KEGG   Methanobrevibacter sp. AbM4: Abm4_0108
Entry
Abm4_0108         CDS       T02687                                 
Name
(GenBank) CRISPR-associated helicase Cas3
  KO
K07012  CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4]
Organism
meb  Methanobrevibacter sp. AbM4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:meb00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:meb02048]
    Abm4_0108
Enzymes [BR:meb01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     Abm4_0108
Prokaryotic defense system [BR:meb02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Type I signiture cas proteins
    Abm4_0108
SSDB
Motif
Pfam: Cas3-like_C_2 DEAD ResIII PhoH Helicase_C Cas3_HD AAA_22
Other DBs
NCBI-GeneID: 15797603
NCBI-ProteinID: AGN16029
UniProt: R9SIT2
LinkDB
Position
complement(126330..129176)
AA seq 948 aa
MDFFDLKYDFDSSFIKLNDDFFYFYAHNNEYLNDHIQKTSHIFDNLLNKKIIENFYEIFK
QDHLINFSFDDFNKIIKYTVYLHDIGKISFNFQLNRLNTNNKKIFNEQSTFLKKHYFEDY
IPLLCKTHSIVGSLIFLSKFKANIDENTLILLLLAYTIYGHHTSIKDILSNKNFSYNLND
KEWNTFCIILLYLDLANKEDIENEKFSTYYFNQIQDNASNYLKSEIEDYNSTLSLFYMYI
YSLLIVSDVFASNKYNISVEEVKKLNFNNRITSNLKNIMFSSFYNKTYNKNLSYNLIIDS
LDNIDNINVLRKNMLLESSLNLIKNIDKNNVFFLNMPTGAGKTNTSMKLALDIINNTEID
RIIYAMPFINIIEQNFDVICDSYGLSEDNGEIRKIYSGSETLFSDASDEFKYDILLNDDF
FNYPVICTTFVSLFNSIIRNDKKSKYKLSALTNSVIILDEIQSLPLKNWNSLYYIINELA
DKYNIYFIIMSATLPNFNRLILDSKSNLRYPNISLIENPSKYFNHSLFKRTETKNEIKSF
ELTSENHAEIIDYLLDIVEENFEQGYNKGLMVFNTIKSSRLIYDYLSEYCEEYNFEIDLL
NSSLIPSSKKAIISKINHMNENQNKKYILISTQSIEAGVDVSFDFVIRDYAILDSVEQVK
GRCNRNGELAIRYNNPSKKGNVYLIKLNDSKKNYYEYIYNNEEQETRIKSTENLIEESPN
YTFEDISKYYDNVSDLINLHNNEKESKFNFIDRDNIKFLNNIEYSKLKDKETGIHLIDNN
QEQFSIFICTDLNIFTESLKINKNFNVWEKLDDNNFIEFYKENKSDFIFSINELKYIKNI
SAKTNKKLYHENKIIGKNLLDYYKSLFKNKNKNYDYYKLIKKEFSSILYKFIINITINKY
DQLYDKINEWEKFKFFYILDKKDIGNEEESFYSLEKGFNFKPVITEIY
NT seq 2847 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatttctttgatttgaaatatgattttgattcatcatttatcaaattaaatgatgat
ttcttttatttctatgcccacaataatgaatatcttaatgatcatattcaaaaaacatct
cacatttttgacaatttattaaataaaaaaattattgagaatttttatgaaatatttaaa
caagaccatttaataaatttttcttttgatgattttaataaaattattaaatatactgtt
tacttacatgatattggaaaaatttcattcaattttcagttgaatcgcttaaatacaaat
aacaagaaaattttcaatgaacaatcaacctttttaaagaaacattattttgaggattat
atacctttattatgtaaaacccattcaattgttggatcattgatttttttatctaaattc
aaggcaaatattgatgaaaataccttaattttattactattagcttatacaatctacgga
caccatacctcaattaaagatattttaagtaataaaaatttttcatacaacttaaacgat
aaggaatggaacacattttgtattatattattatatttagatttggctaacaaagaagat
attgaaaatgaaaaattttcaacatattattttaatcaaatacaagacaatgcctcaaac
tatctaaaaagcgaaattgaagattataatagcacattatctcttttttatatgtatatt
tattcattattaatagtatctgatgttttcgctagtaacaaatacaacatttcagttgag
gaagttaaaaaattaaattttaataatagaataacatccaatttaaaaaatataatgttc
tcatcattttacaataaaacatacaataaaaatttatcatataatttaataattgattct
ttagataatattgataatattaatgttttaagaaaaaatatgttattagaatcctctttg
aatttaattaaaaacattgataagaataatgttttctttctgaatatgcctacaggtgct
ggaaaaacaaacacttctatgaaattagcattagacataataaataatacagaaattgat
agaattatttatgctatgccatttattaatattattgaacagaattttgatgtgatatgt
gattcttatggattaagtgaggataatggagaaattagaaaaatttattcaggatctgaa
accctattttcagatgcaagtgatgaatttaaatacgacatattgttgaatgatgatttt
tttaactaccccgtaatatgtactacatttgtcagtttatttaatagtataattagaaat
gacaaaaaatccaaatataaattatctgcattgacaaattctgtaattattctggatgaa
attcaatcattacctttaaaaaactggaatagtttgtattacattattaatgagttagca
gataaatataatatttattttattataatgagtgccacattacctaattttaatagatta
atattagattcaaaatcaaatctaagatatcctaatatttcattaatagaaaacccctct
aaatatttcaaccattcattatttaaaagaacagaaactaaaaatgaaattaaatcattc
gaattaacatctgaaaatcatgctgaaattattgattatttattggatattgttgaggag
aattttgaacaaggttataacaagggattgatggtttttaacacaattaaatcttccaga
ctaatatatgactatttaagtgaatactgcgaggaatacaactttgaaatagatttgttg
aattcaagcttaataccatctagtaaaaaagcaattatttcaaaaattaatcatatgaat
gaaaaccaaaataaaaaatacattttaataagtacccaaagtatagaggcaggtgttgat
gtaagttttgattttgttattagagattatgctattttagactctgttgaacaagttaaa
ggacgttgtaataggaatggggaactagcaattcgttataataatccttctaaaaaaggt
aatgtatatctaattaaattaaatgattctaaaaaaaattattatgaatatatttataat
aatgaggaacaagaaactcgaattaaatcaactgaaaatttaattgaagaatctccaaac
tatacctttgaggatatttcaaaatattatgataatgtttcagatttaattaatttacat
aataatgaaaaggaatcaaaattcaattttattgatagagacaatattaaatttttaaat
aatatagaatattcaaaattaaaagataaagaaacaggaatacatttaattgataataac
caagaacaattttctatttttatatgcacagatttaaatatattcacagaatcattaaaa
attaacaaaaatttcaatgtttgggaaaaattagatgacaataattttatcgaattttac
aaagaaaataaaagtgattttatcttctcgattaatgagttaaaatatattaaaaacata
tcagctaaaactaataaaaaattgtatcatgaaaataagataattggtaaaaacctgtta
gactattataaatcgctttttaaaaataagaacaaaaactatgattattataaacttatt
aaaaaggagttttcatccatattatataaattcataattaatattaccattaacaaatat
gatcaattatatgataagataaatgagtgggagaaatttaaattcttttatattttagat
aaaaaagatataggaaatgaagaagaatccttttattccttagagaaaggatttaatttt
aaacctgtgattactgaaatttactag

DBGET integrated database retrieval system