVKFFTEKNQKWSPPQIKQLIKNRLNAYF
HRTKRWKPVILTKILYIDQKVDFIKEYQAKKGEKFMIHTLEKSKFDSNFEKLNLQNSDKN
NEISKENPLKTDKFFKPKNLEGKISQKSSKNYYNNQVFNQDFKPKTDNYVKLFKKDNLKT
TKLRRNLQTFDSKKSFNDSTSKKASFLWKKPQINGQNSIITSSFLTSLTDKKVKNEEDSL
KSIKKFPTSKKLNLKTPYEKRAKVNKNDFLNLKNLTYNNRKNTNNHKSSHSLTEQKSFVP
LKNNKPTEVFYRKNQKDDLFNSHKNWKMTKKPFFVQPPQDKITKQDNIAEKVKKQRNNE
NT seq 2520 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcctcaactgtaaatccaacacggttttttggtcttggcggaatgcaagaaatcggt
aaatcaactttagttattgaagatgatcatgatattgtaattattgatgccgggataaaa
ttcgcaaacatttttttaaccggaatcaaaggaatggttccaaattatcaatatttacaa
aaaaaacaagagaaaatacgcggtctttttatcactcacggtcatgaagatcacattggc
ggaattgtttacttggttcaagaagtcaatattaaaaaaattttcgctccaaaaatcgct
attgaatatttgaaggcaaaatttgatgatcaaaaaattaacccaaaagtaacttttgtt
gaaattaacaaaatggattcttatcgttttgaaagtttaacagtcgatttttgaaccgcg
caacattcaattcctgatgcttttggaatcagagttagttcaaaacacggttcaattatg
tgcactggcgatttccgctttgactatacaccaattggaaattacactgattttgaaaga
ctaaaggaaattggtaaccaaagattaacagcacttttttctgattctacaaacgcaatg
cgtccaaatcattcgccttctgaacgggatattcttgctgatatcgaaatgcatatgcgt
tctgcaacgcgaaaaattattattaccgcttttgcctcaaatttaacaagaattaaagcg
ctaattgaaattggtgttaaattaggaaaaaaaattcttgtttttggtcgttcgatggtg
aacggaattaacatcggacgccgttcaggttatattaatgtttctgatgacgttttttta
ggaaaaaatttaaatggcgttgaagaaaatcagatgctaattttaacaactggttcacaa
ggggaacaacttgctgctcttgaccgaatgtcaaataaaaaacaccctaaaatcagtatt
gaaccacgtgatatgattattttttcatcatcgccaattccaggaaataaaatcaaaatt
gaacatttaattaacagactttataaattaagcgcaattattaaagaaaacgggcctgat
ggctatcttcacacttctggacacgcttataaagccgagcatgaaaaaatttttcaatta
acaaaaccaaaatactttttcccttatcatggcgagtatcgaatgtcagttgctcactca
caaactgcaattgaatcaggtgttgatcctaaaaatgtaattattgctgaaaacgggcaa
gtttttaaaatggttgaccaagaaatttacaaaacaagagaaaaaattccttgtgagcca
atttatatcgatggtgaaacaatttcccgtgataattcgcgaattattaatgagcgtcaa
gaaatgcgtgaaaatggttttgtttttgttttgattccttttcacaaagagaaaaattta
cttactggtcgaatttctattattacaaaaggaactttttcagttcgtacaggaagtcaa
attattgcagaaattcgtcgtctttgttttacatcagttaaattttttactgaaaaaaat
caaaaatgatcaccgccacaaatcaaacagttgataaaaaaccgacttaatgcatatttt
cacagaacaaaacgttgaaaaccagtaattttaacaaaaattctttatatagatcaaaaa
gttgattttattaaagaatatcaagcaaaaaaaggtgaaaagttcatgattcacacttta
gaaaaaagcaaatttgattctaattttgaaaaactaaaccttcaaaattcagataaaaac
aacgaaatttcaaaggaaaaccctttaaaaactgataagtttttcaagccaaaaaattta
gaaggcaaaatttctcaaaaatcttcaaaaaattattataataaccaagtttttaaccaa
gattttaaaccaaaaacagataactatgtcaaactctttaaaaaagacaatttaaaaact
accaaattaagaagaaatttacaaacttttgattcaaaaaaatcttttaatgattctaca
agtaaaaaagctagttttttgtgaaaaaaaccgcaaattaatggccaaaactctattatt
acttcttcatttttaacttccttgactgataaaaaagttaaaaatgaagaagatagtctt
aaatcaattaaaaaatttccaacttctaaaaagttaaatctaaaaacaccctatgaaaaa
cgtgctaaagttaataaaaatgactttttgaatttaaaaaatttgacttataataatagg
aaaaatactaataatcataaaagttcgcattctttaactgaacaaaaaagttttgttccg
ttaaaaaacaataaaccaactgaagttttctaccgtaaaaatcaaaaagatgacctattt
aatagtcacaaaaactgaaaaatgactaaaaaaccattttttgttcagccaccgcaagac
aaaataacgaaacaagataatattgcggaaaaagttaaaaaacaaagaaataatgagtaa

DBGET integrated database retrieval system