Methylomonas sp. EFPC1: JWZ98_00090
Help
Entry
JWZ98_00090 CDS
T10319
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
meep Methylomonas sp. EFPC1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
HCBP_related
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QSB01415
LinkDB
All DBs
Position
21028..29538
Genome browser
AA seq
2836 aa
AA seq
DB search
MSVATTDDYIKAAEILFKTFGTPGDVFGGGVNYSNYIADGKTTDAAGAALAIGKITTNLL
TLITDIPGVSNIPGIDILGLIKNVNDLTNTQNDIGITSDKVVAVIGDLSAIGAFASTSLG
PAGLPLLIGLSTVSLVASLYSTYTGIIIDQENAALLKWTTDNITSFGGINSLKWDNYQTT
IFKDSFNKNPAMMPTLLLLREIDSTITPDKALKLIENSGVSTLLDGRIPEVSNTINSLHQ
LLFGVGTQAVTTKEGVNTLINTLWNDFKANPLAGNVEMVDIVSIPLKTADVWTDFGSFLS
LAYLTPFAIKANTPEAEQFLNTIHAGIAAQWEFDKTLTPEQISNGEATYSYKWVQDRLSM
LSWLGASYASDTQSISINSMGMNSSKHFLDMTSGKEINVVGLGDVQQIIFGDDTSTLLPE
GGNLDDHIYGGGGDDGLKGNGGNDYLEGGAGSDVLDGGDGSDTLVGGEGIDFLEGSKGND
KLIGGKGNDIYIFKQGDGFDTISDSDGLGKIQWDNLELKGSNTDTLDLAKWKKLSNTLWQ
DETNDITYSLKIQADGSNTLFINKLGDQIQVKNWTDGDLGITLGNITAPTSAFTYTGDQR
ALIVGSSGSLKYDWGATSWAADGTLTGGVVEQDFNDVIYGDQYAVNDKDVINGLGGNDAL
DGRGGNDQIDGGAGDDLIGGGVGSDTIHGGTGNDEILSATGLNAPQRTGPNDVWQAPAGK
TVQTQGSTWGIYDNGNNTYVISGGGSLALDNAPDVVFGDGGDDRIVGGHGDDYLDGGTEN
DTLTGNGGNDIIDGGSGKDFIQGDGIITPGFYSTTSASLHGKDFLDGGAGNDVLFGNGND
DILLGGADNDNLWGDDSESDLALQYHGNDYLDGGAGDDKLYGNGGDDTLIGGTGNDDLYG
GAGFDTYIINAGDGIDHIIDSDSEKNSKIIFGNGVNSSDVKLRLGSLMLDLGNGNAVHIE
NFDQTDVFNSSAVSSFEFADGTTLSIDQLLARGFDLDGTDQDDIIFGTNTTDRINGMAGN
DQLVGGAGNDTLLGGAGMDYLQGDDGDDYLDGGDGDDLSILNGNVLFDGGLSGGAGDDTL
YGRAGKDELVGGDGQDLLDGGTEDDFLFGEAGNDRLLGGDGDDKLGGGDGNDTLSGGAGA
DYFNGGAGDDTYLDVTAEDVIFDNQGSDTIELLSANGLAATGALSKTGNSSVAVKLDNGD
TLNLINAFYGTHYNLKFANNAIIDLEAMIGNTLTTAVSLGLDDNGGRLYGGAGNDLLQGG
SGNDVLLGYLGNDTLKGGVGNNILSGGDGNDTLFGNGTGIGLSGDDVLNGGVGDDTIYAE
EGNDTIRGGTGNDILSGGLGNDIYLFGRGDGYDGIYETAYLNGSSEDVLRLDAGILPEHV
TLHRMKDQYGSTRIALVIDGSSTQIQFNDLTSSDYSIERIEFDGGLGAVWTAADISAHIQ
VGVRNDMVGTSADDVFIVDNELDTIIEAADSGTDTVLASRTFALSNNIENLTLTGFLNIG
AMGNALNNTLIGNSGNNIIEGNGGYDTGQGGLGDDTYFTVENIVEYADGGIDTWVNPGGG
TLFDNVENLSLYDGNNSHSIYTVYAYGNGLDNILTSGGYGVQGDVFDGRAGADTVIVKGN
DAPIVYIDNIGDKIVGVAYEIRSSIDYSLAQPAVNVNTGQPVPTSTSNRLVLVGADAISG
VGNVLANFLDGSQNAASNTLVGGVGNDTYVISLNDRVIEAANEGSDDVRFWTFAPDSGSE
INIADLMMDNVESFTLAGYANNATLRGNAQNNILSVALQNSSNAGRLMGEGGNDKLYGGA
GADVLNGGTGADEMRGGIGNDLYVVDDINDSVIEYENQGWSDAVETSVGFTLGSNLEILT
LTGAADIDGYGNSLGNTLTGNSAANTLDGGAGDDILIGGDGNDVLIGGAGNDSLTGGGAN
DVLMGGAGSDTYYFDRGFGQDTINSYDLTVGKIDAVEFSSGILPSEVGVSRIDNDLILSL
AGTSDTLTIQHYFDNDGVTPFSIEQIRFKNYPTNTVWNLTTINAKLNNQAPVVATPLPDL
SLVEGRPFDYFVPSNTFADDLDPSSSLVLGATLSDGSPLPSWLHFYGTYFSGRPIGTGTV
SVRVTAQDTAGLKGSDTFDIVTFYQDLMITGTQSNESGYGGTGNDSLYGLGGNDYLFGYE
GNDVLDGGAGNDGLYGGMGNDSYVVDSLSDYTTEDFNEGIDLVQSSITWTLSANVENLTL
TGNAVVNGTGNELDNVLIGNSVANTLTGLGGNDRLIGNAGNDTMIGGTGDDIYIVDSSAD
VITENLNEGLDSVESTATYTLTANVENLTLTGTTAINGTGNALNNVLTGNSAVNTLTGGA
GNDRLDGKAGADKMLGGTGNDTYVVDISTDVITENANEGTDTVETGITYTLGTNVENLVL
TGTAAINGTGNTLNNVITGNSSANTLSGGTGADTLIGGMGNDIYVVDNTLDIVTENVNEG
ADKVQSSVTYSLGANVEDLTLTGTTAINGTGNGLDNVLTGNSAVNTLTGGAGNDRLDGKA
GADKMLGGLGDDTYVVDVSTDVITENTNEGSDTVETGITYTLGANLENLLLTGTTAINGT
GNTLNNVLTGNSAVNTLTGGAGNDRLDGKGGADKMLGGTGDDTFVVDVSTDVLTENANEG
TDTVETGITYTLGTNLENLTLTGSTAINGTGNALNNVLKGNSAVNSLSAAAGNDTLDGGA
GVDTLTGGTGNDTYVLGRGYGADTVVENDATAGNTDIAQFLSGITADQLWFQHVGNNLEA
SVIGTSDKLVMKDWYTGTANHVEQFKTTDGALTLLDSQVENLVSAMAAFAPPAADQTTLP
TNYQTALAPVIAANWH
NT seq
8511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcgtagctacaactgatgattacataaaggcagccgagatactttttaaaacgttt
ggcactcctggggatgttttcggcggcggtgttaactatagtaactatatagccgatggg
aagaccactgatgcagctggtgccgcgctagccattggaaaaataaccacaaatctgcta
actttaataacagatattcctggtgtttcaaacatccctggaattgacatcttagggtta
ataaaaaatgtcaatgatttgacaaatactcagaatgatattggtattactagtgataaa
gttgttgcagttattggcgacctatctgctataggagcttttgccagtacgtccttgggc
cctgctggattgcctttgcttattggtttatcaacagtgagtttagtggcttcattgtat
tctacttacaccggaatcatcattgaccaagaaaatgccgcgttattaaaatggactaca
gataatatcacctcttttggaggtataaatagtttgaaatgggataactatcaaacaaca
atttttaaggatagttttaataaaaatccggcaatgatgccaacattattgctattaagg
gaaattgacagcacaattactccagataaagcattaaaactaatcgaaaattctggcgtt
tcaacattactagacggacgtattcctgaggtatccaacactataaattcacttcatcaa
ttgctatttggcgttggcactcaggcagtaaccacgaaagaaggtgtcaataccttaatt
aatacgctatggaatgacttcaaagcgaacccgctcgccggaaatgtcgaaatggtcgac
atagtctctatccctcttaaaacagccgacgtatggaccgattttggctcctttttgagt
ttggcttacctcacccctttcgcgatcaaagcaaacacgccagaagcagagcagttcctc
aataccatacatgcggggattgccgcccagtgggagtttgacaaaacactgacacctgag
caaatcagtaatggcgaagccacttattcctataaatgggtacaagatcggctttccatg
ttgagttggttaggcgcgtcctacgcatcggacacccaatctatttcgataaattcaatg
ggcatgaattcatcgaaacatttcctcgatatgaccagcggcaaagaaatcaatgtggtc
ggtctgggcgatgtgcaacagattattttcggggatgataccagtacgctgttgcccgaa
ggcggaaacttggatgatcacatctatggcggcggcggtgacgatggccttaagggcaat
ggcggaaacgattaccttgaaggaggggcaggtagcgatgttctggatggaggcgatggg
agtgataccctggtcggcggcgaaggtatcgattttcttgaaggcagcaagggtaacgat
aagttaataggtggtaagggtaatgatatctatatcttcaagcagggtgatggcttcgac
actatctcggatagcgacggcttaggcaaaatccaatgggacaacttagaactgaaaggc
tcgaatacagataccctcgatcttgccaaatggaaaaaattgagcaacaccttatggcag
gacgagaccaacgacatcacctacagtctcaaaatccaagcggatggtagcaatacgttg
tttatcaataaactgggtgatcagatacaagttaaaaattggacggatggtgacctaggg
attacgctaggcaacatcacagcaccgactagtgcctttacctacaccggtgaccaaaga
gcactcatcgtgggctcctcgggttcgctgaagtacgattggggcgcgacctcctgggcg
gctgacggtacgctgaccggcggcgttgtcgaacaagatttcaacgatgtgatttatggc
gaccagtatgcggttaacgacaaagatgtcatcaacggcctgggcggcaacgacgctctg
gatgggcggggcggcaacgatcagatcgacggcggcgcgggtgacgacttgatcggcggt
ggggtgggttccgacaccatccacggaggtaccggcaacgacgaaatcctcagcgccacc
ggcttaaatgcgccgcaacgcaccggccctaacgatgtctggcaagcgcccgccggcaaa
acggtgcagactcaaggcagcacctggggaatttacgataacggaaataatacttatgtc
attagtggcggcggatcattggcgctggataatgcgccggatgtcgtatttggcgacggt
ggagacgaccgcattgtcggtggtcatggggacgactatctggacggtggcacggaaaat
gatacgctaaccggcaacggtggtaacgatattatcgatggcggcagcggcaaagacttt
attcagggtgacggcataataaccccaggattttattcgacgacctccgcatcgctgcat
ggtaaggactttctggacggcggcgcgggtaacgacgtactgttcggtaacggcaatgac
gatattttgctcggcggtgccgataacgataatttgtggggcgacgattcggaaagtgat
ttggccttgcaatatcacggcaacgattatttggacggcggcgcgggtgacgacaaactc
tacggcaacggtggcgacgataccctgattggcggcactggtaacgatgatctatacggc
ggcgcgggtttcgatacctacatcatcaatgctggcgacggtatcgaccacatcatcgac
agcgattccgagaaaaacagcaaaatcatcttcggcaacggtgtgaattcgagcgatgtt
aaattgcgcttgggttcgctgatgcttgacctgggcaacggcaacgccgtgcacatcgaa
aacttcgatcagaccgacgtctttaacagctcagcggtcagcagcttcgaattcgccgac
ggcaccacgctcagcatcgaccaactgttggcacgtggttttgatttggatggcaccgat
caggatgacatcatttttggtaccaataccactgatcgcatcaacggaatggcaggcaat
gaccagttggtcggcggcgccggcaacgacacccttttggggggagccggcatggattat
ttgcagggtgacgatggagatgattaccttgacggcggagatggcgatgaccttagcatc
ctgaatggcaacgtgctgtttgacggcggcctttcgggcggggccggtgacgatacgctg
tatggccgtgcggggaaagatgaactggttggaggagacggccaagacctgctcgacggc
ggcacggaagacgattttctgtttggcgaagccggcaatgacaggctattaggtggggat
ggtgacgataaactgggaggcggggacggcaacgatacgctcagcggtggtgcaggtgcg
gattacttcaatggcggcgccggtgacgacacctacctggatgttactgcggaggacgta
atctttgacaaccaaggcagcgataccatcgaattgttaagtgcgaacgggctggccgca
actggcgcactcagcaaaaccggcaattcaagcgtggccgtgaagctggataacggcgac
acgctaaacctgatcaatgcgttttatggcacccattacaacttaaaatttgccaataac
gcgatcattgatcttgaggccatgatcggcaacaccctcactactgccgtttccctgggg
ctggacgacaacggcgggcgcttatacggtggtgccggcaatgacttactccaaggtggc
tctggtaatgatgttctgcttggctatttaggtaacgacacgcttaaggggggcgtcggt
aacaacattctgagcggtggggatggcaacgatacgctatttggcaatggaaccggcata
ggcctcagtggcgatgacgtgctaaatggcggcgtaggcgatgacacaatttatgctgaa
gaggggaatgatactattcgaggcggcaccggcaatgacatcctgagtggtggcttgggg
aacgatatttatttgtttggtcgaggcgatggctatgatggaatttatgaaacagcatac
ctaaacggttccagcgaagatgtgttacggcttgatgccggtatcctgcccgagcacgtg
actttgcatcggatgaaagatcaatacggctctactcgcatagcgctggtgatcgatggg
tcaagtacacaaatccaattcaatgatttgacctcatcggattattcgattgaacgtatc
gagtttgacggtggtttaggtgctgtatggacagcagcagatatcagcgcacatattcaa
gtcggtgtgcggaacgatatggtgggcacttcggcggatgatgtgttcatcgttgacaac
gagttagacaccataatcgaagcagcggattcgggaacggatactgttctggcctcacga
acatttgccttgtctaacaatatagaaaatctcacattaacgggctttctaaatattggt
gctatgggcaatgcccttaataataccctaatagggaatagcggcaacaatattattgaa
ggaaacggcggttatgatactggtcaaggtggccttggggatgacacttatttcacggtt
gaaaacatagtggaatatgcggatggggggatcgatacctgggtaaatccgggcggcggc
actctattcgacaatgtcgaaaatctgagtttatacgatggcaacaatagccactcgatt
tataccgtttatgcctatggcaatggcttggataatattttgacttctggtggctatggg
gttcagggtgatgtgtttgatggaagagcgggtgccgatacggtcattgtaaaaggtaat
gatgcacctatcgtatatatcgataacataggcgacaaaattgtcggcgtagcttacgaa
atccgtagttctatcgattacagcttggctcagccagcagtcaacgtcaacaccggtcag
cctgtaccgacgagcacatccaaccgattggtgctggtcggagccgatgccattagcggc
gtaggtaacgttctagccaattttctggacggctcacagaatgcagcgtcgaacacatta
gttggcggtgtcggtaacgacacctatgtgattagtttgaacgaccgcgttattgaagcc
gcaaacgagggtagtgatgatgtaaggttttggacttttgcgccagactcgggtagcgaa
atcaacatcgctgatttgatgatggataacgtcgaatctttcacattggcgggttatgcc
aacaatgctacgctgaggggtaacgctcaaaataatattctaagtgtcgcattgcagaat
tcttccaacgctggtcgtttaatgggagaaggaggtaatgataagctctacggcggtgcc
ggggctgacgttctgaacggcggaacaggtgccgatgaaatgcggggtggtataggaaat
gacctttacgtcgtcgatgatataaacgacagtgtgatcgaatatgaaaatcaaggatgg
tcagacgctgttgaaacaagtgtgggttttactttgggaagtaatcttgaaattctcact
ttgactggagcagcagatatagatggatatggcaattcgctgggcaatacacttactggt
aatagcgccgccaataccttggatggcggtgctggtgatgacattttaataggtggtgac
gggaatgatgtcttgataggcggcgctggtaacgattctttaactgggggaggtgctaac
gatgttttgatgggcggtgcgggaagcgatacatactatttcgacagaggctttggtcag
gacacaattaacagttatgacctgactgtcggaaaaatagatgcagttgagttttcatcg
ggcatattgccatctgaagtcggcgttagccgcattgacaatgacttgattctttcgtta
gcagggacctccgatacgcttactattcaacattattttgataacgatggcgttacgcca
ttctcgatagagcagatcaggtttaagaattacccaacgaacacggtctggaacttgact
actattaatgccaagttgaacaaccaagcaccagtcgtggcaacgccattgccagacttg
agcttggtcgagggaaggcctttcgactattttgtgccctcaaatacgtttgccgatgac
cttgatccgtcaagttccctggtgttgggggcaactttgtccgacggaagccctttgccc
agttggttgcatttttatggcacatatttttcgggtcggccaattgggaccggtacggtg
agcgtgcgggtcacggcacaagatactgcgggactgaagggatcagatacgttcgacatt
gtgaccttttaccaagatctgatgattaccggtactcaatcaaacgaaagcggctatggg
ggcacaggcaacgattcgttgtacggcttaggcggcaatgactatttattcggatatgag
ggcaacgatgtccttgacgggggagcgggcaatgatggtctttacggtggtatgggcaat
gatagctatgtggttgacagcctatccgactatacgactgaggactttaacgaaggaatt
gatttagttcaaagttctatcacttggaccctaagtgccaacgtagaaaatttgacattg
actggcaacgccgttgtgaatggcacgggcaacgaacttgacaacgtgctgataggcaac
agtgtagccaacaccttgactggtctcggtggcaacgaccgacttattggcaatgcgggt
aacgatacgatgataggcgggacgggggatgatatttacattgtcgatagctcggctgat
gtaatcaccgaaaaccttaacgagggtctagacagtgtagagtcgactgctacatacaca
ttaaccgctaatgtggaaaacctcacccttacaggtactactgccatcaacggtaccggg
aatgccttgaataatgttcttaccggcaatagtgctgtaaacacactgacaggtggtgcg
ggcaatgaccggcttgacggcaaagccggtgcagataagatgttaggcggtacaggcaac
gatacgtacgttgtcgacatctcaaccgatgtaatcaccgagaatgctaacgaaggtacc
gacaccgttgagaccggtattacctacacgttaggcaccaatgtcgaaaatttggtgctg
accggtactgcagccatcaacggcacaggcaatacgctcaacaatgttatcaccggtaac
agctcagcgaatacgctttccggaggtactggagcggatacactgattggcggtatgggt
aatgacatctatgtagtcgataacaccctagatattgtcacggaaaatgttaatgaaggc
gccgataaggttcagtctagcgttacctattcgctgggtgctaatgttgaagatcttacc
ttaacgggcactactgctatcaacgggaccggtaacggcctggataacgttctgacgggt
aatagcgcggtgaatacgcttaccggcggtgccggtaatgatcggctcgatggtaaggcc
ggtgcagataagatgttaggcggattaggcgatgacacttacgtcgtcgatgtctcaacc
gatgttatcactgagaataccaatgaaggcagcgataccgtggaaaccggcattacctac
acgttaggagccaatctggagaacctgttgttgacaggcaccacagccatcaatggcacc
ggcaataccctcaataatgtgttaaccgggaatagcgctgtcaatacgctaacaggcggt
gcgggtaatgataggctcgatggcaaaggcggtgctgacaaaatgctggggggaacaggc
gacgacacctttgttgtcgatgtttcaaccgacgttctcaccgagaatgccaatgaaggc
accgacaccgtagaaaccggtattacatacaccttgggcacgaaccttgaaaacctgacc
ttgaccggctcaactgccatcaatggcacgggcaatgccttgaacaacgtgctgaagggc
aacagcgccgtcaacagcttatccgctgcggcgggtaacgataccctggatggcggtgca
ggcgtggatacgctgaccggcggcaccggcaacgatacctatgtcttgggtcggggctac
ggtgccgacaccgtggtcgagaacgatgcaacggcgggtaacaccgacatcgcgcaattt
ctgtccggtatcaccgccgaccagctctggttccagcatgtcggcaacaatctggaagcg
agcgttattggtacctccgataaattagtgatgaaggactggtataccggcaccgccaac
cacgtcgagcagttcaaaaccaccgacggtgcgttgaccctactggatagccaagtggaa
aacctggtgtcggcgatggccgcgttcgcgccgccggccgccgatcaaaccactttgccg
actaattaccagacggcactggcaccggtgattgcggctaactggcattaa
DBGET
integrated database retrieval system