Mesomycoplasma dispar: MDIS_03730
Help
Entry
MDIS_03730 CDS
T03700
Name
(GenBank) lactamase
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mds
Mesomycoplasma dispar
Pathway
mds03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mds00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MDIS_03730
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mds03019
]
MDIS_03730
Messenger RNA biogenesis [BR:
mds03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MDIS_03730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
Lactamase_B
Lactamase_B_2
RNase_J_C
RMMBL
Anti-Pycsar_Apyc1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJR12440
UniProt:
A0AAJ5NSG9
LinkDB
All DBs
Position
complement(984858..987377)
Genome browser
AA seq
839 aa
AA seq
DB search
MSSTVNPTRFFGLGGMQEIGKSTLVIEDDHDIVIIDAGIKFANIFLTGIKGMVPNYQYLQ
KKQEKIRGLFITHGHEDHIGGIVYLVQEVNIKKIFAPKIAIEYLKAKFDDQKINPKVTFV
EINKMDSYRFESLTVDFWTAQHSIPDAFGIRVSSKHGSIMCTGDFRFDYTPIGNYTDFER
LKEIGNQRLTALFSDSTNAMRPNHSPSERDILADIEMHMRSATRKIIITAFASNLTRIKA
LIEIGVKLGKKILVFGRSMVNGINIGRRSGYINVSDDVFLGKNLNGVEENQMLILTTGSQ
GEQLAALDRMSNKKHPKISIEPRDMIIFSSSPIPGNKIKIEHLINRLYKLSAIIKENGPD
GYLHTSGHAYKAEHEKIFQLTKPKYFFPYHGEYRMSVAHSQTAIESGVDPKNVIIAENGQ
VFKMVDQEIYKTREKIPCEPIYIDGETISRDNSRIINERQEMRENGFVFVLIPFHKEKNL
LTGRISIITKGTFSVRTGSQIIAEIRRLCFTSVKFFTEKNQKWSPPQIKQLIKNRLNAYF
HRTKRWKPVILTKILYIDQKVDFIKEYQAKKGEKFMIHTLEKSKFDSNFEKLNLQNSDKN
NEISKENPLKTDKFFKPKNLEGKISQKSSKNYYNNQVFNQDFKPKTDNYVKLFKKDNLKT
TKLRRNLQTFDSKKSFNDSTSKKASFLWKKPQINGQNSIITSSFLTSLTDKKVKNEEDSL
KSIKKFPTSKKLNLKTPYEKRAKVNKNDFLNLKNLTYNNRKNTNNHKSSHSLTEQKSFVP
LKNNKPTEVFYRKNQKDDLFNSHKNWKMTKKPFFVQPPQDKITKQDNIAEKVKKQRNNE
NT seq
2520 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcctcaactgtaaatccaacacggttttttggtcttggcggaatgcaagaaatcggt
aaatcaactttagttattgaagatgatcatgatattgtaattattgatgccgggataaaa
ttcgcaaacatttttttaaccggaatcaaaggaatggttccaaattatcaatatttacaa
aaaaaacaagagaaaatacgcggtctttttatcactcacggtcatgaagatcacattggc
ggaattgtttacttggttcaagaagtcaatattaaaaaaattttcgctccaaaaatcgct
attgaatatttgaaggcaaaatttgatgatcaaaaaattaacccaaaagtaacttttgtt
gaaattaacaaaatggattcttatcgttttgaaagtttaacagtcgatttttgaaccgcg
caacattcaattcctgatgcttttggaatcagagttagttcaaaacacggttcaattatg
tgcactggcgatttccgctttgactatacaccaattggaaattacactgattttgaaaga
ctaaaggaaattggtaaccaaagattaacagcacttttttctgattctacaaacgcaatg
cgtccaaatcattcgccttctgaacgggatattcttgctgatatcgaaatgcatatgcgt
tctgcaacgcgaaaaattattattaccgcttttgcctcaaatttaacaagaattaaagcg
ctaattgaaattggtgttaaattaggaaaaaaaattcttgtttttggtcgttcgatggtg
aacggaattaacatcggacgccgttcaggttatattaatgtttctgatgacgttttttta
ggaaaaaatttaaatggcgttgaagaaaatcagatgctaattttaacaactggttcacaa
ggggaacaacttgctgctcttgaccgaatgtcaaataaaaaacaccctaaaatcagtatt
gaaccacgtgatatgattattttttcatcatcgccaattccaggaaataaaatcaaaatt
gaacatttaattaacagactttataaattaagcgcaattattaaagaaaacgggcctgat
ggctatcttcacacttctggacacgcttataaagccgagcatgaaaaaatttttcaatta
acaaaaccaaaatactttttcccttatcatggcgagtatcgaatgtcagttgctcactca
caaactgcaattgaatcaggtgttgatcctaaaaatgtaattattgctgaaaacgggcaa
gtttttaaaatggttgaccaagaaatttacaaaacaagagaaaaaattccttgtgagcca
atttatatcgatggtgaaacaatttcccgtgataattcgcgaattattaatgagcgtcaa
gaaatgcgtgaaaatggttttgtttttgttttgattccttttcacaaagagaaaaattta
cttactggtcgaatttctattattacaaaaggaactttttcagttcgtacaggaagtcaa
attattgcagaaattcgtcgtctttgttttacatcagttaaattttttactgaaaaaaat
caaaaatgatcaccgccacaaatcaaacagttgataaaaaaccgacttaatgcatatttt
cacagaacaaaacgttgaaaaccagtaattttaacaaaaattctttatatagatcaaaaa
gttgattttattaaagaatatcaagcaaaaaaaggtgaaaagttcatgattcacacttta
gaaaaaagcaaatttgattctaattttgaaaaactaaaccttcaaaattcagataaaaac
aacgaaatttcaaaggaaaaccctttaaaaactgataagtttttcaagccaaaaaattta
gaaggcaaaatttctcaaaaatcttcaaaaaattattataataaccaagtttttaaccaa
gattttaaaccaaaaacagataactatgtcaaactctttaaaaaagacaatttaaaaact
accaaattaagaagaaatttacaaacttttgattcaaaaaaatcttttaatgattctaca
agtaaaaaagctagttttttgtgaaaaaaaccgcaaattaatggccaaaactctattatt
acttcttcatttttaacttccttgactgataaaaaagttaaaaatgaagaagatagtctt
aaatcaattaaaaaatttccaacttctaaaaagttaaatctaaaaacaccctatgaaaaa
cgtgctaaagttaataaaaatgactttttgaatttaaaaaatttgacttataataatagg
aaaaatactaataatcataaaagttcgcattctttaactgaacaaaaaagttttgttccg
ttaaaaaacaataaaccaactgaagttttctaccgtaaaaatcaaaaagatgacctattt
aatagtcacaaaaactgaaaaatgactaaaaaaccattttttgttcagccaccgcaagac
aaaataacgaaacaagataatattgcggaaaaagttaaaaaacaaagaaataatgagtaa
DBGET
integrated database retrieval system