Methanobacterium sp. ERen5: NKF70_08530
Help
Entry
NKF70_08530 CDS
T10395
Name
(GenBank) right-handed parallel beta-helix repeat-containing protein
Organism
meer Methanobacterium sp. ERen5
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Beta_helix
Big_3_5
MG4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTB31586
LinkDB
All DBs
Position
1572543..1577279
Genome browser
AA seq
1578 aa
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DB search
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DBGET
integrated database retrieval system