Methyloprofundus sp. INp10_methR40d: methR_P3730
Help
Entry
methR_P3730 CDS
T07025
Name
(GenBank) O-antigen ligase
KO
K02847
O-antigen ligase [EC:
2.4.99.26
]
Organism
mein
Methyloprofundus sp. INp10_methR40d
Pathway
mein00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
mein01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mein00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
methR_P3730
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
mein01005
]
methR_P3730
Enzymes [BR:
mein01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.26 O-antigen ligase
methR_P3730
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
mein01005
]
Core region
methR_P3730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCG65862
UniProt:
A0A7R6WBL6
LinkDB
All DBs
Position
4127836..4129077
Genome browser
AA seq
413 aa
AA seq
DB search
MHNITSKILSLSLGLMPIMVLTVKHGVNISAAIILLTSIIVLLIHFPVSMQLSNKEKVLI
IAMLCLPLIILSDVLLRGFRWRYFDYYARFIVVLPIYFALRQAKVTIKPFVMGILMGAVA
VGLLAVYQCYYIDALNVHGFVIKISFGNISLLLGMMSLASWFLIDSIYYKKIFFISCLLA
FFLGLTASILSGSRGGWVALPFFIALFFWYFPIQKLYKLISVLLLVSILASTYYANDNVK
LRVDLVSKEFNHYFSTDNFGNSEELQVSSVGLRLEVWRAAWLMFTKNPIVGVGSGEFNHT
LQEKIAAGEVADIFIFDHAHSVPIHLLAITGVVGFIGYCVLYVGLLYYFYRSFISSSNNE
LQYLSFLGLMLVGASLVFGLTNYSFGHQVNVVFFAVMVVSLAGMISALEKKQA
NT seq
1242 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataacataacttcaaaaattttgtctttatcgctggggttaatgcctattatggta
ttaaccgtcaagcatggagtaaatataagcgctgcaattattttattaacctcaataata
gtattgcttattcatttcccggtcagtatgcaactcagcaataaagaaaaagtactaata
attgctatgttgtgtttaccgttaatcattctctccgatgtgctgctgagaggttttagg
tggcgatattttgattactatgcaaggtttattgtagttttacctatttattttgcactg
aggcaagcaaaagttactattaagccttttgttatggggatcttaatgggtgcagtagct
gttggtttgttagctgtctatcaatgctattatattgatgccttaaatgtacatggtttt
gttataaaaattagctttggcaatattagcttattattaggcatgatgagcctagcgagt
tggtttttgattgatagtatttattataaaaaaatattttttattagctgtttgctggct
ttttttttgggcttaaccgcatcaatattgtcaggtagtcgaggtggctgggttgctctg
ccattttttatcgctttatttttctggtattttccaatacagaaattatataagttaata
agtgttttattattagtgagcatactcgcgagcacttattatgcaaatgataatgtgaaa
ttacgagtggatttagtttctaaagagtttaatcactatttttctactgataatttcggt
aactctgaggaattacaggtttcttcagtgggcttacgcttggaggtttggagagctgca
tggttgatgtttactaagaacccaatagttggagtgggttctggagaatttaatcatacc
ttacaagaaaaaatagcagcaggtgaggttgctgacatttttatatttgatcatgcgcat
agtgtaccgatacatctactcgccattacaggcgtagttggttttataggttattgtgtg
ttgtatgttgggcttttatattatttttatcgctcatttattagtagtagcaataatgaa
cttcagtacttgagttttttagggcttatgttggttggggcaagcttagtctttggctta
actaattattcatttggccatcaggtgaatgtagttttttttgctgtaatggttgttagt
cttgctggtatgattagtgcgcttgaaaaaaagcaggcataa
DBGET
integrated database retrieval system