Methyloprofundus sp. INp10_methR40d: methR_P3172
Help
Entry
methR_P3172 CDS
T07025
Name
(GenBank) vitamin B12 transporter
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
mein
Methyloprofundus sp. INp10_methR40d
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mein00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mein02000
]
methR_P3172
Transporters [BR:
mein02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
methR_P3172
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCG65341
LinkDB
All DBs
Position
3517292..3519121
Genome browser
AA seq
609 aa
AA seq
DB search
MKKFFIASPFLFSTLPTAVHADHTVALAPLTVTATRNQQDTRLVSSTLITRQDIERKQLN
SIEQALRGVAGINIANNGGLGKNTSVFLRGTESDHVLVLIDGVRAGSATSGGAAWQHIPI
SEVESIEVIRGPKSSLYGADAIGGVIHIHTRSAAASTSAINPELSVGGGNYGHYKVQAGI
SGAVEQAWYNANFSYQANEGFNSCAGALSYGCFTNEPDRDGYQNYSGTLRLGYRFTDWLS
VEGHALYSGGHTEFDGSFVNEGDFAQLVYGGKATIQAMDFWRIDLTGGESRDESTNFLYD
TQKSHFDTQRVSFSALNNFTLAPKQLLSLGYDFQNDSIDSNENFAETSRHNHAVFLQYQG
QLANNQFILAYRSDFNQQFGQNSTWNASWGYAFDNGILVSASYGTAFKAPTFNELYFPGF
GNSDLNPEKSETYEIGVSGEHNNWNWALNGYLTYIDNMIAYDSTIFAPNNLSSARIMGIE
AMLGAQLYGFDLQANYSALDPESMDAATFGNVLPRRAQQTFRFDIDRQFGAASIGSTLNV
EGRRFDDLKNTRSVDGFVTWDLRAEYQFYEQFTLQGSINNILNTQYQTAAGYNSPGMTVF
FNLRYAPTL
NT seq
1830 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattttttattgccagccctttcttattcagcactcttccaacagcagtgcat
gcagatcatacggtagcacttgcacctttaacggtaacggctacacgtaatcaacaagat
actcggctagtatcaagcacccttattactcgacaagatatagaacgcaaacagcttaat
agtattgaacaggctttgcgtggtgttgctggtatcaatatcgctaataatggtggctta
ggtaaaaatacgtcagtatttttacgaggtaccgaatcagatcatgttttagttttgatt
gatggtgttcgtgctggctctgccacatcaggtggtgcagcttggcaacatataccgatc
agtgaagtcgaatcgattgaagtcatacgcggccctaaatccagcttatatggtgctgat
gctattggtggggtcattcatattcatactcgtagtgccgctgcatcgacatcggcaatt
aatcctgaattgtctgtgggtggtgggaattatggacactataaagtacaagccggcata
tcaggagctgttgagcaggcttggtataatgccaactttagttatcaagccaatgagggc
tttaattcctgtgcaggggcattaagctatggttgttttaccaatgaaccggatagagac
ggttaccaaaattattcaggaacactacgtttaggctatcgttttaccgattggctgagt
gtggaaggccatgctttgtatagtggtggtcacactgagtttgatggtagctttgttaat
gaaggtgattttgcacaacttgtttatggtggtaaggcgaccattcaggctatggacttt
tggcgtattgatttaacggggggtgaaagccgcgatgaatccactaacttcttgtatgac
acacaaaaaagtcattttgatacccaacgtgtttcattttcagcactgaataattttact
ttggctcctaaacagttactgtctttaggctatgattttcaaaatgacagtattgatagt
aatgagaattttgcagaaacctcgcgtcataatcatgctgtttttctgcaataccaaggc
cagttggccaataatcaatttatactggcttatcgtagtgattttaatcaacagtttggc
caaaatagcacctggaatgcatcatggggttatgcctttgataatggtattttagtctcg
gcttcttatggcaccgcttttaaagcaccaacttttaacgaactttatttccctggtttt
ggtaatagcgacttaaatccggagaagtcagaaacttatgaaataggcgttagtggtgag
cataataactggaattgggcactgaatggttatttgacctatattgacaatatgattgct
tatgacagcaccatctttgcgccgaataatttaagctcggcgcgtatcatggggatagag
gcgatgcttggtgcacaactttatggttttgatctgcaagcaaattatagtgccttagac
ccggaaagtatggatgcggctacttttggtaatgtactacctaggcgtgcacaacagaca
tttcgctttgatatcgatcgacaatttggtgctgccagtatagggagtacccttaatgtt
gaaggacggcgctttgatgatttgaaaaatacgcgaagtgtcgatggttttgttacttgg
gacttaagagcagaatatcaattctatgagcagtttactttgcaaggttcaatcaataac
attctgaatactcaatatcaaacggcagcaggctataactcgccaggcatgaccgttttc
tttaatttgcgctatgcgccgacactttaa
DBGET
integrated database retrieval system