Methanobrevibacter sp. AbM4: Abm4_0159
Help
Entry
Abm4_0159 CDS
T02687
Name
(GenBank) glycosyl transferase GT2 family
Organism
meb
Methanobrevibacter sp. AbM4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glycos_transf_2
Glyco_tranf_2_3
Glyco_tranf_2_2
Glyco_tranf_2_4
EndoS_Ig-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15797653
NCBI-ProteinID:
AGN16077
UniProt:
R9SH45
LinkDB
All DBs
Position
210775..212934
Genome browser
AA seq
719 aa
AA seq
DB search
MVKLSIIIPVFNTGNFLNNCLNSILKQSFEDFEVICVDDGSTDNSLNILKSYENKDYRIK
IFTQNNKGAGAARNLGLKHVNGEYILFADSDDWFEDNAFQLLYNQAKNLDTDLILFDSLE
HKTDNISRERAYFNSNDFDFTNYIFDYHFRNNILVMNSFFVPWSKLYKAKFLLDNNIRFS
EIPIFNDMYFNVVTTVLASKIAYYPKILYHYNKLNSSSIQSKIKFDKKPFVILYVYETIE
NFLKNHNLYEELEANFLKSKFKQYNNVLNRVNDDYKEELFIKFRDDFKNLELVDSNILYN
LSLKEYSFYIHVLNSNSFREFNEFNSIFNESTLSNNLILSFDKVDENYIDFFNTSLNRIK
ELNLFDENYYIKNYNFTGSINPLIDYLCNGAFKNYNPSERFDTEYYSDFYHLKDNNSLIY
FVNKGYFEGKNKISSSTPNFNSINKIKIDNEILNFNEMGISDENYGEEIIISLTSIPDRM
EDLHYCLYSLFNQSFKPNKIILWLSEEEFPNKEEDIPEAVLNFKNNGLTIKWCKNYYSYK
KLIPTLKKYPNACIVTVDDDLYYDKDCLKNLYEDHIKYPDYIIASRCRIMEFNEDNKLKR
YVDWKLANKGEDISFLNFPTNGAGTLFPPDSLNEKVIDVNLFRKLCPHTDDIWFWSMAVL
NKTKIKRCKKLVQELFYINSYKQIFSENKLWAKNSKGRNDLELNNVLNEFPEILKIIKD
NT seq
2160 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaaactttcaattataattcctgtttttaatactgggaatttcttaaataattgt
ttaaattctatattaaaacaatcatttgaagattttgaagttatttgtgtagatgatggg
tcaacagacaattcattaaatattctaaaatcttatgaaaataaagattatagaataaaa
atttttactcaaaataataaaggggcaggtgctgctcgtaatttaggcttaaaacatgtt
aatggggaatatattttatttgctgactctgatgattggtttgaagataatgcttttcaa
ttactttataatcaggcgaaaaatcttgacacagatttaatcttatttgattcattagaa
cataagactgataatatatcacgagaaagggcttattttaattcaaatgattttgatttt
acaaattatatatttgattatcattttaggaacaatatattagtaatgaatagttttttt
gttccatggtctaaattatataaggcgaaatttttattagataataatattaggttttcg
gaaataccaatttttaatgatatgtattttaatgtagttactactgttttagcttcaaaa
attgcatattatcctaaaattttgtatcattataataaattaaattcctcctcaattcaa
tcaaagattaaatttgataaaaaacctttcgttatcttgtatgtttatgaaactattgaa
aattttttaaagaatcataatctttatgaagaattggaagctaattttttaaaatctaag
tttaaacagtacaataatgttttaaatcgagtaaatgatgattataaggaagaattattt
attaagtttagagatgattttaaaaatttagaattagtggatagtaatatattatataat
ctttctttaaaagaatatagtttttatatacatgtattaaattctaattcttttagggag
tttaatgaatttaattctatttttaatgaatcaacactttcaaataatttaattttaagt
tttgataaagttgatgaaaattatattgatttttttaatacaagtttaaatagaattaaa
gaacttaatctatttgatgaaaactattatattaaaaattataatttcactggtagcata
aatccattaattgattatttatgtaatggtgcttttaagaattataatccttctgaaaga
tttgatactgagtattattctgatttctatcatttaaaagataataattcattaatctat
tttgtaaataaaggatattttgaaggtaaaaataagattagttcatcaactcctaatttt
aattctattaataaaataaaaatagataatgagattttaaattttaatgagatggggatt
tcggatgaaaactatggtgaagaaataattatttcattaacttctattccagataggatg
gaagatcttcattattgtttatattcattatttaatcaatcttttaaacctaataagatt
attttatggttatctgaagaagagtttcctaataaagaagaagatattccggaggcggtt
ttaaattttaaaaataatggtttaactattaaatggtgtaaaaattattattcttataaa
aaattaattcctactttaaaaaagtatcctaatgcatgtattgttactgtagatgatgat
ttatattatgataaagattgtttaaaaaatttatatgaagatcatattaaatatcctgat
tatattattgcttccagatgtagaattatggagtttaatgaggataataaattaaagaga
tatgttgattggaaacttgctaataaaggtgaggacatttcatttttaaattttccaaca
aatggtgctggaactttattcccaccagattcattaaatgagaaagtaattgatgtaaat
ttatttagaaaattatgtcctcatactgatgatatatggttttggtctatggctgtctta
aataaaacaaagataaagagatgtaaaaaattagttcaagagcttttttatattaattca
tataaacaaatattttctgaaaacaaattatgggctaaaaatagtaaaggacgtaatgat
ttagaattaaataatgttttaaatgaatttccagagattttaaaaattattaaggattaa
DBGET
integrated database retrieval system