Methanobrevibacter sp. AbM4: Abm4_0599
Help
Entry
Abm4_0599 CDS
T02687
Name
(GenBank) adhesin-like protein
Organism
meb
Methanobrevibacter sp. AbM4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Big_3_5
MG4
Chlam_PMP
OxRdtase_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15798089
NCBI-ProteinID:
AGN16492
LinkDB
All DBs
Position
729943..734295
Genome browser
AA seq
1450 aa
AA seq
DB search
MNNSIKKSSIFVMVLFSLFIIISGISATDNSSYNTDFDSNDLYLSSNNTINQVDSNSDIL
KDEDTNQGSFSDLNTLISNSSVINLDKSYKYNPDSDSNYKNGLIINKTVRINGNNYTINT
NGGAKLFDIKGNGTLILINVNLINNYSSTKIINNNGNLFLTNCNFTNRINSAPNMLTPIY
STGNLTIENSIFKDSVINSSRMITIAGGLIENYKGNLTIRNTQFLNNGLIVRQNTTAIVT
VNGLLIYNSGGNAVFNNLTVSNNFANLNATSIRFFGFILNSGNNANMTVRNCNLNQNIPL
LIGKSSVGTGVLRSAGGNLYVSNSNFSNNIGYNAGSIYNGGNSTIVNSVFYKNSVSNCGG
AIFNEGNLSSINNSFIANAAKNDGGAIHNYGYYDTGNYDKGNVYIENNIFDLNNVETVSN
ADKLVLAQGGAIYSYSGNLTIINSNFTNNKAIGANGGVISNRANNFLNISKSIFVNNTAT
QLDIWPNSTGLGGVIFIAETEMVNETNPATFDVSYSIFDNNRAEIGDVISSVNVPEYPDY
EVGVKANNNFWGTNNPDFNKLIHNYQNTETLVPNNYVVMDINSNELNDTKIKVNKPYIFN
INLNKLNDSSDCSDNLPDYLVTLNNLISSNVVNTSEILLNKGSGSFGYASNVYGNDTIFI
YLANDIMEDNPIVNITLLTVSPMKDLYVNLSYVGESDGTSDKPYTNLKDALDSIYLDNDS
VIHIASGVYTGVNNINQTITNNNLTIRNWDDEANVIFNGEKNTNLNGGILTFTGDGLLTL
INLTFVNGSANTFAGAIYSNGSGSLNIIDCNFTSNNAYYGGAILSYGAVYINNTVFDSNK
ANNNAGAIQANTVYAFNSNFTNNNGSYRYGRGGSVYSTLGGNFTSCNFIGGRASLGGAIA
CAEDGTVNVSGSTFIGNGANVGGGAIYSQKGLNIDNSTFIKNYANISNRYASGGAVSTNY
ANISNSTFIDNYARYTGGAISIQNDVNVTKSIFVNNTASSEGGAIWSYGDVSVDYSIFER
NNASYGKAVYYTDVYSLSNNWWGNNTPSFTNLIYSRGNAANISNWVVIKINGPNTVYVGE
LTPFNITFNTLNTGEKLVENLPEYKFKLYNNVSENIILDNISSIDGNLTFNYLSNRLGND
TLIIANDYERLVFKDLNITKKDTMIDINVDEDNHIVIIGLKDIDGNVLPGASLHYSINGS
GENSVLTNEDGSVLISGVYGDYVLFVNFAGNDSYNPSSNSAIISLKAPIKNTVIVFSNMT
QKAVDFYKGERGRYFSIILKDTEGNALVNKTVQLTVSGVVYNKTTDSNGIAKLQINLNTA
KNHKILIYFSGDDQYNSSMAIGNIHVIKKDVKITENSNNKKSVKINKYKTLHFYVKGQNA
IKGTYIQNPVGRKVKVTIKGRTYNLKVNSKGIVTLKVKINKAGTYKIVTKFLGDNTYGSK
TYTSKLVVKR
NT seq
4353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataactctattaaaaaatcatcaatttttgttatggttttgtttagtttatttata
atcatatctggtatttcagctactgataatagtagttataatactgattttgattctaat
gatttatatctgtcttctaataatactataaatcaagttgattctaatagtgatatatta
aaagatgaagatactaatcaaggatcattttctgatttaaatactttaatctcaaatagt
agtgtaataaatttagataaatcttataaatacaatccggatagtgatagtaattataag
aatggtctgataattaataaaactgtacgaataaatggtaataattacactataaatact
aatggtggagcaaaattatttgatattaaaggaaatggaactttaattttaataaatgta
aatttaattaataattattcgtctacaaagattattaataataatggaaatttattttta
acaaattgtaattttacaaatcgaatcaattcagctcctaatatgcttactccaatctat
agtactggaaatttaactattgaaaattcaatttttaaggattctgttataaattcaagt
agaatgataactattgcaggtggactgattgaaaattataagggaaacctaactattaga
aatactcaatttttaaataatggattaatagttcgtcaaaatactactgctatagttact
gttaatggattgttaatttataattctggaggtaatgcagttttcaataatttaactgtt
tctaataattttgctaatttaaatgcaacttctattagattttttggctttattcttaat
tctggaaataatgctaatatgactgtaagaaattgtaatctcaatcagaatatcccatta
cttattggtaaaagttcagtaggtacaggtgttttacgtagtgctggaggaaatttatat
gtttccaattctaacttctctaataatataggatataatgcaggatccatatataatggt
ggaaattcaactattgtaaattctgttttttataaaaattcagtttctaattgtggaggg
gcgatatttaatgagggtaatctaagctctattaataacagtttcattgcaaatgctgct
aaaaatgatggtggagcaatacacaattatggatattatgatactggtaattatgataaa
ggtaatgtatatatagaaaataatatctttgatttaaataatgttgaaactgtgtctaat
gctgataagttagtacttgcacaaggtggagctatttattcctattcaggtaatcttaca
ataattaatagtaatttcactaataataaagctataggggctaatggtggtgtaatttca
aatagggctaataattttttaaatattagtaaatcaatttttgttaataatactgctact
cagttagatatttggcctaattctactggtttaggtggagtgatttttattgctgagaca
gaaatggtaaatgaaaccaatcctgcaacatttgatgtaagttattcaatctttgataat
aacagggcagaaattggtgatgtaatatcctctgtaaatgttcctgaatatccagattat
gaagttggtgtaaaggcaaataataatttctggggaacaaataatcctgattttaataaa
ttgattcataactatcaaaatactgagactttggttcctaataattatgtagtaatggat
attaattctaatgagcttaatgatactaaaattaaggtaaataaaccatatatttttaat
ataaaccttaataaattaaatgatagttcagattgttctgataatttacctgattattta
gttacacttaataatcttatttctagtaatgtggtaaatactagtgaaatattattaaat
aagggtagtggttcatttggatatgcttcaaatgtttatggtaatgatactatatttatt
tatttagcaaacgacattatggaagataatcctatagttaatattacattattgactgta
tctcctatgaaagatctttatgttaatttatcttatgttggtgaatctgatggaactagc
gataaaccttacaccaatctaaaagatgctctagattcaatttatttagataatgattct
gtaatacatattgcatctggtgtatatactggagtaaacaatattaatcaaactattact
aataataacttaactattagaaattgggatgatgaggcaaatgttatcttcaatggtgaa
aaaaatactaatcttaatggtggaattttaacttttactggtgatggattattaacttta
atcaatttaacctttgtaaatggttctgctaatacttttgctggtgctatttattctaat
ggctctggttctctaaatattattgattgtaatttcacatctaataatgcatattatggt
ggggcaattttatcctatggggctgtttacataaataacactgtatttgatagtaataaa
gccaataataatgctggagctatacaggctaatactgtttatgcatttaattctaatttt
acaaataataatggtagttatagatatggtcgtggtggatctgtttactctactttaggt
ggaaactttacttcatgtaattttattggtggtcgagctagtttaggtggtgctattgct
tgtgctgaagatggtactgttaatgtaagtggttctactttcattggtaatggggctaat
gttggtggaggagctatatactcccaaaaaggtttaaatattgataattccactttcatt
aaaaattatgctaatataagtaatagatatgcctctggtggtgctgtcagcactaattat
gctaatattagtaattctacttttattgataattatgcaagatatactggtggtgctatt
agtattcaaaatgatgtaaatgtaactaagtctatatttgtaaataatactgctagttca
gaaggtggcgctatttggtcttatggtgatgtttctgtagattattctatctttgagaga
aacaatgcttcatatggtaaagcggtttattatacagatgtttattctttatctaataat
tggtggggaaataatactcctagtttcactaatttaatttattcaagaggtaatgctgca
aatattagtaattgggtagttattaaaattaatggtcctaatacagtttatgtaggggag
ctaacaccatttaatattacatttaatactttaaatactggtgaaaaattagttgagaat
ttacctgagtataagtttaaattatataataatgtttctgagaatattattttggataat
attagttccattgatggaaatctaacatttaattacctatctaataggttaggtaatgat
actctcattatcgcaaatgattatgaaagattagtatttaaagatcttaatattactaaa
aaggataccatgattgacattaatgttgatgaagataatcatattgttataattggttta
aaggatattgatggtaatgttttaccaggtgctagtttacattattctattaatgggtct
ggtgaaaatagtgtcttaactaacgaggatggtagtgtattaatttctggtgtctatggt
gattatgttttatttgtaaattttgcaggtaatgattcatataatccgtctagtaattct
gcaattatatctttgaaggctcctattaaaaatactgttattgtatttagtaatatgact
cagaaagctgtcgatttttataagggtgaaagaggaagatactttagtattattcttaaa
gatactgaaggtaatgctttagttaataaaacagtacaattaactgtaagtggagtggta
tataacaaaaccactgattcaaatggaattgctaagcttcaaatcaaccttaatacagct
aaaaatcataaaattttaatatatttctcaggagatgaccaatataattctagtatggct
ataggaaatatacatgtaattaaaaaagatgttaagataactgaaaatagtaataataaa
aaatcagttaaaattaataaatataaaactttacatttctatgttaagggtcaaaatgct
ataaaggggacttatattcaaaatccagtaggtagaaaagttaaagttactattaaaggt
aggacttataatttgaaagttaactctaaaggtattgttactttaaaagttaaaattaat
aaagcaggtacctataaaattgtaactaaatttttaggtgataacacttatggttcaaag
acctatacatcaaaattagttgtaaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system