Methanimicrococcus hongohii: MmiHf6_11420
Help
Entry
MmiHf6_11420 CDS
T09450
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mehf
Methanimicrococcus hongohii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_5
Flg_new
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WNY23821
UniProt:
A0AA96V9D3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1427799..1433453)
Genome browser
AA seq
1884 aa
AA seq
DB search
MLSAILKKGIGRKKSVLFFSMIVSFLISVFTPKIVSTLPGNSSYGGGAAGYGGTLMKTTA
KKLIFICLLVFMLLVFVPSTAVADTVTLPVEAYNYTNNSNGTVTIKCINATWYANEFGSN
ITPADLNLVIPDEIDGKKVVAIGIRAFTKNYGSENGWPTGRRSYDVVSVDFSQTTALEEI
GDSAFASQTNLTSISLPNTVTKVGNSSFYGLKEITLSNNLTYIGTSAFSSSGFVDSTFVR
VNGGDPNAIFELPNTIETIGERAFYNFFPNSTGELSFKIPASVTTIGRQAFYNANLLNGT
IITVEGSGSYSGFNATAFNITGSTTSATNALAIIFPSMEDCNNFSSKSGIGNFKNSCTYV
VDVNFFDQSSNPLLSEEKVNNKSIKLVKNSYGVWGTDDTYTLPSTTGFTAENGHAPNWVY
EGTVIPVTINDKIAITGTFVNVVPGMSPIDPVSVKGTVNGVVVTEGSKTPGWHSFDLSVP
DVYSPAPTIGVEITHPLYSSDNSSTDSSGGYVIFYTKWFDIKGSTEGPRSYPTAEYPFKY
YNTTDHSISIRSASDLRNGIGDRYEIIIYGLYVNGSNSSDRTKFYQSMSSEISFNGVNNS
NITDSTTFTLLVGNYVPITITYDLSGGNVSGSGSDIVWSDVTASTLGGHGTVPVPTKDGY
ILTGWVDNTSTSTVIAPGDMADEAVTVTKTYTAQWQIDITFDLNGGNVGGDTSAIVRENV
TYGALLNTINIPAPTRDGYVLTGWKDNTTNAIITPDANGIQIIGTKTYTAQWAPKPEIVS
VSPEGDNGGSGYPITTNTVTIVFDIEMNTSHFGTVVLDNGAILANGVWSNGNQTITYDLS
NLTYSKTYSYSVSGFKSSDEAVMDASMDEYNFTTEAAPSEPQIVSVSPNGTGILVSSNLV
TIVFDREMNITHFGTVTLDNGAILENGAWNADKKTLNYTLSNLTYSTTYNFTIKDFNSSS
DVVMVNSIDEHDFTTEAAPKPQISSVSPTGTGISVTSSLVTIVFDMEMNTSHFGTVVLDN
GAILENGAWNADKKTLNYTLSNLTYSTTYNYSISGFKSAYDVEMDSSINVYDFTTIDRPS
ITVVAPVGDNSGSGFPITTDKVSVTFNKEMNASSNHPGTVTLDNGAVLTSGVWSNGNQTI
TYDLSNLTYSKTYNYTIRDFESVEGGAISDSINVYDFTTEAAPKPQISSVSPTGTGISVT
SSLVTIVFDMEMNITHFGTVVLDNGAILENGAWNADKKTLNYTLSNLTYSETYNYSISGF
KSAYDVEMDSSINVYDFTTIDRPSITVVAPVGDNSGSGFPITTDKVSVTFNKEMNASSNH
PGTVTLDNGAVLTSGVWSNGNQTITYDLSNLTYSKTYNYTIRDFESVEGGAISDSINVYD
FTTEAAPKPQISSVSPTGTGISVTSSLVTIVFDMEMNITHFGTVVLDNGAILENGDWNAD
KKTLNYTLSNLTYSETYNYSISGFKSKYDAEMDSSINVYDFTTIDRPSITAVTPVGDNSG
SGFPITTDKVSVTFNKEMNASSNHPGTVTLDNGAVLANGVWSNGNQTITYDLSNLTYSKT
YNYTIKDFESVEGGVISDSINVYDFTTEAAPKPEIDTITPEGDNGGSGHSITTNTVTIVF
DMEMNTSQLGAITLDNGAILTGGTWNADKKTLNYTLSNLTYLETYNYSISGFKSKYDAEM
DLNTTYWFETEPDTHKPYIVKVIPNGTGISVTTDKVLITFNEKMNQVVTGTVELDNSVVL
DVPGIWLNDTTIEYTISSDLDYSTTYNYTIKDFEDSAGNKMDDSINVFWFTTVNKGGSSG
GGGGSGGGTVVDDQEEPEEDSGSGGSDDSGQGGSQMGGFEEDEEVQPVIILTFMIAIAFF
CYRMNMEKRDDEDEIILRQAHNLF
NT seq
5655 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatctgctattttgaaaaaagggattgggcggaagaaatctgttctcttcttttca
atgatcgtatcgtttttgatttctgtttttacgccgaaaatcgtgtcgacgctacctggt
aattcttcctatggggggggggctgccggttatggggggacactcatgaaaacaacggca
aaaaaacttatttttatttgtttgcttgtgtttatgctgcttgtgtttgttccgagcacg
gcggttgctgacacggtaactcttccggttgaggcttataattatactaataattctaat
ggcacagttacaataaaatgtattaatgctacatggtatgctaatgaatttggaagcaac
attacacccgctgatcttaatctcgttattccggatgagattgacggcaaaaaggttgtg
gcaatcggaatccgtgcttttaccaaaaattacgggtctgaaaacggttggcctactggg
cggagatcgtatgatgtggtaagtgttgacttttctcaaacgactgctcttgaagaaatc
ggagactctgcttttgcctcgcaaaccaatttgacatcgatctcgcttcccaacacagta
accaaggttggtaattcctcattctacggcttaaaagaaattacattatctaataatctt
acttatatcggtacatctgctttttcttccagcggttttgttgattcaacttttgtgcgt
gtaaacggcggcgatccgaatgcaatttttgaactgccaaacactattgaaacgatagga
gaaagagcgttttataatttctttccaaatagcacgggagagctgtcttttaagattccg
gcatcagttacaactatcggaaggcaagcgttctataacgcaaatcttctgaacggtact
ataattacagtggaaggaagcggttcatattcaggcttcaatgcaacggcatttaatatc
accggcagtacaacaagtgcaacgaatgcgcttgctatcatttttccgtcaatggaagat
tgtaacaatttttcatctaaatccggaataggcaactttaaaaactcatgtacttatgtg
gtagatgtcaattttttcgatcaatcgtcaaatcctttgttatctgaagaaaaagtcaat
aacaaatccataaaattagttaaaaattcatacggtgtttggggcacagacgacacatat
actctgccatccacaaccggttttaccgctgaaaacggacacgcccccaactgggtgtat
gagggaacagtcatacccgtcacaataaatgataaaattgctatcacgggcacctttgtt
aatgtcgttcccgggatgtctcctatagaccctgtttctgtgaaaggcacagtgaatggt
gtggttgtcacagagggttctaaaaccccgggttggcattcttttgatctctctgttccg
gacgtttactcccctgcccctacaatcggcgttgaaataactcacccgctttattccagt
gataacagttcgacagatagctccggcggttatgtcatcttttatactaaatggtttgat
attaaaggatcgacggaaggaccccgcagttatcctacggcggaatatccctttaagtac
tataatactacggatcattctatcagtatccgcagtgcttccgatttaagaaacgggatc
ggcgaccgttatgaaataatcatatacggtctatacgttaacggctcgaacagctcggat
cgaaccaagttttatcaatctatgtccagtgagattagctttaacggagtgaacaattct
aatataactgactctacgacctttactcttcttgtcggtaactatgtgcctattacgatt
acttatgatttaagcggcggcaatgtcagcggcagcggatccgatatcgtatggtcggat
gtgactgcttcaacattgggcggacacggcaccgttcctgtgccgacaaaagacggatac
atattgaccggttgggtggacaacacctcaacaagtacagtgattgcgcctggggatatg
gcagatgaggcagtcacagttacaaaaacttacacagcacaatggcagattgatatcaca
tttgatctaaacggcggcaatgtcggcggtgacacatccgctatcgtgcgggaaaatgtg
acatacggggcacttttgaatacaatcaatattcctgcaccgacacgagacgggtatgta
ttaacaggctggaaggacaataccacaaatgcaataattacacccgatgctaatggaatt
cagatcattggaacaaaaacttacaccgcgcagtgggcacccaaacctgaaattgtcagt
gtcagtcccgaaggcgacaacggcggttccggttatccgattacaacgaatactgtcacg
attgtctttgacattgaaatgaatacaagccatttcggaaccgttgttttggataacggc
gcaattttggcaaacggtgtttggagcaacggcaatcaaacaatcacttatgatttgtct
aatttgacttattcaaaaacttacagttattcagtttcaggctttaaatcttcagatgaa
gctgtgatggatgcttcaatggatgaatataatttcacgacagaagcggcaccatcggaa
cctcaaattgtcagtgtcagtccaaacggaacaggtattcttgtatcttcaaatcttgtg
acaattgtctttgacagggagatgaatataacccatttcggaactgttactttagataac
ggcgcaattttggaaaacggtgcttggaacgccgataaaaagaccctcaattatactttg
tctaatttgacttattcgacgacttataactttacaattaaggatttcaactcctcaagt
gatgttgtaatggttaattcaattgatgaacatgatttcacgacagaagcagcaccgaaa
ccccaaatttccagtgtcagcccgaccggaaccggcatttctgtaacttcaagtcttgtg
acaattgtctttgatatggaaatgaatacaagtcatttcggaaccgttgttttggataac
ggcgcaattttggaaaacggtgcttggaacgccgataaaaagactctcaattatactttg
agcaatttgacttattcaacgacttacaattattcaatttcaggctttaaatctgcatac
gatgttgaaatggatagctcaatcaatgtttatgattttaccaccattgaccgaccttca
attactgttgttgcgcctgtcggtgataattccggttcgggattcccgattacaactgac
aaagtttctgttacgtttaacaaggaaatgaatgcaagcagcaatcatcccgggactgtt
actttagataacggcgccgttttgacaagcggtgtttggagcaacggcaatcaaacaatc
acttatgatttgtccaatttgacttattcaaaaacttataattatacaattagggacttt
gaatcggttgaaggcggcgccatttcggattcaattaatgtttatgatttcacgacagaa
gcagcaccgaaaccccaaatttccagtgtcagcccgaccggaaccggcatttctgtaact
tcaagtcttgtgacaattgtctttgacatggaaatgaatataacccatttcggaaccgtt
gttttggataacggcgcaattttggaaaacggtgcttggaacgccgataaaaagactctc
aattatactttgagcaatttgacttattcggaaacttacaactattcaatttcaggcttt
aaatctgcatacgatgttgaaatggatagctcaatcaatgtttatgattttaccaccatt
gaccgaccttcaattactgttgttgcgcctgtcggtgataattccggttcgggattcccg
attacaactgacaaagtttctgttacgtttaacaaggaaatgaatgcaagcagcaatcat
cccgggactgttactttagataacggcgccgttttgacaagcggtgtttggagcaacggc
aatcaaacaatcacttatgatttgtccaatttgacttattcaaaaacttataattataca
attagggactttgaatcggttgaaggcggcgccatttcggattcaattaatgtttatgat
ttcacgacagaagcagcaccgaaaccccaaatttccagtgtcagcccgaccggaaccggc
atttctgtaacttcaagtcttgtgacaattgtctttgatatggaaatgaatataacccat
ttcggaaccgttgttttggataacggcgcaattttggaaaacggtgattggaacgccgat
aaaaagactctcaattatactttgagcaatttgacttattcggaaacttacaactattca
atttcaggctttaaatccaaatatgatgctgaaatggatagctcaatcaatgtttatgat
tttaccaccattgaccgaccttcaattactgctgttacgcctgtcggtgataattccggt
tcgggattcccgattacaactgacaaagtttctgttacgtttaacaaggaaatgaatgca
agcagcaatcatcccggaactgttactttagataacggcgccgttttggcaaacggtgtt
tggagcaacggcaatcaaacaatcacttatgatttgtccaatttgacttattcaaaaact
tataattatacaataaaagattttgaatcggttgaaggcggcgtcatttcggattcaatt
aatgtttatgatttcacgaccgaagcagcgcccaagcccgaaattgacacaatcactccc
gaaggcgacaatggcggatcgggtcattcgattacaacgaatactgtcacgattgtcttt
gatatggaaatgaacacaagtcagttgggagctattactttagataacggcgcaattttg
acaggcggtacatggaacgctgataaaaagacccttaattatactttgtccaatttgact
tatttggaaacttacaactattcaatttcaggctttaaatccaaatatgatgctgaaatg
gatctcaatacaacatattggtttgaaaccgaacccgatacacacaaaccgtatattgtc
aaagtcattccgaacggaaccggcatatcagtcacaaccgataaagtgcttattacgttt
aatgaaaaaatgaatcaggttgttaccggaaccgttgaattggacaacagtgtcgtattg
gacgttccgggcatttggctcaacgacacgacaatcgaatatacaatttcatccgatttg
gattattcaacgacttacaactacacgataaaagattttgaagattcagccggaaataag
atggatgattcgatcaatgtcttttggtttacaaccgttaacaaaggaggaagcagcggc
ggtggcggcggcagcggcggaggaactgttgttgatgaccaggaagagcctgaagaagac
tccggatccggaggaagcgatgacagcggccagggcggaagtcaaatgggcggatttgaa
gaagatgaagaggtgcagcctgtcatcattctcacattcatgattgcaattgcattcttc
tgttaccgcatgaatatggaaaagcgtgatgatgaggatgaaattattcttcgtcaggca
cacaatttgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
