Megasphaera stantonii: DKB62_11780
Help
Entry
DKB62_11780 CDS
T05599
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
meg
Megasphaera stantonii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_head
YadA_stalk
ESPR
YadA_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXL22186
UniProt:
A0A346B243
LinkDB
All DBs
Position
2496701..2504524
Genome browser
AA seq
2607 aa
AA seq
DB search
MNRIYKVIWSKVKHQYVVVSELAHSCTKSTSSRVGRSAAAVLAALVLTTGVCAVPVQAED
LTDPYALLNEKVEKSKNSDPIVELVQSPLAKAASETTAETNSDNQPADEEATTPTQPADS
QKQHTIINQDGIYASNGKGTYNTLSKDGLWVGGRDDGEGLYVDNDGNMRTTGNVMVDGAF
SAGDGNAYIAKDGSTSIQVGGSQFIVNSDIAGMSNGNASVSVMNNSAEVRAADNLIAAGI
DGITMSEQTGNTTVTVNQDGMTVDGDLTVTGDTNLKDTGVDGTLNVSGNQTVGGNSTVKG
SQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLH
DLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGG
SSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKG
SQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLH
DLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVNGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGG
SSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKG
SQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLH
DLIVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGG
SSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKGSQEVLHDLTVGGSSTVKG
SQEVLHDLTVGGNSTVKGNQTVGGTITANKGIIGGVILETTDDGKSKVKADKADIGGVII
KDKGIEAGTVQINKGSATDNRVLDVNGNFAVYNDGAFKAAGENFVVKATGDVTANSYRNA
NGTFTADETGLVTATKAQIDNVTIGGEDPSAAIKVSDDNFIVYNDGAFQAAGRKFLVNNQ
GEMTAAAATVDNVVIDNNQVTGLSNTTWNPEDPDSIVEDRAATEGQLMYVDAQVKVNSDD
LAAYKAAGIVAGNEVGQYSNSIALGNNATVDSTNSIAIGAGSTADGAQATALGQNSNALG
HGAVSLGANSEAVGEGAVSIGFNNSAEVAGSVAIGNGAHVYEGGTNSVALGQWSQASDDK
VVSVGNDWLKRRITNVAAGTDPTDAVNVQQLTDRTANMVEWDENTDDTIHGVTLENGMIT
AAEGNFKVYGTGGIYAANGKFQVNGNTGDVSAEGNLKAADGKFFVNGDNGSIIAADGDFK
VSGKGDVTAAGSLTAADEKFKVYGASGGFMAADGKVEVNGYTGDIRTDGKVTANEIHAAN
DNFIVYESGVVKLNDGNLVIGTNGDLNSKGTITGNVLSTGGFVANADGNAEAKGTVIANT
LSTGADGFIANSDGDFEARNAHIDGTLLVGEKFKVTSDGELIAANSAFKVGADGTVTAVK
GGSIGGVELKDGEVTGLNNTTWDAGNIVDDRAATEGQLAVVDAKVKVNSDDLAAYKAAGV
VPGAVPAEAEGAMALGAGAEVRGDSDKAMAIGNGAAATNKNAVALGASATAKGVDSLALG
ANANTDVSAQHAVAIGAWAGATEDNAIAIGQSAGAKAENAVAVGMEAKAEGDHSVALGAN
SGVAEDTTNSMALGNNAKVENAGSDSALAIGDEATVTASHAVAVGAGVEADGVHSLAMGS
DLTVTGDNAIGIGYSAGMGTKISGENAIGIGKAVNATDKNTIALGTAAASNEENAISIGT
RATVDSYNSIAIGAESGVAEGSQEGIALGYNANVSTNGAIAIGSNSVAAGEGSMALGLGA
STTLQAPHSVAIGEGSVADESMVVSVGHAGENGQRRIINVAAGTKDTDAVNVSQIKGMVR
WDQDADDSYLEGTLRGVTLSDGTITAANGNFVVTDDPKSGTDSILNIGEDAFRVNENGGF
VAGNGNFKVFSTGGVVAAGGDFKINSETGAVTTTSVTGLTNTDWNTTHDYSDSTLAATEA
QLQAVAEEAGKQASVVSADGNLTVNDATTNASGGTTFKIGLSDKVVLDGDKGTTITLNSG
ELNADDSAFSITTPGLATGRTQSFDFSSAGAVFKEAYADTSNSTKIAGSTIISENYYHDE
GTGEKRTATTVIDGGTLRVSSSGGESDKTVIKGADITVGTTTGGAAQTHITAKEITIGGD
LLNDDKATALRITNNGVNDRTITGLTNITWKSDEEWQKAHYESSRAATEGQLKIVDDKVN
ANADAIDKLNKFTGLSKDTNAKVSAFAAKTQGINWDNLNTLSQISPMNLAAPMNAAVPTA
NATRFPDLDDESGESGTTGDTGRVPVEGLTVTDDQISTDRDFSVGGDLSVSGDTTLGGKL
TVGGEATFNDNVSIKGDLNMNNNKITGVAAGDVNATSTDAVNGSQLYGVQQDVEANAKNI
STLGGAVNKLGNRIDEVGAGAAALAALHPLDFDPDNKWDFSAGFGNYRGESAVAFGAFYR
PNEDTMFSVGGTVGNDDNMVNAGVSLKIGSGSSGVTTSRVAMAKEIKAMRDVVAKQDAQI
QKLTAMVNALVGVQTEPDTTTMFPDVP
NT seq
7824 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccgaatttacaaagtcatttggagcaaggtcaagcaccagtacgttgtcgtatcg
gaactggctcacagctgcacgaagagtacgagcagccgtgtcggcagaagcgccgccgcc
gtattggctgccttggtgctgacgacgggcgtctgcgctgtaccggtgcaggccgaagac
ctgacagatccgtatgccctgttgaatgagaaggtagaaaaatcaaaaaattcggatcct
atagtagaattggtccaaagcccgttggctaaggctgcgtctgaaaccacagccgaaacg
aatagcgacaaccagccagctgacgaagaagctacgacgccgacacagccggctgattca
caaaaacagcataccattatcaatcaagacggcatctatgccagcaacggcaaaggtacg
tataatacgctgagcaaagacggcctgtgggttggcggaagggatgacggcgaaggactc
tatgtcgataacgacggcaatatgcgcacgacagggaacgtcatggtagacggcgcattt
tcggctggcgacggcaatgcttatattgctaaagacggatcgacgagtattcaggtaggc
ggctcccagtttatcgtcaatagtgatattgctggtatgagtaatggtaatgccagcgtt
tctgtaatgaataatagtgccgaagtacgagcagcagataatctgattgcagcaggtatt
gacggtattaccatgtcggaacagacaggaaacacaacggtaacggttaatcaagatggt
atgactgttgatggggatttgactgttaccggtgatacgaacttgaaagatacaggcgta
gatggaactttaaatgtatctggcaatcagactgttggcgggaattcgacggttaaaggc
agccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccag
gaagtgttgcacgacttaacggttggtggcagttcgacggttaaaggtagccaggaagtg
ttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcat
gacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcacgactta
acggttggtggcagttcgacggttaaaggtagccaggaagtgttgcatgacctgacagtc
ggcggcagttcgacggttaaaggtagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggc
agttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcacgacttaacggttggtggcagttcg
acggttaaaggcagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggtt
aaaggcagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggc
agccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccag
gaagtgttgcacgacttaacggttggtggcagttcgacggttaaaggtagccaggaagtg
ttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcat
gacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcatgacctg
acagtcggcggcagttcgacggttaacggcagccaggaagtgttgcatgacctgacagtc
ggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcacgacttaacggttggtggc
agttcgacggttaaaggtagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcg
acggttaaaggtagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggtt
aaaggcagccaggaagtgttgcacgacttaacggttggtggcagttcgacggttaaaggc
agccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccag
gaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtg
ttgcacgacttaacggttggtggcagttcgacggttaaaggtagccaggaagtgttgcat
gacctgatagtcggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcacgactta
acggttggtggcagttcgacggttaaaggtagccaggaagtgttgcatgacctgacagtc
ggcggcagttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggc
agttcgacggttaaaggcagccaggaagtgttgcacgacttaacggttggtggcagttcg
acggttaaaggtagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggtt
aaaggcagccaggaagtgttgcatgacctgacagtcggcggcagttcgacggttaaaggc
agccaggaagttttacacgacctgacagtcggcgggaattcgaccgtaaaaggaaatcaa
acagtaggtggcacaattaccgctaataagggaattatcggcggcgtcattttagaaacg
acggacgatggcaagagcaaggtcaaagcagataaagccgacatcggcggtgttattatt
aaagataaaggcattgaagctggtactgtacagattaacaaaggcagtgcaacggataac
cgcgtcttagatgtcaatggcaattttgctgtttataatgacggagcctttaaagccgct
ggtgaaaactttgtcgttaaagccactggcgatgtaacggctaattcgtatcgtaacgct
aatggcacgtttacagctgatgaaactggccttgtaacagcaacgaaagcgcaaatagac
aatgtaacgattggcggtgaagacccatctgctgctattaaggtcagcgatgataacttt
atcgtttataatgatggagcattccaagcggcaggacgtaaattcttagttaataatcaa
ggtgaaatgactgctgcagcggcaacggtggataatgttgtcattgataataaccaagtg
acaggtctttctaatacaacatggaatcctgaagatcctgattctatagtagaagacagg
gcagcaacggaaggccagttgatgtatgtcgatgcgcaggtaaaagtcaacagcgatgac
cttgcagcatataaagccgctggtattgttgcaggaaatgaagtgggccagtactctaac
tctattgcgttaggaaacaatgcgactgtcgatagtacgaacagcattgcaatcggtgca
ggcagcactgcagatggagctcaggctacggccttagggcagaattcgaatgccttaggt
catggagcggtttccttaggcgctaattcagaagctgtaggagaaggcgcagtttcgatt
ggttttaacaattcggcggaagtagccggttcggttgctattggcaacggtgcccatgta
tatgaaggcggtacgaattcggttgccttaggccagtggagtcaggcctctgacgataaa
gtcgtttccgtagggaatgattggctgaaacgccggattaccaatgtagccgcaggcaca
gatcctaccgatgctgtcaacgtacaacagctgacagatcggactgccaatatggtggaa
tgggatgaaaatacggatgacacaattcatggtgtcaccttggaaaatggcatgattacg
gctgctgaaggtaacttcaaggtatatggtacaggcggcatctatgctgctaatggcaag
ttccaagtcaacggtaatactggcgatgttagtgcagagggcaatttgaaggccgctgac
ggtaagttcttcgtcaatggtgacaacggcagtatcattgcagctgacggggatttcaaa
gtttccggtaagggcgatgtcactgcagcaggcagccttactgcggcagatgaaaaattc
aaggtttatggcgcaagcggcggctttatggcagctgatggaaaagtagaagtcaacggc
tacactggagacatcagaaccgatgggaaagttacggccaatgaaattcatgcagctaac
gacaacttcattgtttatgaaagtggtgttgtgaaactcaacgatggtaatcttgtgatc
ggtacgaatggcgacttgaattctaaaggcaccatcactggtaacgtattgagtacaggc
ggttttgtagctaatgcagatggaaatgctgaagctaaaggtactgtaatcgctaatact
ttaagtactggtgcagatggatttattgctaacagcgatggtgattttgaagccagaaat
gctcatattgatggcacgcttttggttggtgaaaaattcaaggtaacatccgatggtgaa
ttgattgccgcaaatagcgcctttaaggtgggtgctgatggtacggtgacggctgttaaa
ggcggaagtatcggcggagtagagctgaaagacggtgaagtgactggcctgaacaatacg
acgtgggatgctggtaatattgtcgatgaccgtgcggctacggaaggtcagctggcagtt
gtcgatgcaaaggtaaaagtcaacagcgacgaccttgcagcgtataaagcagccggcgtt
gttccgggcgcagtgcctgctgaagcagaaggagcaatggctcttggtgcaggggcagaa
gtacgaggcgatagcgataaggccatggcgattggcaacggtgcagctgctacgaataaa
aacgctgtagctttgggcgcaagcgcaacggctaaaggtgtagattcgttggctttgggc
gcaaatgccaatactgatgtcagcgcgcagcacgcagtagccatcggcgcgtgggctgga
gctacggaagacaatgctatcgcaatcggtcagagcgctggcgctaaagccgaaaatgct
gtggcagtaggcatggaagcaaaggctgagggcgatcatagcgtagcattaggtgcaaat
agcggagtagcggaagacactactaacagcatggctcttggcaacaacgcgaaggttgaa
aatgcaggcagtgacagtgcgttggctattggcgatgaagcaactgttacggcaagccat
gccgtagctgtaggtgcaggtgtagaagctgacggtgtacattcgctggctatgggttct
gatcttactgtaacaggcgataatgctatcggcatcggctacagtgcaggcatgggaact
aagatcagcggtgaaaatgcgataggcattggtaaagctgtcaatgcgacggacaagaat
acgattgctttaggtacggctgctgcttcgaatgaagaaaacgctatttctatcggcact
agagcgacagttgacagctataatagcattgctattggtgcagaaagcggtgttgcagaa
ggcagccaagaaggtatagccttagggtataatgctaacgttagtacgaatggcgctatt
gcgattggttcgaatagcgttgcggcaggagaaggcagcatggctttgggtttaggcgca
tcgacaacattgcaagctccgcactctgttgctattggtgaaggcagtgttgctgatgaa
tcaatggttgtttccgttggtcatgctggagaaaacggacagcgccgcattatcaacgta
gcggctggcacgaaagataccgatgccgtaaatgtttctcaaattaaaggcatggtaaga
tgggatcaggatgctgacgattcctatctggaagggacgctgagaggcgtaacattgtct
gatggtactattacggcagctaatggtaatttcgtagttacagacgatcccaagagtggt
acggattcgattctcaatattggcgaagatgcgtttagagtcaatgaaaatggtggtttt
gttgctggcaatggaaactttaaagtatttagcactggcggcgttgtagcggctggcgga
gactttaagattaacagtgaaactggtgcagtaactactacttctgttacgggacttacg
aacacagactggaatactacgcatgattatagcgattctactcttgctgcgacagaagcg
cagttgcaggctgtagccgaagaagcaggcaagcaagcgagtgtagtgagtgctgacggc
aacttgacggtgaacgatgctactactaatgctagtggagggactacgttcaaaattggt
cttagcgataaagttgtcttagacggcgataagggaacgacgattactcttaatagtggc
gaactgaatgctgatgattctgcttttagtattacaacgccaggattagcaacgggacgt
acgcaatcctttgatttttcgagtgcgggtgctgttttcaaagaagcatatgcagatacg
tcgaactctactaagattgctggcagcacaattatatctgaaaattattatcatgatgag
ggtactggagaaaaacgtactgctacgactgtaattgatgggggtacccttagagtaagt
agcagtggcggggaatcggataaaaccgttattaaaggtgccgatattacagttggtact
acaactggtggagcggcacaaactcacattaccgctaaggaaattacaattggcggagat
ctgttgaatgatgacaaggcaactgcactgcgaatcacaaataacggcgtaaatgataga
actatcaccggcttgactaatataacgtggaagagtgatgaggaatggcagaaagcgcat
tacgaatcaagtagagctgcaacagaaggccagttgaagatagtagatgacaaagtcaat
gcgaatgccgatgctattgacaagctgaataagttcactggtcttagtaaagacaccaat
gcaaaagtttctgcctttgctgcgaagacgcagggtatcaactgggataatttgaatacc
ttgtcgcagatttcaccgatgaatctggctgcgccgatgaatgcagccgtaccgacggcc
aatgcgacgagattccctgaccttgacgacgaatctggcgaaagcggaactactggagat
acgggcagagttcctgttgaaggattaactgtgacggacgatcaaatttcgactgacaga
gacttcagcgtcggcggagatctgagcgtaagcggcgatacgacgcttggcggcaagctt
acggttggcggcgaagctacgtttaacgacaacgttagcatcaaaggcgacctgaacatg
aacaacaacaagatcactggcgtggctgctggcgatgtaaacgctacatcgacggacgct
gtcaacggcagccagctctacggcgtacagcaggatgttgaagctaacgcgaagaacatc
agcactctcggcggcgcagtcaataagcttggcaaccgcattgacgaagtcggcgctggc
gcagcggccttggcagctctccatccgctcgatttcgacccggacaacaagtgggacttc
tcggcaggcttcggtaactaccgcggtgaaagtgccgtcgccttcggcgccttttaccgt
ccgaatgaagataccatgttcagcgtcggcggtaccgtcggcaacgatgacaacatggtc
aatgccggcgtatccctgaagattggctcgggcagcagcggcgtcaccacgtctcgcgta
gccatggctaaggaaatcaaagccatgcgcgacgtcgtcgctaaacaggacgcccagatc
cagaagctgacggctatggtcaatgccttggtcggcgtgcagacggaaccggatacgacg
acgatgttcccggatgtaccgtaa
DBGET
integrated database retrieval system