Methyloprofundus sp. INp10_methR40d: methR_P2796
Help
Entry
methR_P2796 CDS
T07025
Name
(GenBank) two-component system, cell cycle sensor histidine kinase and response regulator CckA
Organism
mein
Methyloprofundus sp. INp10_methR40d
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_4
PAS_9
PAS
Response_reg
HATPase_c
PAS_3
PAS_8
HisKA
PAS_10
HAMP
SPOB_a
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCG64992
UniProt:
A0A7R6W9X7
LinkDB
All DBs
Position
complement(3135360..3138428)
Genome browser
AA seq
1022 aa
AA seq
DB search
MKNKTKSYRLKLWLPISSFFIFACLLSSIFFFNYRIELDLLHQQTEQHLQEQMERLQLRL
EVFIQQQDSNHIERELSYINLIPQTKIISLIDTKGTILFANDRSWKNKAAKDLFPEFDLK
IYTKTQENFYTTIQNNTETTQYYVYTPIILSSTATQLRAHKVGVIYFVYDNSVAHQAIWQ
NTFKQSVLIGIAVIFSMLILLIIQHFILSTPLRRLIRFTEEIGEGNFSTSNPLFGKGELM
LLGKTLEQTSKLLQQREQNLAVTLNSIGDAVIATDIEGCVARMNPIAEQLTGWSLTEAQG
ISLKTIFPIIDASTRKPIANPVDKVISTGETVYLSNHTTLIAKDKTEYQIADSAAPIRDA
NNAILGMILVFNDVTEKYKVREELNNSMQRLTLHWQDTPLGMVEWNTAFEFIDLNPAAEQ
MFGFRKSEIQGQHITQNILPESARKAVDKVWADLLTNTGGRRSRNENITKDGRIILCEWY
NTPLINDEGQVIGISSLIMDITEQERLSRQEQEYKTQLQEVLNSMLTMVATLLPDGTISF
INTPSLSILELTENDVINNKLWNGPWFSYSKSIQLMIENDCKRAAAGETISREIEIAILD
RQLWVDFSVHPVFDQQGSVKSLVAEGRDASRRKLAEEHAIRSQKMEALSKIVGGIAHDYN
NMLGVITGYTGLLKRKCQDVDGAEKFISEIMHATERGKKLTKKMLNFSRPESSHAEPCNM
NLVLKGFYDILAKSLTSVITLHFDLNTDDCLVWLDVGEFEDAILNMAINAKYAMPEGGTL
SISTHNIYIAEKEAKYLNIAANDYIKLTIADTGTGMDTSIKDKIFDPFFSTKGEAGNGLG
LSQVFGFMERAGGAINVYSQEGKGTQFSLYFPRYHQPTSHSKTINVTRVEPNLSGSETIL
VVDDEPALRELARQILLDAGYKILTAGDGKEALDIIPIQSIDLVLSDVIMPNMDGYQLAQ
KILEYYPEIKIQLTSGFSGERHSVLSDSTLKDNMLYKPYDSHELLLHVRLLLDDLTLPHK
EQ
NT seq
3069 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaaaccaaatcttatcgattaaaattatggctacctattagtagctttttt
atatttgcttgtttgttgagcagcatatttttcttcaattatcgtatagaactggactta
cttcaccagcaaacagagcaacatcttcaggaacaaatggaacggttgcagttaaggctg
gaggtgtttattcaacagcaagatagtaatcatattgaacgcgaattaagctatatcaat
ctgatacctcagactaagattatttctctaatagatactaaaggaacgatcctttttgcc
aatgaccgtagctggaaaaacaaagcagcaaaagatttatttcccgagtttgatctaaag
atatatacaaaaacacaagaaaatttctataccacaatacaaaataacacagaaacaact
caatattacgtatatacgccgattattctttcctcaacagcaacacaattacgcgcacat
aaagtgggtgtgatttactttgtctatgataattcagttgctcaccaagctatttggcaa
aacacttttaagcaaagtgtattaattggtatcgcggtcattttttctatgttgatattg
ttaatcattcaacattttattcttagtacccccttaagacgactgattcgttttactgaa
gaaattggtgaaggcaatttttccacctcaaacccattgtttggaaaaggtgaattgatg
ttgctaggaaaaaccctggaacaaaccagtaaactacttcagcaacgcgaacaaaatctt
gctgttactttaaatagtatcggtgatgcagttatagcaacggatattgaagggtgtgtt
gctcgcatgaacccaatagcggaacagctcactgggtggtcgttgactgaagcccagggg
atatcattaaaaactatttttcctattattgacgcatccactcgcaaacctattgcaaac
cctgtagataaagttattagtacgggagaaaccgtttacctcagtaaccacaccacttta
attgccaaagataaaacggaatatcaaattgctgactctgcggcacccatacgcgatgca
aataatgctattttgggaatgatcctggtcttcaacgatgtgacagagaaatataaagtc
cgcgaagaacttaacaatagcatgcaacgtttaacgctgcattggcaagatacgcctcta
ggtatggtcgaatggaataccgcctttgaatttattgatttgaacccagcagcagaacaa
atgtttggctttagaaagtctgaaattcaagggcaacatattacccaaaatatactaccc
gaaagtgcaagaaaagccgttgataaagtatgggctgacttgttaactaatactggtgga
agaagaagccgtaacgaaaacataacaaaagatggacgtatcattctctgcgaatggtat
aacacacctctgattaatgatgaaggtcaagtaatcggtatttcttctctgataatggat
attactgagcaagagcgcctttcaaggcaggaacaagaatataaaactcaactgcaagaa
gtcttaaatagcatgttaaccatggtagccactctgttgcctgatggaacgattagcttt
atcaacactccttcactatcaatactagagcttactgaaaatgatgtgattaataacaag
ctatggaatggtccttggttttcctatagcaaatctattcaattaatgattgaaaatgac
tgtaagcgtgcagcagcgggtgagacaataagtagagaaatagaaattgcaatcttagat
agacagttatgggttgattttagtgtacaccccgtctttgaccaacaaggaagtgttaaa
tcactggtcgctgaaggcagagatgctagtagacgaaaactggctgaggaacatgcaatt
cgtagccagaaaatggaggcattaagtaagattgtgggaggtattgcccatgactacaat
aatatgctgggggtgattactggttatactggcttactcaaaagaaaatgtcaggatgta
gacggagcagaaaaatttatcagtgaaattatgcacgctacagagcgaggcaaaaaactg
acaaaaaaaatgcttaacttttctcgacctgagagtagtcatgctgagccttgcaatatg
aatctggtacttaaaggtttttatgatattttagccaaatcactcacctctgttatcacg
cttcattttgatttaaatacagacgattgcttggtatggttagatgtcggtgagtttgaa
gatgctattttaaatatggctatcaatgctaagtatgcaatgccagaaggtgggacattg
agtattagcactcacaatatttatatcgcagaaaaagaggcaaaatacctcaatatagcc
gcaaatgattatattaagctcaccattgctgatactggaacgggaatggatacttctata
aaagacaaaatttttgatcctttttttagtaccaaaggagaagctggaaatggccttgga
ttaagtcaggtctttggatttatggagcgggctggtggtgccattaatgtatattctcaa
gaagggaaaggcacacagtttagcctttactttcctcgctatcaccaaccgactagtcat
tctaaaacaataaatgttacacgtgttgagcctaatttatcaggcagcgaaacaatttta
gtggttgatgatgagcctgctttacgcgaactagccagacaaattttgttagatgcaggg
tataagattttaacagcaggtgatggtaaggaggcacttgatataatacctatccagtct
attgaccttgtgttaagtgatgttattatgcctaatatggatggctaccaattggcacaa
aaaatattggagtattaccccgaaatcaaaatacaattaaccagtggttttagcggtgaa
cgacacagcgttttaagtgattcaacgctaaaagataatatgttatataagccttatgac
agtcatgagttattgttgcatgttcgacttttattggatgacttgactcttccacacaag
gaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
